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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1nes | ||||||
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タイトル | STRUCTURE OF THE PRODUCT COMPLEX OF ACETYL-ALA-PRO-ALA WITH PORCINE PANCREATIC ELASTASE AT 1.65 ANGSTROMS RESOLUTION | ||||||
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![]() | HYDROLASE/HYDROLASE INHIBITOR / SERINE PROTEASE/INHIBITOR / HYDROLASE-HYDROLASE INHIBITOR complex | ||||||
機能・相同性 | ![]() pancreatic elastase / serine-type endopeptidase activity / proteolysis / extracellular space / metal ion binding 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | ![]() | ||||||
![]() | Meyer Junior, E.F. / Radhakrishnan, R. / M Cole, G. / Presta, L.G. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Structure of the product complex of acetyl-Ala-Pro-Ala with porcine pancreatic elastase at 1.65 A resolution. 著者: Meyer Jr., E.F. / Radhakrishnan, R. / Cole, G.M. / Presta, L.G. #1: ![]() タイトル: Misbehaving Macromolecules: Backwards Binding Ligands and Other Surprising Structures 著者: Meyer, E.F. / Botos, I. / Scapozza, L. / Zhang, D. #2: ![]() タイトル: Effect of the 7-Amino Substituent on the Inhibitory Potency of Mechanism-Based Isocoumarin Inhibitors for Porcine Pancreatic and Human Neutrophil Elastases: A 1.85-Angstroms X-Ray ...タイトル: Effect of the 7-Amino Substituent on the Inhibitory Potency of Mechanism-Based Isocoumarin Inhibitors for Porcine Pancreatic and Human Neutrophil Elastases: A 1.85-Angstroms X-Ray Structure of the Complex between Porcine Pancreatic Elastase and 7-[(N-Tosylphenylalanyl)Amino]-4-Chloro-3-Methoxyisocoumarin 著者: Hernandez, M.A. / Powers, J.C. / Glinski, J. / Oleksyszyn, J. / Vijayalakshmi, J. / Meyer Junior, E.F. #3: ![]() タイトル: Complexed with 7-Amino-3-(2-Bromoethoxy)-4-Chloroisocoumarin as a Nonreactivatable Doubly Covalent Enzyme-Inhibitor Complex 著者: Vijayalakshmi, J. / Meyer Junior, E.F. / Kam, C.-M. / Powers, J.C. #4: ![]() タイトル: Reaction of Porcine Pancreatic Elastase with 7-Substituted 3-Alkoxy-4-Chloroisocoumarins: Design of Potent Inhibitors Using the Crystal Structure of the Complex Formed with 4-Chloro-3- ...タイトル: Reaction of Porcine Pancreatic Elastase with 7-Substituted 3-Alkoxy-4-Chloroisocoumarins: Design of Potent Inhibitors Using the Crystal Structure of the Complex Formed with 4-Chloro-3-Ethoxy-7-Guanidino-Isocoumarin 著者: Powers, J.C. / Oleksyszyn, J. / Narasimhan, S.L. / Kam, C.-M. / Radhakrishnan, R. / Meyer Junior, E.F. #5: ![]() タイトル: The 2.2-Angstrom Resolution X-Ray Crystal Structure of the Complex of Trypsin Inhibited by 4-Chloro-3-Ethoxy-7-Guanidinoisocoumarin: A Proposed Model of the Thrombin-Inhibitor Complex 著者: Chow, M.M. / Meyer Junior, E.F. / Bode, W. / Kam, C.-M. / Radhakrishnan, R. / Vijayalakshmi, J. / Powers, J.C. #6: ![]() タイトル: Human Leukocyte and Porcine Pancreatic Elastase: X-Ray Crystal Structures, Mechanism, Substrate Specificity, and Mechanism-Based Inhibitors 著者: Bode, W. / Meyer Junior, E.F. / Powers, J.C. #7: ![]() タイトル: Structure of Native Porcine Pancreatic Elastase at 1.65 Angstroms Resolution 著者: Meyer, E. / Cole, G. / Radhakrishnan, R. / Epp, O. #8: ![]() タイトル: Crystal Structures of the Complex of Porcine Pancreatic Elastase with Two Valine-Derived Benzoxazinone Inhibitors 著者: Radhakrishnan, R. / Presta, L.G. / Meyer Junior, E.F. / Wildonger, R. #9: ![]() タイトル: Crystal Structures of the Complex of Porcine Pancreatic Elastase with Two Valine-Derived Benzoxazinone Inhibitors 著者: Radhakrishnan, R. / Presta, L.G. / Meyer Junior, E.F. / Wildonger, R. #10: ![]() タイトル: Stereospecific Reaction of 3-Methoxy-4-Chloro-7-Amino-Isocoumarin with Crystalline Porcine Pancreatic Elastase 著者: Meyer Junior, E.F. / Presta, L.G. / Radhakrishnan, R. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 60.9 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 44.2 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 412.7 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 418.6 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 7.9 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 11.6 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
類似構造データ |
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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単位格子 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 25928.031 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) ![]() ![]() | ||||||||
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#2: タンパク質・ペプチド | 分子量: 283.323 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 組換発現 #3: 化合物 | ChemComp-CA / | #4: 化合物 | ChemComp-SO4 / | #5: 水 | ChemComp-HOH / | Has protein modification | Y | |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.13 Å3/Da / 溶媒含有率: 42.19 % | |||||||||||||||||||||||||
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結晶化 | *PLUS pH: 5 / 手法: microdialysis | |||||||||||||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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-データ収集
放射 | 散乱光タイプ: x-ray |
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放射波長 | 相対比: 1 |
反射 | Observed criterion σ(F): 2 |
反射 | *PLUS 最高解像度: 1.65 Å / Num. obs: 20665 / % possible obs: 72 % |
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解析
ソフトウェア | 名称: EREF / 分類: 精密化 | ||||||||||||
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精密化 | 解像度: 1.65→7 Å / σ(F): 1 /
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 1.65→7 Å
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拘束条件 | *PLUS
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