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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1zjz | ||||||
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タイトル | Structure of R-specific alcohol dehydrogenase (mutant G37D) from Lactobacillus brevis in complex with phenylethanol and NAD | ||||||
![]() | R-specific alcohol dehydrogenase | ||||||
![]() | OXIDOREDUCTASE / short chain reductases/dehydrogenases / magnesium dependence / R-specific alcohol dehydrogenase | ||||||
機能・相同性 | ![]() | ||||||
生物種 | ![]() | ||||||
手法 | ![]() ![]() ![]() | ||||||
![]() | Schlieben, N.H. / Niefind, K. / Muller, J. / Riebel, B. / Hummel, W. / Schomburg, D. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Atomic Resolution Structures of R-specific Alcohol Dehydrogenase from Lactobacillus brevis Provide the Structural Bases of its Substrate and Cosubstrate Specificity 著者: Schlieben, N.H. / Niefind, K. / Muller, J. / Riebel, B. / Hummel, W. / Schomburg, D. #1: ![]() タイトル: The crystal structure of R-specific alcohol dehydrogenase from Lactobacillus brevis suggests the structural basis of its metal dependency 著者: Niefind, K. / Muller, J. / Riebel, B. / Hummel, W. / Schomburg, D. #2: ジャーナル: Acta Crystallogr.,Sect.D / 年: 2000 タイトル: Crystallization and preliminary characterization of crystals of R-alcohol dehydrogenase from Lactobacillus brevis 著者: Niefind, K. / Riebel, B. / Muller, J. / Hummel, W. / Schomburg, D. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 148.5 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 116.9 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 804 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 813.3 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 17.3 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 27.1 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 | ![]()
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単位格子 |
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Components on special symmetry positions |
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詳細 | The biological assembly is a tetramer generated from the monomer in the asymmetric unit by the following operations: x, y, z; -x, -y, z; -x, y, -z; x, -y, -z |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 26714.098 Da / 分子数: 1 / 変異: G37D / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) ![]() 発現宿主: ![]() ![]() |
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#2: 化合物 | ChemComp-MG / |
#3: 化合物 | ChemComp-SS2 / ( |
#4: 化合物 | ChemComp-NAD / |
#5: 水 | ChemComp-HOH / |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.4 Å3/Da / 溶媒含有率: 47.5 % |
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-データ収集
放射光源 | 由来: ![]() ![]() ![]() |
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放射 | プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 0.9155 Å / 相対比: 1 |
反射 | 解像度: 1.1→35.6 Å / Num. all: 90750 / Num. obs: 90750 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 構造決定の手法: ![]()
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溶媒の処理 | イオンプローブ半径: 0.8 Å / 減衰半径: 0.8 Å / VDWプローブ半径: 1.4 Å / 溶媒モデル: BABINET MODEL WITH MASK | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | Biso mean: 10.444 Å2
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 1.1→35.6 Å
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拘束条件 |
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LS精密化 シェル | 解像度: 1.1→1.13 Å / Total num. of bins used: 20 /
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