登録情報 データベース : PDB / ID : 2g09 構造の表示 ダウンロードとリンクタイトル X-ray structure of mouse pyrimidine 5'-nucleotidase type 1, product complex 要素Cytosolic 5'-nucleotidase III 詳細 キーワード HYDROLASE / UniProt Q9D020 / UMPH-1 / Cytosolic 5'-nucleotidase III / Pyrimidine 5'-nucleotidase 1 / P5n-1 / NT5C3 PROTEIN / AAH38029 / BC038029 / MM.158936 / Lead Poisoning / STRUCTURAL GENOMICS FUNCTIONAL FOLLOW-UP STUDY / PROTEIN STRUCTURE INITIATIVE / PSI / CENTER FOR EUKARYOTIC STRUCTURAL GENOMICS / CESG機能・相同性 機能・相同性情報分子機能 ドメイン・相同性 構成要素
Pyrimidine catabolism / CMP catabolic process / dTMP catabolic process / UMP catabolic process / dCMP catabolic process / dUMP catabolic process / 7-methylguanosine nucleotidase / adenosine metabolic process / XMP 5'-nucleosidase activity / 5'-nucleotidase ... Pyrimidine catabolism / CMP catabolic process / dTMP catabolic process / UMP catabolic process / dCMP catabolic process / dUMP catabolic process / 7-methylguanosine nucleotidase / adenosine metabolic process / XMP 5'-nucleosidase activity / 5'-nucleotidase / 5'-nucleotidase activity / transferase activity / nuclear body / nucleotide binding / magnesium ion binding / endoplasmic reticulum / mitochondrion / cytosol / cytoplasm 類似検索 - 分子機能 Pyrimidine 5'-nucleotidase (UMPH-1), N-terminal domain / Pyrimidine 5'-nucleotidase, eukaryotic / Pyrimidine 5'-nucleotidase (UMPH-1) / HAD superfamily/HAD-like / HAD superfamily / HAD-like superfamily / DNA polymerase; domain 1 / Rossmann fold / Orthogonal Bundle / 3-Layer(aba) Sandwich ... Pyrimidine 5'-nucleotidase (UMPH-1), N-terminal domain / Pyrimidine 5'-nucleotidase, eukaryotic / Pyrimidine 5'-nucleotidase (UMPH-1) / HAD superfamily/HAD-like / HAD superfamily / HAD-like superfamily / DNA polymerase; domain 1 / Rossmann fold / Orthogonal Bundle / 3-Layer(aba) Sandwich / Mainly Alpha / Alpha Beta 類似検索 - ドメイン・相同性 PHOSPHATE ION / Cytosolic 5'-nucleotidase 3A 類似検索 - 構成要素生物種 Mus musculus (ハツカネズミ)手法 X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度 : 2.1 Å 詳細データ登録者 Bitto, E. / Bingman, C.A. / Wesenberg, G.E. / Phillips Jr., G.N. / Center for Eukaryotic Structural Genomics (CESG) 引用ジャーナル : J.Biol.Chem. / 年 : 2006タイトル : Structure of pyrimidine 5'-nucleotidase type 1. Insight into mechanism of action and inhibition during lead poisoning.著者 : Bitto, E. / Bingman, C.A. / Wesenberg, G.E. / McCoy, J.G. / Phillips, G.N. 履歴 登録 2006年2月11日 登録サイト : RCSB / 処理サイト : RCSB改定 1.0 2006年4月4日 Provider : repository / タイプ : Initial release改定 1.1 2008年5月1日 Group : Version format compliance改定 1.2 2011年7月13日 Group : Advisory / Version format compliance改定 1.3 2017年10月18日 Group : Refinement description / カテゴリ : software改定 1.4 2023年8月30日 Group : Data collection / Database references ... Data collection / Database references / Derived calculations / Refinement description カテゴリ : chem_comp_atom / chem_comp_bond ... chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model / pdbx_struct_conn_angle / struct_conn / struct_ncs_dom_lim / struct_ref_seq_dif / struct_site Item : _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ... _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.value / _struct_conn.conn_type_id / _struct_conn.id / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag / _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr1_label_seq_id / _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_conn.ptnr2_label_atom_id / _struct_conn.ptnr2_label_comp_id / _struct_conn.ptnr2_label_seq_id / _struct_ncs_dom_lim.beg_auth_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.end_auth_comp_id / _struct_ref_seq_dif.details / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id 改定 1.5 2023年11月15日 Group : Data collection / カテゴリ : chem_comp_atom / chem_comp_bond / Item : _chem_comp_atom.atom_id / _chem_comp_bond.atom_id_2
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