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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1bgu | ||||||
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タイトル | CRYSTAL STRUCTURE OF THE DNA MODIFYING ENZYME BETA-GLUCOSYLTRANSFERASE IN THE PRESENCE AND ABSENCE OF THE SUBSTRATE URIDINE DIPHOSPHOGLUCOSE | ||||||
![]() | BETA-GLUCOSYLTRANSFERASE | ||||||
![]() | TRANSFERASE(GLUCOSYLTRANSFERASE) | ||||||
機能・相同性 | DNA beta-glucosyltransferase / DNA beta-glucosyltransferase activity / DNA beta-glucosyltransferase, bacteriophage / Bacteriophage T4 beta-glucosyltransferase / symbiont-mediated evasion of host restriction-modification system / DNA modification / virus-mediated perturbation of host defense response / URIDINE-5'-DIPHOSPHATE / DNA beta-glucosyltransferase![]() | ||||||
生物種 | ![]() | ||||||
手法 | ![]() | ||||||
![]() | Vrielink, A. / Rueger, W. / Driessen, H.P.C. / Freemont, P.S. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Crystal structure of the DNA modifying enzyme beta-glucosyltransferase in the presence and absence of the substrate uridine diphosphoglucose. 著者: Vrielink, A. / Ruger, W. / Driessen, H.P. / Freemont, P.S. #1: ![]() タイトル: Crystallization and Preliminary X-Ray Studies of T4 Phage Beta-Glucosyltransferase 著者: Freemont, P.S. / Rueger, W. #2: ![]() タイトル: T4-Induced Alpha-and Beta-Glucosyltransferase: Cloning of the Genes and a Comparison of Their Products Based on Sequencing Data 著者: Tomaschewski, J. / Gram, H. / Crabb, J.W. / Ruger, W. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 24.7 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 12.4 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 404.3 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 404.5 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 1.4 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 4.7 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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単位格子 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 40719.879 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) ![]() 属: T4-like viruses / 生物種: Enterobacteria phage T4 sensu lato / 参照: UniProt: P04547, DNA beta-glucosyltransferase |
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#2: 化合物 | ChemComp-UDP / |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.57 Å3/Da / 溶媒含有率: 52.14 % |
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結晶化 | *PLUS 手法: unknown詳細: This particular structure is not described in this paper. |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 解像度: 2.2→10 Å / σ(F): 0 詳細: THE COORDINATES ARE PRESENTED IN A COORDINATE FRAME THAT IS TRANSLATED BY 1/4*151.920 ALONG A AND 1/4*52.26 ALONG B. THUS THE TRANSFORMATION PRESENTED ON *SCALE* RECORDS BELOW IS NOT THE ...詳細: THE COORDINATES ARE PRESENTED IN A COORDINATE FRAME THAT IS TRANSLATED BY 1/4*151.920 ALONG A AND 1/4*52.26 ALONG B. THUS THE TRANSFORMATION PRESENTED ON *SCALE* RECORDS BELOW IS NOT THE DEFAULT. THE DICTIONARY FOR THE UDP PORTION OF THE SUBSTRATE WAS BUILT USING THE CHARM MINIMIZATION WITHIN QUANTA.
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2.2→10 Å
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拘束条件 |
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