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-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1nti | ||||||
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タイトル | RDC-refined NMR structure of bovine Acyl-coenzyme A Binding Protein, ACBP | ||||||
要素 | Acyl-CoA-binding protein | ||||||
キーワード | LIPID BINDING PROTEIN / four-helix-bundle / ACBP family | ||||||
機能・相同性 | 機能・相同性情報 Mitochondrial Fatty Acid Beta-Oxidation / fatty-acyl-CoA binding / fatty acid metabolic process / Golgi apparatus / endoplasmic reticulum 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | Bos taurus (ウシ) | ||||||
手法 | 溶液NMR / simulated annealing, molecular dynamics | ||||||
データ登録者 | Lerche, M.H. / Kragelund, B.B. / Redfield, C. / Poulsen, F.M. | ||||||
引用 | ジャーナル: To be Published タイトル: Subtle structural response to ligand binding revealed by residual dipolar coupling refined NMR structures of acyl coenzyme A binding protein 著者: Lerche, M.H. / Kragelund, B.B. / Redfield, C. / Poulsen, F.M. #1: ジャーナル: J.Biomol.NMR / 年: 1993 タイトル: The three-dimensional structure of acyl-coenzyme A binding protein from bovine liver: structural refinement using heteronuclear multidimensional NMR spectroscopy. 著者: Andersen, K.V. / Poulsen, F.M. #2: ジャーナル: J.Mol.Biol. / 年: 1993 タイトル: Three-dimensional structure of the complex between acyl-coenzyme A binding protein and palmitoyl-coenzyme A. 著者: Kragelund, B.B. / Andersen, K.V. / Madsen, J.C. / Knudsen, J. / Poulsen, F.M. | ||||||
履歴 |
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-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 1nti.cif.gz | 598.8 KB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
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PDB形式 | pdb1nti.ent.gz | 512.6 KB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 1nti.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
文書・要旨 | 1nti_validation.pdf.gz | 354.6 KB | 表示 | wwPDB検証レポート |
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文書・詳細版 | 1nti_full_validation.pdf.gz | 513.3 KB | 表示 | |
XML形式データ | 1nti_validation.xml.gz | 36 KB | 表示 | |
CIF形式データ | 1nti_validation.cif.gz | 57.5 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/nt/1nti ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/nt/1nti | HTTPS FTP |
-関連構造データ
関連構造データ | |
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類似構造データ |
-リンク
-集合体
登録構造単位 |
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1 |
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NMR アンサンブル |
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-要素
#1: タンパク質 | 分子量: 9931.289 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Bos taurus (ウシ) / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 参照: UniProt: P07107 |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR | ||||||||||||
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NMR実験 |
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NMR実験の詳細 | Text: refinement of earlier pdb deposit, 2ABD, see entry for detail. NOE and dihedral angle constraints obtained from this entry. Residual dipolar couplings added as additional restraints |
-試料調製
詳細 |
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試料状態 | イオン強度: no salt added / pH: 6.5 / 圧: ambient / 温度: 310 K |
-NMR測定
放射 | プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M | |||||||||||||||
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放射波長 | 相対比: 1 | |||||||||||||||
NMRスペクトロメーター |
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-解析
NMR software | 名称: X-PLOR / バージョン: modified 3.8 / 分類: 精密化 |
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精密化 | 手法: simulated annealing, molecular dynamics / ソフトェア番号: 1 |
代表構造 | 選択基準: lowest energy |
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: structures with the lowest energy 計算したコンフォーマーの数: 100 / 登録したコンフォーマーの数: 20 |