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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1mtp | ||||||
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タイトル | The X-ray crystal structure of a serpin from a thermophilic prokaryote | ||||||
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![]() | STRUCTURAL GENOMICS / protease inhibitor | ||||||
機能・相同性 | ![]() | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | ![]() ![]() | ||||||
![]() | Irving, J.A. / Cabrita, L.D. / Rossjohn, J. / Pike, R.N. / Bottomley, S.P. / Whisstock, J.C. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: The 1.5 A crystal structure of a prokaryote serpin: controlling conformational change in a heated environment 著者: Irving, J.A. / Cabrita, L.D. / Rossjohn, J. / Pike, R.N. / Bottomley, S.P. / Whisstock, J.C. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 92.5 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 69.1 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 370.7 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 372.4 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 8.2 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 15.4 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
関連構造データ | ![]() 1hleS S: 精密化の開始モデル |
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類似構造データ |
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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単位格子 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 34976.918 Da / 分子数: 1 / 断片: Chain A, residue 55-377 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() ![]() ![]() ![]() |
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#2: タンパク質・ペプチド | 分子量: 4787.580 Da / 分子数: 1 / 断片: Chain B, residue 378-420 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() ![]() ![]() ![]() |
#3: 水 | ChemComp-HOH / |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.16 Å3/Da / 溶媒含有率: 42.94 % | ||||||||||||||||||||||||
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結晶化 | 温度: 294 K / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 / pH: 9 詳細: PEG 4000, 0.1 M Tris, pH 9.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K | ||||||||||||||||||||||||
結晶化 | *PLUS PH range low: 9 / PH range high: 8 | ||||||||||||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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-データ収集
回折 | 平均測定温度: 100 K |
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放射光源 | 由来: ![]() |
検出器 | タイプ: RIGAKU RAXIS IV / 検出器: IMAGE PLATE / 日付: 2002年3月14日 / 詳細: OSMIC MIRRORS |
放射 | プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 1.5418 Å / 相対比: 1 |
反射 | 解像度: 1.5→50 Å / Num. all: 179258 / Num. obs: 179258 / Observed criterion σ(I): 0 |
反射 | *PLUS Num. obs: 54979 / % possible obs: 98.1 % / 冗長度: 3.3 % / Num. measured all: 179258 / Rmerge(I) obs: 0.043 |
反射 シェル | *PLUS % possible obs: 92 % / Rmerge(I) obs: 0.199 / Mean I/σ(I) obs: 2.6 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 構造決定の手法: ![]() 開始モデル: PDB ENTRY 1HLE 解像度: 1.5→50 Å
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 1.5→50 Å
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精密化 | *PLUS 最低解像度: 50 Å / % reflection Rfree: 3 % | ||||||||||||||||||||||||
溶媒の処理 | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||
拘束条件 | *PLUS
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