登録情報 データベース : PDB / ID : 1g6i 構造の表示 ダウンロードとリンクタイトル Crystal structure of the yeast alpha-1,2-mannosidase with bound 1-deoxymannojirimycin at 1.59 A resolution 要素CLASS I ALPHA-1,2-MANNOSIDASE 詳細 キーワード HYDROLASE / alpha-alpha7 barrel機能・相同性 機能・相同性情報分子機能 ドメイン・相同性 構成要素
protein deglycosylation involved in glycoprotein catabolic process / mannosyl-oligosaccharide 1,2-alpha-mannosidase / mannosyl-oligosaccharide 1,2-alpha-mannosidase activity / protein glycosylation / ERAD pathway / trans-Golgi network / carbohydrate metabolic process / endosome / calcium ion binding / endoplasmic reticulum membrane ... protein deglycosylation involved in glycoprotein catabolic process / mannosyl-oligosaccharide 1,2-alpha-mannosidase / mannosyl-oligosaccharide 1,2-alpha-mannosidase activity / protein glycosylation / ERAD pathway / trans-Golgi network / carbohydrate metabolic process / endosome / calcium ion binding / endoplasmic reticulum membrane / endoplasmic reticulum / membrane 類似検索 - 分子機能 Glycoside hydrolase family 47 / Seven-hairpin glycosidases / Glycosyl hydrolase family 47 / Glycosyltransferase - #10 / Six-hairpin glycosidase-like superfamily / Glycosyltransferase / Alpha/alpha barrel / Mainly Alpha 類似検索 - ドメイン・相同性 1-DEOXYMANNOJIRIMYCIN / Endoplasmic reticulum mannosyl-oligosaccharide 1,2-alpha-mannosidase 類似検索 - 構成要素生物種 Saccharomyces cerevisiae (パン酵母)手法 X線回折 / シンクロトロン / AB INITIO PHASING / 解像度 : 1.59 Å 詳細データ登録者 Herscovics, A. / Lipari, F. / Sleno, B. / Romera, P.A. / Vallee, F. / Yip, P. / Howell, P.A. 引用ジャーナル : CARBOHYDRATE BIOENGINEERING. INTERDISCIPLINARY APPROACHES. 年 : 2002タイトル : Structure and function of Class I a1,2-mannosidases involved in glycoprotein biosynthesis.著者 : Herscovics, A. / Lipari, F. / Sleno, B. / Romera, P.A. / Vallee, F. / Yip, P. / Howell, P.A. 履歴 登録 2000年11月6日 登録サイト : RCSB / 処理サイト : RCSB改定 1.0 2003年6月24日 Provider : repository / タイプ : Initial release改定 1.1 2008年4月27日 Group : Version format compliance改定 1.2 2011年7月13日 Group : Non-polymer description / Version format compliance改定 1.3 2017年2月8日 Group : Structure summary改定 2.0 2020年7月29日 Group : Atomic model / Data collection ... Atomic model / Data collection / Database references / Derived calculations / Structure summary カテゴリ : atom_site / chem_comp ... atom_site / chem_comp / entity / pdbx_branch_scheme / pdbx_chem_comp_identifier / pdbx_entity_branch / pdbx_entity_branch_descriptor / pdbx_entity_branch_link / pdbx_entity_branch_list / pdbx_entity_nonpoly / pdbx_nonpoly_scheme / pdbx_struct_assembly_gen / pdbx_struct_conn_angle / struct_asym / struct_conn / struct_ref_seq_dif / struct_site / struct_site_gen Item : _atom_site.B_iso_or_equiv / _atom_site.Cartn_x ... _atom_site.B_iso_or_equiv / _atom_site.Cartn_x / _atom_site.Cartn_y / _atom_site.Cartn_z / _atom_site.auth_asym_id / _atom_site.auth_atom_id / _atom_site.auth_comp_id / _atom_site.auth_seq_id / _atom_site.label_asym_id / _atom_site.label_atom_id / _atom_site.label_comp_id / _atom_site.label_entity_id / _atom_site.occupancy / _atom_site.type_symbol / _chem_comp.name / _chem_comp.type / _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.value / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag / _struct_conn.pdbx_role / _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr1_label_seq_id / _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_conn.ptnr2_label_atom_id / _struct_conn.ptnr2_label_comp_id / _struct_conn.ptnr2_label_seq_id / _struct_ref_seq_dif.details 解説 : Carbohydrate remediation / Provider : repository / タイプ : Remediation改定 2.1 2024年4月3日 Group : Data collection / Database references ... Data collection / Database references / Refinement description / Structure summary カテゴリ : chem_comp / chem_comp_atom ... chem_comp / chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model Item : _chem_comp.pdbx_synonyms / _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession
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