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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1mag | |||||||||
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タイトル | GRAMICIDIN A IN HYDRATED DMPC BILAYERS, SOLID STATE NMR | |||||||||
![]() | GRAMICIDIN A | |||||||||
![]() | ANTIBIOTIC / GRAMICIDIN / ANTIFUNGAL / ANTIBACTERIAL / MEMBRANE ION CHANNEL / LINEAR GRAMICIDIN / ORIENTED BILAYERS | |||||||||
機能・相同性 | GRAMICIDIN A / : ![]() | |||||||||
生物種 | ![]() | |||||||||
手法 | 個体NMR / simulated annealing | |||||||||
![]() | Ketchem, R.R. / Roux, B. / Cross, T.A. | |||||||||
![]() | ![]() タイトル: Macromolecular Structural Elucidation with Solid-State NMR-Derived Orientational Constraints. 著者: Ketchem, R.R. / Lee, K.C. / Huo, S. / Cross, T.A. #1: ![]() 年: 1996 タイトル: Computational Refinement Through Solid State NMR and Energy Constraints of a Membrane Bound Polypeptide 著者: Ketchem, R.R. / Roux, B. / Cross, T.A. #2: ジャーナル: Biochemistry / 年: 1995 タイトル: Lipid-Peptide Interface: Valine Conformation and Dynamics in the Gramicidin Channel 著者: Lee, K.C. / Huo, S. / Cross, T.A. #3: ジャーナル: Biochemistry / 年: 1995 タイトル: Tryptophan Dynamics and Structural Refinement in a Lipid Bilayer Environment: Solid State NMR of the Gramicidin Channel 著者: Hu, W. / Lazo, N.D. / Cross, T.A. #4: ジャーナル: Science / 年: 1993 タイトル: High-Resolution Conformation of Gramicidin a in a Lipid Bilayer by Solid-State NMR 著者: Ketchem, R.R. / Hu, W. / Cross, T.A. | |||||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 20.1 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 15 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 334.4 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 334.2 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 2.1 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 2.3 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
関連構造データ | |
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類似構造データ |
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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NMR アンサンブル |
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要素
-実験情報
-実験
実験 | 手法: 個体NMR | ||||||||||||
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NMR実験 |
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試料調製
試料状態 | pH: 7.0 / 温度: 303 K |
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結晶化 | *PLUS 手法: other / 詳細: NMR |
-NMR測定
NMRスペクトロメーター | タイプ: CHEMAGNETICS CMX / 製造業者: CHEMAGNETICS / モデル: CMX / 磁場強度: 400 MHz |
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解析
NMR software |
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精密化 | 手法: simulated annealing / ソフトェア番号: 1 詳細: CHARMM23 STRUCTURE REFINED WITH TORC (TOTAL REFINEMENT OF CONSTRAINTS), DEVELOPED IN AUTHORS' LAB. TORC RUNS AS A MODULE WITHIN CHARMM AND UTILIZES A SIMULATED ANNEALING PROTOCOL TO REFINE ...詳細: CHARMM23 STRUCTURE REFINED WITH TORC (TOTAL REFINEMENT OF CONSTRAINTS), DEVELOPED IN AUTHORS' LAB. TORC RUNS AS A MODULE WITHIN CHARMM AND UTILIZES A SIMULATED ANNEALING PROTOCOL TO REFINE THE STRUCTURE AGAINST BOTH THE SOLID STATE NMR DATA (INCLUDING SOLID STATE NMR DERIVED ORIENTATIONAL CONSTRAINTS) AND THE CHARMM ENERGY. | |||||||||
NMRアンサンブル | 登録したコンフォーマーの数: 1 |