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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 2ayh | |||||||||
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タイトル | CRYSTAL AND MOLECULAR STRUCTURE AT 1.6 ANGSTROMS RESOLUTION OF THE HYBRID BACILLUS ENDO-1,3-1,4-BETA-D-GLUCAN 4-GLUCANOHYDROLASE H(A16-M) | |||||||||
![]() | 1,3-1,4-BETA-D-GLUCAN 4-GLUCANOHYDROLASE | |||||||||
![]() | HYDROLASE (GLUCANASE) | |||||||||
機能・相同性 | ![]() | |||||||||
生物種 | hybrid (その他) | |||||||||
手法 | ![]() | |||||||||
![]() | Hahn, M. / Keitel, T. / Heinemann, U. | |||||||||
![]() | ![]() タイトル: Crystal and molecular structure at 0.16-nm resolution of the hybrid Bacillus endo-1,3-1,4-beta-D-glucan 4-glucanohydrolase H(A16-M). 著者: Hahn, M. / Keitel, T. / Heinemann, U. #1: ![]() タイトル: Molecular and Active-Site Structure of a Bacillus 1,3-1,4-Beta-Glucanase 著者: Keitel, T. / Simon, O. / Borriss, R. / Heinemann, U. | |||||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 59.2 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 42.4 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 407.7 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 412.8 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 12.5 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 18 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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単位格子 |
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Atom site foot note | 1: CIS PROLINE - PRO 201 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 23935.230 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) hybrid (その他) / プラスミド: PBR322 / 発現宿主: ![]() ![]() |
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#2: 化合物 | ChemComp-CA / |
#3: 水 | ChemComp-HOH / |
構成要素の詳細 | COMPND HYBRID PROTEIN MOLECULE; RESIDUES 1 - 16 ARE DERIVED FROM THE BACILLUS AMYLOLIQUEFACIENS ...COMPND HYBRID PROTEIN MOLECULE; RESIDUES 1 - 16 ARE DERIVED FROM THE BACILLUS AMYLOLIQUE |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.06 Å3/Da / 溶媒含有率: 40.22 % |
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結晶 | *PLUS 溶媒含有率: 52 % |
結晶化 | *PLUS 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 / pH: 7 |
溶液の組成 | *PLUS 濃度: 12-16 %(w/v) / 一般名: PEG6000 |
-データ収集
反射 | *PLUS Num. obs: 21561 / % possible obs: 80.4 % / Observed criterion σ(I): 1 / Rmerge F obs: 0.109 |
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解析
ソフトウェア | 名称: TNT / 分類: 精密化 | ||||||||||||||||||||||||||||||
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精密化 | 解像度: 1.6→8 Å / σ(F): 2 /
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 1.6→8 Å
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拘束条件 |
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ソフトウェア | *PLUS 名称: TNT / 分類: refinement | ||||||||||||||||||||||||||||||
精密化 | *PLUS Rfactor all: 0.197 / Rfactor obs: 0.143 / Rfactor Rfree: 0.22 / Rfactor Rwork: 13.1 | ||||||||||||||||||||||||||||||
溶媒の処理 | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||
拘束条件 | *PLUS タイプ: t_angle_d / Dev ideal: 2.92 |