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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 2alj | ||||||
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タイトル | Structure of the cis confomer of the major extracytoplasmic domain of the bacterial cell division protein divib from geobacillus stearothermophilus | ||||||
![]() | cell-division initiation protein | ||||||
![]() | CELL CYCLE / CELL-DIVISION INITIATION PROTEIN / DIVIB / FTSQ / DIVISOME | ||||||
機能・相同性 | ![]() | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | 溶液NMR / TORSION ANGLE DYNAMICS (CANDID, CYANA), SIMULATED ANNEALING (XPLOR) | ||||||
![]() | Robson, S.A. / King, G.F. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Domain architecture and structure of the bacterial cell division protein DivIB 著者: Robson, S.A. / King, G.F. #1: ![]() タイトル: Cloning and expression of a bacillus subtilis division initiation gene for which a homolog has not been identified in another organism 著者: Harry, E.J. / Wake, R.G. #2: ![]() タイトル: Nucleotide sequence and insertional inactivation of a bacillus subtilis gene that affects cell division, sporulation, and temperature sensitivity 著者: Beall, B. / Lutkenhaus, J. #3: ![]() タイトル: DIVIB, FTSZ and cell division in bacillus subtilis 著者: Rowland, S.L. / Katis, V.L. / Partridge, S.R. / Wake, R.G. #4: ![]() タイトル: Membrane-bound division proteins DivIB and DivIC of bacillus subtilis function solely through their external domains in both vegetative and sporulation division 著者: Katis, V.L. / Wake, R.G. | ||||||
履歴 |
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Remark 650 | HELIX DETERMINATION METHOD: AUTHOR DETERMINED | ||||||
Remark 999 | SEQUENCE DIVIB FRAGMENT WAS SUBCLONED AS A TRANSLATIONAL FUSION TO THE C-TERMINUS OF SCHISTOSOMA ...SEQUENCE DIVIB FRAGMENT WAS SUBCLONED AS A TRANSLATIONAL FUSION TO THE C-TERMINUS OF SCHISTOSOMA JAPONICUM GLUTATHIONE S-TRANSFERASE. THE GENE SEQUENCE ENCODING THIS PROTEIN DOMAIN WAS CLONED USING CHROMOSOMAL DNA FROM GEOBACILLUS STEAROTHERMOPHILUS. The sequence matches that of THE CORRESPONDING DOMAIN OF the DIVIB ORTHOLOG from Geobacillus kaustophilus (SWISS-PROT ENTRY Q5L0X5_GEOKA and Genbank GI:56419655). |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 904.9 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 757 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 351.4 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 529.4 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 51.7 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 85.4 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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NMR アンサンブル |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 13365.084 Da / 分子数: 1 / 断片: beta domain / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) ![]() ![]() 遺伝子: DivIB / プラスミド: PSAR19 / 生物種 (発現宿主): Escherichia coli / 発現宿主: ![]() ![]() |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR | ||||||||||||||||||||
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NMR実験 |
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試料調製
詳細 | 内容: 1 MM DIVIB, 150 MM NACL, 10 MM SODIUM PHOSPHATE, 10 MICROMOLAR EDTA, 10 MICROMOLAR 4-(2- AMINOETHYL)BENZENESULFONYL FLOURIDE (AEBSF), 0.02% SODIUM AZIDE, PH 6.0, 92.5% H2O, 7.5% D2O; 1 MM ...内容: 1 MM DIVIB, 150 MM NACL, 10 MM SODIUM PHOSPHATE, 10 MICROMOLAR EDTA, 10 MICROMOLAR 4-(2- AMINOETHYL)BENZENESULFONYL FLOURIDE (AEBSF), 0.02% SODIUM AZIDE, PH 6.0, 92.5% H2O, 7.5% D2O; 1 MM DIVIB, 150 MM NACL, 10 MM SODIUM PHOSPHATE, 10 MICROMOLAR EDTA, 10 MICROMOLAR 4- (2-AMINOETHYL)BENZENESULFONYL FLOURIDE (AEBSF), 0.02% SODIUM AZIDE, PH 6.0, 100% D2O |
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試料状態 | イオン強度: 0.16 / pH: 6.0 / 圧: AMBIENT / 温度: 308 K |
-NMR測定
放射 | プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M | |||||||||||||||
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放射波長 | 相対比: 1 | |||||||||||||||
NMRスペクトロメーター |
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解析
NMR software |
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精密化 | 手法: TORSION ANGLE DYNAMICS (CANDID, CYANA), SIMULATED ANNEALING (XPLOR) ソフトェア番号: 1 詳細: THE STRUCTURES ARE BASED ON A TOTAL OF 2544 NOE-DERIVED DISTANCE RESTRAINTS, 88 RESTRAINTS DEFINING 44 HYDROGEN BONDS, AND 197 DIHEDRAL ANGLE RESTRAINTS | ||||||||||||||||||||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: STRUCTURES WITH LOWEST ENERGY AND NO RESTRAINT VIOLATIONS 計算したコンフォーマーの数: 60 / 登録したコンフォーマーの数: 25 |