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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 269d | ||||||||||||||||||
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タイトル | STRUCTURAL STUDIES ON NUCLEIC ACIDS | ||||||||||||||||||
![]() | DNA (5'-D(*![]() DNA / B-DNA / DOUBLE HELIX / MODIFIED / COMPLEXED WITH DRUG | 機能・相同性 | Chem-HT / DNA / DNA (> 10) | ![]() 手法 | ![]() ![]() ![]() Partridge, B.L. / Salisbury, S.A. | ![]() #1: ![]() タイトル: Structural Studies on Nucleic Acids 著者: Partridge, B.L. 履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 30.8 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 18.4 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 569.3 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 597.7 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 9.1 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 11.2 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
関連構造データ | |
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類似構造データ |
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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単位格子 |
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要素
#1: DNA鎖 | 分子量: 3677.419 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 合成 #2: 化合物 | ChemComp-MG / | #3: 化合物 | ChemComp-HT / | #4: 水 | ChemComp-HOH / | |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.23 Å3/Da / 溶媒含有率: 44.87 % | ||||||||||||
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結晶化 | pH: 7.1 / 詳細: pH 7.10 | ||||||||||||
溶液の組成 |
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-データ収集
回折 | 平均測定温度: 100 K |
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放射光源 | 由来: ![]() |
検出器 | タイプ: RIGAKU RAXIS IIC / 検出器: IMAGE PLATE / 日付: 1995年7月23日 |
放射 | モノクロメーター: GRAPHITE / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 相対比: 1 |
反射 | 解像度: 2.15→34.3 Å / Num. obs: 8997 / Rmerge(I) obs: 0.0656 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 構造決定の手法: ![]() 詳細: STANDARD R-FACTOR = 16.0% ERROR R-FACTOR = 3.4% WEIGHTED R-FACTOR = 15.6% NUMBER OF REFLECTIONS INCLUDED = 8997 AVERAGE |FO-FC| DISCREPANCY = 27.31 AVERAGE WEIGHTED |FO-FC| DISCREPANCY = -0. ...詳細: STANDARD R-FACTOR = 16.0% ERROR R-FACTOR = 3.4% WEIGHTED R-FACTOR = 15.6% NUMBER OF REFLECTIONS INCLUDED = 8997 AVERAGE |FO-FC| DISCREPANCY = 27.31 AVERAGE WEIGHTED |FO-FC| DISCREPANCY = -0.04 CORRELATION COEFFICIENT =101.0% RESOLUTION BREAKDOWN "ALL" R FACTOR = 14.4%
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 最高解像度: 2.15 Å
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拘束条件 |
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