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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1rst | ||||||
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タイトル | COMPLEX BETWEEN STREPTAVIDIN AND THE STREP-TAG PEPTIDE | ||||||
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![]() | COMPLEX (SIGNAL PROTEIN/PEPTIDE) / COMPLEX (SIGNAL PROTEIN-PEPTIDE) / SIGNAL PROTEIN / COMPLEX (SIGNAL PROTEIN-PEPTIDE) complex | ||||||
機能・相同性 | ![]() | ||||||
生物種 | ![]() | ||||||
手法 | ![]() | ||||||
![]() | Koepke, J. / Schmidt, T. / Skerra, A. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Molecular interaction between the Strep-tag affinity peptide and its cognate target, streptavidin. 著者: Schmidt, T.G. / Koepke, J. / Frank, R. / Skerra, A. #1: ![]() タイトル: One-Step Affinity Purification of Bacterially Produced Proteins by Means of the 'Strep Tag' and Immobilized Recombinant Core Streptavidin 著者: Schmidt, T.G. / Skerra, A. #2: ![]() タイトル: The Random Peptide Library-Assisted Engineering of a C-Terminal Affinity Peptide, Useful for the Detection and Purification of a Functional Ig Fv Fragment 著者: Schmidt, T.G. / Skerra, A. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 48.8 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 35.8 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 435.6 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 437.9 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 8.7 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 11.4 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 | ![]()
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単位格子 |
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Components on special symmetry positions |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 13341.454 Da / 分子数: 1 / 断片: RESIDUES 13 - 139 / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) ![]() プラスミド: PSA1 / 発現宿主: ![]() ![]() |
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#2: タンパク質・ペプチド | 分子量: 1057.164 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 |
#3: 水 | ChemComp-HOH / |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.61 Å3/Da / 溶媒含有率: 48.9 % | |||||||||||||||
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結晶化 | *PLUS pH: 7 / 手法: 蒸気拡散法, シッティングドロップ法 | |||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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-データ収集
放射光源 | 波長: 1.5418 |
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検出器 | タイプ: RIGAKU / 検出器: IMAGE PLATE / 日付: 1993年12月8日 |
放射 | 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 1.5418 Å / 相対比: 1 |
反射 | 解像度: 1.7→37.38 Å / Num. obs: 16059 / % possible obs: 92.3 % / Observed criterion σ(I): 0 / Rmerge(I) obs: 0.0891 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 解像度: 1.7→8 Å / σ(F): 2
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原子変位パラメータ | Biso mean: 18.7 Å2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Refine analyze | Luzzati coordinate error obs: 0.2 Å | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 1.7→8 Å
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拘束条件 |
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ソフトウェア | *PLUS 名称: ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
拘束条件 | *PLUS
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