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-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 2jua | ||||||
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タイトル | Assignment, structure, and dynamics of de novo designed protein S836 | ||||||
要素 | de novo protein S836 | ||||||
キーワード | DE NOVO PROTEIN | ||||||
機能・相同性 | Designed four-helix bundle protein / hypothetical protein mp506/mpn330, domain 1 / Up-down Bundle / Mainly Alpha 機能・相同性情報 | ||||||
生物種 | unidentified (未定義) | ||||||
手法 | 溶液NMR / simulated annealing | ||||||
データ登録者 | Go, A. / Kim, S. / Baum, J.S. / Hecht, M.H. | ||||||
引用 | ジャーナル: Protein Sci. / 年: 2008 タイトル: Structure and dynamics of de novo proteins from a designed superfamily of 4-helix bundles. 著者: Go, A. / Kim, S. / Baum, J. / Hecht, M.H. #1: ジャーナル: To be Published タイトル: NMR assignment of S836: a de novo Protein from a Designed Protein Superfamily 著者: Go, A. / Kim, S. / Hecht, M.H. / Baum, J.S. | ||||||
履歴 |
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Remark 999 | Sequence This is a de novo Protein design sequence. |
-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 2jua.cif.gz | 639.7 KB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
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PDB形式 | pdb2jua.ent.gz | 533.2 KB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 2jua.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
文書・要旨 | 2jua_validation.pdf.gz | 339.2 KB | 表示 | wwPDB検証レポート |
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文書・詳細版 | 2jua_full_validation.pdf.gz | 532.4 KB | 表示 | |
XML形式データ | 2jua_validation.xml.gz | 64.4 KB | 表示 | |
CIF形式データ | 2jua_validation.cif.gz | 85.1 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/ju/2jua ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/ju/2jua | HTTPS FTP |
-関連構造データ
関連構造データ | |
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類似構造データ | |
その他のデータベース |
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-リンク
-集合体
登録構造単位 |
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1 |
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NMR アンサンブル |
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-要素
#1: タンパク質 | 分子量: 11946.391 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 詳細: Ambiguous conformational states: Y2, Q24, and N84 register possible alternate alpha carbon chemical shifts 由来: (組換発現) unidentified (未定義) / プラスミド: pet3A / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 株 (発現宿主): BL21 (DE3) |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NMR実験 |
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-試料調製
詳細 |
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試料 |
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試料状態 | pH: 4 / 圧: ambient / 温度: 298 K |
-NMR測定
NMRスペクトロメーター |
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-解析
NMR software |
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精密化 | 手法: simulated annealing / ソフトェア番号: 1 | ||||||||||||||||||
代表構造 | 選択基準: lowest energy | ||||||||||||||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: structures with the lowest energy 計算したコンフォーマーの数: 100 / 登録したコンフォーマーの数: 20 |