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-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1hxs | |||||||||
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タイトル | CRYSTAL STRUCTURE OF MAHONEY STRAIN OF POLIOVIRUS AT 2.2A RESOLUTION | |||||||||
要素 | (GENOME POLYPROTEIN, COAT PROTEIN ...) x 4 | |||||||||
キーワード | VIRUS / Picornavirus / Poliovirus / Coat Protein / ab initio phase determinaion / Icosahedral virus | |||||||||
機能・相同性 | 機能・相同性情報 symbiont-mediated suppression of host translation initiation / symbiont-mediated suppression of host cytoplasmic pattern recognition receptor signaling pathway via inhibition of RIG-I activity / symbiont-mediated suppression of host cytoplasmic pattern recognition receptor signaling pathway via inhibition of MDA-5 activity / symbiont-mediated suppression of host cytoplasmic pattern recognition receptor signaling pathway via inhibition of MAVS activity / picornain 2A / symbiont-mediated suppression of host mRNA export from nucleus / ribonucleoside triphosphate phosphatase activity / symbiont genome entry into host cell via pore formation in plasma membrane / picornain 3C / T=pseudo3 icosahedral viral capsid ...symbiont-mediated suppression of host translation initiation / symbiont-mediated suppression of host cytoplasmic pattern recognition receptor signaling pathway via inhibition of RIG-I activity / symbiont-mediated suppression of host cytoplasmic pattern recognition receptor signaling pathway via inhibition of MDA-5 activity / symbiont-mediated suppression of host cytoplasmic pattern recognition receptor signaling pathway via inhibition of MAVS activity / picornain 2A / symbiont-mediated suppression of host mRNA export from nucleus / ribonucleoside triphosphate phosphatase activity / symbiont genome entry into host cell via pore formation in plasma membrane / picornain 3C / T=pseudo3 icosahedral viral capsid / host cell cytoplasmic vesicle membrane / endocytosis involved in viral entry into host cell / nucleoside-triphosphate phosphatase / protein complex oligomerization / monoatomic ion channel activity / RNA helicase activity / induction by virus of host autophagy / RNA-directed RNA polymerase / viral RNA genome replication / cysteine-type endopeptidase activity / RNA-dependent RNA polymerase activity / virus-mediated perturbation of host defense response / DNA-templated transcription / host cell nucleus / virion attachment to host cell / structural molecule activity / proteolysis / RNA binding / ATP binding / membrane / metal ion binding 類似検索 - 分子機能 | |||||||||
生物種 | Human poliovirus 1 (ポリオウイルス) | |||||||||
手法 | X線回折 / 分子置換 / 解像度: 2.2 Å | |||||||||
データ登録者 | Miller, S.T. / Hogle, J.M. / Filman, D.J. | |||||||||
引用 | ジャーナル: J.Mol.Biol. / 年: 2001 タイトル: Ab initio phasing of high-symmetry macromolecular complexes: successful phasing of authentic poliovirus data to 3.0 A resolution. 著者: Miller, S.T. / Hogle, J.M. / Filman, D.J. #1: ジャーナル: To be Published タイトル: Ab initio Phasing of High-Symmetry Macromolecular Complexes: Successful Phasing of Authentic Poliovirus Data to 3.0A Resolution 著者: Miller, S.T. / Hogle, J.M. / Filman, D.J. #2: ジャーナル: Acta Crystallogr.,Sect.D / 年: 1996 タイトル: A Genetic Algorithm for the ab initio phasing of Icosahedral Viruses 著者: Miller, S.T. / Hogle, J.M. / Filman, D.J. #3: ジャーナル: Nat.Struct.Biol. / 年: 1997 タイトル: Structural Studies of Poliovirus Mutants that overcome receptor defects 著者: Wien, M.W. / Curry, S. / Filman, D.J. / Hogle, J.M. #4: ジャーナル: Embo J. / 年: 1989 タイトル: Structural factors that control conformational transitions and serotype specificity in type 3 poliovirus 著者: Filman, D.J. / Syed, R. / Chow, M. / Macadam, A.J. / Minor, P.D. / Hogle, J.M. #5: ジャーナル: Science / 年: 1985 タイトル: Three-dimensional structure of poliovirus at 2.9A resolution 著者: Hogle, J.M. / Chow, M. / Filman, D.J. #6: ジャーナル: J.APPL.CRYSTALLOGR. / 年: 1999 タイトル: Collection of very low resolution protein data 著者: Miller, S.T. / Genova, J.G. / Hogle, J.M. | |||||||||
履歴 |
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-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 1hxs.cif.gz | 195.9 KB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
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PDB形式 | pdb1hxs.ent.gz | 150.2 KB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 1hxs.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/hx/1hxs ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/hx/1hxs | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
関連構造データ | 1asjS S: 精密化の開始モデル |
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類似構造データ |
-リンク
-集合体
登録構造単位 |
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2 |
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3 |
| x 5|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
4 |
| x 6|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
5 |
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単位格子 |
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対称性 | 点対称性: (ヘルマン・モーガン記号: 532 / シェーンフリース記号: I (正20面体型対称)) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
非結晶学的対称性 (NCS) | NCS oper:
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