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-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1rbb | ||||||
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タイトル | THE CRYSTAL STRUCTURE OF RIBONUCLEASE B AT 2.5-ANGSTROMS RESOLUTION | ||||||
要素 | RIBONUCLEASE B | ||||||
キーワード | HYDROLASE (NUCLEIC ACID / RNA) | ||||||
機能・相同性 | 機能・相同性情報 pancreatic ribonuclease / ribonuclease A activity / RNA nuclease activity / nucleic acid binding / lyase activity / defense response to Gram-positive bacterium / extracellular region 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | Bos taurus (ウシ) | ||||||
手法 | X線回折 / 解像度: 2.5 Å | ||||||
データ登録者 | Williams, R.L. / Greene, S.M. / McPherson, A. | ||||||
引用 | ジャーナル: J.Biol.Chem. / 年: 1987 タイトル: The crystal structure of ribonuclease B at 2.5-A resolution. 著者: Williams, R.L. / Greene, S.M. / McPherson, A. #1: ジャーナル: J.Biol.Chem. / 年: 1982 タイトル: Preliminary Diffraction Data for Crystals of Ribonucleasesa Andb and Their Complexes with Deoxy(Pa)4 and Deoxy(Pa)6 著者: Brayer, G.D. / McPherson, A. | ||||||
履歴 |
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-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 1rbb.cif.gz | 56.9 KB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
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PDB形式 | pdb1rbb.ent.gz | 41.2 KB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 1rbb.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/rb/1rbb ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/rb/1rbb | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
類似構造データ |
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-リンク
-集合体
登録構造単位 |
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1 |
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単位格子 |
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Atom site foot note | 1: RESIDUES 93 AND 114 OF BOTH CHAINS ARE CIS PROLINES. / 2: SEE REMARK 3. | ||||||||
非結晶学的対称性 (NCS) | NCS oper: (Code: given Matrix: (-0.56472, 0.79491, -0.22183), ベクター: |
-要素
#1: タンパク質 | 分子量: 13708.326 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Bos taurus (ウシ) / 器官: PANCREAS / 参照: UniProt: P61823, EC: 3.1.27.5 |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: X線回折 |
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-試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.28 Å3/Da / 溶媒含有率: 46.02 % | ||||||||||||||||||||||||
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結晶化 | *PLUS 温度: 23 ℃ / 手法: 蒸気拡散法 | ||||||||||||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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-データ収集
放射 | 散乱光タイプ: x-ray |
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放射波長 | 相対比: 1 |
-解析
ソフトウェア | 名称: CORELS / 分類: 精密化 | ||||||||||||
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精密化 | Rfactor Rwork: 0.218 / 最高解像度: 2.5 Å | ||||||||||||
精密化ステップ | サイクル: LAST / 最高解像度: 2.5 Å
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精密化 | *PLUS Rfactor Rwork: 0.218 | ||||||||||||
溶媒の処理 | *PLUS | ||||||||||||
原子変位パラメータ | *PLUS |