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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1bep | ||||||
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タイトル | EFFECT OF UNNATURAL HEME SUBSTITUTION ON KINETICS OF ELECTRON TRANSFER IN CYTOCHROME C PEROXIDASE | ||||||
![]() | YEAST CYTOCHROME C PEROXIDASE | ||||||
![]() | PEROXIDASE / OXIDOREDUCTASE | ||||||
機能・相同性 | ![]() cytochrome-c peroxidase / cytochrome-c peroxidase activity / response to reactive oxygen species / hydrogen peroxide catabolic process / mitochondrial intermembrane space / peroxidase activity / cellular response to oxidative stress / mitochondrial matrix / heme binding / mitochondrion / metal ion binding 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | ![]() | ||||||
![]() | Miller, M. / Kraut, J. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Effect of Unnatural Heme Substitution on Kinetics of Electron Transfer in Cytochrome C Peroxidase 著者: Miller, M.A. / Millett, F. / Durham, B. / Mei, H.K. / Ashford, V.A. / Xuong, N.-H. / Kraut, J. #1: ![]() タイトル: X-Ray Structures of Recombinant Yeast Cytochrome C Peroxidase and Three Heme-Cleft Mutants Prepared by Site-Directed Mutagenesis 著者: Wang, J.M. / Mauro, M. / Edwards, S.L. / Oatley, S.J. / Fishel, L.A. / Ashford, V.A. / Xuong, N.H. / Kraut, J. #2: ![]() タイトル: Crystal Structure of Yeast Cytochrome C Peroxidase Refined at 1.7-A Resolution 著者: Finzel, B.C. / Poulos, T.L. / Kraut, J. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 77 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 55.9 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 476.8 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 486.4 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 8.8 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 13.6 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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単位格子 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 33226.922 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 詳細: THE NATURALLY OCCURRING PROTOHEME REPLACED BY CHLOROCRUOROHEME 2-CHO, 4CH=CH2 PORPHYRIN 由来: (組換発現) ![]() ![]() プラスミド: PUC18CCPMI / 発現宿主: ![]() ![]() |
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#2: 化合物 | ChemComp-CCH / [ |
#3: 水 | ChemComp-HOH / |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.67 Å3/Da / 溶媒含有率: 54 % |
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結晶化 | pH: 6 / 詳細: 30% MPD; 50 MM POTASSIUM PHOSPHATE, PH 6.0 |
-データ収集
回折 | 平均測定温度: 273 K |
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放射光源 | 由来: ![]() |
検出器 | 検出器: AREA DETECTOR / 日付: 1997年6月1日 |
放射 | 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 1.5418 Å / 相対比: 1 |
反射 | 最高解像度: 2.2 Å / Num. obs: 22700 / % possible obs: 95 % / Observed criterion σ(I): 2 / Rsym value: 0.07836 |
反射 シェル | 最高解像度: 2.2 Å / Mean I/σ(I) obs: 2.77 / Rsym value: 0.227 |
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解析
ソフトウェア | 名称: TNT / バージョン: 1 / 分類: 精密化 | ||||||||||||||||||||||||||||||
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精密化 | 解像度: 2.2→20 Å / Isotropic thermal model: TNT BCORREL / 立体化学のターゲット値: TNT PROTGEO /
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2.2→20 Å
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拘束条件 |
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