+
データを開く
-
基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1tet | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
タイトル | CRYSTAL STRUCTURE OF AN ANTICHOLERA TOXIN PEPTIDE COMPLEX AT 2.3 ANGSTROMS | ||||||
![]() |
| ||||||
![]() | IMMUNOGLOBULIN | ||||||
機能・相同性 | ![]() | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | ![]() | ||||||
![]() | Shoham, M. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Crystal structure of an anticholera toxin peptide complex at 2.3 A. 著者: Shoham, M. #1: ![]() タイトル: Crystal Parameters and Molecular Replacement of an Anticholera Toxin Peptide Complex 著者: Shoham, M. / Proctor, P. / Hughes, D. / Baldwin, E.T. | ||||||
履歴 |
|
-
構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
---|
-
ダウンロードとリンク
-
ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 101.7 KB | 表示 | ![]() |
---|---|---|---|---|
PDB形式 | ![]() | 76.9 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
---|
-関連構造データ
類似構造データ |
---|
-
リンク
-
集合体
登録構造単位 | ![]()
| ||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
1 |
| ||||||||
単位格子 |
| ||||||||
Atom site foot note | 1: CIS PROLINE - PRO L 8 / 2: CIS PROLINE - PRO L 95 / 3: CIS PROLINE - PRO L 141 / 4: CIS PROLINE - PRO H 147 / 5: CIS PROLINE - PRO H 149 6: SER H 186 - PRO H 187 OMEGA = 145.25 PEPTIDE BOND DEVIATES SIGNIFICANTLY FROM TRANS CONFORMATION 7: CIS PROLINE - PRO H 189 |
-
要素
#1: 抗体 | 分子量: 23872.490 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) ![]() ![]() |
---|---|
#2: 抗体 | 分子量: 22805.709 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) ![]() ![]() |
#3: タンパク質・ペプチド | 分子量: 1625.800 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 参照: UniProt: P32890 |
#4: 化合物 | ChemComp-CIT / |
#5: 水 | ChemComp-HOH / |
配列の詳細 | THE NUMBERING OF TE33 RESIDUES IS ESSENTIALLY ACCORDING TO C.CHOTHIA AND A.M.LESK, J.MOL.BIOL. V. ...THE NUMBERING OF TE33 RESIDUES IS ESSENTIALL |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
---|
-
試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.42 Å3/Da / 溶媒含有率: 49.26 % | ||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
結晶化 | *PLUS pH: 4 / 手法: unknown | ||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
|
-データ収集
反射 | *PLUS 最高解像度: 2.3 Å / % possible obs: 84 % / Rmerge(I) obs: 0.1 |
---|
-
解析
ソフトウェア |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
精密化 | 解像度: 2.3→5 Å / σ(F): 2 /
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2.3→5 Å
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
拘束条件 |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ソフトウェア | *PLUS 名称: ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化 | *PLUS 最高解像度: 2.3 Å / 最低解像度: 5 Å / Num. reflection obs: 13714 / σ(F): 2 / Rfactor obs: 0.148 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶媒の処理 | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
拘束条件 | *PLUS タイプ: x_angle_d / Dev ideal: 3.58 |