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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1j3s | ||||||
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タイトル | Solution Structure of Reduced Recombinant Human Cytochrome c | ||||||
![]() | Cytochrome c | ||||||
![]() | ELECTRON TRANSPORT / Ferrocytochrome c | ||||||
機能・相同性 | ![]() Formation of apoptosome / apoptosome / Release of apoptotic factors from the mitochondria / Respiratory electron transport / Activation of caspases through apoptosome-mediated cleavage / Regulation of the apoptosome activity / SMAC (DIABLO) binds to IAPs / SMAC(DIABLO)-mediated dissociation of IAP:caspase complexes / cellular respiration / mitochondrial electron transport, cytochrome c to oxygen ...Formation of apoptosome / apoptosome / Release of apoptotic factors from the mitochondria / Respiratory electron transport / Activation of caspases through apoptosome-mediated cleavage / Regulation of the apoptosome activity / SMAC (DIABLO) binds to IAPs / SMAC(DIABLO)-mediated dissociation of IAP:caspase complexes / cellular respiration / mitochondrial electron transport, cytochrome c to oxygen / execution phase of apoptosis / mitochondrial electron transport, ubiquinol to cytochrome c / Detoxification of Reactive Oxygen Species / Pyroptosis / : / intrinsic apoptotic signaling pathway / TP53 Regulates Metabolic Genes / Transcriptional activation of mitochondrial biogenesis / Cytoprotection by HMOX1 / mitochondrial intermembrane space / mitochondrial inner membrane / electron transfer activity / heme binding / mitochondrion / nucleus / metal ion binding / cytosol 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() | ||||||
手法 | 溶液NMR / Hybrid distance geometry-dynamical simulated annealing method | ||||||
![]() | Jeng, W.-Y. / Shiu, J.-H. / Tsai, Y.-H. / Chuang, W.-J. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Solution Structure of Reduced Recombinant Human Cytochrome c 著者: Jeng, W.-Y. / Shiu, J.-H. / Tsai, Y.-H. / Chuang, W.-J. #1: ![]() タイトル: Expression and Characterization of Recombinant Human Cytochrome c in E. Coli 著者: Jeng, W.-Y. / Shiu, J.-H. / Tsai, Y.-H. / Chuang, W.-J. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 676.5 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 561.3 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
類似構造データ | |
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その他のデータベース |
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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NMR アンサンブル |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 11640.582 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() ![]() ![]() |
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#2: 化合物 | ChemComp-HEC / |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NMR実験 |
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試料調製
詳細 |
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試料状態 | イオン強度: 125 / pH: 6.5 / 圧: ambient / 温度: 300 K |
-NMR測定
放射 | プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M |
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放射波長 | 相対比: 1 |
NMRスペクトロメーター | タイプ: Bruker AVANCE / 製造業者: Bruker / モデル: AVANCE / 磁場強度: 600 MHz |
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解析
NMR software |
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精密化 | 手法: Hybrid distance geometry-dynamical simulated annealing method ソフトェア番号: 1 詳細: The structures are based on a total of 1562 restraints, 1449 are NOE-derived distance constraints, 80 dihedral angle restraints,33 distance restraints from hydrogen bonds. | ||||||||||||||||
代表構造 | 選択基準: closest to the average | ||||||||||||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: structures with acceptable covalent geometry 計算したコンフォーマーの数: 100 / 登録したコンフォーマーの数: 20 |