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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1chp | ||||||
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タイトル | SURPRISING LEADS FOR A CHOLERA TOXIN RECEPTOR BINDING ANTAGONIST; CRYSTALLOGRAPHIC STUDIES OF CTB MUTANTS | ||||||
![]() | CHOLERA TOXIN B PENTAMER | ||||||
![]() | TOXIN | ||||||
機能・相同性 | ![]() host cell surface binding / galactose binding / catalytic complex / positive regulation of tyrosine phosphorylation of STAT protein / toxin activity / periplasmic space / host cell plasma membrane / extracellular region / membrane 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | ![]() | ||||||
![]() | Merritt, E.A. / Hol, W.G.J. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Surprising leads for a cholera toxin receptor-binding antagonist: crystallographic studies of CTB mutants. 著者: Merritt, E.A. / Sarfaty, S. / Chang, T.T. / Palmer, L.M. / Jobling, M.G. / Holmes, R.K. / Hol, W.G. #1: ![]() タイトル: 2.2 Angstroms Crystal Structure of Cholera Toxin B5 Pentamer Bound to Receptor GM1 Pentasaccharide 著者: Merritt, E.A. / Sarfaty, S. / Van Den Akker, F. / L'Hoir, C. / Martial, J.A. / Hol, W.G.J. #2: ![]() タイトル: Analysis of Structure and Function of the B Subunit of Cholera Toxin by the Use of Site-Directed Mutagenesis 著者: Jobling, M.G. / Holmes, R.K. | ||||||
履歴 |
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Remark 700 | SHEET IN THE PENTAMER THE BETA SHEETS FROM ADJACENT MONOMERS COMBINE TO FORM A CONTINUOUS SIX- ...SHEET IN THE PENTAMER THE BETA SHEETS FROM ADJACENT MONOMERS COMBINE TO FORM A CONTINUOUS SIX-STRANDED ANTI-PARALLEL SHEET ACROSS EACH MONOMER-MONOMER INTERFACE. |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 110.8 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 92.2 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 444 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 451.5 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 23.4 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 32.8 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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単位格子 |
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Atom site foot note | 1: CIS PROLINE - PRO D 93 / 2: CIS PROLINE - PRO E 93 / 3: CIS PROLINE - PRO F 93 / 4: CIS PROLINE - PRO G 93 / 5: CIS PROLINE - PRO H 93 | ||||||||
詳細 | CHOLERA TOXIN IS AN AB5 HEXAMER. THE B-PENTAMER OF CHOLERA TOXIN IS RESPONSIBLE FOR RECEPTOR RECOGNITION AND BINDING. |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 11681.303 Da / 分子数: 5 / 変異: G33D / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() ![]() ![]() ![]() #2: 化合物 | ChemComp-CL / | #3: 水 | ChemComp-HOH / | 構成要素の詳細 | THE FIVE IDENTICAL B SUBUNITS ARE LABELLED AS CHAINS D, E, F, G, AND H CORRESPONDING TO CHAIN ...THE FIVE IDENTICAL B SUBUNITS ARE LABELLED AS CHAINS D, E, F, G, AND H CORRESPOND | |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.18 Å3/Da / 溶媒含有率: 43.62 % | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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結晶化 | pH: 7.5 / 詳細: pH 7.5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
結晶化 | *PLUS 手法: 蒸気拡散法, シッティングドロップ法 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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-データ収集
放射光源 | 波長: 1.54 |
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検出器 | タイプ: SIEMENS X1000 / 検出器: AREA DETECTOR / 日付: 1994年7月14日 |
放射 | 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 1.54 Å / 相対比: 1 |
反射 | Num. obs: 32710 / % possible obs: 99 % / Observed criterion σ(I): 0 / 冗長度: 2.85 % / Rmerge(I) obs: 0.081 |
反射 | *PLUS 最高解像度: 2 Å / Rmerge(I) obs: 0.081 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 解像度: 2→12 Å / σ(F): 3 /
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原子変位パラメータ | Biso mean: 21.5 Å2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2→12 Å
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拘束条件 |
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ソフトウェア | *PLUS 名称: ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化 | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶媒の処理 | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | *PLUS |