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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1glc | ||||||
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タイトル | CATION PROMOTED ASSOCIATION (CPA) OF A REGULATORY AND TARGET PROTEIN IS CONTROLLED BY PHOSPHORYLATION | ||||||
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![]() | PHOSPHOTRANSFERASE | ||||||
機能・相同性 | ![]() negative regulation of carbohydrate metabolic process / negative regulation of maltose transport / enzyme IIA-maltose transporter complex / negative regulation of transmembrane transport / glycerol kinase / glycerol-3-phosphate biosynthetic process / glycerol kinase activity / glycerol metabolic process / phosphoenolpyruvate-dependent sugar phosphotransferase system / glycerol catabolic process ...negative regulation of carbohydrate metabolic process / negative regulation of maltose transport / enzyme IIA-maltose transporter complex / negative regulation of transmembrane transport / glycerol kinase / glycerol-3-phosphate biosynthetic process / glycerol kinase activity / glycerol metabolic process / phosphoenolpyruvate-dependent sugar phosphotransferase system / glycerol catabolic process / triglyceride metabolic process / transmembrane transporter complex / kinase activity / phosphorylation / DNA damage response / zinc ion binding / ATP binding / identical protein binding / membrane / metal ion binding / cytosol 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | ![]() | ||||||
![]() | Feese, M.D. / Meadow, N.D. / Roseman, S. / Pettigrew, D.W. / Remington, S.J. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Cation-promoted association of a regulatory and target protein is controlled by protein phosphorylation. 著者: Feese, M. / Pettigrew, D.W. / Meadow, N.D. / Roseman, S. / Remington, S.J. #1: ![]() タイトル: Three-Dimensional Structure of the Regulatory Complex of Escherichia Coli III-Glc with Glycerol Kinase 著者: Hurley, J.H. / Worthylake, D. / Faber, H.R. / Meadow, N.D. / Roseman, S. / Pettigrew, D.W. / Remington, S.J. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 140.6 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 106.9 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 477.9 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 537 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 22.2 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 32.9 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 | ![]()
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単位格子 |
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Atom site foot note | 1: CIS PROLINE - PRO G 354 | ||||||||
詳細 | THE CRYSTAL CONTAINS TETRAMERS OF THE GLYCEROL KINASE/III-GLC COMPLEX WITH 222 POINT-GROUP SYMMETRY. THE TETRAMER IS LOCATED AT THE INTERSECTION OF THREE CRYSTALLOGRAPHIC TWO-FOLD AXES. THE FOLLOWING TRANSFORMATIONS WILL PRODUCE A TETRAMER OF THE COMPLEX WHEN APPLIED TO THE COORDINATES IN THIS ENTRY: TRANSFORM 1 (-X, 1-Y, Z) -1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 -1.0 0.0 125.16 0.0 0.0 1.0 0.0 TRANSFORM 2 ( X, 1-Y, -Z) 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 -1.0 0.0 125.16 0.0 0.0 1.0 0.0 TRANSFORM 3 (-X, Y, -Z) -1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 -1.0 0.0 |
-
要素
-タンパク質 , 2種, 2分子 FG
#1: タンパク質 | 分子量: 18141.834 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() ![]() 参照: UniProt: P69783, protein-Npi-phosphohistidine-sugar phosphotransferase |
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#2: タンパク質 | 分子量: 56162.352 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() ![]() |
-非ポリマー , 5種, 46分子 ![](data/chem/img/ZN.gif)
![](data/chem/img/MG.gif)
![](data/chem/img/G3H.gif)
![](data/chem/img/ADP.gif)
![](data/chem/img/HOH.gif)
![](data/chem/img/MG.gif)
![](data/chem/img/G3H.gif)
![](data/chem/img/ADP.gif)
![](data/chem/img/HOH.gif)
#3: 化合物 | ChemComp-ZN / |
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#4: 化合物 | ChemComp-MG / |
#5: 化合物 | ChemComp-G3H / |
#6: 化合物 | ChemComp-ADP / |
#7: 水 | ChemComp-HOH / |
-詳細
非ポリマーの詳細 | THE COMPLEX OF GLYCEROL KINASE AND III-GLC CREATES AN INTERMOLECULAR ZINC BINDING SITE. HISTIDINES ...THE COMPLEX OF GLYCEROL KINASE AND III-GLC CREATES AN INTERMOLEC |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 3.48 Å3/Da / 溶媒含有率: 64.66 % | ||||||||||||||||||||||||||||||
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結晶化 | *PLUS pH: 6.1 / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 | ||||||||||||||||||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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-データ収集
放射 | 散乱光タイプ: x-ray |
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放射波長 | 相対比: 1 |
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解析
ソフトウェア | 名称: TNT / 分類: 精密化 | ||||||||||||||||||||||||||||||
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精密化 | 解像度: 2.65→14.5 Å / Rfactor obs: 0.166 | ||||||||||||||||||||||||||||||
精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2.65→14.5 Å
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拘束条件 |
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ソフトウェア | *PLUS 名称: TNT / 分類: refinement | ||||||||||||||||||||||||||||||
精密化 | *PLUS Rfactor obs: 0.166 | ||||||||||||||||||||||||||||||
溶媒の処理 | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||
拘束条件 | *PLUS
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