[English] 日本語
Yorodumi- PDB-3lk4: Crystal structure of CapZ bound to the uncapping motif from CD2AP -
+Open data
-Basic information
Entry | Database: PDB / ID: 3lk4 | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
Title | Crystal structure of CapZ bound to the uncapping motif from CD2AP | ||||||
Components |
| ||||||
Keywords | PROTEIN BINDING / CapZ / CD2AP / actin filaments / uncapping / actin-filament regulators / protein-protein comple / Actin capping / Actin-binding / Cytoplasm / Cytoskeleton | ||||||
Function / homology | Function and homology information Advanced glycosylation endproduct receptor signaling / RHOD GTPase cycle / RHOF GTPase cycle / HSP90 chaperone cycle for steroid hormone receptors (SHR) in the presence of ligand / COPI-independent Golgi-to-ER retrograde traffic / COPI-mediated anterograde transport / negative regulation of small GTPase mediated signal transduction / Factors involved in megakaryocyte development and platelet production / transforming growth factor beta1 production / WASH complex ...Advanced glycosylation endproduct receptor signaling / RHOD GTPase cycle / RHOF GTPase cycle / HSP90 chaperone cycle for steroid hormone receptors (SHR) in the presence of ligand / COPI-independent Golgi-to-ER retrograde traffic / COPI-mediated anterograde transport / negative regulation of small GTPase mediated signal transduction / Factors involved in megakaryocyte development and platelet production / transforming growth factor beta1 production / WASH complex / sperm connecting piece / F-actin capping protein complex / negative regulation of transforming growth factor beta1 production / negative regulation of filopodium assembly / substrate-dependent cell migration, cell extension / cell junction assembly / barbed-end actin filament capping / actin polymerization or depolymerization / regulation of cell morphogenesis / regulation of lamellipodium assembly / Nephrin family interactions / lamellipodium assembly / cortical cytoskeleton / cell leading edge / filamentous actin / brush border / centriolar satellite / cytoskeleton organization / ruffle / hippocampal mossy fiber to CA3 synapse / actin filament organization / positive regulation of protein secretion / regulation of actin cytoskeleton organization / synapse organization / neuromuscular junction / Schaffer collateral - CA1 synapse / cell morphogenesis / structural constituent of cytoskeleton / fibrillar center / Z disc / SH3 domain binding / positive regulation of protein localization to nucleus / actin filament binding / cell-cell junction / cell migration / actin cytoskeleton / lamellipodium / actin cytoskeleton organization / protein-containing complex assembly / vesicle / postsynaptic density / cadherin binding / cell cycle / axon / cell division / dendrite / signal transduction / extracellular exosome / membrane / identical protein binding / plasma membrane / cytosol / cytoplasm Similarity search - Function | ||||||
Biological species | Gallus gallus (chicken) homo sapiens (human) | ||||||
Method | X-RAY DIFFRACTION / SYNCHROTRON / MOLECULAR REPLACEMENT / Resolution: 1.99 Å | ||||||
Authors | Hernandez-Valladares, M. / Kim, T. / Kannan, B. / Tung, A. / Cooper, J.A. / Robinson, R.C. | ||||||
Citation | Journal: Nat.Struct.Mol.Biol. / Year: 2010 Title: Structural characterization of a capping protein interaction motif defines a family of actin filament regulators. Authors: Hernandez-Valladares, M. / Kim, T. / Kannan, B. / Tung, A. / Aguda, A.H. / Larsson, M. / Cooper, J.A. / Robinson, R.C. | ||||||
History |
|
-Structure visualization
Structure viewer | Molecule: MolmilJmol/JSmol |
---|
-Downloads & links
-Download
PDBx/mmCIF format | 3lk4.cif.gz | 2.5 MB | Display | PDBx/mmCIF format |
---|---|---|---|---|
PDB format | pdb3lk4.ent.gz | 2.1 MB | Display | PDB format |
PDBx/mmJSON format | 3lk4.json.gz | Tree view | PDBx/mmJSON format | |
Others | Other downloads |
-Validation report
Arichive directory | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/lk/3lk4 ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/lk/3lk4 | HTTPS FTP |
---|
-Related structure data
Related structure data | 3lk2SC 3lk3C S: Starting model for refinement C: citing same article (ref.) |
---|---|
Similar structure data |
-Links
-Assembly
Deposited unit |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
1 |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2 |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3 |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
4 |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
5 |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
6 |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
7 |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
8 |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
9 |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
10 |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
11 |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
12 |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Unit cell |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Noncrystallographic symmetry (NCS) | NCS domain:
NCS domain segments:
|