ENGINEERED RESIDUE IN CHAIN A, GLU 69 TO ALA ENGINEERED RESIDUE IN CHAIN A, GLU 70 TO ALA ...ENGINEERED RESIDUE IN CHAIN A, GLU 69 TO ALA ENGINEERED RESIDUE IN CHAIN A, GLU 70 TO ALA ENGINEERED RESIDUE IN CHAIN A, ARG 73 TO ALA
配列の詳細
THE SEQUENCE DISCREPANCIES ARE BECAUSE THE DATABASE SEQUENCE IS FROM E.COLI STRAIN O157-H7. THE ...THE SEQUENCE DISCREPANCIES ARE BECAUSE THE DATABASE SEQUENCE IS FROM E.COLI STRAIN O157-H7. THE GENE WHICH WAS USED FOR PROTEIN EXPRESSION AND STRUCTURE DETERMINATION WAS ISOLATED FROM E.COLI BL21 (DE3).
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実験情報
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実験
実験
手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1
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試料調製
結晶
マシュー密度: 1.9 Å3/Da / 溶媒含有率: 35 % 解説: THE DATA SET WAS MERGED FROM DATA OF TWO FRAGMENTS OF THE SAME CRYSTAL COLLECTED AT BESSY AND AT THE SLS.
結晶化
詳細: 17% PEG 8000, 120 MM LICL
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データ収集
回折
ID
平均測定温度 (K)
Crystal-ID
1
100
1
2
1
放射光源
由来
サイト
ビームライン
ID
波長
シンクロトロン
BESSY
14.1
1
1.0332
シンクロトロン
SLS
X06SA
2
検出器
タイプ
ID
検出器
日付
MARRESEARCH
1
CCD
2005年9月6日
2
放射
ID
モノクロメーター
プロトコル
単色(M)・ラウエ(L)
散乱光タイプ
Wavelength-ID
1
MIRRORS
SINGLEWAVELENGTH
M
x-ray
1
2
x-ray
1
放射波長
波長: 1.0332 Å / 相対比: 1
反射
解像度: 2.26→49 Å / Num. obs: 20321 / % possible obs: 99.2 % / Observed criterion σ(I): 0 / 冗長度: 7.6 % / Rmerge(I) obs: 0.07 / Net I/σ(I): 7.4
反射 シェル
解像度: 2.26→2.34 Å / 冗長度: 4.8 % / Rmerge(I) obs: 0.55 / Mean I/σ(I) obs: 3.7 / % possible all: 94.1
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解析
ソフトウェア
名称
バージョン
分類
REFMAC
5.2.0005
精密化
XDS
データ削減
XSCALE
データスケーリング
CCP4
位相決定
精密化
構造決定の手法: 分子置換 / 解像度: 2.26→49.21 Å / Cor.coef. Fo:Fc: 0.947 / Cor.coef. Fo:Fc free: 0.926 / SU B: 16.189 / SU ML: 0.223 / TLS residual ADP flag: LIKELY RESIDUAL / 交差検証法: THROUGHOUT / ESU R: 0.5 / ESU R Free: 0.261 / 立体化学のターゲット値: MAXIMUM LIKELIHOOD / 詳細: HYDROGENS HAVE BEEN ADDED IN THE RIDING POSITIONS.
Rfactor
反射数
%反射
Selection details
Rfree
0.25
1017
5 %
RANDOM
Rwork
0.206
-
-
-
obs
0.208
19305
99.2 %
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溶媒の処理
イオンプローブ半径: 0.8 Å / 減衰半径: 0.8 Å / VDWプローブ半径: 1.2 Å / 溶媒モデル: MASK