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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1cof | ||||||
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タイトル | YEAST COFILIN, ORTHORHOMBIC CRYSTAL FORM | ||||||
![]() | COFILIN | ||||||
![]() | ACTIN-BINDING PROTEIN / ACTIN-BINDING / CYTOSKELETON | ||||||
機能・相同性 | ![]() actin filament fragmentation / actin cortical patch / actin filament severing / Golgi to plasma membrane protein transport / actin filament depolymerization / actin filament organization / nuclear matrix / endocytosis / actin filament binding / actin cytoskeleton ...actin filament fragmentation / actin cortical patch / actin filament severing / Golgi to plasma membrane protein transport / actin filament depolymerization / actin filament organization / nuclear matrix / endocytosis / actin filament binding / actin cytoskeleton / plasma membrane / cytoplasm 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | ![]() ![]() | ||||||
![]() | Fedorov, A.A. / Lappalainen, P. / Fedorov, E.V. / Drubin, D.G. / Almo, S.C. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Structure determination of yeast cofilin. 著者: Fedorov, A.A. / Lappalainen, P. / Fedorov, E.V. / Drubin, D.G. / Almo, S.C. #1: ![]() タイトル: The Adf/Cofilin Proteins: Stimulus-Responsive Modulators of Actin Dynamics 著者: Moon, A. / Drubin, D.G. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 37.8 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 26.1 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 363.1 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 364.1 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 4 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 5.8 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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単位格子 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 15919.742 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) ![]() ![]() 発現宿主: ![]() ![]() |
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#2: 水 | ChemComp-HOH / |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 1.97 Å3/Da / 溶媒含有率: 38 % |
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結晶化 | pH: 7.2 / 詳細: CRYSTALLIZED FROM 25% PEG 4000 SOLUTION., pH 7.2 |
結晶化 | *PLUS 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 / PH range low: 7.5 / PH range high: 7 |
溶液の組成 | *PLUS 濃度: 20-30 % / 一般名: PEG4000 |
-データ収集
回折 | 平均測定温度: 290 K |
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放射光源 | 由来: ![]() |
検出器 | タイプ: SIEMENS / 検出器: AREA DETECTOR / 日付: 1995 |
放射 | モノクロメーター: GRAPHITE(002) / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 1.5418 Å / 相対比: 1 |
反射 | 解像度: 2.3→26.2 Å / Num. obs: 6330 / % possible obs: 87.5 % / Observed criterion σ(I): 2 / 冗長度: 2.33 % / Rmerge(I) obs: 0.049 / Net I/σ(I): 18.5 |
反射 | *PLUS Rmerge(I) obs: 0.067 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 構造決定の手法: ![]() 詳細: N-TERMINAL RESIDUES 1 - 5 AND C-TERMINAL RESIDUES 141 - 143 ARE NOT VISIBLE IN THE MAPS. LOOP 73 - 78 HAS WEAK ELECTRON DENSITY.
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原子変位パラメータ | Biso mean: 25.2 Å2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Refine analyze | Luzzati coordinate error obs: 0.23 Å | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2.3→8 Å
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拘束条件 |
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Xplor file |
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ソフトウェア | *PLUS 名称: PROFFT / 分類: refinement | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
拘束条件 | *PLUS
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