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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1e1m | ||||||
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タイトル | ADRENODOXIN REDUCTASE in complex with NADPH obtained by a soaking experiment | ||||||
![]() | ADRENODOXIN REDUCTASE | ||||||
![]() | OXIDOREDUCTASE / NADPH / FLAVOENZYME / ELECTRON TRANSFERASE | ||||||
機能・相同性 | ![]() adrenodoxin-NADP+ reductase / NADPH-adrenodoxin reductase activity / ubiquinone biosynthetic process / steroid biosynthetic process / cholesterol metabolic process / electron transport chain / NADP binding / flavin adenine dinucleotide binding / mitochondrial inner membrane / mitochondrion 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | ![]() ![]() ![]() | ||||||
![]() | Ziegler, G.A. / Schulz, G.E. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Crystal Structures of Adrenodoxin Reductase in Complex with Nadp+ and Nadph Suggesting a Mechanism for the Electron Transfer of an Enzyme Family 著者: Ziegler, G.A. / Schulz, G.E. #1: ![]() タイトル: The Structure of Adrenodoxin Reductase of Mitochondrial P450 Systems: Electron Transfer for Steroid Biosynthesis 著者: Ziegler, G.A. / Vonrhein, C. / Hanukoglu, I. / Schulz, G.E. #2: ジャーナル: FEBS Lett. / 年: 1999 タイトル: Chaperone-Assisted Expression of Authentic Bovine Adrenodoxin Reductase in Escherichia Coli 著者: Vonrhein, C. / Schmidt, U. / Ziegler, G.A. / Schweiger, S. / Hanukoglu, I. / Schulz, G.E. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 113.9 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 84.8 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 1013.5 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 1 MB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 24.2 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 35.8 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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単位格子 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 50360.410 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() ![]() ![]() ![]() |
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#2: 化合物 | ChemComp-FAD / |
#3: 化合物 | ChemComp-NAP / |
#4: 水 | ChemComp-HOH / |
配列の詳細 | FIRST 32 RESIDUES OF SWISS-PROT SEQUENCE REFER TO A MITOCHONDRIAL LEADER SEQUENCE THAT WAS DELETED ...FIRST 32 RESIDUES OF SWISS-PROT SEQUENCE REFER TO A MITOCHONDR |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.87 Å3/Da / 溶媒含有率: 57.19 % | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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結晶化 | pH: 6.5 / 詳細: pH 6.50 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
結晶化 | *PLUS 温度: 20 ℃ / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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-データ収集
回折 | 平均測定温度: 100 K |
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放射光源 | 由来: ![]() ![]() ![]() |
検出器 | 日付: 1999年4月15日 |
放射 | プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 0.847 Å / 相対比: 1 |
反射 | 解像度: 1.85→18 Å / Num. obs: 47207 / % possible obs: 96.3 % / 冗長度: 3.2 % / Biso Wilson estimate: 18.8 Å2 / Rmerge(I) obs: 0.053 / Rsym value: 0.044 / Net I/σ(I): 12.3 |
反射 シェル | 解像度: 1.85→1.95 Å / 冗長度: 2.9 % / Rmerge(I) obs: 0.18 / Mean I/σ(I) obs: 5 / Rsym value: 0.15 / % possible all: 96.3 |
反射 | *PLUS Num. obs: 47193 / % possible obs: 96 % / Rmerge(I) obs: 0.044 |
反射 シェル | *PLUS % possible obs: 91 % / Rmerge(I) obs: 0.15 |
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解析
ソフトウェア | 名称: REFMAC / 分類: 精密化 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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精密化 | 構造決定の手法: ![]() 開始モデル: 1CJC 解像度: 1.85→18 Å / σ(F): 0
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原子変位パラメータ | Biso mean: 23.4 Å2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 1.85→18 Å
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拘束条件 |
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精密化 | *PLUS | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶媒の処理 | *PLUS | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | *PLUS Biso mean: 23 Å2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
拘束条件 | *PLUS
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