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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1ghe | ||||||
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タイトル | CRYSTAL STRUCTURE OF TABTOXIN RESISTANCE PROTEIN COMPLEXED WITH AN ACYL COENZYME A | ||||||
![]() | ACETYLTRANSFERASE | ||||||
![]() | TRANSFERASE / Acyl Coenzyme A complex | ||||||
機能・相同性 | ![]() acyltransferase activity, transferring groups other than amino-acyl groups / 転移酵素; アシル基を移すもの; アミノアシル基以外のアシル基を移すもの 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() | ||||||
手法 | ![]() ![]() | ||||||
![]() | He, H. / Ding, Y. / Bartlam, M. / Sun, F. / Le, Y. / Qin, X. / Tang, H. / Zhang, R. / Joachimiak, A. / Liu, Y. ...He, H. / Ding, Y. / Bartlam, M. / Sun, F. / Le, Y. / Qin, X. / Tang, H. / Zhang, R. / Joachimiak, A. / Liu, Y. / Zhao, N. / Rao, Z. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Crystal Structure of Tabtoxin Resistance Protein Complexed with Acetyl Coenzyme A Reveals the Mechanism for beta-Lactam Acetylation 著者: He, H. / Ding, Y. / Bartlam, M. / Sun, F. / Le, Y. / Qin, X. / Tang, H. / Zhang, R. / Joachimiak, A. / Liu, Y. / Zhao, N. / Rao, Z. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 82.7 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 62.3 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 491.3 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 503 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 11.1 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 15.5 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 | ![]()
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2 | ![]()
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単位格子 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 19492.443 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) ![]() 生物種: Pseudomonas amygdali / プラスミド: PQE-30 / 発現宿主: ![]() ![]() 参照: UniProt: P16966, 転移酵素; アシル基を移すもの; アミノアシル基以外のアシル基を移すもの #2: 化合物 | #3: 水 | ChemComp-HOH / | Has protein modification | Y | |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.42 Å3/Da / 溶媒含有率: 49.1 % | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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結晶化 | 温度: 291 K / 手法: hanging drop/vapor diffusion / pH: 8 詳細: PEG 4000, sodium acetate, Tris-HCL, pH 8.0, HANGING DROP/VAPOR DIFFUSION, temperature 291.0K | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
結晶化 | *PLUS 温度: 291 K / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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-データ収集
回折 | 平均測定温度: 115 K |
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放射光源 | 由来: ![]() ![]() ![]() |
検出器 | タイプ: SBC-2 / 検出器: CCD / 日付: 2000年9月1日 |
放射 | プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 0.9639 Å / 相対比: 1 |
反射 | 解像度: 1.4→100 Å / Num. all: 105976 / Num. obs: 93060 / % possible obs: 95.3 % / Observed criterion σ(I): -3 / 冗長度: 3 % / Biso Wilson estimate: 13.4 Å2 / Rmerge(I) obs: 0.067 / Net I/σ(I): 5.9 |
反射 シェル | 解像度: 1.4→1.45 Å / 冗長度: 1 % / Rmerge(I) obs: 0.32 / Num. unique all: 4747 / % possible all: 65 |
反射 | *PLUS 最高解像度: 1.49 Å / 最低解像度: 100 Å / Num. obs: 56060 / % possible obs: 92 % / Num. measured all: 307917 / Rmerge(I) obs: 0.071 |
反射 シェル | *PLUS Mean I/σ(I) obs: 2.5 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 解像度: 1.55→30 Å / σ(F): 0 / σ(I): 0 / 立体化学のターゲット値: Engh & Huber / 詳細: CNS
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 1.55→30 Å
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拘束条件 |
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精密化 | *PLUS 最低解像度: 30 Å / % reflection Rfree: 10 % / Rfactor Rfree: 0.23 | |||||||||||||||||||||
溶媒の処理 | *PLUS | |||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | *PLUS | |||||||||||||||||||||
拘束条件 | *PLUS
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