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-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 2hn8 | ||||||
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タイトル | Structural characterization and oligomerization of PB1-F2, a pro-apoptotic influenza A virus protein | ||||||
要素 | Protein PB1-F2 | ||||||
キーワード | VIRAL PROTEIN / pro-apoptotic mitochondrial targeting protein | ||||||
機能・相同性 | 機能・相同性情報 host cell mitochondrial inner membrane / Influenza Virus Induced Apoptosis / host cell cytosol / Viral mRNA Translation / symbiont-mediated suppression of host cytoplasmic pattern recognition receptor signaling pathway via inhibition of MAVS activity / virus-mediated perturbation of host defense response / host cell nucleus / membrane 類似検索 - 分子機能 | ||||||
手法 | 溶液NMR / simulated annealing | ||||||
データ登録者 | Bruns, K. / Studtrucker, N. / Sharma, A. / Fossen, T. / Mitzner, D. / Eissmann, A. / Tessmer, U. / Roder, R. / Henklein, P. / Wray, V. / Schubert, U. | ||||||
引用 | ジャーナル: J.Biol.Chem. / 年: 2007 タイトル: Structural characterization and oligomerization of PB1-F2, a pro-apoptotic influenza A virus protein. 著者: Bruns, K. / Studtrucker, N. / Sharma, A. / Fossen, T. / Mitzner, D. / Eissmann, A. / Tessmer, U. / Roder, R. / Henklein, P. / Wray, V. / Schubert, U. | ||||||
履歴 |
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-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 2hn8.cif.gz | 279.4 KB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
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PDB形式 | pdb2hn8.ent.gz | 231.4 KB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 2hn8.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
文書・要旨 | 2hn8_validation.pdf.gz | 335.4 KB | 表示 | wwPDB検証レポート |
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文書・詳細版 | 2hn8_full_validation.pdf.gz | 457.7 KB | 表示 | |
XML形式データ | 2hn8_validation.xml.gz | 26.1 KB | 表示 | |
CIF形式データ | 2hn8_validation.cif.gz | 40.3 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/hn/2hn8 ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/hn/2hn8 | HTTPS FTP |
-関連構造データ
類似構造データ | |
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その他のデータベース |
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-リンク
-集合体
登録構造単位 |
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1 |
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NMR アンサンブル |
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-要素
#1: タンパク質・ペプチド | 分子量: 4848.931 Da / 分子数: 1 / 断片: C-terminal domain, amino acid residues 50-87 / 由来タイプ: 合成 詳細: The peptide was chemically synthesized. The sequence of the peptide is naturally expressed/found in cells infected with Homo sapiens (human) Influenza A virus strain A/Puerto Rico/8/34 (H1N1). 参照: UniProt: P0C0U1 |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR | ||||||||||||
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NMR実験 |
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NMR実験の詳細 | Text: This structure was determined using standard 2D homonuclear techniques. |
-試料調製
詳細 | 内容: 2 mM PB(50-87), 300 K, pH 3, 50% H2O, 50% TFE-d2 / 溶媒系: 50% H2O, 50% TFE-d2 |
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試料状態 | イオン強度: 0 / pH: 3 / 圧: ambient / 温度: 300 K |
-NMR測定
放射 | プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M |
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放射波長 | 相対比: 1 |
NMRスペクトロメーター | タイプ: Bruker DMX / 製造業者: Bruker / モデル: DMX / 磁場強度: 600 MHz |
-解析
NMR software |
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精密化 | 手法: simulated annealing / ソフトェア番号: 1 | ||||||||||||
代表構造 | 選択基準: closest to the average | ||||||||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: structures with the least restraint violations 計算したコンフォーマーの数: 100 / 登録したコンフォーマーの数: 20 |