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データを開く
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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 2cj6 | ||||||
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タイトル | Crystal Structure of a Cell Wall Invertase Inhibitor from Tobacco (pH 7.5) | ||||||
![]() | INVERTASE INHIBITOR | ||||||
![]() | INHIBITOR / PROTEIN BINDING / FOUR-HELIX BUNDLE / HELICAL HAIRPIN | ||||||
機能・相同性 | ![]() | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | ![]() ![]() ![]() | ||||||
![]() | Hothorn, M. / Scheffzek, K. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Multiple Crystal Forms of the Cell-Wall Invertase Inhibitor from Tobacco Support High Conformational Rigidity Over a Broad Ph-Range 著者: Hothorn, M. / Scheffzek, K. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 44.4 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 30.7 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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単位格子 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 16031.401 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() ![]() ![]() ![]() | ||
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#2: 化合物 | ChemComp-IOD / #3: 水 | ChemComp-HOH / | |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.9 Å3/Da / 溶媒含有率: 57.4 % |
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結晶化 | pH: 7.5 / 詳細: 18 % PEG 4000, 0.1 M BIS-TRIS PH 7.5, 0.2 M NAI |
-データ収集
回折 | 平均測定温度: 100 K |
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放射光源 | 由来: ![]() ![]() ![]() |
検出器 | タイプ: MARRESEARCH / 検出器: CCD / 日付: 2003年2月26日 |
放射 | プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 0.976 Å / 相対比: 1 |
反射 | 解像度: 2→46.93 Å / Num. obs: 12748 / % possible obs: 99.7 % / Observed criterion σ(I): -3 / 冗長度: 4.9 % / Rmerge(I) obs: 0.2 / Net I/σ(I): 7.8 |
反射 シェル | 解像度: 2→2.12 Å / 冗長度: 4.9 % / Rmerge(I) obs: 0.65 / Mean I/σ(I) obs: 2.5 / % possible all: 98.5 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 構造決定の手法: ![]() 開始モデル: PDB ENTRY 1RJ1 解像度: 2→46.93 Å / Cor.coef. Fo:Fc: 0.904 / Cor.coef. Fo:Fc free: 0.844 / SU B: 5.129 / SU ML: 0.146 / 交差検証法: THROUGHOUT / ESU R: 0.183 / ESU R Free: 0.178 / 立体化学のターゲット値: MAXIMUM LIKELIHOOD / 詳細: HYDROGENS HAVE BEEN ADDED IN THE RIDING POSITIONS.
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溶媒の処理 | イオンプローブ半径: 0.8 Å / 減衰半径: 0.8 Å / VDWプローブ半径: 1.2 Å / 溶媒モデル: MASK | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | Biso mean: 13.97 Å2
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2→46.93 Å
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拘束条件 |
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