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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1qca | ||||||
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タイトル | QUADRUPLE MUTANT Q92C, N146F, Y168F, I172V TYPE III CAT COMPLEXED WITH FUSIDIC ACID. CRYSTALS GROWN AT PH 6.3. X-RAY DATA COLLECTED AT ROOM TEMPERATURE | ||||||
![]() | TYPE III CHLORAMPHENICOL ACETYLTRANSFERASE | ||||||
![]() | TRANSFERASE (ACYLTRANSFERASE) / CHLORAMPHENICOL / FUSIDATE / STEROID | ||||||
機能・相同性 | ![]() chloramphenicol O-acetyltransferase activity / chloramphenicol O-acetyltransferase / response to antibiotic 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() | ||||||
手法 | ![]() | ||||||
![]() | Leslie, A.G.W. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Steroid recognition by chloramphenicol acetyltransferase: engineering and structural analysis of a high affinity fusidic acid binding site. 著者: Murray, I.A. / Cann, P.A. / Day, P.J. / Derrick, J.P. / Sutcliffe, M.J. / Shaw, W.V. / Leslie, A.G. #1: ![]() タイトル: Chloramphenicol Acetyltransferase 著者: Shaw, W.V. / Leslie, A.G.W. #2: ![]() タイトル: Refined Crystal Structure of Type III Chloramphenicol Acetyltransferase at 1.75-Angstroms Resolution 著者: Leslie, A.G.W. #3: ![]() タイトル: Structure of Chloramphenicol Acetyltransferase at 1.75-Angstroms Resolution 著者: Leslie, A.G.W. / Moody, P.C.E. / Shaw, W.V. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 62.8 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 44.4 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 475.6 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 488.5 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 8.1 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 11.7 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 | ![]()
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2 | ![]()
| x 6|||||||||||||||||||||
単位格子 |
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Components on special symmetry positions |
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詳細 | SYMMETRY THE CRYSTALLOGRAPHIC SYMMETRY TRANSFORMATIONS PRESENTED BELOW GENERATE THE SUBUNITS OF THE POLYMERIC MOLECULE. APPLIED TO RESIDUES: MET 6 .. LYS 219 120 DEGREE ROTATION ABOUT Z SYMMETRY1 1 -0.499953 -0.866025 0.000000 0.00000 SYMMETRY2 1 0.866026 -0.500047 0.000000 0.00000 SYMMETRY3 1 0.000000 0.000000 1.000000 0.00000 APPLIED TO RESIDUES: MET 6 .. LYS 219 120 DEGREE ROTATION ABOUT Z SYMMETRY1 2 -0.500047 0.866025 0.000000 0.00000 SYMMETRY2 2 -0.866026 -0.499953 0.000000 0.00000 SYMMETRY3 2 0.000000 0.000000 1.000000 0.00000 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 24999.553 Da / 分子数: 1 / 変異: Q92C, N146F, Y168F, I172V / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) ![]() 解説: TRANSMISSIBLE PLASMID R387 ISOLATED FROM SHIGELLA FLEXNERI プラスミド: PUC18 / 発現宿主: ![]() ![]() 参照: UniProt: P00484, chloramphenicol O-acetyltransferase | ||||||||
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#2: 化合物 | #3: 化合物 | ChemComp-FUA / | #4: 水 | ChemComp-HOH / | 非ポリマーの詳細 | THERE ARE TWO COBALT IONS (BOTH OF WHICH LIE ON CRYSTALLOGRAPHIC TWO-FOLD AXES) WHICH PLAY A ...THERE ARE TWO COBALT IONS (BOTH OF WHICH LIE ON CRYSTALLOG | 配列の詳細 | THE AMINO ACID NUMBERING SCHEME ADOPTED IS BASED ON THE ALIGNMENT OF SEVERAL CAT SEQUENCES. FOR THE ...THE AMINO ACID NUMBERING SCHEME ADOPTED IS BASED ON THE ALIGNMENT OF SEVERAL CAT SEQUENCES. FOR THE TYPE III ENZYME WHOSE COORDINATE | |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.78 Å3/Da / 溶媒含有率: 55.69 % | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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結晶化 | pH: 6.3 / 詳細: pH 6.3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
結晶化 | *PLUS 温度: 4 ℃ / 手法: microdialysis | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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-データ収集
回折 | 平均測定温度: 298 K |
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放射光源 | 波長: 1.5418 Å |
検出器 | 検出器: IMAGE PLATE / 日付: 1992年8月27日 |
放射 | 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 1.5418 Å / 相対比: 1 |
反射 | 解像度: 2.2→15.6 Å / Num. obs: 14238 / % possible obs: 99 % / Observed criterion σ(I): 0 / 冗長度: 4.8 % / Rmerge(I) obs: 0.095 |
反射 | *PLUS Num. measured all: 68511 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 解像度: 2.2→6 Å / σ(F): 0 詳細: THE STRUCTURE WAS SOLVED BY MOLECULAR REPLACEMENT USING THE REFINED 1.75 ANGSTROMS RESOLUTION STRUCTURE OF THE WILD-TYPE ENZYME AS A STARTING MODEL. CRYST1 TEXT TO EXPLAIN UNUSUAL UNIT-CELL ...詳細: THE STRUCTURE WAS SOLVED BY MOLECULAR REPLACEMENT USING THE REFINED 1.75 ANGSTROMS RESOLUTION STRUCTURE OF THE WILD-TYPE ENZYME AS A STARTING MODEL. CRYST1 TEXT TO EXPLAIN UNUSUAL UNIT-CELL DATA: HEXAGONAL SETTING FOR R32 HOH 328 LIES ON A CRYSTALLOGRAPHIC TWO-FOLD AXIS AND IS NOT A TRUE SOLVENT MOLECULE, BUT IS IN MODELLING DENSITY SURROUNDING THE COBALT ION CO223 (ALSO ON THE TWO-FOLD AXIS). PRESUMABLY THIS DENSITY IS DUE TO THE HEXAMMINE GROUP (THE CRYSTALS WERE GROWN IN THE PRESENCE OF COBALT HEXAMMINE).
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原子変位パラメータ | Biso mean: 19.9 Å2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2.2→6 Å
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拘束条件 |
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ソフトウェア | *PLUS 名称: PROTIN/PROLSQ / 分類: refinement | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
拘束条件 | *PLUS タイプ: p_plane_restr / Dev ideal target: 0.02 |