dTDP-4-dehydrorhamnose reductase / dTDP-4-dehydrorhamnose reductase activity / O antigen biosynthetic process / dTDP-rhamnose biosynthetic process / lipopolysaccharide biosynthetic process / extracellular polysaccharide biosynthetic process / metal ion binding / cytosol 類似検索 - 分子機能
#1: ジャーナル: Acta Crystallogr.,Sect.D / 年: 1999 タイトル: Overexpression, purification, crystallisation and preliminary structural study of dTDP-6-deoxy-lyxo-4-reductase (RmlD) the fourth enzyme of the dTDP-rhanose synthesis pathway,from ...タイトル: Overexpression, purification, crystallisation and preliminary structural study of dTDP-6-deoxy-lyxo-4-reductase (RmlD) the fourth enzyme of the dTDP-rhanose synthesis pathway,from Salmonella entrica serovar Typhimurim 著者: Giraud, M.F. / McMiken, H.J. / Leonard, G.A. / Messner, P. / Whitfield, C. / Naismith, J.H.
プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長
波長: 0.934 Å / 相対比: 1
反射
解像度: 2→54.23 Å / Num. obs: 19137 / % possible obs: 99.8 % / Observed criterion σ(I): 1.5 / 冗長度: 4.7 % / Biso Wilson estimate: 36 Å2 / Rmerge(I) obs: 0.08 / Net I/σ(I): 5.6
反射 シェル
解像度: 2→2.05 Å / Rmerge(I) obs: 0.478 / Mean I/σ(I) obs: 1.5 / % possible all: 100
-
解析
ソフトウェア
名称
バージョン
分類
MOSFLM
データ削減
SCALA
データスケーリング
SOLVE
位相決定
REFMAC
5
精密化
CCP4
(SCALA)
データスケーリング
精密化
構造決定の手法: 多波長異常分散 / 解像度: 2→81.7 Å / 交差検証法: THROUGHOUT / σ(F): 0 詳細: TLS-OPTION WITH COFACTOR- BINDING, SUBSTRATE-BINDING DOMAINS AND WATERS AS THREE SEPARATE TLS-BODIES WAS USED THROUGHOUT