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-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1eky | ||||||
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タイトル | MODEL STRUCTURE FROM NON-NOE BASED NMR STRUCTURE CALCULATION | ||||||
要素 | CYTOCHROME C' | ||||||
キーワード | OXYGEN STORAGE/TRANSPORT / four helix bundle / OXYGEN STORAGE-TRANSPORT COMPLEX | ||||||
機能・相同性 | 機能・相同性情報 electron transport chain / periplasmic space / electron transfer activity / iron ion binding / heme binding 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | Rhodobacter capsulatus (バクテリア) | ||||||
手法 | 溶液NMR / in-house modification of discover code | ||||||
データ登録者 | Hus, J.C. / Marion, D. / Blackledge, M. | ||||||
引用 | ジャーナル: J.Mol.Biol. / 年: 2000 タイトル: De novo determination of protein structure by NMR using orientational and long-range order restraints. 著者: Hus, J.C. / Marion, D. / Blackledge, M. | ||||||
履歴 |
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-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 1eky.cif.gz | 632 KB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
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PDB形式 | pdb1eky.ent.gz | 478.7 KB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 1eky.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
文書・要旨 | 1eky_validation.pdf.gz | 364.2 KB | 表示 | wwPDB検証レポート |
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文書・詳細版 | 1eky_full_validation.pdf.gz | 585.2 KB | 表示 | |
XML形式データ | 1eky_validation.xml.gz | 56.3 KB | 表示 | |
CIF形式データ | 1eky_validation.cif.gz | 98.8 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/ek/1eky ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/ek/1eky | HTTPS FTP |
-関連構造データ
関連構造データ | |
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類似構造データ |
-リンク
-集合体
登録構造単位 |
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1 |
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NMR アンサンブル |
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-要素
#1: タンパク質 | 分子量: 13154.733 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Rhodobacter capsulatus (バクテリア) / 株: M110 / 参照: UniProt: P00147 |
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#2: 化合物 | ChemComp-HEM / |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR |
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-試料調製
詳細 | 内容: 7mM Cyt c', 15N, 100mM PO4 pH6 / 溶媒系: 90% H20 10% D20 |
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試料状態 | イオン強度: 100mM / pH: 6 / 圧: ambient / 温度: 293 K |
結晶化 | *PLUS 手法: other / 詳細: NMR |
-NMR測定
NMRスペクトロメーター | タイプ: Varian INOVA / 製造業者: Varian / モデル: INOVA / 磁場強度: 600 MHz |
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-解析
NMR software |
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精密化 | 手法: in-house modification of discover code / ソフトェア番号: 1 | ||||||||||||
代表構造 | 選択基準: lowest energy | ||||||||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: structures with the lowest energy 計算したコンフォーマーの数: 300 / 登録したコンフォーマーの数: 32 |