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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1bzf | ||||||
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タイトル | NMR SOLUTION STRUCTURE AND DYNAMICS OF THE COMPLEX OF LACTOBACILLUS CASEI DIHYDROFOLATE REDUCTASE WITH THE NEW LIPOPHILIC ANTIFOLATE DRUG TRIMETREXATE, 22 STRUCTURES | ||||||
![]() | DIHYDROFOLATE REDUCTASE | ||||||
![]() | OXIDOREDUCTASE / INHIBITOR-ENZYME COMPLEX | ||||||
機能・相同性 | ![]() response to methotrexate / dihydrofolate metabolic process / glycine biosynthetic process / dihydrofolate reductase / dihydrofolate reductase activity / folic acid metabolic process / tetrahydrofolate biosynthetic process / one-carbon metabolic process / NADP binding / response to antibiotic / cytosol 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() | ||||||
手法 | 溶液NMR / simulated annealing | ||||||
![]() | Polshakov, V.I. / Birdsall, B. / Frenkiel, T.A. / Gargaro, A.R. / Feeney, J. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Structure and dynamics in solution of the complex of Lactobacillus casei dihydrofolate reductase with the new lipophilic antifolate drug trimetrexate. 著者: Polshakov, V.I. / Birdsall, B. / Frenkiel, T.A. / Gargaro, A.R. / Feeney, J. #1: ![]() タイトル: The Solution Structure of the Complex of Lactobacillus Casei Dihydrofolate Reductase with Methotrexate 著者: Gargaro, A.R. / Soteriou, A. / Frenkiel, T.A. / Bauer, C.J. / Birdsall, B. / Polshakov, V.I. / Barsukov, I.L. / Roberts, G.C. / Feeney, J. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 1.1 MB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 929.3 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 428.3 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 549.3 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 78.9 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 88.6 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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NMR アンサンブル |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 18331.594 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) ![]() プラスミド: PMT702 / 発現宿主: ![]() ![]() |
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#2: 化合物 | ChemComp-TMQ / |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NMR実験 |
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試料調製
詳細 | 内容: 90% H2O/10% D2O, 100% D2O |
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試料状態 | イオン強度: 550 mM / pH: 6.5 / 圧: 1 atm / 温度: 308 K |
結晶化 | *PLUS 手法: other / 詳細: NMR |
-NMR測定
NMRスペクトロメーター | タイプ: Varian UNITY / 製造業者: Varian / モデル: UNITY / 磁場強度: 600 MHz |
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解析
ソフトウェア |
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NMR software |
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精密化 | 手法: simulated annealing / ソフトェア番号: 1 | |||||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: NO NOE VIOLATION MORE THAN 0.1 ANGSTROM; NO DIHEDRAL ANGLE VIOLATION MORE THAN 3 DEGREES 計算したコンフォーマーの数: 22 / 登録したコンフォーマーの数: 22 |