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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1bgs | ||||||
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タイトル | RECOGNITION BETWEEN A BACTERIAL RIBONUCLEASE, BARNASE, AND ITS NATURAL INHIBITOR, BARSTAR | ||||||
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![]() | ENDONUCLEASE | ||||||
機能・相同性 | ![]() 加水分解酵素; エステル加水分解酵素; 3'-リン酸モノエステル産生エンドリボヌクレアーゼ / RNA endonuclease activity / RNA binding / extracellular region / cytoplasm 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | ![]() | ||||||
![]() | Guillet, V. / Lapthorn, A. / Mauguen, Y. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Recognition between a bacterial ribonuclease, barnase, and its natural inhibitor, barstar. 著者: Guillet, V. / Lapthorn, A. / Hartley, R.W. / Mauguen, Y. #1: ![]() タイトル: Crystallization and Preliminary X-Ray Investigation of Barstar, the Intracellular Inhibitor of Barnase 著者: Guillet, V. / Lapthorn, A. / Fourniat, J. / Benoit, J.P. / Hartley, R.W. / Mauguen, Y. #2: ![]() タイトル: Three-Dimensional Structure of Barnase-3'Gmp Complex at 2.2 Angstroms Resolution 著者: Guillet, V. / Lapthorn, A. / Mauguen, Y. #3: ![]() タイトル: Crystal Structure of a Barnase-D(Gpc) Complex at 1.9 Angstroms Resolution 著者: Baudet, S. / Janin, J. #4: ![]() タイトル: Molecular Structure of a New Family of Ribonucleases 著者: Mauguen, Y. / Hartley, R.W. / Dodson, E.J. / Dodson, G.G. / Bricogne, G. / Chothia, C. / Jack, A. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 129.1 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 102.3 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 401.3 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 418.1 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 13.3 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 22.2 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 | ![]()
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2 | ![]()
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3 | ![]()
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単位格子 |
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Atom site foot note | 1: CIS PROLINE - PRO E 48 / 2: CIS PROLINE - PRO F 48 / 3: CIS PROLINE - PRO G 48 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 12398.721 Da / 分子数: 3 / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) ![]() ![]() 発現宿主: ![]() ![]() 参照: UniProt: P00648, 加水分解酵素; エステル加水分解酵素; 3'-リン酸モノエステル産生エンドリボヌクレアーゼ #2: タンパク質 | 分子量: 10157.412 Da / 分子数: 3 / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) ![]() ![]() 発現宿主: ![]() ![]() #3: 水 | ChemComp-HOH / | |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.66 Å3/Da / 溶媒含有率: 53.76 % | |||||||||||||||
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結晶化 | *PLUS 手法: other | |||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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-データ収集
放射 | 散乱光タイプ: x-ray |
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放射波長 | 相対比: 1 |
反射 | *PLUS 最高解像度: 2.6 Å / Num. obs: 22051 / % possible obs: 98.8 % / Num. measured all: 77876 / Rmerge(I) obs: 0.072 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | Rfactor Rwork: 0.17 / Rfactor obs: 0.17 / 最高解像度: 2.6 Å | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化ステップ | サイクル: LAST / 最高解像度: 2.6 Å
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拘束条件 |
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ソフトウェア | *PLUS 名称: ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化 | *PLUS 最低解像度: 8 Å / Rfactor obs: 0.17 / Rfactor Rwork: 0.17 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶媒の処理 | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
拘束条件 | *PLUS
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LS精密化 シェル | *PLUS 最高解像度: 2.6 Å / 最低解像度: 2.71 Å / Rfactor Rfree: 0.32 / Total num. of bins used: 8 / Rfactor obs: 0.206 |