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基本情報
登録情報 | データベース: EMDB / ID: EMD-6827 | |||||||||||||||
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タイトル | Cryo-EM Structure of the Exocyst Complex | |||||||||||||||
![]() | Cryo-EM map of the yeast Exocyst complex overall structure at 5.5A resolution | |||||||||||||||
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![]() | exocyst / coiled-coil / EXOCYTOSIS | |||||||||||||||
機能・相同性 | ![]() vesicle tethering involved in exocytosis / exocyst assembly / exocyst localization / negative regulation of SNARE complex assembly / endoplasmic reticulum inheritance / exocyst / prospore membrane / Golgi inheritance / incipient cellular bud site / cellular bud tip ...vesicle tethering involved in exocytosis / exocyst assembly / exocyst localization / negative regulation of SNARE complex assembly / endoplasmic reticulum inheritance / exocyst / prospore membrane / Golgi inheritance / incipient cellular bud site / cellular bud tip / Golgi to plasma membrane transport / cellular bud neck / mating projection tip / vesicle docking involved in exocytosis / exocytosis / spliceosomal complex assembly / Rho protein signal transduction / transport vesicle / phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate binding / SNARE binding / cell periphery / intracellular protein transport / protein localization / small GTPase binding / protein transport / plasma membrane / cytoplasm 類似検索 - 分子機能 | |||||||||||||||
生物種 | ![]() ![]() ![]() ![]() | |||||||||||||||
手法 | 単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 4.4 Å | |||||||||||||||
![]() | Mei K / Li Y | |||||||||||||||
資金援助 | ![]() ![]()
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![]() | ![]() タイトル: Cryo-EM structure of the exocyst complex. 著者: Kunrong Mei / Yan Li / Shaoxiao Wang / Guangcan Shao / Jia Wang / Yuehe Ding / Guangzuo Luo / Peng Yue / Jun-Jie Liu / Xinquan Wang / Meng-Qiu Dong / Hong-Wei Wang / Wei Guo / ![]() ![]() 要旨: The exocyst is an evolutionarily conserved octameric protein complex that mediates the tethering of post-Golgi secretory vesicles to the plasma membrane during exocytosis and is implicated in many ...The exocyst is an evolutionarily conserved octameric protein complex that mediates the tethering of post-Golgi secretory vesicles to the plasma membrane during exocytosis and is implicated in many cellular processes such as cell polarization, cytokinesis, ciliogenesis and tumor invasion. Using cryo-EM and chemical cross-linking MS (CXMS), we solved the structure of the Saccharomyces cerevisiae exocyst complex at an average resolution of 4.4 Å. Our model revealed the architecture of the exocyst and led to the identification of the helical bundles that mediate the assembly of the complex at its core. Sequence analysis suggests that these regions are evolutionarily conserved across eukaryotic systems. Additional cell biological data suggest a mechanism for exocyst assembly that leads to vesicle tethering at the plasma membrane. | |||||||||||||||
履歴 |
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構造の表示
ムービー |
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構造ビューア | EMマップ: ![]() ![]() ![]() |
添付画像 |
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ダウンロードとリンク
-EMDBアーカイブ
マップデータ | ![]() | 12.6 MB | ![]() | |
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ヘッダ (付随情報) | ![]() ![]() | 57.7 KB 57.7 KB | 表示 表示 | ![]() |
FSC (解像度算出) | ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() | 12.7 KB 12.7 KB 12.8 KB 12.8 KB 12.7 KB 12.7 KB | 表示 表示 表示 表示 表示 表示 | ![]() |
画像 | ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() | 41.6 KB 41.6 KB 32.4 KB 27.3 KB 30.4 KB 47 KB | ||
マスクデータ | ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() | 178 MB 178 MB 178 MB 178 MB 178 MB | ![]() | |
Filedesc metadata | ![]() | 12.8 KB | ||
その他 | ![]() ![]() ![]() ![]() | 9.8 MB 9.7 MB 14.4 MB 13.7 MB | ||
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 471.5 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 471 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 13.1 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 17.7 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
関連構造データ | ![]() 5yfpMC M: このマップから作成された原子モデル C: 同じ文献を引用 ( |
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類似構造データ | |
電子顕微鏡画像生データ | ![]() Data size: 10.0 TB Data #1: Unaligned multi-frame micrographs of Yeast Exocyst complex [micrographs - multiframe]) |
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リンク
EMDBのページ | ![]() ![]() |
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「今月の分子」の関連する項目 |
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マップ
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注釈 | Cryo-EM map of the yeast Exocyst complex overall structure at 5.5A resolution | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
投影像・断面図 | 画像のコントロール
画像は Spider により作成 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ボクセルのサイズ | X=Y=Z: 1.30654 Å | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
密度 |
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対称性 | 空間群: 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
詳細 | EMDB XML:
CCP4マップ ヘッダ情報:
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-添付データ
-マスク #1
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投影像・断面図 |
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密度ヒストグラム |
-マスク #2
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投影像・断面図 |
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密度ヒストグラム |
-マスク #3
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投影像・断面図 |
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密度ヒストグラム |
-マスク #4
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投影像・断面図 |
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密度ヒストグラム |
-マスク #5
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投影像・断面図 |
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密度ヒストグラム |
-追加マップ: Cryo-EM map of the yeast Exocyst complex head-part...
ファイル | emd_6827_additional_1.map | ||||||||||||
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注釈 | Cryo-EM map of the yeast Exocyst complex head-part structure at 6.7A resolution | ||||||||||||
投影像・断面図 |
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密度ヒストグラム |
-追加マップ: Cryo-EM map of the yeast Exocyst complex top...
ファイル | emd_6827_additional_2.map | ||||||||||||
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注釈 | Cryo-EM map of the yeast Exocyst complex top head-part structure at 6.2A resolution | ||||||||||||
投影像・断面図 |
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密度ヒストグラム |
-追加マップ: Cryo-EM map of the yeast Exocyst complex bottom...
ファイル | emd_6827_additional_3.map | ||||||||||||
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注釈 | Cryo-EM map of the yeast Exocyst complex bottom leg-part structure at 4.6A resolution | ||||||||||||
投影像・断面図 |
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密度ヒストグラム |
-追加マップ: Cryo-EM map of the yeast Exocyst complex body-part...
ファイル | emd_6827_additional_4.map | ||||||||||||
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注釈 | Cryo-EM map of the yeast Exocyst complex body-part structure at 4.4A resolution | ||||||||||||
投影像・断面図 |
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密度ヒストグラム |