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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1f9u | ||||||
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タイトル | CRYSTAL STRUCTURES OF MUTANTS REVEAL A SIGNALLING PATHWAY FOR ACTIVATION OF THE KINESIN MOTOR ATPASE | ||||||
![]() | KINESIN-LIKE PROTEIN KAR3 | ||||||
![]() | CONTRACTILE PROTEIN / Kar3 / Kinesin-related protein / motor protein / microtubule binding protein | ||||||
機能・相同性 | ![]() minus-end-directed kinesin ATPase / microtubule bundle formation involved in mitotic spindle midzone assembly / nuclear migration involved in conjugation with cellular fusion / protein transport along microtubule to mitotic spindle pole body / karyogamy involved in conjugation with cellular fusion / minus-end-directed microtubule motor activity / spindle pole body / mitotic sister chromatid cohesion / cytoplasmic microtubule / regulation of mitotic spindle organization ...minus-end-directed kinesin ATPase / microtubule bundle formation involved in mitotic spindle midzone assembly / nuclear migration involved in conjugation with cellular fusion / protein transport along microtubule to mitotic spindle pole body / karyogamy involved in conjugation with cellular fusion / minus-end-directed microtubule motor activity / spindle pole body / mitotic sister chromatid cohesion / cytoplasmic microtubule / regulation of mitotic spindle organization / isomerase activity / meiotic cell cycle / spindle pole / chromosome / mitotic cell cycle / microtubule binding / microtubule / cell division / ATP hydrolysis activity / ATP binding / nucleus 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | ![]() ![]() | ||||||
![]() | Yun, M. / Zhang, X. / Park, C.G. / Park, H.W. / Endow, S.A. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: A structural pathway for activation of the kinesin motor ATPase. 著者: Yun, M. / Zhang, X. / Park, C.G. / Park, H.W. / Endow, S.A. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 81 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 58.3 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 765 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 774.6 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 16.6 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 23.5 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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単位格子 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 38978.809 Da / 分子数: 1 / 断片: N650K MUTANT MOTOR DOMAIN / 変異: L383M, N650K / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) ![]() ![]() 解説: SACCHAROMYCES CEREVISIAE / プラスミド: PMW174 / 発現宿主: ![]() ![]() |
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#2: 化合物 | ChemComp-MG / |
#3: 化合物 | ChemComp-ADP / |
#4: 水 | ChemComp-HOH / |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 1.99 Å3/Da / 溶媒含有率: 38.21 % | ||||||||||||||||||||||||||||||
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結晶化 | 温度: 291 K / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 / pH: 7 詳細: HEPES, PEG 2000 ME, Ethylen Glycol, magnesium chloride, Sodium chloride, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K | ||||||||||||||||||||||||||||||
結晶化 | *PLUS 温度: 18 ℃ / PH range low: 8 / PH range high: 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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-データ収集
回折 | 平均測定温度: 100 K |
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放射光源 | 由来: ![]() ![]() ![]() |
検出器 | 検出器: CCD / 日付: 2000年4月21日 |
放射 | プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 0.9795 Å / 相対比: 1 |
反射 | 解像度: 1.7→20 Å / Num. all: 31822 / Num. obs: 31822 / % possible obs: 93.5 % / Observed criterion σ(I): -3 / 冗長度: 9.72 % / Rmerge(I) obs: 0.069 / Net I/σ(I): 17.5 |
反射 シェル | 解像度: 1.7→1.73 Å / 冗長度: 2.95 % / Num. unique all: 1519 / % possible all: 89.5 |
反射 | *PLUS Num. measured all: 309408 |
反射 シェル | *PLUS % possible obs: 89.5 % |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 解像度: 1.7→20 Å / σ(F): 2
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 1.7→20 Å
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拘束条件 |
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ソフトウェア | *PLUS 名称: ![]() | |||||||||||||||||||||||||
精密化 | *PLUS 最高解像度: 1.7 Å / 最低解像度: 20 Å / σ(F): 2 / % reflection Rfree: 10 % / Rfactor obs: 0.217 | |||||||||||||||||||||||||
溶媒の処理 | *PLUS | |||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | *PLUS |