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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1eag | ||||||
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タイトル | Secreted aspartic proteinase (SAP2) from Candida albicans complexed with A70450 | ||||||
![]() | ASPARTIC PROTEINASE (SAP2 GENE PRODUCT) | ||||||
![]() | HYDROLASE/HYDROLASE INHIBITOR / SAP2 / CANDIDA ALBICANS / HYDROLASE-HYDROLASE INHIBITOR COMPLEX / ASPARTIC PROTEASE | ||||||
機能・相同性 | ![]() : / : / protein catabolic process => GO:0030163 / candidapepsin / signal peptide processing / : / fungal-type cell wall organization / adhesion of symbiont to host / fungal-type cell wall / protein metabolic process ...: / : / protein catabolic process => GO:0030163 / candidapepsin / signal peptide processing / : / fungal-type cell wall organization / adhesion of symbiont to host / fungal-type cell wall / protein metabolic process / protein catabolic process / extracellular vesicle / aspartic-type endopeptidase activity / proteolysis / extracellular region / metal ion binding 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() | ||||||
手法 | ![]() | ||||||
![]() | Cutfield, J.F. / Cutfield, S.M. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: The crystal structure of a major secreted aspartic proteinase from Candida albicans in complexes with two inhibitors. 著者: Cutfield, S.M. / Dodson, E.J. / Anderson, B.F. / Moody, P.C.E. / Marshall, C.J. / Sullivan, P.A. / Cutfield, J.F. #1: ![]() タイトル: Crystallization of Inhibited Aspartic Proteinase from Candida Albicans 著者: Cutfield, S. / Marshall, C. / Moody, P. / Sullivan, P. / Cutfield, J. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 75.2 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 60.1 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 460 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 472.2 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 9.8 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 14.7 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 | ![]()
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単位格子 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 36357.723 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) ![]() 参照: UniProt: P28871, UniProt: P0CS83*PLUS, candidapepsin |
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#2: 化合物 | ChemComp-A70 / |
#3: 水 | ChemComp-HOH / |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.52 Å3/Da / 溶媒含有率: 50 % | ||||||||||||||||||||||||||||||
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結晶化 | *PLUS 温度: 20 ℃ / pH: 6.2 / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 / 詳細: Cutfield, S., (1993) J.Mol.Biol., 234, 1266. | ||||||||||||||||||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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-データ収集
放射光源 | 波長: 1.5418 |
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検出器 | タイプ: RIGAKU RAXIS IIC / 検出器: IMAGE PLATE / 日付: 1993 |
放射 | 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 1.5418 Å / 相対比: 1 |
反射 | Num. obs: 24302 / % possible obs: 98 % / 冗長度: 7.5 % / Rmerge(I) obs: 0.072 |
反射 | *PLUS 最高解像度: 2.05 Å |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 解像度: 2.1→8 Å / σ(F): 0 詳細: LOOP RESIDUES A 284, A 285, AND A 286 HAVE WEAK, DISORDERED DENSITY AND THEIR COORDINATES HAVE BEEN OMITTED.
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原子変位パラメータ | Biso mean: 32.4 Å2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2.1→8 Å
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拘束条件 |
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ソフトウェア | *PLUS 名称: PROLSQ / 分類: refinement | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化 | *PLUS Rfactor obs: 0.195 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶媒の処理 | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | *PLUS |