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-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1gmq | ||||||
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タイトル | COMPLEX OF RIBONUCLEASE FROM STREPTOMYCES AUREOFACIENS WITH 2'-GMP AT 1.7 ANGSTROMS RESOLUTION | ||||||
要素 | RIBONUCLEASE SA | ||||||
キーワード | HYDROLASE / GUANYLORIBONUCLEASE | ||||||
機能・相同性 | 機能・相同性情報 ribonuclease T1 activity / ribonuclease T1 / RNA endonuclease activity / lyase activity / RNA binding / extracellular region 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | Streptomyces aureofaciens (バクテリア) | ||||||
手法 | X線回折 / 解像度: 1.8 Å | ||||||
データ登録者 | Sevcik, J. / Hill, C. / Dauter, Z. / Wilson, K. | ||||||
引用 | ジャーナル: Acta Crystallogr.,Sect.B / 年: 1991 タイトル: Continuation of the Rnase Sa Work After 1Sar and 2Sar Structures 著者: Sevcik, J. / Dodson, E.J. / Dodson, G.G. | ||||||
履歴 |
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Remark 0 | THIS ENTRY 1GMQ REFLECTS AN ALTERNATIVE MODELING OF THE ORIGINAL STRUCTURAL DATA R1SARSF DETERMINED ...THIS ENTRY 1GMQ REFLECTS AN ALTERNATIVE MODELING OF THE ORIGINAL STRUCTURAL DATA R1SARSF DETERMINED BY AUTHORS OF THE PDB ENTRY 1SAR: AUTHOR J.SEVCIK,E.J.DODSON,G.G.DODSON | ||||||
Remark 200 | AUTHOR USED THE SF DATA FROM ENTRY 1SAR. |
-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 1gmq.cif.gz | 55.1 KB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
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PDB形式 | pdb1gmq.ent.gz | 42.6 KB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 1gmq.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
文書・要旨 | 1gmq_validation.pdf.gz | 427.1 KB | 表示 | wwPDB検証レポート |
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文書・詳細版 | 1gmq_full_validation.pdf.gz | 430.5 KB | 表示 | |
XML形式データ | 1gmq_validation.xml.gz | 15.4 KB | 表示 | |
CIF形式データ | 1gmq_validation.cif.gz | 23.2 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/gm/1gmq ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/gm/1gmq | HTTPS FTP |
-関連構造データ
-リンク
-集合体
登録構造単位 |
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1 |
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単位格子 |
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Atom site foot note | 1: RESIDUES PRO A 27 AND PRO B 27 ARE CIS PROLINES. |
-要素
#1: タンパク質 | 分子量: 10584.531 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) Streptomyces aureofaciens (バクテリア) 参照: UniProt: P05798, EC: 3.1.27.3 #2: 化合物 | ChemComp-SO4 / | #3: 水 | ChemComp-HOH / | |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: X線回折 |
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-試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.35 Å3/Da / 溶媒含有率: 47.72 % | ||||||||||||
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結晶化 | *PLUS pH: 7.2 / 手法: 蒸気拡散法 / 詳細: referred to Acta Cryst.B47.240-253 1991 | ||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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-データ収集
放射 | 散乱光タイプ: x-ray |
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放射波長 | 相対比: 1 |
反射 | *PLUS 最高解像度: 1.8 Å / Num. obs: 18996 / % possible obs: 99.3 % / Num. measured all: 71868 / Rmerge(I) obs: 0.033 |
-解析
ソフトウェア | 名称: PROLSQ / 分類: 精密化 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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精密化 | Rfactor obs: 0.139 / 最高解像度: 1.8 Å | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化ステップ | サイクル: LAST / 最高解像度: 1.8 Å
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拘束条件 |
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精密化 | *PLUS 最高解像度: 1.8 Å / 最低解像度: 10 Å / Num. reflection obs: 18895 / Rfactor obs: 0.139 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶媒の処理 | *PLUS | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | *PLUS | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
拘束条件 | *PLUS
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