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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1rba | ||||||
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タイトル | SUBSTITUTION OF ASP193 TO ASN AT THE ACTIVE SITE OF RIBULOSE-1,5-BISPHOSPHATE CARBOXYLASE RESULTS IN CONFORMATIONAL CHANGES | ||||||
![]() | RUBISCO | ||||||
![]() | LYASE(CARBON-CARBON) | ||||||
機能・相同性 | ![]() ribulose-bisphosphate carboxylase / ribulose-bisphosphate carboxylase activity / reductive pentose-phosphate cycle / monooxygenase activity / magnesium ion binding 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() | ||||||
手法 | ![]() | ||||||
![]() | Schneider, G. / Soderlind, E. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Substitution of ASP193 to ASN at the active site of ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase results in conformational changes. 著者: Soderlind, E. / Schneider, G. / Gutteridge, S. | ||||||
履歴 |
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Remark 700 | SHEET THE SHEETS PRESENTED AS *ACT* AND *BCT* ON SHEET RECORDS BELOW ARE ACTUALLY EIGHT-STRANDED ...SHEET THE SHEETS PRESENTED AS *ACT* AND *BCT* ON SHEET RECORDS BELOW ARE ACTUALLY EIGHT-STRANDED BETA-BARRELS. THIS IS REPRESENTED BY A NINE-STRANDED SHEET IN WHICH THE FIRST AND LAST STRANDS ARE IDENTICAL. |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 167 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 116.4 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 390.2 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 578.2 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 42.1 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 58.2 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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単位格子 |
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Atom site foot note | 1: CIS PROLINE - PRO A 167 / 2: CIS PROLINE - PRO B 167 | ||||||||
非結晶学的対称性 (NCS) | NCS oper: (Code: given Matrix: (0.37374, -0.056207, 0.940855), ベクター: |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 50537.934 Da / 分子数: 2 / 変異: D193N / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) ![]() 参照: UniProt: P04718, ribulose-bisphosphate carboxylase #2: 水 | ChemComp-HOH / | 配列の詳細 | SEQUENCE ADVISORY NOTICE: DIFFERENCE BETWEEN SWISS-PROT AND PDB SEQUENCE. SWISS-PROT ENTRY NAME: ...SEQUENCE ADVISORY NOTICE: DIFFERENCE | |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.31 Å3/Da / 溶媒含有率: 46.81 % | ||||||||||||||||||||||||||||||
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結晶化 | *PLUS 温度: 4,20 K / 手法: microdialysis / PH range low: 5.8 / PH range high: 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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-データ収集
放射 | 散乱光タイプ: x-ray |
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放射波長 | 相対比: 1 |
反射 | *PLUS 最高解像度: 2.6 Å / Num. obs: 23071 / Num. measured all: 57727 / Rmerge(I) obs: 0.093 |
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解析
ソフトウェア | 名称: PROLSQ / 分類: 精密化 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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精密化 | Rfactor obs: 0.207 / 最高解像度: 2.6 Å | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化ステップ | サイクル: LAST / 最高解像度: 2.6 Å
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拘束条件 |
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ソフトウェア | *PLUS 名称: PROLSQ / 分類: refinement | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化 | *PLUS 最高解像度: 2.6 Å / 最低解像度: 6.5 Å / Rfactor obs: 0.207 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶媒の処理 | *PLUS | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | *PLUS |