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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1avu | ||||||
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タイトル | TRYPSIN INHIBITOR FROM SOYBEAN (STI) | ||||||
![]() | TRYPSIN INHIBITOR | ||||||
![]() | SERINE PROTEASE INHIBITOR / TRYPSIN INHIBITOR / KUNITZ-TYPE / BETA-TREFOIL FOLD | ||||||
機能・相同性 | ![]() | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | ![]() ![]() | ||||||
![]() | Song, H.K. / Suh, S.W. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Kunitz-type soybean trypsin inhibitor revisited: refined structure of its complex with porcine trypsin reveals an insight into the interaction between a homologous inhibitor from ...タイトル: Kunitz-type soybean trypsin inhibitor revisited: refined structure of its complex with porcine trypsin reveals an insight into the interaction between a homologous inhibitor from Erythrina caffra and tissue-type plasminogen activator. 著者: Song, H.K. / Suh, S.W. #1: ![]() タイトル: Crystal Structure Analyses of Human A1-Antitrypsin, Soybean Kunitz-Type Trypsin Inhibitor, and Barley Chitinase 著者: Song, H.K. #2: ![]() タイトル: Crystallization of Kunitz-Type Soybean Trypsin Inhibitor 著者: Lee, J.K. / Song, H.K. / Hwang, K.Y. / Kim, K.K. / Suh, S.W. #3: ![]() タイトル: Crystallization and Preliminary X-Ray Crystallographic Study of Kunitz-Type Soybean Trypsin Inhibitor 著者: Lee, J.K. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 42.4 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 32.1 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 416.4 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 420.6 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 9.3 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 11.9 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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単位格子 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 20115.641 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) ![]() ![]() |
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#2: 水 | ChemComp-HOH / |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.75 Å3/Da / 溶媒含有率: 55 % |
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結晶化 | pH: 7.5 / 詳細: pH 7.5 |
結晶化 | *PLUS 手法: other / 詳細: Lee, J., (1993) Mol. Cells, 3, 335. |
-データ収集
回折 | 平均測定温度: 293 K |
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放射光源 | 由来: ![]() |
検出器 | タイプ: ENRAF-NONIUS FAST / 検出器: DIFFRACTOMETER / 日付: 1993年3月1日 |
放射 | モノクロメーター: GRAPHITE(002) / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 1.5418 Å / 相対比: 1 |
反射 | 解像度: 2.1→99 Å / Num. obs: 10234 / % possible obs: 76 % / Observed criterion σ(I): 0.5 / 冗長度: 2.7 % / Rmerge(I) obs: 0.045 |
反射 シェル | 解像度: 2.1→2.3 Å / % possible all: 26.7 |
反射 | *PLUS 最低解像度: 33 Å / Num. measured all: 27868 |
反射 シェル | *PLUS % possible obs: 26.7 % |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 構造決定の手法: ![]() 開始モデル: 1TIE 解像度: 2.3→8 Å / Data cutoff high absF: 0 / Data cutoff low absF: 0 / σ(F): 2
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原子変位パラメータ | Biso mean: 38.3 Å2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Refine analyze | Luzzati d res low obs: 0 Å | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2.3→8 Å
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拘束条件 |
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Xplor file |
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