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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1ecp | ||||||
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タイトル | PURINE NUCLEOSIDE PHOSPHORYLASE | ||||||
![]() | PURINE NUCLEOSIDE PHOSPHORYLASE | ||||||
![]() | PENTOSYLTRANSFERASE / PURINE NUCLEOSIDE PHOSPHORYLASE / GLYCOSYLTRANSFERASE | ||||||
機能・相同性 | ![]() purine nucleoside interconversion / guanosine phosphorylase activity / purine-nucleoside phosphorylase / purine nucleoside catabolic process / purine-nucleoside phosphorylase activity / DNA damage response / identical protein binding / membrane / cytosol 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | ![]() | ||||||
![]() | Mao, C. / Ealick, S.E. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: The crystal structure of Escherichia coli purine nucleoside phosphorylase: a comparison with the human enzyme reveals a conserved topology. 著者: Mao, C. / Cook, W.J. / Zhou, M. / Koszalka, G.W. / Krenitsky, T.A. / Ealick, S.E. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 271.4 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 221.7 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
類似構造データ |
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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単位格子 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 25850.748 Da / 分子数: 6 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() ![]() ![]() ![]() #2: 水 | ChemComp-HOH / | 由来についての詳細 | MOLECULE_NAME: PURINE NUCLEOSIDE PHOSPHORYLASE. THE PROTEIN WAS PURCHASED FROM SIGMA CO. THE ...MOLECULE_NAME: PURINE NUCLEOSIDE | |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.21 Å3/Da / 溶媒含有率: 44.38 % | |||||||||||||||
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結晶 | *PLUS 溶媒含有率: 45 % | |||||||||||||||
結晶化 | *PLUS 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 / PH range low: 5 / PH range high: 4.8 | |||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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-データ収集
放射光源 | 波長: 1.5418 |
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検出器 | タイプ: XUONG-HAMLIN MULTIWIRE MARK II / 検出器: AREA DETECTOR |
放射 | 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 1.5418 Å / 相対比: 1 |
反射 | Num. obs: 71593 / % possible obs: 70 % / Observed criterion σ(I): 1 / 冗長度: 3.26 % / Rmerge(I) obs: 0.0875 |
反射 | *PLUS 最高解像度: 2 Å / Num. obs: 70600 / Num. measured all: 230200 / Rmerge(I) obs: 0.087 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 解像度: 2→15 Å / σ(F): 2 /
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2→15 Å
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拘束条件 |
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精密化 | *PLUS 最低解像度: 8 Å | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶媒の処理 | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
拘束条件 | *PLUS
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