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- EMDB-51104: LSU structure derived from the LSU sample of the mitoribosome fro... -

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基本情報

登録情報
データベース: EMDB / ID: EMD-51104
タイトルLSU structure derived from the LSU sample of the mitoribosome from T. gondii.
マップデータDeepEMhanced map of the LSU structure derived from the LSU sample of the mitoribosome from T. gondii.
試料
  • 複合体: LSU structure derived from the LSU sample of the mitoribosome from T. gondii.
    • タンパク質・ペプチド: x 71種
    • RNA: x 33種
キーワードComplex / translation / rRNA / RIBOSOME
機能・相同性
機能・相同性情報


regulation of mitochondrial mRNA stability / ribonucleoprotein granule / mitochondrial RNA processing / mitochondrial large ribosomal subunit / mitochondrial translation / cyclosporin A binding / peptidylprolyl isomerase / peptidyl-prolyl cis-trans isomerase activity / ubiquitin-protein transferase activity / protein folding ...regulation of mitochondrial mRNA stability / ribonucleoprotein granule / mitochondrial RNA processing / mitochondrial large ribosomal subunit / mitochondrial translation / cyclosporin A binding / peptidylprolyl isomerase / peptidyl-prolyl cis-trans isomerase activity / ubiquitin-protein transferase activity / protein folding / large ribosomal subunit / transferase activity / 5S rRNA binding / large ribosomal subunit rRNA binding / cytosolic large ribosomal subunit / negative regulation of translation / rRNA binding / structural constituent of ribosome / ribosome / translation / mitochondrial matrix / DNA-binding transcription factor activity / ribonucleoprotein complex / mRNA binding / DNA binding / RNA binding / nucleus / membrane / cytoplasm
類似検索 - 分子機能
HECTD4 / : / : / : / Domain of unknown function (DUF6831) / Domain of unknown function (DUF6832) / Apicomplexa microprotein / Apicomplexa microprotein / RAP domain / RAP domain ...HECTD4 / : / : / : / Domain of unknown function (DUF6831) / Domain of unknown function (DUF6832) / Apicomplexa microprotein / Apicomplexa microprotein / RAP domain / RAP domain / RAP domain profile. / RAP / AP2 domain / AP2/ERF domain / : / FAS1 domain / FAS1 domain superfamily / FAS1/BIgH3 domain profile. / Ribosomal protein L37, mitochondrial / Mitochondrial ribosomal protein L37 / Ribosomal protein L49/IMG2 / Mitochondrial large subunit ribosomal protein (Img2) / Ribosomal protein L27/L41, mitochondrial / Mitochondrial ribosomal protein L27 / 39S ribosomal protein L46, mitochondrial / 39S ribosomal protein L43/54S ribosomal protein L51 / Ribosomal protein L47, mitochondrial / MRP-L47 superfamily, mitochondrial / Mitochondrial 39-S ribosomal protein L47 (MRP-L47) / HECT domain / HECT, E3 ligase catalytic domain / HECT-domain (ubiquitin-transferase) / HECT domain profile. / Domain Homologous to E6-AP Carboxyl Terminus with / ANL, N-terminal domain / Cyclophilin-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, conserved site / Cyclophilin-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase signature. / Cyclophilin-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase domain profile. / Cyclophilin-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase domain / Cyclophilin type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase/CLD / Cyclophilin-like domain superfamily / Ribosomal protein/NADH dehydrogenase domain / Mitochondrial ribosomal protein L51 / S25 / CI-B8 domain / Ribosomal protein L11, N-terminal / Ribosomal protein L11, N-terminal domain / Ribosomal protein L11/L12 / Ribosomal protein L11, C-terminal / Ribosomal protein L11, C-terminal domain superfamily / Ribosomal protein L11/L12, N-terminal domain superfamily / Ribosomal protein L11/L12 / Ribosomal protein L11, RNA binding domain / Ribosomal protein L28/L24 superfamily / Eukaryotic RNA Recognition Motif (RRM) profile. / RNA recognition motif domain / Ribosomal protein L25/Gln-tRNA synthetase, anti-codon-binding domain superfamily / Ribosomal protein L9, N-terminal domain superfamily / Ribosomal protein L9 / Ribosomal protein L9, N-terminal / Ribosomal protein L9, N-terminal domain / Ribosomal protein L9/RNase H1, N-terminal / RNA-binding domain superfamily / Ribosomal protein L5, bacterial-type / Ribosomal protein L2, bacterial/organellar-type / Ribosomal protein L33 / Ribosomal protein L33 / Ribosomal protein L33 superfamily / Ribosomal protein L16 / Ribosomal protein L28/L24 / L28p-like / Ribosomal protein L27 / Ribosomal L27 protein / Ribosomal protein L20 / Ribosomal protein L20 / Ribosomal protein L20, C-terminal / Ribosomal protein L17 / Ribosomal protein L17 superfamily / Ribosomal protein L17 / Ribosomal proteins 50S L24/mitochondrial 39S L24 / Ribosomal protein L21-like / L21-like superfamily / Ribosomal prokaryotic L21 protein / Ribosomal protein L24 / Ribosomal protein L3, bacterial/organelle-type / Ribosomal protein L15, bacterial-type / 50S ribosomal protein uL4 / Ribosomal protein L13, bacterial-type / : / Ribosomal protein L10e/L16 / Ribosomal protein L10e/L16 superfamily / Ribosomal protein L16p/L10e / Prokaryotic membrane lipoprotein lipid attachment site profile. / Ribosomal protein L2, domain 3 / Ribosomal Proteins L2, C-terminal domain / Ribosomal protein L2, C-terminal / Ribosomal Proteins L2, C-terminal domain / Ribosomal Proteins L2, RNA binding domain / Ribosomal Proteins L2, RNA binding N-terminal domain / Ribosomal Proteins L2, RNA binding domain / Ribosomal protein L2 / KOW (Kyprides, Ouzounis, Woese) motif.
類似検索 - ドメイン・相同性
Uncharacterized protein / Uncharacterized protein / Large ribosomal subunit protein uL24c / Ribosomal protein L11, putative / Uncharacterized protein / Ribosomal protein RPL22 / Large ribosomal subunit protein mL49 / Uncharacterized protein / Putative 50S ribosomal protein L33 / Uncharacterized protein ...Uncharacterized protein / Uncharacterized protein / Large ribosomal subunit protein uL24c / Ribosomal protein L11, putative / Uncharacterized protein / Ribosomal protein RPL22 / Large ribosomal subunit protein mL49 / Uncharacterized protein / Putative 50S ribosomal protein L33 / Uncharacterized protein / Large ribosomal subunit protein uL24c / Putative 60S ribosomal protein L27 / Uncharacterized protein / Large ribosomal subunit protein uL4m / BIR protein / Putative 50S ribosomal protein L13 / Putative ribosomal protein L28 / Large ribosomal subunit protein uL29m / Uncharacterized protein / AP2 domain transcription factor AP2VIIb-2 / Large ribosomal subunit protein uL23m / Large ribosomal subunit protein uL3m / RAP domain-containing protein / Ribosomal L22p/L17e protein / Transmembrane protein / Large ribosomal subunit protein bL21m / Putative 50S ribosomal protein L16 / Uncharacterized protein / Uncharacterized protein / Uncharacterized protein / Uncharacterized protein / Transmembrane protein / DUF6832 domain-containing protein / Large ribosomal subunit protein mL43 / Uncharacterized protein / Uncharacterized protein / AP2 domain transcription factor AP2IV-1 / Uncharacterized protein / Putative 50S ribosomal protein L17 / Uncharacterized protein / Putative ribosomal protein L20 / Uncharacterized protein / RAP domain-containing protein / Ribosomal l25 family protein / Uncharacterized protein / RAP domain-containing protein / Ribosomal protein L46 / Large ribosomal subunit protein mL54 / RAP domain-containing protein / Large ribosomal subunit protein uL2m / RRM domain-containing protein / FAS1 domain-containing protein / AMP-dependent synthetase/ligase domain-containing protein / Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase / RAP domain-containing protein / Uncharacterized protein / Ribosomal protein L9, N-terminal domain-containing protein / RAP domain-containing protein / Macro domain-containing protein / RAP domain-containing protein / Ribosomal protein L15, putative / HECT-domain (Ubiquitin-transferase) domain-containing protein
類似検索 - 構成要素
生物種Toxoplasma gondii (トキソプラズマ)
手法単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 2.89 Å
データ登録者Rocha REO / Barua S / Boissier F / Nguyen TT / Hashem Y
資金援助European Union, 1件
OrganizationGrant number国
European Commission101088541European Union
引用ジャーナル: Acta Crystallogr D Struct Biol / 年: 2018
タイトル: ISOLDE: a physically realistic environment for model building into low-resolution electron-density maps.
著者: Tristan Ian Croll /
要旨: This paper introduces ISOLDE, a new software package designed to provide an intuitive environment for high-fidelity interactive remodelling/refinement of macromolecular models into electron-density ...This paper introduces ISOLDE, a new software package designed to provide an intuitive environment for high-fidelity interactive remodelling/refinement of macromolecular models into electron-density maps. ISOLDE combines interactive molecular-dynamics flexible fitting with modern molecular-graphics visualization and established structural biology libraries to provide an immersive interface wherein the model constantly acts to maintain physically realistic conformations as the user interacts with it by directly tugging atoms with a mouse or haptic interface or applying/removing restraints. In addition, common validation tasks are accelerated and visualized in real time. Using the recently described 3.8 Å resolution cryo-EM structure of the eukaryotic minichromosome maintenance (MCM) helicase complex as a case study, it is demonstrated how ISOLDE can be used alongside other modern refinement tools to avoid common pitfalls of low-resolution modelling and improve the quality of the final model. A detailed analysis of changes between the initial and final model provides a somewhat sobering insight into the dangers of relying on a small number of validation metrics to judge the quality of a low-resolution model.
履歴
登録2024年7月18日-
ヘッダ(付随情報) 公開2024年12月11日-
マップ公開2024年12月11日-
更新2025年1月1日-
現状2025年1月1日処理サイト: PDBe / 状態: 公開

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構造の表示

添付画像

emd_51104.png

ダウンロードとリンク

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マップ

ファイルダウンロード / ファイル: emd_51104.map.gz / 形式: CCP4 / 大きさ: 347.6 MB / タイプ: IMAGE STORED AS FLOATING POINT NUMBER (4 BYTES)
注釈DeepEMhanced map of the LSU structure derived from the LSU sample of the mitoribosome from T. gondii.
投影像・断面図

画像のコントロール

大きさ
明度
コントラスト
その他
軸Z (Sec.)Y (Row.)X (Col.)
1.16 Å/pix.
x 450 pix.
= 520.785 Å		1.16 Å/pix.
x 450 pix.
= 520.785 Å		1.16 Å/pix.
x 450 pix.
= 520.785 Å

表面

投影像

断面 (1/3)

断面 (1/2)

断面 (2/3)

画像は Spider により作成

ボクセルのサイズX=Y=Z: 1.1573 Å
密度

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)
表面レベル登録者による: 0.15
最小 - 最大-0.058848277 - 2.021188
平均 (標準偏差)0.002833141 (±0.032387104)
対称性空間群: 1
詳細

EMDB XML:

マップ形状
Axis orderXYZ
Origin000
サイズ450450450
Spacing450450450
セルA=B=C: 520.785 Å
α=β=γ: 90.0 °

-
添付データ

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マスク #1

ファイルemd_51104_msk_1.map
投影像・断面図
軸ZYX

投影像

断面 (1/2)
密度ヒストグラム

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)

-
追加マップ: Sharpened map of the LSU structure derived from...

ファイルemd_51104_additional_1.map
注釈Sharpened map of the LSU structure derived from the LSU sample of the mitoribosome from T. gondii.
投影像・断面図
軸ZYX

投影像

断面 (1/2)
密度ヒストグラム

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)

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ハーフマップ: Half map A of the LSU structure derived...

ファイルemd_51104_half_map_1.map
注釈Half map A of the LSU structure derived from the LSU sample of the mitoribosome from T. gondii.
投影像・断面図
軸ZYX

投影像

断面 (1/2)
密度ヒストグラム

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)

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ハーフマップ: Half map B of the LSU structure derived...

ファイルemd_51104_half_map_2.map
注釈Half map B of the LSU structure derived from the LSU sample of the mitoribosome from T. gondii.
投影像・断面図
軸ZYX

投影像

断面 (1/2)
密度ヒストグラム

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)

-
試料の構成要素

+
全体 : LSU structure derived from the LSU sample of the mitoribosome fro...

全体名称: LSU structure derived from the LSU sample of the mitoribosome from T. gondii.
要素
  • 複合体: LSU structure derived from the LSU sample of the mitoribosome from T. gondii.
    • タンパク質・ペプチド: RRM domain-containing protein
    • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein mL54
    • タンパク質・ペプチド: mL162
    • タンパク質・ペプチド: Ribosomal l25 family protein
    • タンパク質・ペプチド: RAP domain-containing protein
    • タンパク質・ペプチド: mL183
    • タンパク質・ペプチド: uL1m
    • タンパク質・ペプチド: uL14m
    • タンパク質・ペプチド: Putative 50S ribosomal protein L17
    • タンパク質・ペプチド: DUF6832 domain-containing protein
    • タンパク質・ペプチド: Putative 50S ribosomal protein L13
    • タンパク質・ペプチド: Putative ribosomal protein L20
    • タンパク質・ペプチド: Macro domain-containing protein
    • タンパク質・ペプチド: Ribosomal protein L46
    • タンパク質・ペプチド: FAS1 domain-containing protein
    • タンパク質・ペプチド: bL36m
    • タンパク質・ペプチド: Ribosomal protein RPL22
    • タンパク質・ペプチド: Ribosomal protein L9, N-terminal domain-containing protein
    • タンパク質・ペプチド: Putative 60S ribosomal protein L27
    • タンパク質・ペプチド: RAP domain-containing protein
    • タンパク質・ペプチド: BIR protein
    • タンパク質・ペプチド: AMP-dependent synthetase/ligase domain-containing protein
    • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein uL11m
    • タンパク質・ペプチド: bL35m
    • タンパク質・ペプチド: LSU ribosomal protein L2P, putative
    • タンパク質・ペプチド: Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase
    • タンパク質・ペプチド: mL175
    • タンパク質・ペプチド: mL172
    • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein uL24c
    • タンパク質・ペプチド: Putative 50S ribosomal protein L33
    • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein mL49
    • タンパク質・ペプチド: mL148
    • タンパク質・ペプチド: Putative 50S ribosomal protein L3
    • タンパク質・ペプチド: mL176
    • タンパク質・ペプチド: Ribosomal L22p/L17e protein
    • タンパク質・ペプチド: mL174
    • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein uL23m
    • タンパク質・ペプチド: RAP domain-containing protein
    • タンパク質・ペプチド: RAP domain-containing protein
    • タンパク質・ペプチド: RAP domain-containing protein
    • タンパク質・ペプチド: RAP domain-containing protein
    • タンパク質・ペプチド: HECT-domain (Ubiquitin-transferase) domain-containing protein
    • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein uL29m
    • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein uL4m
    • タンパク質・ペプチド: RAP domain-containing protein
    • タンパク質・ペプチド: mL177
    • タンパク質・ペプチド: AP2 domain transcription factor AP2VIIb-2
    • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein mL43
    • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein uL24c
    • タンパク質・ペプチド: mL185
    • タンパク質・ペプチド: Transmembrane protein
    • タンパク質・ペプチド: bL19m
    • タンパク質・ペプチド: RAP domain-containing protein
    • タンパク質・ペプチド: Putative ribosomal protein L28
    • タンパク質・ペプチド: Ribosomal protein L15, putative
    • タンパク質・ペプチド: mL40
    • タンパク質・ペプチド: mL164
    • タンパク質・ペプチド: mL180
    • タンパク質・ペプチド: Putative 50S ribosomal protein L16
    • タンパク質・ペプチド: mL173
    • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein bL21m
    • タンパク質・ペプチド: mL182
    • タンパク質・ペプチド: mL178
    • タンパク質・ペプチド: bL27m
    • タンパク質・ペプチド: mL179
    • タンパク質・ペプチド: Transmembrane protein
    • タンパク質・ペプチド: mL53
    • タンパク質・ペプチド: bL32m
    • タンパク質・ペプチド: AP2 domain transcription factor AP2IV-1
    • タンパク質・ペプチド: mL181
    • タンパク質・ペプチド: mL184
    • RNA: RNA23t
    • RNA: RNA29
    • RNA: LSUB
    • RNA: RNA6
    • RNA: RNA1
    • RNA: RNA31
    • RNA: RNA14
    • RNA: RNA11
    • RNA: RNA36
    • RNA: RNA3
    • RNA: RNA2
    • RNA: RNA38
    • RNA: RNA35
    • RNA: RNA32
    • RNA: RNA15
    • RNA: RNA10
    • RNA: LSUC
    • RNA: RNA16
    • RNA: RNA13
    • RNA: LSUD/E
    • RNA: SSUF
    • RNA: RNA7
    • RNA: LSUF/G
    • RNA: RNA37
    • RNA: LSUA
    • RNA: ulr1
    • RNA: ulr2
    • RNA: ulr3
    • RNA: ulr4
    • RNA: ulr5
    • RNA: ulr6
    • RNA: ulr7,ulr8
    • RNA: ulr9

+
超分子 #1: LSU structure derived from the LSU sample of the mitoribosome fro...

超分子名称: LSU structure derived from the LSU sample of the mitoribosome from T. gondii.
タイプ: complex / ID: 1 / 親要素: 0 / 含まれる分子: all
由来(天然)生物種: Toxoplasma gondii (トキソプラズマ)

+
分子 #1: RRM domain-containing protein

分子名称: RRM domain-containing protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 1 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Toxoplasma gondii (トキソプラズマ)
分子量理論値: 47.857098 KDa
配列文字列: ACRPGATRMK WYFQKPYVRR VKSDFFRFPL LSQVTKQKID WQYHHPRSGY EAACIFGPNT LEVTNLPMGK TCQYLQERLW RFFGKFGIV EQVRVLPHER DPYQTCGTAY VCFRSRMASL RAVRLPVHLP ASLHNRVLHL RHLGTDRTSD DLFYFRRQQA I SNLVAIAQ ...文字列:
ACRPGATRMK WYFQKPYVRR VKSDFFRFPL LSQVTKQKID WQYHHPRSGY EAACIFGPNT LEVTNLPMGK TCQYLQERLW RFFGKFGIV EQVRVLPHER DPYQTCGTAY VCFRSRMASL RAVRLPVHLP ASLHNRVLHL RHLGTDRTSD DLFYFRRQQA I SNLVAIAQ QLYAYLEERG PLPAHRALRL LFERSYPRLA WRQAGVSVRT CCGSWLGFFS RSPFNELFYL AREDEVARPT EV TELEADP RASRKMISNE GTEGAAETRG RKTKSKLGDT KDGTSPGLKS LTDREENAML EKMVIFPHLL SREKLQALLL RAG RLLQMD LQNELSVHWR TDRPPLPDWT QKQIQLWQHQ DPLPEELQIW SRTKDYYKIH EERFLFKLKL KKERAQAKQE MKQQ RRRLE

UniProtKB: RRM domain-containing protein

+
分子 #2: Large ribosomal subunit protein mL54

分子名称: Large ribosomal subunit protein mL54 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 2 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Toxoplasma gondii (トキソプラズマ)
分子量理論値: 10.873589 KDa
配列文字列:
GADHVFNIFK DLPDHKILED KHYPAWLFTL DKPEKTYGEL AMTFLYGVGI ENATLDEYLR FTRLHTKNLI KLNNMRLKKS KRSSVKPLF WDA

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein mL54

+
分子 #3: mL162

分子名称: mL162 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 3 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Toxoplasma gondii (トキソプラズマ)
分子量理論値: 30.027393 KDa
配列文字列: GGPGRALCTP TFHGLSDGPY RRLKFSLKPI RHDYRDVLVS ADLRKLAETA QELLRGKETK RRAFWEIFSK RVKASAHMLS PSLMALIAK SFDVHDRDTG IYVALATVLP EAVKRADGRS LLTLSDVFSR RLKRDSNPHL FSTLARQLPN ALYQLTGKDV L RILSSLDA ...文字列:
GGPGRALCTP TFHGLSDGPY RRLKFSLKPI RHDYRDVLVS ADLRKLAETA QELLRGKETK RRAFWEIFSK RVKASAHMLS PSLMALIAK SFDVHDRDTG IYVALATVLP EAVKRADGRS LLTLSDVFSR RLKRDSNPHL FSTLARQLPN ALYQLTGKDV L RILSSLDA AGLADMLACR QVARKLLAEL DELDSVDLAD ASAVFASQGY RNPELYSALA RRAVDVKDSF DAPTVFRLLS GF SQNAVAC DELLESFSTL LVSSKDQFTQ HER

UniProtKB: Uncharacterized protein

+
分子 #4: Ribosomal l25 family protein

分子名称: Ribosomal l25 family protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 4 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Toxoplasma gondii (トキソプラズマ)
分子量理論値: 37.394488 KDa
配列文字列: KNFKTDLIRM QWPAMRDEMV RFFQSQNAIA FDKISKRHPS ASLSSDASSS SSSPSANRGE RRATAEEVDR EEQGKLSFAE MVVGSTRSA CGVLGAGRSS AVDVACKPWK RFVRKEDIQR AGYVPCIVEK YGIERRLAIH RDTLEALAFD EQHGHLSYLF Q ARLFRLRI ...文字列:
KNFKTDLIRM QWPAMRDEMV RFFQSQNAIA FDKISKRHPS ASLSSDASSS SSSPSANRGE RRATAEEVDR EEQGKLSFAE MVVGSTRSA CGVLGAGRSS AVDVACKPWK RFVRKEDIQR AGYVPCIVEK YGIERRLAIH RDTLEALAFD EQHGHLSYLF Q ARLFRLRI GNWIEECIPT FVQADPVARR LYFVKFERHV AGKISEVDIP TTMVGLLACP AYQRGYHVEL VMPTIRCQCV GA EIPPPFF VDVSRLHYSP PYTAITLQDL QHLLPADGSA RFHPSYDAAT QEVAWAYEVG SLPDAPLPAD YVDPNFVDRK GQK MDVCFR NHFPN

UniProtKB: Ribosomal l25 family protein

+
分子 #5: RAP domain-containing protein

分子名称: RAP domain-containing protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 5 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Toxoplasma gondii (トキソプラズマ)
分子量理論値: 49.29877 KDa
配列文字列: PSPSSFPHYS RRHFKRQSPR QLHQLASNLA ARGCTDVVLW SSMIQRAIEV NRSPESGAAD VSVAPFRFFE ALGFLGAVSS LGLTDRELF LSFVPCFLRS LSALEPRHLV QLLTVYEAAG VRPRGLYVAV FNRVLKLAPS FYSHEFADFL CCLARLKIAN P SFLSAFSQ ...文字列:
PSPSSFPHYS RRHFKRQSPR QLHQLASNLA ARGCTDVVLW SSMIQRAIEV NRSPESGAAD VSVAPFRFFE ALGFLGAVSS LGLTDRELF LSFVPCFLRS LSALEPRHLV QLLTVYEAAG VRPRGLYVAV FNRVLKLAPS FYSHEFADFL CCLARLKIAN P SFLSAFSQ TLVSRLPEIA FPDACRCVGA LRSLGVAQQS LFDLFDERQK KELELLPTQL LLEDFQKVLS LEFSWQAYEN MI QEEFIKR TEAMIDDKDV DELADPFACL NFMKTRNLVS DKFLLALSKW CRAAVNRPAT RSYKRPLAHQ LVELHDLMRE RNL EQNKAL EQAVLRFVAD DGGCKRRPRE VKPLLYQRNR RYISCPDLIP DGIEPARPCA EALPDVFMER QASLVRACTP EDLA RQELP FAVQAETAYR RLQRNKRFLR FVQEE

UniProtKB: RAP domain-containing protein

+
分子 #6: mL183

分子名称: mL183 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 6 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Toxoplasma gondii (トキソプラズマ)
分子量理論値: 3.787588 KDa
配列文字列:
RWRPKKSYKK RTMGLPSTKA RRRWAQMRRG

+
分子 #7: uL1m

分子名称: uL1m / タイプ: protein_or_peptide / ID: 7 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Toxoplasma gondii (トキソプラズマ)
分子量理論値: 6.736038 KDa
配列文字列:
GKRYIPFRTP RNPKSKHILA TPPPLFAATA LDARSFVWPP LHFVERRRRL LMEKNLL

+
分子 #8: uL14m

分子名称: uL14m / タイプ: protein_or_peptide / ID: 8 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Toxoplasma gondii (トキソプラズマ)
分子量理論値: 12.981468 KDa
配列文字列:
GLWRQSIVRC ADNTGVIKAC IIGIRNKYGT GKIGARIRVS VRDKTPECTA PKMPKGVIVR RRKETRRKDG SYIKFDENAF VIIQKNKAR GTKIKGPVPM EIRHNCKTLA RWIFA

+
分子 #9: Putative 50S ribosomal protein L17

分子名称: Putative 50S ribosomal protein L17 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 9 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Toxoplasma gondii (トキソプラズマ)
分子量理論値: 29.244455 KDa
配列文字列: GWSKVVNFLN KGVQRRPHRR LPGQPHHQWN MLKTQLDQLV RSDRLELTLP RAHELQQYAE ELVHFAKQNT PESSLIVESM IFTPAARRK LFHELCPLYA NRPFFYTRVV NQHRLRMRDA APMAYLEFVD RPGEIRPARP VGFERKQAIW EEMQATRRGR R QWWNHAKK ...文字列:
GWSKVVNFLN KGVQRRPHRR LPGQPHHQWN MLKTQLDQLV RSDRLELTLP RAHELQQYAE ELVHFAKQNT PESSLIVESM IFTPAARRK LFHELCPLYA NRPFFYTRVV NQHRLRMRDA APMAYLEFVD RPGEIRPARP VGFERKQAIW EEMQATRRGR R QWWNHAKK LGLIDEETGD VISDINALRR PSAAEWEESD SEEEKADSPS PYKMVAAPKR ALEPFFVDLP PPTERYRKQR YV FKRFRP

UniProtKB: Putative 50S ribosomal protein L17

+
分子 #10: DUF6832 domain-containing protein

分子名称: DUF6832 domain-containing protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 10 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Toxoplasma gondii (トキソプラズマ)
分子量理論値: 55.084473 KDa
配列文字列: MTTREYEEAF LPRRLKRIKV FNTPPPSELP AFFHKRLDNA HSNPRSILKL YRQYMRKDDY PAYDWLVRCF CHLGNVFGFN SFWATKDKQ VIQALPSFKF LVYDLIERKH LIEARQVPRL LYAFACLEYR SWHLLPTLLE HVEANLEKWR TPTLANMALT L ALLGVGDD ...文字列:
MTTREYEEAF LPRRLKRIKV FNTPPPSELP AFFHKRLDNA HSNPRSILKL YRQYMRKDDY PAYDWLVRCF CHLGNVFGFN SFWATKDKQ VIQALPSFKF LVYDLIERKH LIEARQVPRL LYAFACLEYR SWHLLPTLLE HVEANLEKWR TPTLANMALT L ALLGVGDD APDHNQFGPP DLLSRDYTGL VSKLALEVHR RLLALQSASS SGPRKSPLHD SLGCMPFDYA GLAFALTLQG SY DLCLPSD ETAKSTLALF LQRACEPLSL EQLENSGWVQ FFLYQTLYCV DVEKPKREVE VKKAVPFAFQ KHLHLSWLDK ILI NAQPQG NELLQLDVDA ALKRLHITDA LINCSAGRQW DEQHCWFAGH LVRSRNLALE YDYLLPLGPG RPKVSGWLAC KRRM LKAFG LNVATIHQSF WSLLNLEQKD VQLTRLLAQF PPVLEAVKDE KKAYEEDRHL RFQRHARQKF ETWPPEKLEI

UniProtKB: DUF6832 domain-containing protein

+
分子 #11: Putative 50S ribosomal protein L13

分子名称: Putative 50S ribosomal protein L13 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 11 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Toxoplasma gondii (トキソプラズマ)
分子量理論値: 24.25534 KDa
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SQSYPKGSFH EGHINPFADV QWISRPFMKR NMPRDHHPLA KQHTSLKAVT MLDEESGNHW HVLDGKGRSV GGLAAQVVRL LQGKHRVDF TPRTAAGDSV IVVNAIHLKM AGHTWDTKVY KFDRKTHPAG PKIITAKTIM ARNPAMILNL AVKRMLPPNR L RPIMYRKL FVYAGALHPH WQVPQVIVPA KTPAEVSFLP FSVERADPVQ AAARIAALG

UniProtKB: Putative 50S ribosomal protein L13

+
分子 #12: Putative ribosomal protein L20

分子名称: Putative ribosomal protein L20 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 12 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Toxoplasma gondii (トキソプラズマ)
分子量理論値: 14.651096 KDa
配列文字列:
MQIPRDVIFE VVRGFRGRSR NCIKIARVRA MKALLYSYIM RRQRQRRYRV FWIGRINAAG REWSFPYAWL ATSLWRQNIW LDRKMLANL AETEPASFRA LVNEGKSVYF WNPDKVRDIQ DL

UniProtKB: Putative ribosomal protein L20

+
分子 #13: Macro domain-containing protein

分子名称: Macro domain-containing protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 13 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Toxoplasma gondii (トキソプラズマ)
分子量理論値: 57.139934 KDa
配列文字列: VRPNQGRNDY NQVGGKKRGQ GVQVLPETIR LLIETRKAAT AGGPVGRQPL PKATEATGVS SWGRDRRFPI TEALRLPTVA EVNAPWEPY DETANKRRSG SRPLSSSVDG CHENHDPSSD GVARGQDRLG RLDKVVLHSG DISRLRVDAT VVGAVRSFKT V GDGRGFTG ...文字列:
VRPNQGRNDY NQVGGKKRGQ GVQVLPETIR LLIETRKAAT AGGPVGRQPL PKATEATGVS SWGRDRRFPI TEALRLPTVA EVNAPWEPY DETANKRRSG SRPLSSSVDG CHENHDPSSD GVARGQDRLG RLDKVVLHSG DISRLRVDAT VVGAVRSFKT V GDGRGFTG CSALLEGAGP FLSSFVSQQR RHLGEELLHT PVRGDPSSAQ TVAAAAVRGL RRGIHHFTAS TVPLPLRSSS TV PSLAEVE EMPIMELSQL AARAALLGSA RGGGTRGFGL SSHPQTRRLE GVSTASGATE GSDAALSFAN EVRDQATASQ FPA RDLIQT PLDPSQLSPP GAVLISPGFN LPSNFLIHVA EPNAVLSNQQ MLDTLFRLEE REALRRKEQL LSRFGAAQAA DEAM SDDEV REEDNEMTPR SMWQDDAERD TGVQRMLLLE ECYINALNAA WALGVRSVAL PCLGAGVGRF PVYIAARCAA RGVAR WMSE HRDCDAWENA ESDKRADFDR IVFCTSSDVE WNALRRVIPQ FLS

UniProtKB: Macro domain-containing protein

+
分子 #14: Ribosomal protein L46

分子名称: Ribosomal protein L46 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 14 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Toxoplasma gondii (トキソプラズマ)
分子量理論値: 32.456908 KDa
配列文字列: GTSRRLSLFF SDPPPAYALS LHAGYKIQAA LCVDRLPLVY REPRYEKRWR EFKEQWEAQT KNGLTLADEI TFMKFPFHFF ETEEAQKKR EELISKTGDA EVSELELLLS EEGFSGKRKL QRDRDAKKAA REEQSAVKSA GRGQDEKGLR SLEREPERTL Y LIVRYGDS ...文字列:
GTSRRLSLFF SDPPPAYALS LHAGYKIQAA LCVDRLPLVY REPRYEKRWR EFKEQWEAQT KNGLTLADEI TFMKFPFHFF ETEEAQKKR EELISKTGDA EVSELELLLS EEGFSGKRKL QRDRDAKKAA REEQSAVKSA GRGQDEKGLR SLEREPERTL Y LIVRYGDS WQFPLEDRIH GQSMRSTLKR LCSEQLGSSY APFLLGYSPF SYAKRTYPKK TKEAGILGRK IFYYRAHHIP GS ENLKLPE GSPVSDFAWV TLQELPAYIS PRKLAAVSAG LLLEE

UniProtKB: Ribosomal protein L46

+
分子 #15: FAS1 domain-containing protein

分子名称: FAS1 domain-containing protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 15 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Toxoplasma gondii (トキソプラズマ)
分子量理論値: 37.960836 KDa
配列文字列: RWWTRASGMR NPVKWTRDWE VLNRKVYFAF DEREIRRSML DAVNAHRKTA SLFHRMINAV PGVAHAMSLP GPHTFFLPSD KACRDHLSP DSLHALTERV AFLEEQQRQR VGARVQVEGG VSVRGGTAAA IADRVAKTTE QLRTFVLAHL IPGEWRMKTL L LACGAGDP ...文字列:
RWWTRASGMR NPVKWTRDWE VLNRKVYFAF DEREIRRSML DAVNAHRKTA SLFHRMINAV PGVAHAMSLP GPHTFFLPSD KACRDHLSP DSLHALTERV AFLEEQQRQR VGARVQVEGG VSVRGGTAAA IADRVAKTTE QLRTFVLAHL IPGEWRMKTL L LACGAGDP RRNGSLRYQD TDRELFAPVM YASRLGTGEK TKRRQTASRE GVEHENAQEL GRTRDEETDR SSVFLLPPPQ ST DEPLPVW VQASRYAAFL PITTSTNFPR FEGTECRGNS DREEAESVEN SGEYSQRRST VGGALHLWVG GALVTKGDLR AHN GVVHMI DKPLIPVQLL AS

UniProtKB: FAS1 domain-containing protein

+
分子 #16: bL36m

分子名称: bL36m / タイプ: protein_or_peptide / ID: 16 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Toxoplasma gondii (トキソプラズマ)
分子量理論値: 10.376198 KDa
配列文字列:
WHRGTLSLLC SSCRYVVRKW HVPILGVDCN ANPRHKQALS VPAPRSRGIP KHLYPFLVGK QYPRHPRWRQ AFTHRSRMGK YKPQVARN

UniProtKB: Uncharacterized protein

+
分子 #17: Ribosomal protein RPL22

分子名称: Ribosomal protein RPL22 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 17 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Toxoplasma gondii (トキソプラズマ)
分子量理論値: 17.693154 KDa
配列文字列:
SANPYKPKSR EVFHPYVPAP EHLPPPAYTT AVLKPMQQFI PKDFYRDMRV DSLRDGVSLG SDFPWNVTHK YRFWRRRKYN IQLDDRFIR LSPVTGVDYY PRLNVFAVQW REDGQHRIRW FRAAYGLTRA MRAAENFRKT LEATGRVDN

UniProtKB: Ribosomal protein RPL22

+
分子 #18: Ribosomal protein L9, N-terminal domain-containing protein

分子名称: Ribosomal protein L9, N-terminal domain-containing protein
タイプ: protein_or_peptide / ID: 18 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Toxoplasma gondii (トキソプラズマ)
分子量理論値: 9.818443 KDa
配列文字列:
AISHLNPSIS KGKVHYRVPN PYIPVLLLQA VPGLGKRGEL KQVRRGTLRL FLAPKGLAVV ASWQNIDAFY LAEKEEEERR RRAQAGR

UniProtKB: Ribosomal protein L9, N-terminal domain-containing protein

+
分子 #19: Putative 60S ribosomal protein L27

分子名称: Putative 60S ribosomal protein L27 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 19 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Toxoplasma gondii (トキソプラズマ)
分子量理論値: 8.731462 KDa
配列文字列:
AKVGPSKGRG PLLAKFAPVG FKKGFGAIGL GRHTKKGFFI INTMLVPMFK VPDLSNCKLK CYVAPDTYRI VQQSFNKRE

UniProtKB: Putative 60S ribosomal protein L27

+
分子 #20: RAP domain-containing protein

分子名称: RAP domain-containing protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 20 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Toxoplasma gondii (トキソプラズマ)
分子量理論値: 51.732992 KDa
配列文字列: GILRPRERLL LNALKKEADI RYRGRRMHKR FRSWAQQRVR HYWLPQKVCV TSDPQLMDGS YIAACVQKAA TLRKHDLQLW HGFSKRILE LADSLTPQQM GYIFYGYGKS LFRHEELYRG LLPFVAEALP EFHSHALMTV AWALERVRVN DRAVVAQIAE E ALAKKDLM ...文字列:
GILRPRERLL LNALKKEADI RYRGRRMHKR FRSWAQQRVR HYWLPQKVCV TSDPQLMDGS YIAACVQKAA TLRKHDLQLW HGFSKRILE LADSLTPQQM GYIFYGYGKS LFRHEELYRG LLPFVAEALP EFHSHALMTV AWALERVRVN DRAVVAQIAE E ALAKKDLM RPADFIKIVN CVARMGAAPP SLAAALSAEL MRVLDEKCNA LLFRGAVDHV AVATLYSDPL RLYLLERFTK TA ICCRPMH YQKAFQSAVA IRVLHPPVWQ QLSKAVRNFY IRLSLRRIPQ RARRPSPLHW DVSNALAKLG VFHRNTFQWG CFW IDIGEI DDRRQCWFVD GPSDFYSSTN EYTEANKLQH RILSELGWNI RRVRWNDWVQ LGTDMDAKVE YLRKLRERPP WPAI LTDGP SSSRQEMVAN LRSARDVQRA LKERREKNRQ PHSLVMNL

UniProtKB: RAP domain-containing protein

+
分子 #21: BIR protein

分子名称: BIR protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 21 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Toxoplasma gondii (トキソプラズマ)
分子量理論値: 26.967836 KDa
配列文字列: SGALQRAVRE IPWKSRQDIL RERERPVYAA ECRGTPRREY SKNVIDGVRV KPTFNPFVKL NKAKRYVLDN WPSRNWDDWS PYRCYVRGS RRRYNIPQDL LPYKDELGEW HPPRLSARYQ ADVKKQYLMN NLPWVWQKDF YEGKMHFGDR EPLGPKVWYR K AFREERVK ...文字列:
SGALQRAVRE IPWKSRQDIL RERERPVYAA ECRGTPRREY SKNVIDGVRV KPTFNPFVKL NKAKRYVLDN WPSRNWDDWS PYRCYVRGS RRRYNIPQDL LPYKDELGEW HPPRLSARYQ ADVKKQYLMN NLPWVWQKDF YEGKMHFGDR EPLGPKVWYR K AFREERVK EAMRKMDDLV LDYRQENRDR RRYNWFEKVV HDFAGEEIAT QFIRKRKEPK L

UniProtKB: BIR protein

+
分子 #22: AMP-dependent synthetase/ligase domain-containing protein

分子名称: AMP-dependent synthetase/ligase domain-containing protein
タイプ: protein_or_peptide / ID: 22 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Toxoplasma gondii (トキソプラズマ)
分子量理論値: 92.87318 KDa
配列文字列: IATLVERSLE KHKDRLFDCG ASGQPVTYKE VAEHARSISE TLKAAAAYLH VPLTLPSALG RAGADGQARH TATSTEDCTG SASTLKCRG KPLNRPTIGL IVPPNSVAIL AHLVGVWQCG GVGLLLPFPD PACLPFVADS TAAAAASAAN AAVLFAKGGK T LHTYRPDA ...文字列:
IATLVERSLE KHKDRLFDCG ASGQPVTYKE VAEHARSISE TLKAAAAYLH VPLTLPSALG RAGADGQARH TATSTEDCTG SASTLKCRG KPLNRPTIGL IVPPNSVAIL AHLVGVWQCG GVGLLLPFPD PACLPFVADS TAAAAASAAN AAVLFAKGGK T LHTYRPDA LFQGNTGPSV YAKTVNPNSL PFLNSQNNAH NRNGVAQLWE YQAAESRCHL LVVTPEVAPM AAEVASKLSI PI CVLRTSW VRKSDGTNGA EEQRAPERDL WSVRGRNKLE VKAYVPEVFH DSSRTSRNIT RWQLLEVTPH ECTHAAADEE SIA EVAAPA THFFQGPAAH APRAVIYSHK ALSDQVIRNK DLLQLNAEDH VVILHLPFFG SHRSGTGSQA SSRMLCTPKG LVAV AMPAV AAGSTLSFLS SSDKIQDSLL PLPLQLQRLQ DRLPQNEKIP RQPEQRQALL PLGCDIPEKT PWRCSGTTTR GPLVP RGNQ EGLQVDFTGA YENTLEVNAL QMWEKIASLH EDGRNTTRSR KQRFTSRDKA TPELSRQATV LAMDAETAAT MVQVIA TER FQMEGTNEKA HASGGSDASR FPTITSKDIT RYKAAVKSLR LICICTDEGD LGASFSGRWS SSNKGGGIRI QSLLRSL QA LAGPDTKILH LCSLTETGLL MVGGPLPDGS PGSRERGEKS DFGEPLQDHL STGCKDSKTQ CLDATDGEDR ANFTGVVA P GIKVEIDDET DQLRVRSGHM AMGFHGRPRS TQESFDSAGL FRSSFGGSLV TNRRNDTDII GCDRGEAEQR VELFKCVYS AAVPRLPLLH RLIASFKNSP KMESHIEGYV KKKPIAGRDW NNLHAPRKHW KKMFL

UniProtKB: AMP-dependent synthetase/ligase domain-containing protein

+
分子 #23: Large ribosomal subunit protein uL11m

分子名称: Large ribosomal subunit protein uL11m / タイプ: protein_or_peptide / ID: 23 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Toxoplasma gondii (トキソプラズマ)
分子量理論値: 19.700133 KDa
配列文字列:
SVVGRFRLIV PAATAKPSPA IGQTLGPLGI NMMQFCKEFN ARTANVRPEV PLQVTIVPLT DRSYKFSIRA PSNIWFLLRT ARCPMGSES PGHQSVGNVT LKEIYHIARC KSMDWPLIGM SLRGICRSLI GTARASGIEI SKEILPAYHK RDYTDVQALD S MRKDMRQR KKAAKRAAT

UniProtKB: Ribosomal protein L11, putative

+
分子 #24: bL35m

分子名称: bL35m / タイプ: protein_or_peptide / ID: 24 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Toxoplasma gondii (トキソプラズマ)
分子量理論値: 13.974433 KDa
配列文字列:
YKPVIDWVKN RINARMRQYR KRSLKKKNHS KVIQRFKLTR FGWQRLRSGR NGEKENLTHK QLKRTMGYTF VSRDDLWKFR FQLPSHILR LRDAPINRNP NIRKIRRSLP SYFG

UniProtKB: Uncharacterized protein

+
分子 #25: LSU ribosomal protein L2P, putative

分子名称: LSU ribosomal protein L2P, putative / タイプ: protein_or_peptide / ID: 25 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Toxoplasma gondii (トキソプラズマ)
分子量理論値: 37.607527 KDa
配列文字列: MLWLAATHRN RVAFQLFATP REPTASKAAA AARAAAEAVA RSSTVSAPFT VQKQQRLLAL LAASSSVADP SADLFRVHGL PGFSGFRPS SPPHLSKLFR GRVSRHLSCR RVNHLGRNNS GRITVRFRGA GHFRRLRFVD YKRGRKDIFG TVLRLEYDPN R SAHLALLQ ...文字列:
MLWLAATHRN RVAFQLFATP REPTASKAAA AARAAAEAVA RSSTVSAPFT VQKQQRLLAL LAASSSVADP SADLFRVHGL PGFSGFRPS SPPHLSKLFR GRVSRHLSCR RVNHLGRNNS GRITVRFRGA GHFRRLRFVD YKRGRKDIFG TVLRLEYDPN R SAHLALLQ YDDGVLSYIL ATEVTRPGDR VVASKHASIA PGNCLPLGNI PVSTIVHNVE LRPGAGGQIV RAGGCYATVV AK DRHFVTL KLSSTEVRRF PADCWATVGQ VSNAAHAERI RGKAGVSYWM GERPRTRGKA MNPVDHPHGG GTGKKGLKRP PVS KWGILC KGYKTRAKKK PLGLIVRR

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL2m

+
分子 #26: Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase

分子名称: Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase / タイプ: protein_or_peptide / ID: 26 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO / EC番号: peptidylprolyl isomerase
由来(天然)生物種: Toxoplasma gondii (トキソプラズマ)
分子量理論値: 26.422135 KDa
配列文字列: LPNPLVHLDI SIGGRDAGRM VFQLFADTHP ITAENFRCLC TGETGLGYWM RPRWYKSTPF HRIVPGFMCQ GGDIHRGDGR GGECIYGQF FRDERFLYKH SKRGLLSMAK ARRQHTNNSQ FFITFDACPW LDGEHVVFGQ LQSGAEVLDQ IEEQGTPGGW R KRPVEIWN ...文字列:
LPNPLVHLDI SIGGRDAGRM VFQLFADTHP ITAENFRCLC TGETGLGYWM RPRWYKSTPF HRIVPGFMCQ GGDIHRGDGR GGECIYGQF FRDERFLYKH SKRGLLSMAK ARRQHTNNSQ FFITFDACPW LDGEHVVFGQ LQSGAEVLDQ IEEQGTPGGW R KRPVEIWN CGELLLNTLR EIPREAPAAV RHQEMLKDLI IDATERPEKL YEPSEQVIPI PDDVYIKARR GF

UniProtKB: Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase

+
分子 #27: mL175

分子名称: mL175 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 27 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Toxoplasma gondii (トキソプラズマ)
分子量理論値: 8.480817 KDa
配列文字列:
NKVRTDKKER KRAFPQRGFW KKQNFLQVKN NTVRLAFAVQ GVDLLKLKRL RWGEVRKGNT GWWTDDYRSP

UniProtKB: Uncharacterized protein

+
分子 #28: mL172

分子名称: mL172 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 28 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Toxoplasma gondii (トキソプラズマ)
分子量理論値: 15.186954 KDa
配列文字列:
IADRVRTSWT YRHSRYSGGV RFSLPRFMVT KRTYLSTKFR RPSTVTKWGN PQYTLPSNVQ REMQENSAEG DTDQATSEEL GGRTGKKEL GRNGKSAGKT KKAADTAAQE VQHTPKYCDM LFLHQEDQQS RRR

UniProtKB: Uncharacterized protein

+
分子 #29: Large ribosomal subunit protein uL24c

分子名称: Large ribosomal subunit protein uL24c / タイプ: protein_or_peptide / ID: 29 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Toxoplasma gondii (トキソプラズマ)
分子量理論値: 25.840291 KDa
配列文字列: SRYVKVYRKV MNLQRRKTPL PWTPTFLEFS KEPSVPFPVR EKLQPAPIDL SYYLNMEVGD LVEVLHGPDC GRQGVVLSIS KKRNTVVVD GCNMKKSFWN PGVGASLITQ EMPIHITNVA LLDPVVKRPT RVKRRFMMNG ECVRISKLSG SAMPEPVSTS A LRQPNLYQ ...文字列:
SRYVKVYRKV MNLQRRKTPL PWTPTFLEFS KEPSVPFPVR EKLQPAPIDL SYYLNMEVGD LVEVLHGPDC GRQGVVLSIS KKRNTVVVD GCNMKKSFWN PGVGASLITQ EMPIHITNVA LLDPVVKRPT RVKRRFMMNG ECVRISKLSG SAMPEPVSTS A LRQPNLYQ EYLRQKALGP PLKASYARPD PLHLKILQRL ARHISWGQGS PLPTAENPRV NSPEPMALRR

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL24c

+
分子 #30: Putative 50S ribosomal protein L33

分子名称: Putative 50S ribosomal protein L33 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 30 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Toxoplasma gondii (トキソプラズマ)
分子量理論値: 14.149608 KDa
配列文字列:
RSRSKRLFVQ LKSAAMTNFC YVTRKSPEKK NFRIALRKYD PGVNKHVMFY EARLPSEKNK KQITLSLQRY IRWTGKQVKL LLDKVEKAW EYGRFQKYFD NQAPLLTDRR GRAVPRYK

UniProtKB: Putative 50S ribosomal protein L33

+
分子 #31: Large ribosomal subunit protein mL49

分子名称: Large ribosomal subunit protein mL49 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 31 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Toxoplasma gondii (トキソプラズマ)
分子量理論値: 8.876495 KDa
配列文字列:
SHVPYKVVRT PSGNLPVYSR VRKHGTEVTT IVRHAFGDIT AMKKDLVAIC EAPVRERLGT LEVKGLHVLK IKQWLRSLG

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein mL49

+
分子 #32: mL148

分子名称: mL148 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 32 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Toxoplasma gondii (トキソプラズマ)
分子量理論値: 96.130992 KDa
配列文字列: SVASRIHFLN SRTRFQTAVH ASDVAPPFLL LPLASPRPLL AYHHRFRTRN RKRGSRFHPH PLPLPPPPLS PPRSDAAHLF AGKPLAASA VSTAAGQQTL PPPLLRHLQG LFPVFRGPEC DPSCGVGPAG EAAGLALLPP PSLVEPRHLE DLARRALQAR G ETRDAASG ...文字列:
SVASRIHFLN SRTRFQTAVH ASDVAPPFLL LPLASPRPLL AYHHRFRTRN RKRGSRFHPH PLPLPPPPLS PPRSDAAHLF AGKPLAASA VSTAAGQQTL PPPLLRHLQG LFPVFRGPEC DPSCGVGPAG EAAGLALLPP PSLVEPRHLE DLARRALQAR G ETRDAASG ACKSDRLFWR ELAARVEKVR DLLPIESLVR LLTILTLNGA SGTVRPVKQI FQAFETQDED TPATPANRTG LR LASETLP CVRPLPPRLL LASTREFLED LKKLSPPATA ALAATFAWSN CASSALLFAL MERWAWRQPR AEPSVQTDVE SEV EPLGKR REAETGVEEE AENAKKLEAV ETQGHLGDFT PADFALFVSA LGHLLSQQEA THVKYSRQAR HLREISGKQI MAAF REQKR QKGKQTADAN FENFEETKSA WHFTAAFFDG CCRFMATRAE SFSLFSFASA ARTLVENLDA VALVGEAAES RALAV DGEG AGSVESLGIH GISTFSSFEG SVSRSEKPHV ACPTPDSVEA LAKAISLFVA SWDGGDKTHG RLATRAANLL LVARLL RAA SQCELYIHLH RALRLEAEGS GEGKSPQKRN SGEQASGAGV DDGGRGIAVD TVGACKTLLE HISCELGLLH SELEALP LL NSTLEDADDS ADEKKAVDAP TERGFVHISP DTVYVRNELL AAAGESAAAV VRLHHAKSLL QATDEVARDS QSLRKGEA E NVCHLSTGAR VDRVKRWMRG QQAERMQLET LGELKSEAEH LADAIDRVLR ERGAAGLPTE QLADLMEVFA LCVGDKRVS QTPEETSRWF RLGLGDKAEK MNQANLSSLQ ALSSEIVRRY AALDVNQKRR IKWATRQMDW KDPYLNHCLG RFTAAVTRQR

UniProtKB: Uncharacterized protein

+
分子 #33: Putative 50S ribosomal protein L3

分子名称: Putative 50S ribosomal protein L3 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 33 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Toxoplasma gondii (トキソプラズマ)
分子量理論値: 34.639078 KDa
配列文字列: YDSRWVKRLD RLRESKFYDP APIIKEEEIL EADKIHPLLK KVTPSWNSRR TGLLAYKIGM MSLWDGWGER HAVTVCQVDR CVVMDQRTL DKDGYEACVM GIGYKPIHKV TKPMLGVYIR SQIEPKSRIA EFKCSSDCLL PVGHEMSVRH FTPGQQVFVS G WSKDKGYL ...文字列:
YDSRWVKRLD RLRESKFYDP APIIKEEEIL EADKIHPLLK KVTPSWNSRR TGLLAYKIGM MSLWDGWGER HAVTVCQVDR CVVMDQRTL DKDGYEACVM GIGYKPIHKV TKPMLGVYIR SQIEPKSRIA EFKCSSDCLL PVGHEMSVRH FTPGQQVFVS G WSKDKGYL GVKKRWGFAG QNASHGVEAK AHSSPGSIGQ SKTVNVVWRF KKMAGHAGGD PRVVNCKVFR IEAQRNLIFL KG CVPGYKG SLIKISDARG KTHHRHNRHI PLHFPTFVPE PGVSYPVTLE CPDAEQDPFL YPEIAIADK

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL3m

+
分子 #34: mL176

分子名称: mL176 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 34 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Toxoplasma gondii (トキソプラズマ)
分子量理論値: 11.10865 KDa
配列文字列:
YWPPTRKDRS KRIRLPSGKK CFVFNAKRDQ DGELEPVLCF VDSQDNLLMW FNEEELLEFE KLMPRLESYY ELWEEKASRT RMKEAIVAE AES

UniProtKB: Uncharacterized protein

+
分子 #35: Ribosomal L22p/L17e protein

分子名称: Ribosomal L22p/L17e protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 35 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Toxoplasma gondii (トキソプラズマ)
分子量理論値: 41.242996 KDa
配列文字列: SSGLPNTKRR IRDPFWRRSG WWRWRQQEVK AMNRSRAFRR HLFPRFTTET VSFVDAAEAE AKRFKEIVAE TGRYPGQTVN FFVPKVEGA KLDPFAALPS RQKRLKLRRK AVREAEEAEK AREDADFVWR GKGGGRVWEE RKANIPLGKK KLLLYCTIIK G LQITDAID ...文字列:
SSGLPNTKRR IRDPFWRRSG WWRWRQQEVK AMNRSRAFRR HLFPRFTTET VSFVDAAEAE AKRFKEIVAE TGRYPGQTVN FFVPKVEGA KLDPFAALPS RQKRLKLRRK AVREAEEAEK AREDADFVWR GKGGGRVWEE RKANIPLGKK KLLLYCTIIK G LQITDAID WLSSLCLHRV NYLLNLLNAS RKKIHEQGGD ISRVYVESYM LNIQGQIKRP QFRLRMVNLI KTWKFAVVLR FR EYPMDEY FHKLFILKHV PRSLTTDMRL ALAGQRVGLH AVRDWYPFLD SKTRFFHRKR LKWLDRTRQF DYCLARRVFK SKY EENCRR RKIQVLQARG ASDAVIEEAN

UniProtKB: Ribosomal L22p/L17e protein

+
分子 #36: mL174

分子名称: mL174 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 36 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Toxoplasma gondii (トキソプラズマ)
分子量理論値: 22.605217 KDa
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GNFRIKPPGA RHAFPKLGTH RMVMFRRMNL LNWPPEDASP LHPIEPWGRQ FFVFNAFATI DPADWCGPRG PFPRLPPLAK PAPDAATLA ASPSSLLSAL RETEERSATR TVMCVTDFAQ RPLMFLGKDD FRALRENLPR IKEELKAFKE RIQPNPVHAQ Y DLRRKLLV YPRQAMQRLK TGEHGGYGTR RGTIRERKT

UniProtKB: Uncharacterized protein

+
分子 #37: Large ribosomal subunit protein uL23m

分子名称: Large ribosomal subunit protein uL23m / タイプ: protein_or_peptide / ID: 37 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Toxoplasma gondii (トキソプラズマ)
分子量理論値: 25.045127 KDa
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PPKTPRNVFF PWQVFSVHRT GAFLERRRVA LKVPVNLTKF EIQSYLEKIY GARVLKVSTL IVVPRRRRDI FGPRPSMRYY RVGCTFKKA IVTLEDGVPD AVKMLRSSIE LAKNPDITKH NLTYSGRVRA FKPPSAAQRW EMGESKYAWR LPIPNLLAGD E MQLNPALR IDESTTQMFP DFSKPFFHNA HFNFSWKPEE VPFQQTVKLD ITPWRR

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL23m

+
分子 #38: RAP domain-containing protein

分子名称: RAP domain-containing protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 38 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Toxoplasma gondii (トキソプラズマ)
分子量理論値: 83.547664 KDa
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FFYYRFHKRI GKGNFNRYLE FYQKPRGIEN TLRLRYNYTP TFTAKKRSEM WKVNLVKKIA HATDAKQVLD VWTYYRHRRT KRPYHYLLA LQRLVEVGGC DPTDFRFRLI ARGIYRTAKR FINLPRVCVY LAKLNATGDL QDLSRFLIPQ VEAYFPFQLC L LAHAFGSV RLQDKVLFAA IDEALRPHLS ELPAAMLVKL TQGYAGALVH NYGLLARVSL LLQQRLSRAA TGEADPLTAC DE EDETGRT LSSKEPQGGS RQRETTKAAR EITEAEDDCL EATEKKTVKR RHSGPLLPTL HHLLAFGRVC ADLKYQDFGY LEM LSIQMQ AAFRADLAVS SSRETFQRFS PFSVQELVEI FHRLKVNDVS LLLAALRHVQ ARMHDYPPSC VASIGFCTAQ MLPC DASTV RQVHAQMLEV LQEAVPLLDL CSLGQLAAFA KKAKPRRNRS ALRSSVFEAV EARVIELQGD GRTVFDVGRL LELLS LNGR RVSEEAFHIL CRQAHRHLDL FEPQDFCRLA RALARVKCQG SRGEQSEGLQ ASSLVNALAR RTLRQEDEFS PRDFLS LLR SLTLAGPPDR VYAVPLKEKL RRKQVLHNYF PASQSEDAEA FEDSEQLLES DLPPSSRQTP TLRKGRLLLG PQVIRRP QQ QGSPESAEGE ARSEKETLEE ESLSYSPVPD GEQEAEVNGN HAGKSVSVLS EGGRSRIRRR RLEEKLRIAE EEGWDLLH R RVASLRQLKG WL

UniProtKB: RAP domain-containing protein

+
分子 #39: RAP domain-containing protein

分子名称: RAP domain-containing protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 39 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Toxoplasma gondii (トキソプラズマ)
分子量理論値: 58.330211 KDa
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EKLYGIPHNG FWNQRRMYTE ARGQTAALAA MQDPVEVLNF AGSNEMASTY LLVSCLRRVS ALCDKKHAVL ETVAKDERLQ RLIQLISPH VDDCDARCLV DLCWAVWGFR GAPDVVEPLL NRMASVVVRR ENAFTPKQLG TIAFTFSWFR GAPTDTVADF V LAECVKLL PEMEPFHVTL LFGSLRRMRR LNRDVANLMI EKLTDDIDRF TSDDVVGVLR ALAANSITRG FLLRRVATLV FD NLDSFKP KQLASVLNSL TLLRFLTVEN GEELFSCLSG SLSELPAASI AEILEALTIL NFPRPEVVRT CLDLLAEKNG LIS QGSWVR DHMIIAAHAV IQFQLYDKNP VVKPLLEELF RSRVNSSRTQ HRVEEVIHAL DLEKASPRVD VPPYWRAMID QANR EEQAR LEHSGLQNEL TLVLDSLRGK FQLQIQKNQQ AGPYSVQFLD DETKICIEID YPCCRTPHII KARHLKQLGY HYLLV DCWQ WRRLRSEAEQ TVFLKQLLSG PLLEVGRL

UniProtKB: RAP domain-containing protein

+
分子 #40: RAP domain-containing protein

分子名称: RAP domain-containing protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 40 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Toxoplasma gondii (トキソプラズマ)
分子量理論値: 49.907582 KDa
配列文字列: RLQRLIQLIS PHVDDCDARC LVDLCWAVWG FRGAPDVVEP LLNRMASVVV RRENAFTPKQ LGTIAFTFSW FRGAPTDTVA DFVLAECVK LLPEMEPFHV TLLFGSLRRM RRLNRDVANL MIEKLTDDID RFTSDDVVGV LRALAANSIT RGFLLRRVAT L VFDNLDSF ...文字列:
RLQRLIQLIS PHVDDCDARC LVDLCWAVWG FRGAPDVVEP LLNRMASVVV RRENAFTPKQ LGTIAFTFSW FRGAPTDTVA DFVLAECVK LLPEMEPFHV TLLFGSLRRM RRLNRDVANL MIEKLTDDID RFTSDDVVGV LRALAANSIT RGFLLRRVAT L VFDNLDSF KPKQLASVLN SLTLLRFLTV ENGEELFSCL SGSLSELPAA SIAEILEALT ILNFPRPEVV RTCLDLLAEK NG LISQGSW VRDHMIIAAH AVIQFQLYDK NPVVKPLLEE LFRSRVNSSR TQHRVEEVIH ALDLEKASPR VDVPPYWRAM IDQ ANREEQ ARLEHSGLQN ELTLVLDSLR GKFQLQIQKN QQAGPYSVQF LDDETKICIE IDYPCCRTPH IIKARHLKQL GYHY LLVDC WQWRRLRSEA EQTVFLKQLL SGPLLEVGRL EG

UniProtKB: RAP domain-containing protein

+
分子 #41: RAP domain-containing protein

分子名称: RAP domain-containing protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 41 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Toxoplasma gondii (トキソプラズマ)
分子量理論値: 43.435762 KDa
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RELGLGAASA IEQKASAFFS RLTDVQQRQL EKQGLLASRF YRFLVISLME KEGTFTYYDF YVWRKGCLAY LKAAEEEMQG IVGKSARKL ADLGWEKLRP STSPEFKEME LHLKILSHFT PEELSRDTAE QFTSAAIKNI AKAAETSVKN VKNVLLGHAI A LTDRTWYM RLMEMQRPIP QSVEDYLLLA ETDRPYMIRL PYGEKFYNYE LEEALAKKRA SERHKSQRDV PRLGRKQHRI RR LFVPNAR VAFDRWARIP HARLDAYGNF LYRLNQPAKG AAAVARAAER EKLRVEMSEN AEFYSDAALS ASRITLNNLP PGA FRRRTG MQRKSGEIHH VAPPRDPVLR ELFAAAIQRE KDEKRNRERR AQEDAAAAEK

UniProtKB: RAP domain-containing protein

+
分子 #42: HECT-domain (Ubiquitin-transferase) domain-containing protein

分子名称: HECT-domain (Ubiquitin-transferase) domain-containing protein
タイプ: protein_or_peptide / ID: 42 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Toxoplasma gondii (トキソプラズマ)
分子量理論値: 25.178906 KDa
配列文字列: GGSYGYDAFF RGAAEVLNGS NIQLPHLPEN EEQKEGKVYQ LHSVRFPPQV RRLGANYFFR RQRAVPLTYY HHLVEAKPAS EGSAPDGVH AQTGRGQALC FVASANPGYL QSKELENAVF ESTRGFACQL ILEGRGVKAY FDPEWPNLMV RLGVGVKPLA L RRLAEQYA ...文字列:
GGSYGYDAFF RGAAEVLNGS NIQLPHLPEN EEQKEGKVYQ LHSVRFPPQV RRLGANYFFR RQRAVPLTYY HHLVEAKPAS EGSAPDGVH AQTGRGQALC FVASANPGYL QSKELENAVF ESTRGFACQL ILEGRGVKAY FDPEWPNLMV RLGVGVKPLA L RRLAEQYA TRAKIFVDKR GLLLTVHGYD KCAVGTLAMS LFNHLQANPY TMKGAHVAMH PIKKKVTR

UniProtKB: HECT-domain (Ubiquitin-transferase) domain-containing protein

+
分子 #43: Large ribosomal subunit protein uL29m

分子名称: Large ribosomal subunit protein uL29m / タイプ: protein_or_peptide / ID: 43 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Toxoplasma gondii (トキソプラズマ)
分子量理論値: 25.977322 KDa
配列文字列: GIDELWKGSY LDPTIGAKQK EANAVAGDAW PACLLRMKSF EDLHKLWYIC LKEKNLLMGE RWAARQHKQE MKQPERLQKV RRTMRRILI VLTKREIQQQ CLRAKDILAK QQKREALETR RFQLEEKMLQ LEHRIRRMEP AQSLQKEAWQ ATLDRYRSDH E DILIQLHP ...文字列:
GIDELWKGSY LDPTIGAKQK EANAVAGDAW PACLLRMKSF EDLHKLWYIC LKEKNLLMGE RWAARQHKQE MKQPERLQKV RRTMRRILI VLTKREIQQQ CLRAKDILAK QQKREALETR RFQLEEKMLQ LEHRIRRMEP AQSLQKEAWQ ATLDRYRSDH E DILIQLHP LRKETTQLLA PDWRYERKYS DLPGPIRWKK QYIPALEDQY RKPIRF

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL29m

+
分子 #44: Large ribosomal subunit protein uL4m

分子名称: Large ribosomal subunit protein uL4m / タイプ: protein_or_peptide / ID: 44 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Toxoplasma gondii (トキソプラズマ)
分子量理論値: 54.296121 KDa
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PLQPSFTPSV AFPAHKPVPL NSPLSPSVHA APQVRRPGSV VRMNEVIRHW WSVPAVGFNS VLEVPIYRFE VFQRRAEEAG EGEASIAEE GDHPEEEEGC VVLPNDIFGL PLRPDILYRC YWFYRRAIAG WTERMQLFKW EWPGSKRKLR TQQRSGRARI G WRKAPGKY VGVKAHPLRP HDQRIKINKR LLWQGLKIML SAKFAQGQIT VVDHFNLQSH KTKHCVRHLR RLLGRKCPSA LL VHEGTTD VNDNFRYATA HILAVRRENV EGINVYNLLK YRQLVITEKA LLKLIYNIQT YPEKRGWLPK YATPDGKPAP APE KVEGWD REWRQMKERE RNAKFSKALL RERILKWKWS DETKGAIKVP RVDPFKGFRL ARFSLHEPTM PWEKFEENYV DTDP LEDEE DGDMFDEAQA LGEETQRLER LDHEELSDAA AYDDMSLTDM PLTERMHRPK RLENFKMEP

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL4m

+
分子 #45: RAP domain-containing protein

分子名称: RAP domain-containing protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 45 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Toxoplasma gondii (トキソプラズマ)
分子量理論値: 67.893922 KDa
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SRSFPLGIKQ TLPRHILRAT GDQPSSSSSM SALAAKPPKS PCSLSVDTCK DSSPSELVVY ERRDGKRWVH RHQLSLYLSH AVGLGYFRA QFEDSSVTPA AVFDCLSHLV RPPVHAARSE EDEGDEGGER RQNKQVDGAP DGDGERVTAQ DLSEFMKNCV A SRYRDVDV LDVVTDVLSA LLIGSADLPL LVDIASSCIA LSLLRPKLFT AIASRLLVLL PPAPASGSSP LDAAALSPRQ AV RLVESFS HQRFRHPDVL PLLFLSLSPS LPFLSPRLAC RLLHAVAGLG ACAAPAETVQ LLLSRVASGL GDCVGRPGCE SET HCQTAT GDHRMIQQTS DLPESEFLEK QIQGQKLQPQ LALADLTKAT HALLLLEIEL EQKPLLESLL TAMAPEIFDH PVEF WSSSP AGPSLHRRLL LIRTALRHLH RDTIYNSLPT MVRQAFRRLH RIEITSPPRS PTHFVTRMSA LLTRLRIAHF CYAIR GPLV FDVLERDRPI VWQCNTADRF YVNSAEKTTA VKLQERITQA MGLKVGNCEY WQWMKMKRKR TRLEYIRMQR YYILKD RRQ HDPDFEGWTL PLVHHMHRRN RLHYDYYFPN YTPLSRVEY

UniProtKB: RAP domain-containing protein

+
分子 #46: mL177

分子名称: mL177 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 46 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Toxoplasma gondii (トキソプラズマ)
分子量理論値: 13.90315 KDa
配列文字列:
GVLRSLYSRV SQRVWSTLHF RVGSRGQVRT NKGFKPTAFP HLGAALFFAR MSKGLTRDSV EKFVRLNVSE AQRQEIKNWP GSVVRCIEN GACIPSRELQ SRLEQVVGVP LTRRKKRAGN RRL

UniProtKB: Uncharacterized protein

+
分子 #47: AP2 domain transcription factor AP2VIIb-2

分子名称: AP2 domain transcription factor AP2VIIb-2 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 47 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Toxoplasma gondii (トキソプラズマ)
分子量理論値: 21.280488 KDa
配列文字列:
EPKVYRQREG MIQFVFQWGI GNSFRAVSAN RFRPVHAARP KEVSIHPSYF ESPHPFVIWE PLNEAWEVYF YENLKKSAKP FPVKKFGIA RAKREALLFL EQMKLEGKLE KPTFSSGVDG VTFDQVTGSW ICRFVDEEGR CVSRGFGADF HGFEEARKLA I ERQAEMKK VEASGLGPRM RLVKEK

UniProtKB: AP2 domain transcription factor AP2VIIb-2

+
分子 #48: Large ribosomal subunit protein mL43

分子名称: Large ribosomal subunit protein mL43 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 48 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Toxoplasma gondii (トキソプラズマ)
分子量理論値: 22.268557 KDa
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MASRGGTLWH LKEVVIQYSA SGNSSQGLRF FFRHLLHRWK QRNPQVQVHT VENKYEAPKA TFKYLGERTD SRCETPLKDL SPGQIEQIL DLHRNSKGDN RFLKHGGPRT WTERRSIQGL WRPSLPSQLI ALKWFRRKRP PMRLPKYSPL SLSLSIQAIR G HGRWGSER EFPRGWDQLH LKDILGSPLR SE

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein mL43

+
分子 #49: Large ribosomal subunit protein uL24c

分子名称: Large ribosomal subunit protein uL24c / タイプ: protein_or_peptide / ID: 49 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Toxoplasma gondii (トキソプラズマ)
分子量理論値: 22.014469 KDa
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MKFVHPRHWI LQWKIRPGDK VVVISGKFKT IRGTVLQIDK MRNGVSVSGV KEQKRVKQED GSFIRIPGLI HVSNVMLIDQ AIDLPTRVA LRVDDRGNVV RISKKSGLVI PWPNGEMIKF GDNRKSREFL KSKEERDVEL RKEQNDDEER AGPKDTPAEV A VERTYDYQ RDVATMQALR QMMTKYNRDF R

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL24c

+
分子 #50: mL185

分子名称: mL185 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 50 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Toxoplasma gondii (トキソプラズマ)
分子量理論値: 6.289062 KDa
配列文字列:
NESSPLHMGA GSANWTAVAR LEDFTLRGLS HPPWIHVSSR PFYGAGGGAV LAACMSSAVW

UniProtKB: Uncharacterized protein

+
分子 #51: Transmembrane protein

分子名称: Transmembrane protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 51 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Toxoplasma gondii (トキソプラズマ)
分子量理論値: 31.526201 KDa
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PFKIFKASPP PAPTGRKPTG YRGNHWHKKV LYDPVYPTTK VPAALVPRYP IDWRNGGRAL LIAALSKLEG ASALQRRIFL RENSRESQV PQTPLSPFQT GSSASGGGAY LVSSLGRKRS YVGRIAVSLM PRHRQIADYQ RVGGFCSPRC FSECSKELRR C LCAWRCTG FHEHVVQMDG MLGEYKGEVK TEKPLFSVLR RQARRNADPS EGVAFCAESA KFKSVRRAQH PAFEAFDRQG PD GPSQKPA PRKEPPLPFY SASHVPNVPR PPPPQPYTGP LKVREG

UniProtKB: Transmembrane protein

+
分子 #52: bL19m

分子名称: bL19m / タイプ: protein_or_peptide / ID: 52 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Toxoplasma gondii (トキソプラズマ)
分子量理論値: 43.663891 KDa
配列文字列: LRHRVLPSSL PNRLFSVDNR ETTRFWPPPL QKEEDERRGA FVESCLQPSG KASLLQPPQC LPRAPSHLAK LMEEEERLRL YRHLKKEER DAATLNKFGI WAGEPIADTP AAKMQPLVAR TCRQTMRHLQ QIEIERLDKQ RNFQVPLFGP GDLMEVKYEL S RSQQTFAT ...文字列:
LRHRVLPSSL PNRLFSVDNR ETTRFWPPPL QKEEDERRGA FVESCLQPSG KASLLQPPQC LPRAPSHLAK LMEEEERLRL YRHLKKEER DAATLNKFGI WAGEPIADTP AAKMQPLVAR TCRQTMRHLQ QIEIERLDKQ RNFQVPLFGP GDLMEVKYEL S RSQQTFAT FQGYCVEVRK KRLNSSFVLR NSYEGIGVEQ RIPLYSPRII SLKVVSSCAS PTQDFLLERH KPLTRDYRYK WK YNFRGRW SRRIGKHKPG IRSVEKKIRQ RIVRIRKRYM GQRIEAGLPP YVWGGPYPQY GRKRSLFIRG EMYRRMLIYS FDE RRRRAE KLRKRRQAVK WGVFKLRQPS VPPALTALPT YHPLYPGNLP KR

+
分子 #53: RAP domain-containing protein

分子名称: RAP domain-containing protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 53 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Toxoplasma gondii (トキソプラズマ)
分子量理論値: 85.917836 KDa
配列文字列: WYTPPSKRTW SKQHNKIFTP RPLSERFSPH KLHPEFEWWR ERTVQPSALF MGFPDLLALP LRGGSAYIHE MDAATLAVVL ASLAHSPSA YSVSERRPPP SPSPAVSLSS SSFSPTHLPQ HLDSLLALLG RQAAATAAHA PDSTLAFLFR GCAEAGVVEK N VVCTLLGR ...文字列:
WYTPPSKRTW SKQHNKIFTP RPLSERFSPH KLHPEFEWWR ERTVQPSALF MGFPDLLALP LRGGSAYIHE MDAATLAVVL ASLAHSPSA YSVSERRPPP SPSPAVSLSS SSFSPTHLPQ HLDSLLALLG RQAAATAAHA PDSTLAFLFR GCAEAGVVEK N VVCTLLGR VEQRLPCMQL PECLVLLDAL RPGLPEVYRH PRFVARLVAH AGLLLQFRGA ESEAEDLCDL AFSLVFAANC RD AALLQTT ALLLVHGKRM QSLNETAPLA LARAMEAFAA CRDAVNAPLL AETAAAAENG DAEGSRNTKA AELFCASPLL RAR EPSVHL SPSGWLLLSL LSPVVQALHR AEKGRRKRRG FHQDGEAAGL TAEREVQNRG ASRESHALTE AAARAAAAVA EETQ TLKNR ESSLFRGLLR CLERVDDHRE SLSPGSMCKV LFAATVARAA PSRDFFPDVL KRLGDQLGAC TPEDLSRALF ALVKL SSVS GLDPRCQDLL PPLLGTVLQA VESSLPVADV ASLARLHSAA VSALISSSET KKEEMKQLAE ETSRLMHARL EEASPA HLT AFVRHWDLVP APSGAFREAL VAQAIRQLYF FDEDHLSRLL EGVTRLAASS KDETLLASVD ELFRRAEEEA TTEQAFF SP ESCLRIFVSL VRYGEVRPEA PRNRERLVVA LCNYLTGVDS VAAVSSDGAS DPEELWVKED EDLPLLFFAE DAKGFSLR E DSALDRDSAN ESRLQALSAA SYIRLLGALR ELGVRGGVLL SRVAQLLHMK RYDLTDAQQE AAAEIC

UniProtKB: RAP domain-containing protein

+
分子 #54: Putative ribosomal protein L28

分子名称: Putative ribosomal protein L28 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 54 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Toxoplasma gondii (トキソプラズマ)
分子量理論値: 33.213918 KDa
配列文字列: PKNLNLWGKY LRLVGRGARR GFKKWQVIPP IPVKAYGREP SAASQTGLYH DEDFNYHTKR TFSMRRTRRK IKPNVFRRTF TSSLLNVTI PNVRVTTSAL HAMDDMGGFD AYILRTPPQE LRSHMGERMR QVMYYYQDQP AIRDWGLPWK VFLKVASRRD P FYACYRHN ...文字列:
PKNLNLWGKY LRLVGRGARR GFKKWQVIPP IPVKAYGREP SAASQTGLYH DEDFNYHTKR TFSMRRTRRK IKPNVFRRTF TSSLLNVTI PNVRVTTSAL HAMDDMGGFD AYILRTPPQE LRSHMGERMR QVMYYYQDQP AIRDWGLPWK VFLKVASRRD P FYACYRHN LRKQQYEADL RSRVRSFSPY YLPSGHQPHA ERQVFHEGAG ESPPLNLWWR ENRELEEAFR RRLGEAKCFE RA FADSSEP LGYTKGRCRG GGGKSGRSVR RRSKTHKYRE NRAF

UniProtKB: Putative ribosomal protein L28

+
分子 #55: Ribosomal protein L15, putative

分子名称: Ribosomal protein L15, putative / タイプ: protein_or_peptide / ID: 55 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Toxoplasma gondii (トキソプラズマ)
分子量理論値: 36.395137 KDa
配列文字列: NAERGDADGG TSALRVTREQ FHDGSRGLFR PHPFNRRFAR VRKPVFPIEA RNLRLMYKRK SKRRRGRGDK SNAKGIRWKH VHQQAGRYK GPRSRTFEGG KLPLYRRIPK WPDAWLARQR KVLEPLNLAK LRTFIESGRL DTRFTITQRH LNDSRCVKVK N GVSLFNVN ...文字列:
NAERGDADGG TSALRVTREQ FHDGSRGLFR PHPFNRRFAR VRKPVFPIEA RNLRLMYKRK SKRRRGRGDK SNAKGIRWKH VHQQAGRYK GPRSRTFEGG KLPLYRRIPK WPDAWLARQR KVLEPLNLAK LRTFIESGRL DTRFTITQRH LNDSRCVKVK N GVSLFNVN DYPFPYKISI EVAGADQSSI DAIRRVGGEV IIVYRNRLNL RAHIKPYKFE VLPKTARPNL EMVHYLEKMR AR GCVVKYV KPQWLIDEEK SLKTELAEFE AEALIAKGEA IERGDPDLRE SVDDLQQRLL KRFRLRETRA AELL

UniProtKB: Ribosomal protein L15, putative

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分子 #56: mL40

分子名称: mL40 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 56 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Toxoplasma gondii (トキソプラズマ)
分子量理論値: 27.113559 KDa
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PKHLTRYLPF VPTSLVHETT SFLHDATKLR ALLALIFSPC KPEASVADEL ASPAARLEFQ QEKERYHAIR DQHTDCYRRH ESAAAASMW RAIEALPSDL YEEAVQSVTF APPYENEPPP PDPSELRPGK NASTETQAAS AGQQPSAASR GSSVRTLAGP G AAGEAVSQ PEHGFYHERF AFPRALMFHE MYGEQIFQSL SQLERRKLQV FMNLMHVRYP HAELKRDKPA LFWLPERQVL SR

UniProtKB: Uncharacterized protein

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分子 #57: mL164

分子名称: mL164 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 57 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Toxoplasma gondii (トキソプラズマ)
分子量理論値: 26.163025 KDa
配列文字列: DRFRSAVHRE MIVAMTRTHL QNLLLKRFGT FKTQECRILA SPAFSAVVLK AWASAVVDAN LRLDGEGAMR LAYASPPPAV LSDPKVKEL VASDPEAAWM LKKLSCQSVA SFASLPREEE ALEEVVRVKQ KDNVPQPHFP SVLKMDHPQF PYEPHELEKM R DLYGVLLK ...文字列:
DRFRSAVHRE MIVAMTRTHL QNLLLKRFGT FKTQECRILA SPAFSAVVLK AWASAVVDAN LRLDGEGAMR LAYASPPPAV LSDPKVKEL VASDPEAAWM LKKLSCQSVA SFASLPREEE ALEEVVRVKQ KDNVPQPHFP SVLKMDHPQF PYEPHELEKM R DLYGVLLK WPYREQGQVA SVAARRASLE SKREERLRKG ETEVAGQLKV TTGCSDSYVY APSEMETGLY REHA

+
分子 #58: mL180

分子名称: mL180 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 58 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Toxoplasma gondii (トキソプラズマ)
分子量理論値: 13.209486 KDa
配列文字列:
MRNAIFPRID FLRYLKKIHV SYCPTRPKTE IAKQLIMRVT SESVKKKFPH LQASWEMLAY DAPATVEVEL LDGRRVRRII DGYSKAEKK KIVDDWRFTA NMEPWPEVLG PQP

UniProtKB: Uncharacterized protein

+
分子 #59: Putative 50S ribosomal protein L16

分子名称: Putative 50S ribosomal protein L16 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 59 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Toxoplasma gondii (トキソプラズマ)
分子量理論値: 20.393672 KDa
配列文字列:
PPFRFKAPQE VRIKVPIGRI PPAVGPEIRL GKSIVAVAPH RVTAEQLEDA RRVLRRVLGR SKEVHQNVHA TYAVTRKPEG TKMGQGKGS IDRFVARVPA GRILFHIPQI NPFHPFPEVE PNFAAFKAIA PRLPVPVVFR EQNNFFQMHS VKDLIRKRQA E ERENREKT ARDKLGGFHT D

UniProtKB: Putative 50S ribosomal protein L16

+
分子 #60: mL173

分子名称: mL173 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 60 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Toxoplasma gondii (トキソプラズマ)
分子量理論値: 11.371296 KDa
配列文字列:
TVKSLAAAEQ WEPSPLTLKQ HQQVVVWKKD RTCILCKKEV QGGNVEKVET ACEKAWRFLS GYSRSAHVCP ILPQMRILRY GELPLRDRA KFDAKLRRE

UniProtKB: Uncharacterized protein

+
分子 #61: Large ribosomal subunit protein bL21m

分子名称: Large ribosomal subunit protein bL21m / タイプ: protein_or_peptide / ID: 61 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Toxoplasma gondii (トキソプラズマ)
分子量理論値: 47.176762 KDa
配列文字列: LQIYPQRRVI GHRIEIFRGK HRRRRMVPPR IPLHPLAANT SEETASKDMN LFETYRDLQL RWKKTCRQRK KKFNIARKWR MPRNIRPLP DPSWTLVFHV NPRSGYRRGR GVCRDRRREN LQGDALEVSA EDEENRLAGK APSNRDQEDR QRGRGAQETY F RSGAALDA ...文字列:
LQIYPQRRVI GHRIEIFRGK HRRRRMVPPR IPLHPLAANT SEETASKDMN LFETYRDLQL RWKKTCRQRK KKFNIARKWR MPRNIRPLP DPSWTLVFHV NPRSGYRRGR GVCRDRRREN LQGDALEVSA EDEENRLAGK APSNRDQEDR QRGRGAQETY F RSGAALDA AIEEENILQI LARHPEKGRV EGSGRPRGAD GWGRDGPLPQ WMQILQRTPQ EELFCVMKSN VSTQHKVTAG DL IQAEKLH RKQAGDKVVF GTVMLVGSRD WTIIGKPTVP FAKVEATVEE QTLAGETLSF FYRKSRRVSR FRRIRHCVTM LRI DRIVVD PNMTVDPPAP KPDRLLDLWA NRWLYPDELD GIKRNESGEP VVSEIYDGRE HQKGSYQRRG LTASYRWYPD PQSA HWRP

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein bL21m

+
分子 #62: mL182

分子名称: mL182 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 62 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Toxoplasma gondii (トキソプラズマ)
分子量理論値: 14.08363 KDa
配列文字列:
TEPISHMQEK PATLRLRGLP YRTTAEDIAN FFEGYSLAGP PDEAIQLHRR MDGRPTGWAS VYFESEQEAR RAKQDKHRSY LHGRYIEIF INFETGELEW IHQPQLSENV NRKHHGKDNR G

+
分子 #63: mL178

分子名称: mL178 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 63 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Toxoplasma gondii (トキソプラズマ)
分子量理論値: 10.027898 KDa
配列文字列:
GHKHSESVLQ QFYNRLPVRK RFLKAIRKGT LIWDKGQVKI PPIAMQGYGL PNKLVLPHQK EFNNKLPKFK GKINQLKATR IWFQD

UniProtKB: Uncharacterized protein

+
分子 #64: bL27m

分子名称: bL27m / タイプ: protein_or_peptide / ID: 64 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Toxoplasma gondii (トキソプラズマ)
分子量理論値: 20.579828 KDa
配列文字列:
ASYRRPSRAS PTGQARKPHV GVRRLAAEYV WPGVVLVKQR KVIAFNVETK RRNRHFKLYP GENVKVSKVT NLVALCHGRV KFTHDVSRD VLVVNVLPER REELLREDLW RYRTEHVRSM EENRHICFLR RKAVRMFGKE LVNPPTKPPL RPFYFTKYDS W ENPALPDV PQLDDD

UniProtKB: Uncharacterized protein

+
分子 #65: mL179

分子名称: mL179 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 65 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Toxoplasma gondii (トキソプラズマ)
分子量理論値: 12.288569 KDa
配列文字列:
AHKFAAPPCP NLLLLRKTIH QRLQPILFFL KNDVTMGNYV YDQHFKGVLC SPLFEGKSYK EIYAMVDRVL EDIGLSGRVK LYCEPPSLL HKMKYHVRKH WPLEKG

+
分子 #66: Transmembrane protein

分子名称: Transmembrane protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 66 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Toxoplasma gondii (トキソプラズマ)
分子量理論値: 4.380174 KDa
配列文字列:
IRPRKKGMRL DRRRSKKQYK HGRHVGGWNY RWLGS

UniProtKB: Transmembrane protein

+
分子 #67: mL53

分子名称: mL53 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 67 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Toxoplasma gondii (トキソプラズマ)
分子量理論値: 13.313315 KDa
配列文字列:
PKYDLFKPLD FLACVKSVHV AYHPGRPRSE VCRQLIHHMK SDSVRKRFPS LQASYQLLGY NAPSTIKIEL INGKKHEFQA EHFSLREMQ MRFDTDQFEA YLEYMKSQSV EAKP

UniProtKB: Uncharacterized protein

+
分子 #68: bL32m

分子名称: bL32m / タイプ: protein_or_peptide / ID: 68 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Toxoplasma gondii (トキソプラズマ)
分子量理論値: 9.466959 KDa
配列文字列:
AVPKGKRSKH KCKQRQLIYF FDQFDGVFKR RRESFYRSFY NPPYFSKQTE QTSLPPSVLR PFRFPGFWPG RFAFKMAS

UniProtKB: Uncharacterized protein

+
分子 #69: AP2 domain transcription factor AP2IV-1

分子名称: AP2 domain transcription factor AP2IV-1 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 69 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Toxoplasma gondii (トキソプラズマ)
分子量理論値: 19.040816 KDa
配列文字列:
GTQRVVQKRR HQMRILHPAQ TAYVPVEQRP PPIPHSLTAS STVKRLLNNN TVAAKEAAKR INWGAYISHQ RGVRWHPQGA WRVQFSRRN HERNFFVRCE CYFRVGTYGF QMAKDLAIRY RQRLEKEWEE LQEQWTKLDI LEAEQRAKYK EKREEHLLL

UniProtKB: AP2 domain transcription factor AP2IV-1

+
分子 #70: mL181

分子名称: mL181 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 70 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Toxoplasma gondii (トキソプラズマ)
分子量理論値: 5.74183 KDa
配列文字列:
CNPQQTRRKQ QYASIIGKQG LSKKQCGIFW DYYKRKCKKR RSTKKFI

+
分子 #71: mL184

分子名称: mL184 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 71 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Toxoplasma gondii (トキソプラズマ)
分子量理論値: 4.226115 KDa
配列文字列:
WNRNPSARYP KKGNKGCRPV CRAMRKIRKR LRTGR

UniProtKB: Uncharacterized protein

+
分子 #72: RNA23t

分子名称: RNA23t / タイプ: rna / ID: 72 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Toxoplasma gondii (トキソプラズマ)
分子量理論値: 14.103465 KDa
配列文字列:
AACAGGUGCC AGGCCAACAA GAAUCCGAUC CGUGUAUUCC GUAC

+
分子 #73: RNA29

分子名称: RNA29 / タイプ: rna / ID: 73 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Toxoplasma gondii (トキソプラズマ)
分子量理論値: 16.10764 KDa
配列文字列:
UUCGUUGACU GUGUUUACCA CGGGGAAUUA GAACAGAAUA UCAAAAAAAA

+
分子 #74: LSUB

分子名称: LSUB / タイプ: rna / ID: 74 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Toxoplasma gondii (トキソプラズマ)
分子量理論値: 9.946909 KDa
配列文字列:
AUGUUUGCUU GGAAGCUGUA GUCAUUAAAA A

+
分子 #75: RNA6

分子名称: RNA6 / タイプ: rna / ID: 75 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Toxoplasma gondii (トキソプラズマ)
分子量理論値: 18.903307 KDa
配列文字列:
UGAUAUAAUU AUCGUACAAG CACUCAGCUA GUUAUUGAGA GACACUCACG AGCCCAAAA

+
分子 #76: RNA1

分子名称: RNA1 / タイプ: rna / ID: 76 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Toxoplasma gondii (トキソプラズマ)
分子量理論値: 30.072777 KDa
配列文字列:
CCUUUUAAUU GAUUAUGCUG ACUUUAGUCC CGAUAAACUA CAGUUCUGCU UAAACUGAGG AGUCAAGUAG GUACAAACCG UACAAGGAU UAAUU

+
分子 #77: RNA31

分子名称: RNA31 / タイプ: rna / ID: 77 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Toxoplasma gondii (トキソプラズマ)
分子量理論値: 11.474785 KDa
配列文字列:
AUCAUUGUGU UAUGGUUCUA UCGCAAACCA UUGAGA

+
分子 #78: RNA14

分子名称: RNA14 / タイプ: rna / ID: 78 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Toxoplasma gondii (トキソプラズマ)
分子量理論値: 16.141808 KDa
配列文字列:
ACAGGAUCAA AUCUUCCUUG AGCGACUCGA CAGGCAAAAA AAAAAAAAAA

+
分子 #79: RNA11

分子名称: RNA11 / タイプ: rna / ID: 79 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Toxoplasma gondii (トキソプラズマ)
分子量理論値: 22.303367 KDa
配列文字列:
UUGCGUACAU UCCUUAAUAU CUGGAACGAU AGAUUAUGAU UAGGUAGUGG AAAAAAAAAA AAAAAAAAA

+
分子 #80: RNA36

分子名称: RNA36 / タイプ: rna / ID: 80 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Toxoplasma gondii (トキソプラズマ)
分子量理論値: 10.631465 KDa
配列文字列:
AGGGCAUGCA AUACCAAUCA GAUAACAACU GAA

+
分子 #81: RNA3

分子名称: RNA3 / タイプ: rna / ID: 81 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Toxoplasma gondii (トキソプラズマ)
分子量理論値: 29.09023 KDa
配列文字列:
UCCUAUUUCC UAGUACCAUU AGUGAACUCA UUUGGUCUGA UCCUAAGUAC GCAGUGAGCU AAAUAGAUAC AAGGAACUUG ACAAGCAUU AC

+
分子 #82: RNA2

分子名称: RNA2 / タイプ: rna / ID: 82 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Toxoplasma gondii (トキソプラズマ)
分子量理論値: 20.90449 KDa
配列文字列:
GGACUCCUUA ACUUAAACUG AGGAGUCAAG UAGGUACAAA CCGUACAAGG AUUAAUUAUG UCCAA

+
分子 #83: RNA38

分子名称: RNA38 / タイプ: rna / ID: 83 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Toxoplasma gondii (トキソプラズマ)
分子量理論値: 14.798939 KDa
配列文字列:
UGUGUGAGAA GGAGCUAUAC AGAUACAGGC GAAGGAGAAG CGGGA

+
分子 #84: RNA35

分子名称: RNA35 / タイプ: rna / ID: 84 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Toxoplasma gondii (トキソプラズマ)
分子量理論値: 8.744303 KDa
配列文字列:
UGUAACGGUA CAAGCUGUAA ACAAAGG

+
分子 #85: RNA32

分子名称: RNA32 / タイプ: rna / ID: 85 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Toxoplasma gondii (トキソプラズマ)
分子量理論値: 5.058104 KDa
配列文字列:
AUUAACAUAA CAACAU

+
分子 #86: RNA15

分子名称: RNA15 / タイプ: rna / ID: 86 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Toxoplasma gondii (トキソプラズマ)
分子量理論値: 9.490738 KDa
配列文字列:
CGGCGAGAAG GGAAGUGUGU UUCAAAGAA

+
分子 #87: RNA10

分子名称: RNA10 / タイプ: rna / ID: 87 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Toxoplasma gondii (トキソプラズマ)
分子量理論値: 28.356836 KDa
配列文字列:
GAGUCUAGCU UCAGUUGUUA UCUGAUUGGU AUUGCAUGCC CUGAGUACGU AAGGAAAAGG AAAGGUUAAC CGCUAUUUAA ACAAAAAA

+
分子 #88: LSUC

分子名称: LSUC / タイプ: rna / ID: 88 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Toxoplasma gondii (トキソプラズマ)
分子量理論値: 8.406138 KDa
配列文字列:
CUAAAGAUAG CGUGAAAGCU CAAAAA

+
分子 #89: RNA16

分子名称: RNA16 / タイプ: rna / ID: 89 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Toxoplasma gondii (トキソプラズマ)
分子量理論値: 8.614088 KDa
配列文字列:
UUCUUGGCAU AACGUUGUGU AGUUAAA

+
分子 #90: RNA13

分子名称: RNA13 / タイプ: rna / ID: 90 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Toxoplasma gondii (トキソプラズマ)
分子量理論値: 15.628477 KDa
配列文字列:
AAGGGAUGUU UAGCCGGGAA GUUAGCGUCU AACAAAAAAA AAAAAAAA

+
分子 #91: LSUD/E

分子名称: LSUD/E / タイプ: rna / ID: 91 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Toxoplasma gondii (トキソプラズマ)
分子量理論値: 89.620805 KDa
配列文字列: AGGAGAGCGU CUGUUGUACA UCAACACUAG AUACCGCUAA UACCACUGUA GAGGUAUAGU AUAUAAUCCC UGCCCGGUGC AGUAACAUG UAAACGGCGG CUGUUGACGG UCCAAAGGUA GGAAAAUCCU UGUCGGGUAA UUAUCGUCGU GCGUGAAAGU U GGUCCGAC ...文字列:
AGGAGAGCGU CUGUUGUACA UCAACACUAG AUACCGCUAA UACCACUGUA GAGGUAUAGU AUAUAAUCCC UGCCCGGUGC AGUAACAUG UAAACGGCGG CUGUUGACGG UCCAAAGGUA GGAAAAUCCU UGUCGGGUAA UUAUCGUCGU GCGUGAAAGU U GGUCCGAC UCUUCACAUG UCGUUUAUCU AAAACUUUUU GAAAUAGAAU UAUCUUUGAA UAUGAGGAUC GAGAUGGCCC GA CGGUUAG ACCCUGAGCA CCUUUACAUC CCUUAAAUCA AA

+
分子 #92: SSUF

分子名称: SSUF / タイプ: rna / ID: 92 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Toxoplasma gondii (トキソプラズマ)
分子量理論値: 12.351436 KDa
配列文字列:
ACACAGUCGG UACGAAGUCG AAACAAGGUA GUUGAUGG

+
分子 #93: RNA7

分子名称: RNA7 / タイプ: rna / ID: 93 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Toxoplasma gondii (トキソプラズマ)
分子量理論値: 29.367545 KDa
配列文字列:
UGGGAGCGAA GAUAAUCUAA UAUGUAACUC CGUUCAUGGA AAUCAAAAGA GCUUUCACUG AUUGUAUUUA UGAAACGUGA AAAAAAAAA AA

+
分子 #94: LSUF/G

分子名称: LSUF/G / タイプ: rna / ID: 94 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Toxoplasma gondii (トキソプラズマ)
分子量理論値: 62.298734 KDa
配列文字列: AUAUAACGGU CGUAAGGUAC GCCGGGGAUA ACAGGUCAGA UAAUAUUGGG AGUUCUAAUC CUCGGAUUGU AUCAGCACCU CCAUGUCGG CUCAUUACUC CCUUGUUAUU GAACAAGAUU CAGUUAGGAA CGAUAGUUCA CCGUCAGAUG UAAUACGUGA G CUGGGUGU ...文字列:
AUAUAACGGU CGUAAGGUAC GCCGGGGAUA ACAGGUCAGA UAAUAUUGGG AGUUCUAAUC CUCGGAUUGU AUCAGCACCU CCAUGUCGG CUCAUUACUC CCUUGUUAUU GAACAAGAUU CAGUUAGGAA CGAUAGUUCA CCGUCAGAUG UAAUACGUGA G CUGGGUGU CUGGAGACAG UUUGUUCCCU AUCUAC

+
分子 #95: RNA37

分子名称: RNA37 / タイプ: rna / ID: 95 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Toxoplasma gondii (トキソプラズマ)
分子量理論値: 19.888807 KDa
配列文字列:
ACCGGUGGUU UGUUAGUAUU UAUGUCAUCA ACAUGUCAAU GAAAUAUCAA UAACGAUGAA AA

+
分子 #96: LSUA

分子名称: LSUA / タイプ: rna / ID: 96 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Toxoplasma gondii (トキソプラズマ)
分子量理論値: 57.982391 KDa
配列文字列:
GUUAGUAUGA UCUCAAAGUA CCAGAAGCCA UGUGAUCUAU AUAGUAUAAC GGGACAUUAG ACCGAACCUG CGAUAGAUAA AUAUAUCUU GGAUGAUUGU AUAUUAGCGG CUAAAUGUCA AUCAAACAUG CGAAUUUUAG GUUUUCCAUG AAAUCUAUUU G GAAGAAGA GGCUUGAAAA AA

+
分子 #97: ulr1

分子名称: ulr1 / タイプ: rna / ID: 97 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Toxoplasma gondii (トキソプラズマ)
分子量理論値: 8.833851 KDa
配列文字列:
UUUUUUUUUU UUUUUUUUUU UUUUUUUUU

+
分子 #98: ulr2

分子名称: ulr2 / タイプ: rna / ID: 98 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Toxoplasma gondii (トキソプラズマ)
分子量理論値: 11.283175 KDa
配列文字列:
UUUUUUUUUU UUUUUUUUUU UUUUUUUUUU UUUUUUU

+
分子 #99: ulr3

分子名称: ulr3 / タイプ: rna / ID: 99 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Toxoplasma gondii (トキソプラズマ)
分子量理論値: 8.527686 KDa
配列文字列:
UUUUUUUUUU UUUUUUUUUU UUUUUUUU

+
分子 #100: ulr4

分子名称: ulr4 / タイプ: rna / ID: 100 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Toxoplasma gondii (トキソプラズマ)
分子量理論値: 2.098203 KDa
配列文字列:
UUUUUUU

+
分子 #101: ulr5

分子名称: ulr5 / タイプ: rna / ID: 101 / コピー数: 2
由来(天然)生物種: Toxoplasma gondii (トキソプラズマ)
分子量理論値: 4.241363 KDa
配列文字列:
UUUUUUUUUU UUUU

+
分子 #102: ulr6

分子名称: ulr6 / タイプ: rna / ID: 102 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Toxoplasma gondii (トキソプラズマ)
分子量理論値: 4.547529 KDa
配列文字列:
UUUUUUUUUU UUUUU

+
分子 #103: ulr7,ulr8

分子名称: ulr7,ulr8 / タイプ: rna / ID: 103 / コピー数: 2
由来(天然)生物種: Toxoplasma gondii (トキソプラズマ)
分子量理論値: 3.0167 KDa
配列文字列:
UUUUUUUUUU

+
分子 #104: ulr9

分子名称: ulr9 / タイプ: rna / ID: 104 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Toxoplasma gondii (トキソプラズマ)
分子量理論値: 17.712656 KDa
配列文字列:
UUUUUUUUUU UUUUUUUUUU UUUUUUUUUU UUUUUUUUUU UUUUUUUUUU UUUUUUUU

-
実験情報

-
構造解析

手法クライオ電子顕微鏡法
解析単粒子再構成法
試料の集合状態particle

-
試料調製

緩衝液pH: 7.5
グリッドモデル: Quantifoil R2/2 / 材質: COPPER / 支持フィルム - 材質: CARBON / 支持フィルム - トポロジー: HOLEY / 支持フィルム - Film thickness: 2
凍結凍結剤: ETHANE / チャンバー内湿度: 100 % / チャンバー内温度: 277 K / 詳細: Blotting force 5, blotting time 2.5 seconds..

-
電子顕微鏡法

顕微鏡FEI TALOS ARCTICA
温度最低: 90.0 K / 最高: 95.0 K
撮影フィルム・検出器のモデル: GATAN K2 SUMMIT (4k x 4k)
検出モード: COUNTING / デジタル化 - サイズ - 横: 4096 pixel / デジタル化 - サイズ - 縦: 4096 pixel / デジタル化 - 画像ごとのフレーム数: 1-40 / 撮影したグリッド数: 1 / 実像数: 9524 / 平均露光時間: 6.0 sec. / 平均電子線量: 50.0 e/Å2
電子線加速電圧: 200 kV / 電子線源: FIELD EMISSION GUN
電子光学系C2レンズ絞り径: 30.0 µm / 照射モード: FLOOD BEAM / 撮影モード: BRIGHT FIELD / Cs: 2.7 mm / 最大 デフォーカス（公称値）: 2.5 µm / 最小 デフォーカス（公称値）: 0.5 µm / 倍率（公称値）: 59000
試料ステージ試料ホルダーモデル: FEI TITAN KRIOS AUTOGRID HOLDER
ホルダー冷却材: NITROGEN
実験機器
モデル: Talos Arctica / 画像提供: FEI Company

+
画像解析

粒子像選択選択した数: 280177
初期モデルモデルのタイプ: NONE
最終 再構成使用したクラス数: 1 / アルゴリズム: BACK PROJECTION / 解像度のタイプ: BY AUTHOR / 解像度: 2.89 Å / 解像度の算出法: FSC 0.143 CUT-OFF / 使用した粒子像数: 22169
初期 角度割当タイプ: COMMON LINE
最終 角度割当タイプ: PROJECTION MATCHING
最終 3次元分類クラス数: 4 / 平均メンバー数/クラス: 70000 / ソフトウェア - 名称: cryoSPARC (ver. 4.5.1)
FSC曲線 (解像度の算出)

-
原子モデル構築 1

初期モデルChain - Source name: Modeller / Chain - Initial model type: in silico model
精密化空間: REAL / プロトコル: AB INITIO MODEL
得られたモデル

PDB-9g6k:
LSU structure derived from the LSU sample of the mitoribosome from T. gondii.

+
万見について

-
お知らせ

-
2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

-
2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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万見 (Yorodumi)

幾万の構造データを、幾万の視点から

  • 万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
  • EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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