[日本語] English
万見
- PDB-1w63: AP1 clathrin adaptor core -

+
データを開く


IDまたはキーワード:

読み込み中...

-
基本情報

登録情報
データベース: PDB / ID: 1w63
タイトルAP1 clathrin adaptor core
要素
  • ADAPTER-RELATED PROTEIN COMPLEX 1 BETA 1 SUBUNIT
  • ADAPTER-RELATED PROTEIN COMPLEX 1 GAMMA 1 SUBUNIT
  • ADAPTER-RELATED PROTEIN COMPLEX 1 SIGMA 1A SUBUNIT
  • ADAPTOR-RELATED PROTEIN COMPLEX 1, MU 1 SUBUNIT
キーワードENDOCYTOSIS / CLATHRIN ADAPTOR / TRANSPORT / COATED PITS
機能・相同性
機能・相同性情報


basolateral protein secretion / endosome to melanosome transport / AP-1 adaptor complex / Lysosome Vesicle Biogenesis / clathrin adaptor complex / clathrin coat / platelet dense granule organization / Lysosome Vesicle Biogenesis / melanosome assembly / Golgi Associated Vesicle Biogenesis ...basolateral protein secretion / endosome to melanosome transport / AP-1 adaptor complex / Lysosome Vesicle Biogenesis / clathrin adaptor complex / clathrin coat / platelet dense granule organization / Lysosome Vesicle Biogenesis / melanosome assembly / Golgi Associated Vesicle Biogenesis / MHC class II antigen presentation / Golgi to vacuole transport / Golgi Associated Vesicle Biogenesis / clathrin coat assembly / clathrin-coated vesicle membrane / clathrin adaptor activity / MHC class II antigen presentation / retrograde transport, endosome to Golgi / determination of left/right symmetry / clathrin-coated vesicle / clathrin binding / protein serine/threonine kinase binding / clathrin-coated pit / vesicle-mediated transport / Neutrophil degranulation / kidney development / trans-Golgi network membrane / intracellular protein transport / trans-Golgi network / terminal bouton / synaptic vesicle / heart development / presynapse / early endosome / lysosomal membrane / intracellular membrane-bounded organelle / synapse / protein kinase binding / perinuclear region of cytoplasm / Golgi apparatus / cytosol
類似検索 - 分子機能
Beta-Lactamase - #60 / AP-1 complex subunit sigma / Adaptor protein complex AP-1, gamma subunit / Gamma-adaptin ear (GAE) domain / Gamma-adaptin ear (GAE) domain profile. / Adaptor protein complex, sigma subunit / Clathrin adaptor, beta-adaptin, appendage, Ig-like subdomain / Beta-adaptin appendage, C-terminal subdomain / AP-1/2/4 complex subunit beta / Beta2-adaptin appendage, C-terminal sub-domain ...Beta-Lactamase - #60 / AP-1 complex subunit sigma / Adaptor protein complex AP-1, gamma subunit / Gamma-adaptin ear (GAE) domain / Gamma-adaptin ear (GAE) domain profile. / Adaptor protein complex, sigma subunit / Clathrin adaptor, beta-adaptin, appendage, Ig-like subdomain / Beta-adaptin appendage, C-terminal subdomain / AP-1/2/4 complex subunit beta / Beta2-adaptin appendage, C-terminal sub-domain / Beta2-adaptin appendage, C-terminal sub-domain / AP complex subunit beta / : / Clathrin adaptor complex, small chain / Clathrin adaptor complexes small chain signature. / Clathrin adaptor complexes medium chain signature 1. / Clathrin adaptor, mu subunit / Clathrin adaptor, mu subunit, conserved site / Clathrin adaptor complexes medium chain signature 2. / : / Coatomer/calthrin adaptor appendage, C-terminal subdomain / Adaptor complexes medium subunit family / AP complex, mu/sigma subunit / Clathrin adaptor complex small chain / AP-2 complex subunit mu, C-terminal superfamily / Clathrin adaptor, alpha/beta/gamma-adaptin, appendage, Ig-like subdomain / Mu homology domain / Adaptin C-terminal domain / Mu homology domain (MHD) profile. / Adaptin C-terminal domain / Clathrin/coatomer adaptor, adaptin-like, N-terminal / Adaptin N terminal region / Clathrin adaptor, appendage, Ig-like subdomain superfamily / Longin-like domain superfamily / TBP domain superfamily / Leucine-rich Repeat Variant / Leucine-rich Repeat Variant / Beta-Lactamase / Armadillo-like helical / Alpha Horseshoe / Armadillo-type fold / 2-Layer Sandwich / Mainly Alpha / Alpha Beta
類似検索 - ドメイン・相同性
AP-1 complex subunit gamma-1 / AP-1 complex subunit mu-1 / AP-1 complex subunit beta-1 / AP-1 complex subunit sigma-1A
類似検索 - 構成要素
生物種MUS MUSCULUS (ハツカネズミ)
RATTUS NORVEGICUS (ドブネズミ)
手法X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 4 Å
データ登録者Heldwein, E. / Macia, E. / Wang, J. / Yin, H.L. / Kirchhausen, T. / Harrison, S.C.
引用ジャーナル: Proc.Natl.Acad.Sci.USA / 年: 2004
タイトル: Crystal Structure of the Clathrin Adaptor Protein 1 Core
著者: Heldwein, E. / Macia, E. / Wang, J. / Yin, H.L. / Kirchhausen, T. / Harrison, S.C.
履歴
登録2004年8月12日登録サイト: PDBE / 処理サイト: PDBE
改定 1.02004年9月21日Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.12011年5月8日Group: Version format compliance
改定 1.22011年7月13日Group: Version format compliance
改定 1.32019年4月3日Group: Data collection / Other / Source and taxonomy
カテゴリ: database_PDB_rev / database_PDB_rev_record ...database_PDB_rev / database_PDB_rev_record / entity_src_gen / pdbx_database_proc / pdbx_database_status / struct_biol
Item: _entity_src_gen.pdbx_host_org_cell_line / _entity_src_gen.pdbx_host_org_scientific_name ..._entity_src_gen.pdbx_host_org_cell_line / _entity_src_gen.pdbx_host_org_scientific_name / _entity_src_gen.pdbx_host_org_vector / _entity_src_gen.pdbx_host_org_vector_type / _pdbx_database_status.recvd_author_approval
改定 1.42023年12月13日Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Other / Refinement description
カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_database_status / pdbx_initial_refinement_model
Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _pdbx_database_status.status_code_sf
Remark 700 SHEET THE SHEET STRUCTURE OF THIS MOLECULE IS BIFURCATED. IN ORDER TO REPRESENT THIS FEATURE IN ... SHEET THE SHEET STRUCTURE OF THIS MOLECULE IS BIFURCATED. IN ORDER TO REPRESENT THIS FEATURE IN THE SHEET RECORDS BELOW, TWO SHEETS ARE DEFINED.

-
構造の表示

構造ビューア分子:
MolmilJmol/JSmol

ダウンロードとリンク

-
集合体

登録構造単位
A: ADAPTER-RELATED PROTEIN COMPLEX 1 GAMMA 1 SUBUNIT
B: ADAPTER-RELATED PROTEIN COMPLEX 1 BETA 1 SUBUNIT
C: ADAPTER-RELATED PROTEIN COMPLEX 1 GAMMA 1 SUBUNIT
D: ADAPTER-RELATED PROTEIN COMPLEX 1 BETA 1 SUBUNIT
E: ADAPTER-RELATED PROTEIN COMPLEX 1 GAMMA 1 SUBUNIT
F: ADAPTER-RELATED PROTEIN COMPLEX 1 BETA 1 SUBUNIT
G: ADAPTER-RELATED PROTEIN COMPLEX 1 GAMMA 1 SUBUNIT
H: ADAPTER-RELATED PROTEIN COMPLEX 1 BETA 1 SUBUNIT
I: ADAPTER-RELATED PROTEIN COMPLEX 1 GAMMA 1 SUBUNIT
J: ADAPTER-RELATED PROTEIN COMPLEX 1 BETA 1 SUBUNIT
K: ADAPTER-RELATED PROTEIN COMPLEX 1 GAMMA 1 SUBUNIT
L: ADAPTER-RELATED PROTEIN COMPLEX 1 BETA 1 SUBUNIT
M: ADAPTOR-RELATED PROTEIN COMPLEX 1, MU 1 SUBUNIT
N: ADAPTOR-RELATED PROTEIN COMPLEX 1, MU 1 SUBUNIT
O: ADAPTOR-RELATED PROTEIN COMPLEX 1, MU 1 SUBUNIT
P: ADAPTOR-RELATED PROTEIN COMPLEX 1, MU 1 SUBUNIT
Q: ADAPTER-RELATED PROTEIN COMPLEX 1 SIGMA 1A SUBUNIT
R: ADAPTOR-RELATED PROTEIN COMPLEX 1, MU 1 SUBUNIT
S: ADAPTER-RELATED PROTEIN COMPLEX 1 SIGMA 1A SUBUNIT
T: ADAPTER-RELATED PROTEIN COMPLEX 1 SIGMA 1A SUBUNIT
U: ADAPTER-RELATED PROTEIN COMPLEX 1 SIGMA 1A SUBUNIT
V: ADAPTOR-RELATED PROTEIN COMPLEX 1, MU 1 SUBUNIT
W: ADAPTER-RELATED PROTEIN COMPLEX 1 SIGMA 1A SUBUNIT
X: ADAPTER-RELATED PROTEIN COMPLEX 1 SIGMA 1A SUBUNIT


分子量 (理論値)分子数
合計 (水以外)1,218,98324
ポリマ－1,218,98324
非ポリマー00
水00
1
A: ADAPTER-RELATED PROTEIN COMPLEX 1 GAMMA 1 SUBUNIT
B: ADAPTER-RELATED PROTEIN COMPLEX 1 BETA 1 SUBUNIT
M: ADAPTOR-RELATED PROTEIN COMPLEX 1, MU 1 SUBUNIT
S: ADAPTER-RELATED PROTEIN COMPLEX 1 SIGMA 1A SUBUNIT


分子量 (理論値)分子数
合計 (水以外)203,1644
ポリマ－203,1644
非ポリマー00
水0
タイプ名称対称操作数
identity operation1_555x,y,z1
手法PQS
2
C: ADAPTER-RELATED PROTEIN COMPLEX 1 GAMMA 1 SUBUNIT
D: ADAPTER-RELATED PROTEIN COMPLEX 1 BETA 1 SUBUNIT
N: ADAPTOR-RELATED PROTEIN COMPLEX 1, MU 1 SUBUNIT
T: ADAPTER-RELATED PROTEIN COMPLEX 1 SIGMA 1A SUBUNIT


分子量 (理論値)分子数
合計 (水以外)203,1644
ポリマ－203,1644
非ポリマー00
水0
タイプ名称対称操作数
identity operation1_555x,y,z1
手法PQS
3
E: ADAPTER-RELATED PROTEIN COMPLEX 1 GAMMA 1 SUBUNIT
F: ADAPTER-RELATED PROTEIN COMPLEX 1 BETA 1 SUBUNIT
O: ADAPTOR-RELATED PROTEIN COMPLEX 1, MU 1 SUBUNIT
U: ADAPTER-RELATED PROTEIN COMPLEX 1 SIGMA 1A SUBUNIT


分子量 (理論値)分子数
合計 (水以外)203,1644
ポリマ－203,1644
非ポリマー00
水0
タイプ名称対称操作数
identity operation1_555x,y,z1
手法PQS
4
I: ADAPTER-RELATED PROTEIN COMPLEX 1 GAMMA 1 SUBUNIT
J: ADAPTER-RELATED PROTEIN COMPLEX 1 BETA 1 SUBUNIT
R: ADAPTOR-RELATED PROTEIN COMPLEX 1, MU 1 SUBUNIT
X: ADAPTER-RELATED PROTEIN COMPLEX 1 SIGMA 1A SUBUNIT


分子量 (理論値)分子数
合計 (水以外)203,1644
ポリマ－203,1644
非ポリマー00
水0
タイプ名称対称操作数
identity operation1_555x,y,z1
手法PQS
5
K: ADAPTER-RELATED PROTEIN COMPLEX 1 GAMMA 1 SUBUNIT
L: ADAPTER-RELATED PROTEIN COMPLEX 1 BETA 1 SUBUNIT
V: ADAPTOR-RELATED PROTEIN COMPLEX 1, MU 1 SUBUNIT
W: ADAPTER-RELATED PROTEIN COMPLEX 1 SIGMA 1A SUBUNIT


分子量 (理論値)分子数
合計 (水以外)203,1644
ポリマ－203,1644
非ポリマー00
水0
タイプ名称対称操作数
identity operation1_555x,y,z1
手法PQS
6
G: ADAPTER-RELATED PROTEIN COMPLEX 1 GAMMA 1 SUBUNIT
H: ADAPTER-RELATED PROTEIN COMPLEX 1 BETA 1 SUBUNIT
P: ADAPTOR-RELATED PROTEIN COMPLEX 1, MU 1 SUBUNIT
Q: ADAPTER-RELATED PROTEIN COMPLEX 1 SIGMA 1A SUBUNIT


分子量 (理論値)分子数
合計 (水以外)203,1644
ポリマ－203,1644
非ポリマー00
水0
タイプ名称対称操作数
identity operation1_555x,y,z1
手法PQS
単位格子
Length a, b, c (Å)178.140, 178.140, 1134.994
Angle α, β, γ (deg.)90.00, 90.00, 120.00
Int Tables number153
Space group name H-MP3212

-
要素

#1: タンパク質
ADAPTER-RELATED PROTEIN COMPLEX 1 GAMMA 1 SUBUNIT / GAMMA-ADAPTIN / ADAPTOR PROTEIN COMPLEX AP-1 GAMMA-1 SUBUNIT / GOLGI ADAPTOR HA1/AP1 ADAPTIN GAMMA- ...GAMMA-ADAPTIN / ADAPTOR PROTEIN COMPLEX AP-1 GAMMA-1 SUBUNIT / GOLGI ADAPTOR HA1/AP1 ADAPTIN GAMMA-1 SUBUNIT / CLATHRIN ASSEMBLY PROTEIN COMPLEX 1 GAMMA-1 LARGE CHAIN


分子量: 69728.781 Da / 分子数: 6 / 断片: CORE, RESIDUES 0-612 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) MUS MUSCULUS (ハツカネズミ) / プラスミド: PFASTBAC1, PFASTBACHTB / 細胞株 (発現宿主): High Five / 発現宿主: Trichoplusia ni (イラクサキンウワバ) / 参照: UniProt: P22892
#2: タンパク質
ADAPTER-RELATED PROTEIN COMPLEX 1 BETA 1 SUBUNIT / BETA-ADAPTIN 1 / ADAPTOR PROTEIN COMPLEX AP-1 BETA-1 SUBUNIT / GOLGI ADAPTOR HA1/AP1 ADAPTIN BETA ...BETA-ADAPTIN 1 / ADAPTOR PROTEIN COMPLEX AP-1 BETA-1 SUBUNIT / GOLGI ADAPTOR HA1/AP1 ADAPTIN BETA SUBUNIT / CLATHRIN ASSEMBLY PROTEIN COMPLEX 1 BETA LARGE CHAIN


分子量: 66086.398 Da / 分子数: 6 / 断片: CORE, RESIDUE 1-584 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) RATTUS NORVEGICUS (ドブネズミ) / プラスミド: PFASTBAC1, PFASTBACHTB / 細胞株 (発現宿主): High Five / 発現宿主: Trichoplusia ni (イラクサキンウワバ) / 参照: UniProt: P52303
#3: タンパク質
ADAPTOR-RELATED PROTEIN COMPLEX 1, MU 1 SUBUNIT / MU-ADAPTIN 1 / ADAPTOR PROTEIN COMPLEX AP-1 MU-1 SUBUNIT / GOLGI ADAPTOR HA1/AP1 ADAPTIN MU-1 ...MU-ADAPTIN 1 / ADAPTOR PROTEIN COMPLEX AP-1 MU-1 SUBUNIT / GOLGI ADAPTOR HA1/AP1 ADAPTIN MU-1 SUBUNIT / CLATHRIN ASSEMBLY PROTEIN ASSEMBLY PROTEIN COMPLEX 1 MEDIUM CHAIN 1 / CLATHRIN COAT ASSEMBLY PROTEIN AP47 / CLATHRIN COAT ASSOCIATED PROTEIN AP47 / AP-MU CHAIN FAMILY MEMBER MU1A


分子量: 48590.730 Da / 分子数: 6 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) MUS MUSCULUS (ハツカネズミ) / プラスミド: PFASTBAC1, PFASTBACHTB / 細胞株 (発現宿主): High Five / 発現宿主: Trichoplusia ni (イラクサキンウワバ) / 参照: UniProt: P35585
#4: タンパク質
ADAPTER-RELATED PROTEIN COMPLEX 1 SIGMA 1A SUBUNIT / SIGMA-ADAPTIN 1A / ADAPTOR PROTEIN COMPLEX AP-1 SIGMA-1A SUBUNIT / GOLGI ADAPTOR HA1/AP1 ADAPTIN ...SIGMA-ADAPTIN 1A / ADAPTOR PROTEIN COMPLEX AP-1 SIGMA-1A SUBUNIT / GOLGI ADAPTOR HA1/AP1 ADAPTIN SIGMA-1A SUBUNIT / CLATHRIN ASSEMBLY PROTEIN COMPLEX 1 SIGMA-1A SMALL CHAIN / CLATHRIN COAT ASSEMBLY PROTEIN AP19 / HA1 19 KDA SUBUNIT / SIGMA 1A SUBUNIT OF AP-1 CLATHRIN


分子量: 18757.994 Da / 分子数: 6 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) MUS MUSCULUS (ハツカネズミ) / プラスミド: PFASTBAC1, PFASTBACHTB / 細胞株 (発現宿主): High Five / 発現宿主: Trichoplusia ni (イラクサキンウワバ) / 参照: UniProt: P61967
配列の詳細FIRST 5 RESIDUES (GAGMS) OF CHAIN A ORIGINATE FROM EXPRESSION VECTOR

-
実験情報

-
実験

実験手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 7

-
試料調製

結晶マシュー密度: 4.27 Å3/Da / 溶媒含有率: 70.97 % / 解説: DATA WERE COLLECTED USING DOUBLE CCD DETECTOR SETUP
結晶化pH: 7 / 詳細: 8-9% ETHANOL, 0.1 M NA HEPES, PH 7.5, 2 MM CYSTEINE

-
データ収集

回折平均測定温度: 100 K
放射光源由来: シンクロトロン / サイト: CHESS / ビームライン: F1 / 波長: 1.1808
検出器タイプ: ADSC CCD / 検出器: CCD
放射プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長波長: 1.1808 Å / 相対比: 1
反射解像度: 4.01→39.84 Å / Num. obs: 141015 / % possible obs: 81.3 % / Observed criterion σ(I): 0 / 冗長度: 6.5 % / Rmerge(I) obs: 0.12 / Net I/σ(I): 9.4
反射 シェル解像度: 4→4.1 Å / 冗長度: 4.7 % / Rmerge(I) obs: 0.47 / Mean I/σ(I) obs: 2.5 / % possible all: 69.7

-
解析

ソフトウェア
名称バージョン分類
CNS1.1精密化
DENZOデータ削減
SCALEPACKデータスケーリング
AMoRE位相決定
精密化構造決定の手法: 分子置換
開始モデル: PDB ENTRY 1GW5

1gw5
PDB 未公開エントリ


解像度: 4→40 Å / Data cutoff high absF: 10000 / 交差検証法: THROUGHOUT / σ(F): 0
詳細: CHAIN A IS MISSING RESIDUES 590-613 CHAIN B IS MISSING RESIDUES 1, 268-274, AND 584 CHAIN M IS MISSING RESIDUES 1, 146-156, 219-231, AND 363-372 CHAIN S IS MISSING RESIDUES 149-158
Rfactor反射数%反射Selection details
Rfree0.3097 6890 3.9 %THIN RESOLUTION SHELLS
Rwork0.2972 ---
obs0.2972 137671 78.8 %-
溶媒の処理Bsol: 41.3296 Å2 / ksol: 0.32 e/Å3
原子変位パラメータ
Baniso -1Baniso -2Baniso -3
1--4.719 Å2-24.176 Å20 Å2
2---4.719 Å20 Å2
3---9.439 Å2
精密化ステップサイクル: LAST / 解像度: 4→40 Å
タンパク質核酸リガンド溶媒全体
原子数81744 0 0 0 81744
拘束条件
Refine-IDタイプDev ideal
X-RAY DIFFRACTIONc_bond_d0.014004
X-RAY DIFFRACTIONc_bond_d_na
X-RAY DIFFRACTIONc_bond_d_prot
X-RAY DIFFRACTIONc_angle_d
X-RAY DIFFRACTIONc_angle_d_na
X-RAY DIFFRACTIONc_angle_d_prot
X-RAY DIFFRACTIONc_angle_deg1.86103
X-RAY DIFFRACTIONc_angle_deg_na
X-RAY DIFFRACTIONc_angle_deg_prot
X-RAY DIFFRACTIONc_dihedral_angle_d
X-RAY DIFFRACTIONc_dihedral_angle_d_na
X-RAY DIFFRACTIONc_dihedral_angle_d_prot
X-RAY DIFFRACTIONc_improper_angle_d
X-RAY DIFFRACTIONc_improper_angle_d_na
X-RAY DIFFRACTIONc_improper_angle_d_prot
X-RAY DIFFRACTIONc_mcbond_it
X-RAY DIFFRACTIONc_mcangle_it
X-RAY DIFFRACTIONc_scbond_it
X-RAY DIFFRACTIONc_scangle_it
Refine LS restraints NCSNCS model details: CONSTRAINTS
Xplor fileSerial no: 1 / Param file: PROTEIN_REP.PARAM

+
万見について

-
お知らせ

-
2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

-
2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

+
2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

+
2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

-
万見 (Yorodumi)

幾万の構造データを、幾万の視点から

  • 万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
  • EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

他の情報も見る