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- EMDB-50470: SSU(body) structure derived from the SSU sample of the mitoriboso... -

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基本情報

登録情報
データベース: EMDB / ID: EMD-50470
タイトルSSU(body) structure derived from the SSU sample of the mitoribosome from T. gondii.
マップデータ
試料
  • 複合体: LSU structure derived from the LSU sample of the mitoribosome from T. gondii.
    • タンパク質・ペプチド: x 43種
    • RNA: x 23種
キーワードComplex / translation / rRNA / RIBOSOME
機能・相同性
機能・相同性情報


hydro-lyase activity / mitochondrial small ribosomal subunit / mitochondrial translation / fatty acid metabolic process / isomerase activity / small ribosomal subunit / small ribosomal subunit rRNA binding / ribosome / structural constituent of ribosome / translation ...hydro-lyase activity / mitochondrial small ribosomal subunit / mitochondrial translation / fatty acid metabolic process / isomerase activity / small ribosomal subunit / small ribosomal subunit rRNA binding / ribosome / structural constituent of ribosome / translation / ribonucleoprotein complex / mitochondrion / DNA binding / RNA binding / cytoplasm
類似検索 - 分子機能
: / Enoyl-CoA hydratase/isomerase domain / Enoyl-CoA hydratase/isomerase / Acylphosphatase-like domain / Acylphosphatase-like domain profile. / Double stranded RNA-binding domain (dsRBD) profile. / Double-stranded RNA-binding domain / ClpP/crotonase-like domain superfamily / Homeobox-like domain superfamily / Ribosomal protein S6, plastid/chloroplast ...: / Enoyl-CoA hydratase/isomerase domain / Enoyl-CoA hydratase/isomerase / Acylphosphatase-like domain / Acylphosphatase-like domain profile. / Double stranded RNA-binding domain (dsRBD) profile. / Double-stranded RNA-binding domain / ClpP/crotonase-like domain superfamily / Homeobox-like domain superfamily / Ribosomal protein S6, plastid/chloroplast / Ribosomal protein S16 / Ribosomal protein S16 domain superfamily / Ribosomal protein S16 / Ribosomal protein S15, bacterial-type / Ribosomal protein S12, bacterial-type / Ribosomal protein S18 / Ribosomal protein S18 / Ribosomal protein S18 superfamily / Ribosomal protein S6 / Ribosomal protein S6 / Ribosomal protein S6 superfamily / Translation elongation factor EF1B/ribosomal protein S6 / S5 double stranded RNA-binding domain profile. / Ribosomal protein S5, N-terminal / Ribosomal protein S5, N-terminal domain / Ribosomal protein S8 / Ribosomal protein S8 superfamily / Ribosomal protein S8 / Ribosomal protein S12/S23 / Ribosomal protein S12/S23 / Ribosomal protein S17/S11 / Ribosomal protein S17 / Ribosomal protein S15 / Ribosomal_S15 / Ribosomal protein S15 / Ribosomal protein S11 superfamily / S15/NS1, RNA-binding / Macro domain / Macro domain profile. / Macro domain / Macro domain-like / Ribosomal protein S5 domain 2-type fold, subgroup / Ribosomal protein S5 domain 2-type fold / Nucleic acid-binding, OB-fold
類似検索 - ドメイン・相同性
Uncharacterized protein / Uncharacterized protein / Uncharacterized protein / Putative ribosomal protein S17 / Acylphosphatase-like domain-containing protein / Uncharacterized protein / Uncharacterized protein / Putative homeodomain containing protein / Uncharacterized protein / CHCH domain-containing protein ...Uncharacterized protein / Uncharacterized protein / Uncharacterized protein / Putative ribosomal protein S17 / Acylphosphatase-like domain-containing protein / Uncharacterized protein / Uncharacterized protein / Putative homeodomain containing protein / Uncharacterized protein / CHCH domain-containing protein / Putative 30S ribosomal protein S15 / Putative ribosomal protein S8 / Uncharacterized protein / Putative mitochondrial ribosomal protein s6-2 / DnaJ domain-containing protein / Putative 30S ribosomal protein S16 / Enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein / Ribosomal protein S12, mitochondrial / Uncharacterized protein / Pentatricopeptide repeat domain-containing protein / 30S ribosomal protein S5, putative / Ribosomal protein S11, putative / Ribosomal protein S18, putative / Uncharacterized protein / Uncharacterized protein / Uncharacterized protein / Uncharacterized protein / Macro domain-containing protein / RAP domain-containing protein
類似検索 - 構成要素
生物種Toxoplasma gondii (トキソプラズマ)
手法単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 3.29 Å
データ登録者Rocha REO / Barua S / Boissier F / Nguyen TT / Hashem Y
資金援助European Union, 1件
OrganizationGrant number国
European Commission101088541European Union
引用ジャーナル: Nat Commun / 年: 2024
タイトル: Apicomplexan mitoribosome from highly fragmented rRNAs to a functional machine.
著者: Chaoyue Wang / Sari Kassem / Rafael Eduardo Oliveira Rocha / Pei Sun / Tan-Trung Nguyen / Joachim Kloehn / Xianyong Liu / Lorenzo Brusini / Alessandro Bonavoglia / Sramona Barua / Fanny ...著者: Chaoyue Wang / Sari Kassem / Rafael Eduardo Oliveira Rocha / Pei Sun / Tan-Trung Nguyen / Joachim Kloehn / Xianyong Liu / Lorenzo Brusini / Alessandro Bonavoglia / Sramona Barua / Fanny Boissier / Mayara Lucia Del Cistia / Hongjuan Peng / Xinming Tang / Fujie Xie / Zixuan Wang / Oscar Vadas / Xun Suo / Yaser Hashem / Dominique Soldati-Favre / Yonggen Jia /
要旨: The phylum Apicomplexa comprises eukaryotic parasites that cause fatal diseases affecting millions of people and animals worldwide. Their mitochondrial genomes have been significantly reduced, ...The phylum Apicomplexa comprises eukaryotic parasites that cause fatal diseases affecting millions of people and animals worldwide. Their mitochondrial genomes have been significantly reduced, leaving only three protein-coding genes and highly fragmented mitoribosomal rRNAs, raising challenging questions about mitoribosome composition, assembly and structure. Our study reveals how Toxoplasma gondii assembles over 40 mt-rRNA fragments using exclusively nuclear-encoded mitoribosomal proteins and three lineage-specific families of RNA-binding proteins. Among these are four proteins from the Apetala2/Ethylene Response Factor (AP2/ERF) family, originally known as transcription factors in plants and Apicomplexa, now repurposed as essential mitoribosome components. Cryo-EM analysis of the mitoribosome structure demonstrates how these AP2 proteins function as RNA binders to maintain mitoribosome integrity. The mitoribosome is also decorated with members of lineage-specific RNA-binding proteins belonging to RAP (RNA-binding domain abundant in Apicomplexa) proteins and HPR (heptatricopeptide repeat) families, highlighting the unique adaptations of these parasites. Solving the molecular puzzle of apicomplexan mitoribosome could inform the development of therapeutic strategies targeting organellar translation.
履歴
登録2024年5月28日-
ヘッダ(付随情報) 公開2024年12月11日-
マップ公開2024年12月11日-
更新2025年1月1日-
現状2025年1月1日処理サイト: PDBe / 状態: 公開

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構造の表示

添付画像

emd_50470.png

ダウンロードとリンク

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マップ

ファイルダウンロード / ファイル: emd_50470.map.gz / 形式: CCP4 / 大きさ: 282.6 MB / タイプ: IMAGE STORED AS FLOATING POINT NUMBER (4 BYTES)
投影像・断面図

画像のコントロール

大きさ
明度
コントラスト
その他
軸Z (Sec.)Y (Row.)X (Col.)
1.51 Å/pix.
x 420 pix.
= 632.394 Å		1.51 Å/pix.
x 420 pix.
= 632.394 Å		1.51 Å/pix.
x 420 pix.
= 632.394 Å

表面

投影像

断面 (1/3)

断面 (1/2)

断面 (2/3)

画像は Spider により作成

ボクセルのサイズX=Y=Z: 1.5057 Å
密度

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)
表面レベル登録者による: 0.1
最小 - 最大-0.014584136 - 2.1594462
平均 (標準偏差)0.0007459928 (±0.016903061)
対称性空間群: 1
詳細

EMDB XML:

マップ形状
Axis orderXYZ
Origin000
サイズ420420420
Spacing420420420
セルA=B=C: 632.394 Å
α=β=γ: 90.0 °

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添付データ

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マスク #1

ファイルemd_50470_msk_1.map
投影像・断面図
軸ZYX

投影像

断面 (1/2)
密度ヒストグラム

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)

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追加マップ: #1

ファイルemd_50470_additional_1.map
投影像・断面図
軸ZYX

投影像

断面 (1/2)
密度ヒストグラム

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)

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ハーフマップ: #2

ファイルemd_50470_half_map_1.map
投影像・断面図
軸ZYX

投影像

断面 (1/2)
密度ヒストグラム

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)

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ハーフマップ: #1

ファイルemd_50470_half_map_2.map
投影像・断面図
軸ZYX

投影像

断面 (1/2)
密度ヒストグラム

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)

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試料の構成要素

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全体 : LSU structure derived from the LSU sample of the mitoribosome fro...

全体名称: LSU structure derived from the LSU sample of the mitoribosome from T. gondii.
要素
  • 複合体: LSU structure derived from the LSU sample of the mitoribosome from T. gondii.
    • タンパク質・ペプチド: Mitochondrial ribosomal protein, mS145
    • タンパク質・ペプチド: unidentified peptide
    • タンパク質・ペプチド: Ribosomal protein S18, putative
    • タンパク質・ペプチド: Mitochondrial ribosomal protein, mS23
    • タンパク質・ペプチド: CHCH domain-containing protein
    • タンパク質・ペプチド: Ribosomal protein S11, putative
    • タンパク質・ペプチド: Putative mitochondrial ribosomal protein s6-2
    • タンパク質・ペプチド: unidentified peptide
    • タンパク質・ペプチド: unidentified peptide
    • タンパク質・ペプチド: DnaJ domain-containing protein
    • タンパク質・ペプチド: Mitochondrial ribosomal protein, mS137
    • タンパク質・ペプチド: RAP domain-containing protein
    • タンパク質・ペプチド: Mitochondrial ribosomal protein, mS47
    • タンパク質・ペプチド: Pentatricopeptide repeat domain-containing protein
    • タンパク質・ペプチド: Mitochondrial ribosomal protein, mS140
    • タンパク質・ペプチド: Mitochondrial ribosomal protein, mS147
    • タンパク質・ペプチド: Ribosomal protein, uS2m
    • タンパク質・ペプチド: Putative ribosomal protein S8
    • タンパク質・ペプチド: unidentified peptide
    • タンパク質・ペプチド: unidentified peptide
    • タンパク質・ペプチド: Mitochondrial ribosomal protein, mS26
    • タンパク質・ペプチド: Putative ribosomal protein S17
    • タンパク質・ペプチド: Putative 30S ribosomal protein S15
    • タンパク質・ペプチド: unidentified peptide
    • タンパク質・ペプチド: Macro domain-containing protein
    • タンパク質・ペプチド: Ribosomal protein, bS21m
    • タンパク質・ペプチド: Mitochondrial ribosomal protein, mS156
    • タンパク質・ペプチド: unidentified peptide
    • タンパク質・ペプチド: Putative homeodomain containing protein
    • タンパク質・ペプチド: Mitochondrial ribosomal protein, mS144
    • タンパク質・ペプチド: unidentified peptide
    • タンパク質・ペプチド: unidentified peptide
    • タンパク質・ペプチド: unidentified peptide
    • タンパク質・ペプチド: Enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein
    • タンパク質・ペプチド: unidentified peptide
    • タンパク質・ペプチド: unidentified peptide
    • タンパク質・ペプチド: Ribosomal protein, uS2m
    • タンパク質・ペプチド: Putative 30S ribosomal protein S16
    • タンパク質・ペプチド: Mitochondrial ribosomal protein, mS153
    • タンパク質・ペプチド: Mitochondrial ribosomal protein, mS26
    • タンパク質・ペプチド: 30S ribosomal protein S12, putative
    • タンパク質・ペプチド: 30S ribosomal protein S5, putative
    • タンパク質・ペプチド: Acylphosphatase-like domain-containing protein
    • RNA: ulr11
    • RNA: SSUE
    • RNA: ulr12
    • RNA: RNA13
    • RNA: RNA19
    • RNA: RNA15
    • RNA: RNA8
    • RNA: ulr13
    • RNA: ulr14
    • RNA: ulr15
    • RNA: RNA33
    • RNA: RNA5
    • RNA: RNA17
    • RNA: SSUB
    • RNA: SSUA
    • RNA: ulr16
    • RNA: ulr17
    • RNA: RNA30
    • RNA: url18
    • RNA: SSUF
    • RNA: ulr19
    • RNA: ulr20
    • RNA: ulr21

+
超分子 #1: LSU structure derived from the LSU sample of the mitoribosome fro...

超分子名称: LSU structure derived from the LSU sample of the mitoribosome from T. gondii.
タイプ: complex / ID: 1 / 親要素: 0 / 含まれる分子: all
由来(天然)生物種: Toxoplasma gondii (トキソプラズマ) / Organelle: Mitochondria / 細胞中の位置: Cytoplasm
分子量理論値: 4 MDa

+
分子 #1: Mitochondrial ribosomal protein, mS145

分子名称: Mitochondrial ribosomal protein, mS145 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 1 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Toxoplasma gondii (トキソプラズマ)
分子量理論値: 75.00157 KDa
配列文字列: MPRPLASRRL SALRACRRTS LASVSSAGRY SSLPSAPLSL CFPDAPSVCR PFSVCRSHLY APFSPESFDS SQRSSAQTYR HRRFISSLA AVSTVRSPTS TGNNPASPSS PVSSSSSSSV LFSSSCVLPA FSASSVSASS ASSSVPFSAS CVLPAFSCFH S IRERRGDG ...文字列:
MPRPLASRRL SALRACRRTS LASVSSAGRY SSLPSAPLSL CFPDAPSVCR PFSVCRSHLY APFSPESFDS SQRSSAQTYR HRRFISSLA AVSTVRSPTS TGNNPASPSS PVSSSSSSSV LFSSSCVLPA FSASSVSASS ASSSVPFSAS CVLPAFSCFH S IRERRGDG REGCLRLGSA PPLVALRRLG CEKTSELPAL PKTRARFFSV NAGEAPERGE GKDAAENTGE RAETQKFREE KD SPEKAGK ETEGDSAETT ASRAESPTEA KDARGGGGAK DGAEDQPASV AGLSSPPSLS EESEAATTPA PPAASLPPQW WDC PEALVE FLLPPPVENF FSVDGADLDR GRVEAVIRRV YTHSKADLAA PAEPSAWSSD TASATGDAPA PWLQYPEPNA LWPN PLLHN HRLKPFLHPA RREQGSGEAA ESERKRLSGE EADAAALEAK QLRMNKHRLE HLWKFARSYG MSWDALDEVY IRFVQ LKRS REAQWEAKRG EILQYAAVVA AREVREKRKK EIEEAGMDLA SVQPEHREQM LLPRSLYRKQ TRRLFFEWRR SYLAPW RPG GLQKLMKAVV TMRMLQRETR ERFLFLDEER SKRREEREEE QARLEEELVT LLQRQAKNGV ANLDLEKSEG AAATKDR TS FDIWEFDGVG AKQTGAPDSE EEEEELEGDE ELGEEARG

UniProtKB: Uncharacterized protein

+
分子 #2: unidentified peptide

分子名称: unidentified peptide / タイプ: protein_or_peptide / ID: 2 / 詳細: unidentified peptide / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Toxoplasma gondii (トキソプラズマ)
分子量理論値: 1.464797 KDa
配列文字列:
(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)

+
分子 #3: Ribosomal protein S18, putative

分子名称: Ribosomal protein S18, putative / タイプ: protein_or_peptide / ID: 3 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Toxoplasma gondii (トキソプラズマ)
分子量理論値: 84.465203 KDa
配列文字列: MEYVAISSQW AKRPSFAGLP CQKRSAGCRG RGRKSCRAAA TPTYSEFSSS VPALSTGISA VSPLPHERTS MLTGPLRGQR MRLVPRNMS TLASWLQYTT LVRIPLTMRN KLPQPHQWTG SEQRGSGLPF VHRVGRRDNY MQFFRRGHAS RFSCTSTFSS G TPRWQSAH ...文字列:
MEYVAISSQW AKRPSFAGLP CQKRSAGCRG RGRKSCRAAA TPTYSEFSSS VPALSTGISA VSPLPHERTS MLTGPLRGQR MRLVPRNMS TLASWLQYTT LVRIPLTMRN KLPQPHQWTG SEQRGSGLPF VHRVGRRDNY MQFFRRGHAS RFSCTSTFSS G TPRWQSAH PRLRLDCLKA SVTAVRRSSR SLPPAFAKTR HREDCWKYQP QSWVRTGLET RTPVPSDRAP LWTTLSSSHH RS SIAASLS SQLHAPASAS GSVTGCHSRA LSTPHPNCFL ALIHGFPFAP GCWSSTPVTA MKGTRRFFSS RFRRPLPFSA KPQ QPLRPP QQQSRPDESQ GPSPKSREAP STPPTRPLER VSKSALQTRL HRGPPGAVTS PRMDVRSLQQ PSKEDRSPSF EQQF LNDKL LGQNTLQFTK VSEKGTADAL FAECLESIRH RRFKLDPDVD NRSSEAVEKL TQEERAIAEK IFQRVDPERK IAPRL ESRG CYIDPLWDPF KRVEELQQQV AQDLTEYAKL VGAAEARRQR LLVRASLRRQ YRMHDPLSEG HRRFFGAQRA DPFPTP HRV HERFWDPSPD VRVALKNNNV PISWRDLHIL HHFVGENGLI LPRRTTHASR YQQRCIFKAI CMARRMALFP YDWKPTQ GE LMPVMDPLQY LVDELTSRYK ATGDLRADAM LCVMLSKYPK LNYFRYLQYK AQTQKSEVEA MQQQEEEDRG DFSRLLRK Y KRATTDQDSR YRPTTSA

UniProtKB: Ribosomal protein S18, putative

+
分子 #4: Mitochondrial ribosomal protein, mS23

分子名称: Mitochondrial ribosomal protein, mS23 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 4 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Toxoplasma gondii (トキソプラズマ)
分子量理論値: 41.612438 KDa
配列文字列: MGKGAVHYTG TNFRRVQRLD IVDRMRALVA QGLVDAPLWL SAAERAPPME LSNLKLMDRK VHNKYLSLTQ AVLKKYPNMR FQDCYVDGN DWSKGNDSYR ADHPVMQFVA LQLRLMNLGL DRHAAFREAE QAFYARRMQL EKQQKLNMAA AVVAAAARDP S AFARRPGS ...文字列:
MGKGAVHYTG TNFRRVQRLD IVDRMRALVA QGLVDAPLWL SAAERAPPME LSNLKLMDRK VHNKYLSLTQ AVLKKYPNMR FQDCYVDGN DWSKGNDSYR ADHPVMQFVA LQLRLMNLGL DRHAAFREAE QAFYARRMQL EKQQKLNMAA AVVAAAARDP S AFARRPGS RGQGGSVPSS SLPRLTAMGL GDVQPLFTSG QAYWQFEIAK SQANHLLRIR SVLRRMKAQA EAAAQQEAES PS SSPPPSP SSPSAAASPS PRPSRRGANG LQSLRQRAFS LSERQRRASL LGQRSQAEEA SPLSSLAARS SVSSTASGGD QRD SEGSAE RGRELSERAS LSGEEEELEE GEYLAEPIDE EAMMRWFDAG EEEFDGDEDR D

UniProtKB: Uncharacterized protein

+
分子 #5: CHCH domain-containing protein

分子名称: CHCH domain-containing protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 5 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Toxoplasma gondii (トキソプラズマ)
分子量理論値: 16.112727 KDa
配列文字列:
MNGCSKRKSH RLLKPVFELQ QSFPKIQHWQ GAEILHRLKQ KEKDAAVIHP CIDTWGDYAQ CLRRYPATSA ARCRVESDRH TRCLQQHGR WKPSDSLEAL KLLEMFKVFN ETARFKYPPP PVHSLVRGCA FPFSDPPKK

UniProtKB: CHCH domain-containing protein

+
分子 #6: Ribosomal protein S11, putative

分子名称: Ribosomal protein S11, putative / タイプ: protein_or_peptide / ID: 6 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Toxoplasma gondii (トキソプラズマ)
分子量理論値: 43.464711 KDa
配列文字列: MAVHWGVLQC GVERCLPWMK AAASHCCLQR SVGAVRHASV RRFVLFASYS QTRPETQLAV NLGRVVKTPR IHTRDGVSQR RVPYRVDSN SQRKMPVPGH SDSPRERSVS VSNNFADGNI SWKESKQRLA DSGLKIQSAT AGTTHQLPFS SAFPRSSYVS A RPRQRLFF ...文字列:
MAVHWGVLQC GVERCLPWMK AAASHCCLQR SVGAVRHASV RRFVLFASYS QTRPETQLAV NLGRVVKTPR IHTRDGVSQR RVPYRVDSN SQRKMPVPGH SDSPRERSVS VSNNFADGNI SWKESKQRLA DSGLKIQSAT AGTTHQLPFS SAFPRSSYVS A RPRQRLFF STGSAGTAAS TPDVKDAKRS SSEASLSPNS QAALSEIRSN VVRASEKGKA LASASSTSGG TGRQVKKQLS KK EMRTLGG HPRRFKLMGG RPEFHHVDRN KNGHIIEPTD KFQVVITTSK NNVHAQVVNK SRAYRTIFGS FAGNVGIRKQ AQQ GTQCAY RIGQNIARKC RRLGISQVEI KFRRIMRVNQ LLQAFTAHGL GVTAIAHEPR LPKCGQNATK PRKRRRV

UniProtKB: Ribosomal protein S11, putative

+
分子 #7: Putative mitochondrial ribosomal protein s6-2

分子名称: Putative mitochondrial ribosomal protein s6-2 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 7 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Toxoplasma gondii (トキソプラズマ)
分子量理論値: 19.272775 KDa
配列文字列:
MGKWRWPPAA TVRALASFFC CAVSSRTLLR FWFSHCKILS LVKNRKYMMV FYETFVLFSK RVQRADIRQL LKQQEALITK HHGSMLAVR DLGWRKTAFR VIKPRQGIFW FGRLFYFSFG ANPAAITEMS QSLQSTNGVL RHATVRMKKR HNLMTYNHHI H ARD

UniProtKB: Putative mitochondrial ribosomal protein s6-2

+
分子 #8: unidentified peptide

分子名称: unidentified peptide / タイプ: protein_or_peptide / ID: 8 / 詳細: Unidentified peptide 2 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Toxoplasma gondii (トキソプラズマ)
分子量理論値: 1.039273 KDa
配列文字列:
(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)

+
分子 #9: unidentified peptide

分子名称: unidentified peptide / タイプ: protein_or_peptide / ID: 9 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Toxoplasma gondii (トキソプラズマ)
分子量理論値: 1.805216 KDa
配列文字列:
(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)

+
分子 #10: DnaJ domain-containing protein

分子名称: DnaJ domain-containing protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 10 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Toxoplasma gondii (トキソプラズマ)
分子量理論値: 25.359863 KDa
配列文字列: MRHRVRSNSL GSCFSVCSPS LEKPSKRLCE PQQTPQRPRK MAGRAFAFPA GPPSGLAKSP VALTRVQAPF VSLLARPYPP VPFCSHTFS SASSLFSCYQ LARGYVRPFP VLTRRLRRAF STAPSSSVSS SPSSRASSSS SSAASSSSSP ASPSSAEGSG K TAGSGKKS ...文字列:
MRHRVRSNSL GSCFSVCSPS LEKPSKRLCE PQQTPQRPRK MAGRAFAFPA GPPSGLAKSP VALTRVQAPF VSLLARPYPP VPFCSHTFS SASSLFSCYQ LARGYVRPFP VLTRRLRRAF STAPSSSVSS SPSSRASSSS SSAASSSSSP ASPSSAEGSG K TAGSGKKS GESFFLSLCE LEQKKRTERA IQHSQDLWKK RTAAKDAHSE KTPELYDGPF WLKFWRRKKR PGARG

UniProtKB: DnaJ domain-containing protein

+
分子 #11: Mitochondrial ribosomal protein, mS137

分子名称: Mitochondrial ribosomal protein, mS137 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 11 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Toxoplasma gondii (トキソプラズマ)
分子量理論値: 102.582984 KDa
配列文字列: MCMQIVISFE SSFCRVRELR GFVSTRCARV RFCSTSARPL ERNWIPSRAN WNFSPASKMA ARFPPFRSLH PLLPPCRFSR KNLTDAKTT PRTEEASSSL HLPSASFSLQ LSLRAEAGFA SQVHEADRSP FLSSSPRPFF RRPYSVLCSS LGPGIPRGVP D LLRAPSFR ...文字列:
MCMQIVISFE SSFCRVRELR GFVSTRCARV RFCSTSARPL ERNWIPSRAN WNFSPASKMA ARFPPFRSLH PLLPPCRFSR KNLTDAKTT PRTEEASSSL HLPSASFSLQ LSLRAEAGFA SQVHEADRSP FLSSSPRPFF RRPYSVLCSS LGPGIPRGVP D LLRAPSFR EERRVFSQTS SSGDPNVPSN KRETAKNPPA SGRFRLLRAV ENLVSARAKR GPVSSPETPG GPLSPVSASA AP EREGAGD TPQQNAEGER DLEETEAKSE SEKITDEGSH WLARRARGSR LATGRSLLAG QPDGCSVQDR REDGSESKPV TVV YAHASS METTRPASSA SLSRFLSNLL PRLFLFPTPL SSAQRTAEKP VAEGASVGAE SAAREPLLSP SQRQSLPFNF VTVD VAAEP RLGAFLALPS VPALVCFYRK KLYSVLAPGA SDVALLRFLK EAADLSETSI SASREKNVCS RVSPENVAEA VHGAR VAAA TTAGGKGSLA VGSAALGSKR LTETEAIALE GAWAERKDVQ CLLTQLGVAM TREQAEEVQT LKNELVAEDR SEDAVL TGG RRLFAELQLQ LTGDSPPDRE ALSTLLSEIL GSALSLPESL QPPKLSEVSR QEAGRSVSSD SRPSRKKTGY AEQWASL YQ IEGYWNELET SPVCARLLAK ATVALFNHEQ VNLQELDLCI DRASGEDDEE WPSIRASLSE SLKTALNADE PVRPLDEA V HYAHLTMKNE KDFSSLRPSF FFLGSTAVLD CPLRTASRLR RLKAARLFHG GAYEEALKFA VFAYRLECQG PVETRRAAA PEHVLGKWRD EEAALLAVDS SHDKVGGNGT EDLFDQMACA RAGWPARTLL MAMYMALGAK HPAVQRSRAE LEVLLGTDGF VPVVFPHTR ARAGGKPIMM RGKSGKWHWL GPYWKPPWAP SNKARWPTGP EEWAWSDPTR

UniProtKB: Uncharacterized protein

+
分子 #12: RAP domain-containing protein

分子名称: RAP domain-containing protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 12 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Toxoplasma gondii (トキソプラズマ)
分子量理論値: 168.566484 KDa
配列文字列: MRGVRPSCFT DCLHKPCFCL ATNGGAPGLR VSHAPGGLHQ QAPFRGANLD GFGGKQQTAS RSVCSRCGAP FDRPYLTQRD SPCLPRNTR TRPNVARSQG VEDCVSSRVG FHGNADLPPS MTTCGFAHFP SGIISFPTSS AASIRQSNEL SKCSFTDPDS V CIPAQHHG ...文字列:
MRGVRPSCFT DCLHKPCFCL ATNGGAPGLR VSHAPGGLHQ QAPFRGANLD GFGGKQQTAS RSVCSRCGAP FDRPYLTQRD SPCLPRNTR TRPNVARSQG VEDCVSSRVG FHGNADLPPS MTTCGFAHFP SGIISFPTSS AASIRQSNEL SKCSFTDPDS V CIPAQHHG SPTHWDGPHR FLFRRRLTTL ASTLSLSRSA RKVPVCGTSQ LSPREFRRQS LKLQRQGELF GYFAGLPYVS WR SLLRVLH LLVTKPFFRG QDLLALPVVC KRLGVSDFRV VDRLLAGAVV RPSMNFASPF SDSSDGQVTE EDRSCLRTGD TST KPDPAY RAHAPTAARV ALKKRPPFSL FVASLDDWPV QHHPHHMHAV QRLLAAICAN LHNYTTPDLL LLFDGLTALG TPQG GDGSE VALPKLKRGL GQMPVEALEE FEVTLGLLLL QIRARLREGE SAGGTGKDGE SFFSSRNVLK AYEIVSRVAG VPPEC WTSP FFAGARVRAN AGAGGVLPSS AEPTEGQLTV QKHALAKFLN TSPAARVGGA GETNDDFTCS PAHAVEDLLC LLGSRI LAD DVANEALLAN VACSVSTVAL DTISLVQASS IVAGSHSRRS PAYLALAYMR LAERQPPRPT AAAMAQEILK RVASMKL PV EKDGKTHWYT VRELLPSSGI PTEARHALIT ALSLAPPSVL PAFAGAVWRE LEAGFKGERQ SGVAASNDHR TGSFRELS S PPSDGPSALS EATLVAALPL FSRCAILAVT IPRECRDTRE ELECTTGFSS QGRARGREWH SVDNVSSPHS DAKGVMCTR APNGLLWLRR LSSVVELALK RQMERMQRDC SSTRDSSSPG EPQTLPTGRV CGAGWREDPV PGLESAVEVF CAADVGARLT KSLKSSLFW SRRSWKRSSL SGQRRQGKAL RWPAAWLSAT SLERGVVKKR LLDSFQWKRE TVFRILTSVH RRFVLSRRLA E LQLRQATF EAGPLLSDAS LARLTALTSP TRSSEGEIVS CSSGQPHTSD PGVSVGERRR NKRSQLFRSE RQSIHDWLVP HV IRVCPLH MSALYFQLLV NELATSCWRR ACGSVDARGY GGKAASVRSE SRCVKESREA DSSGSDGARA TWQGAQSVDS DSA KRSALS RTNAPVGDRL LLHALRIADH VRQRLDGIRR QLARQCRLSA AQQERVLISL PQFQQYNKEL VLRDRHLDFS PFGK LFNLR EPACGVRTSR DVLALVKVTN QHVSRAMASV ATLQSSVQLW LSELQEVGRT GRGAGRVGSA NDGEEAHLSG EKGAP SRGR SRGSPEMERV DIRNGLRNYC RELQEVTEAL ARSSRRCLYT AIVQIPLRRK TWVGPCQGEV EWATQQALAI MEADGA RDR SGVSRLLEAT ENEEGRLPSA AGTGAVQTLA SELAAGSGVR GCKEKPNGVG AADGKSTLSR MAEMNAIIQC MQPERGI VA WELRNPPRVV TARGRGLRGH HQGRWREGVE HRLGENAHDR SGGIPGMFAR LRILKKSDAA ESRRENSNEE HAGHTLQS S VNGESETITA TVAGKKERFM VQVGAT

UniProtKB: RAP domain-containing protein

+
分子 #13: Mitochondrial ribosomal protein, mS47

分子名称: Mitochondrial ribosomal protein, mS47 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 13 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Toxoplasma gondii (トキソプラズマ)
分子量理論値: 44.677082 KDa
配列文字列: MAGKSLEARC LLTMKRRFVA SPVCYKSFLP SSLLSSLSSP SHSAYPPSAS PSSSSSHSLS CPPHSLSSPF SLSSRSLSSS SPLRSSPSS SRSSPASSSS SPPSPAFPAG SVVSAFCASS LAAVFALPGA LSGLGRDRLW ACVSSRSVSF KNRAEWRAFM R LPPKSRVE ...文字列:
MAGKSLEARC LLTMKRRFVA SPVCYKSFLP SSLLSSLSSP SHSAYPPSAS PSSSSSHSLS CPPHSLSSPF SLSSRSLSSS SPLRSSPSS SRSSPASSSS SPPSPAFPAG SVVSAFCASS LAAVFALPGA LSGLGRDRLW ACVSSRSVSF KNRAEWRAFM R LPPKSRVE PRRPIPRIFP WRMAHNPLPR RYPLYKHRTL FLPLSLPSYS PQPAISGVAV APLTITTNAA QLPRTLLLQS AV RQLRPLS APQSPSPSSP QSSPSQASSE PSFPLNLPGV LREGGLRRRE GARSSSWLAS LATSLQDDAA QLAGQCFPSA SPN ISRPAS CAFAGTFLAV YSSDEFPAIC VVREALGRVA PGVRLALRQE AGEGLLKIFR DDGMAVFVKD EVNRLDRTRK TALA KREAG RAAVQSILLA CGVAVG

UniProtKB: Uncharacterized protein

+
分子 #14: Pentatricopeptide repeat domain-containing protein

分子名称: Pentatricopeptide repeat domain-containing protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 14 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Toxoplasma gondii (トキソプラズマ)
分子量理論値: 74.72993 KDa
配列文字列: MSAVLLVRCV KQGTWSSPRS SAAQRFSRRL FSTASASRQS EDAPSLPPQT TRGLLHAGRR HRLLQRFCAA SFMPSAPRED GSDLPPFSV CARRLSRSPA HPSEKAAHSS RSSTSSSSSS TASSSPASSS FPASAASFQG TASFQAREEQ RRQALKSFIS R LDDLFNLP ...文字列:
MSAVLLVRCV KQGTWSSPRS SAAQRFSRRL FSTASASRQS EDAPSLPPQT TRGLLHAGRR HRLLQRFCAA SFMPSAPRED GSDLPPFSV CARRLSRSPA HPSEKAAHSS RSSTSSSSSS TASSSPASSS FPASAASFQG TASFQAREEQ RRQALKSFIS R LDDLFNLP HQQWLPLHSG APLGAKREAA RRHGDSGRFA KSREKRLRPE ALSPESPAEA EAVESPNGRD RLSPTNGRDD AL SAQEAFL AACRLASTRG DFQWCLQGLN LLVNFGRLRP DWELSDRLMA LSLHCRRPEQ AEQLLSAFPH FLACPPSPVL LFT LIDEAL AAGRPQDVRR IFATMREQWQ LALRPAFYVA AIRAMLLLPT SADQSLKEAQ LVAEDAAALG VPLPPVAHQL LVER ALTLF EERLRQADLP GDSGDSVAAS AEEPQSEHQG GDETDSARAG ACYTTEELLN LAQESHNRLL VDQARDAVRR HISGS SSLA DFSASLTFPP AQRIPRAEVS ELFLWNRAPN AHLLAQAAWL QWAAERFAER HNADAEHGGS ERQADGEKAD DKPGAR RRR RAQSGGKLAS WIQLLQQSCS ASLQELAGGI DRGSSLHRGL PPALLAALIR SSDASPLAFP VLPEDGQKRE IVLRKRN VL LKERREAAQA LRALQHSAFA DKLPPVHVLS ALLRSGADVG SASS

UniProtKB: Pentatricopeptide repeat domain-containing protein

+
分子 #15: Mitochondrial ribosomal protein, mS140

分子名称: Mitochondrial ribosomal protein, mS140 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 15 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Toxoplasma gondii (トキソプラズマ)
分子量理論値: 116.97732 KDa
配列文字列: MQSLVNALPE MASRRLVLAA SPSASLSSPP LSSSLSPPSS PLSSSCCLSP VSSSVSSPRS SHSLRACLLR FRRRSASGCP ASLRRLFPG NARVPSSPAS LHSLSCPLLG ETGFLQFDSS LASRSLRSSP AFQELLAASP ARTRSPQFPR YGRALSSIAR A SQSLLNRA ...文字列:
MQSLVNALPE MASRRLVLAA SPSASLSSPP LSSSLSPPSS PLSSSCCLSP VSSSVSSPRS SHSLRACLLR FRRRSASGCP ASLRRLFPG NARVPSSPAS LHSLSCPLLG ETGFLQFDSS LASRSLRSSP AFQELLAASP ARTRSPQFPR YGRALSSIAR A SQSLLNRA LVCSSLTLPQ QLVSPAKHAD RDLSRLRRSQ RRASPSTFLQ RTPQSRELPG PVLERSKPRC TYTPKWMYTP DS VCAGNVN APFRAFSTGV TDEKATTVAE KGASSADIPS ESRSRAQPPV LSRSLRQTFP YVLPVIRPLQ ALAALPVWQQ GTS PRSLEL RSVSVRLAHA FMPPFSTETE ELWCAYIRRL LAGSALASAD ENHREQKSEK SRPNPVQLSV DLGLQIARLF ASRN VVLAE AWKGLFASMD PLLRELRQRE ERESAAAARA MVSKDSAPGA GAEKREDGEA TDTKERFPDV VLKLCEAANR VRHEW TWGT EELMLYARRQ LPALEAPEAA RLLHALASSP STSESVVARL AEAFVFLWER DLSGTVEPAA GLQLLETLAR KRATER DFI RDISRRMHCY LHLGLLTPFE KTRLAVVYRQ LEFRHFTFFR HLAEELLQQN AERQRLLALG RSEPSADALQ AARQHQR RQ RLSRLQSELN PKKKSLESSP SSPSPSSFSS PSPSSSSSPS PSSSSCSSAS SSSASPSDSV SCSSSCSSSS LEQGTGEW R WQEYLRPGYV MGLGLEKDFS PSGVILQEEI LPLVTREKVA ELRRGLRGSL PPVSVQLPDA KAGESPDAQE TFPRSEDFS PCGIKAFTLG QTAVILDSML FLGFHHQSRF FGPVADVLLQ RATERGAVET LDPQQCTSLM VFFAETRRQL SEDPDDCIRR LTERFVDAL VCEVASPAQC LLFFKSLVKW SATKSPQPHC KRKRWREWSN TYRPLPWLHA PRPEARDTRP LLLAVCKQLC K RVHNFSMK ELTGMLRAIA YVDFREPAFF TVFVNYLKER LGEMQEEDIA NVTQAFNKAK IEEPHLFSLM GKRYQHLQAN VM AVKRRGV LVRRTG

+
分子 #16: Mitochondrial ribosomal protein, mS147

分子名称: Mitochondrial ribosomal protein, mS147 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 16 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Toxoplasma gondii (トキソプラズマ)
分子量理論値: 34.463469 KDa
配列文字列: MPRGSHRGGV FPVSGLTWGM NRPYLKRGLY QHRRDHIFTP RWGTRTANFN PSALPDGSTR RWENDAFKAW PLYGLPHHVK LYAVNEARY LVPAARCTAG PEITQYILNQ LDPGGAGRNC SGIGRPDVRL PLAKPAAPST THLPRHLVQI ARHVMGEAGE K VRRKALSF ...文字列:
MPRGSHRGGV FPVSGLTWGM NRPYLKRGLY QHRRDHIFTP RWGTRTANFN PSALPDGSTR RWENDAFKAW PLYGLPHHVK LYAVNEARY LVPAARCTAG PEITQYILNQ LDPGGAGRNC SGIGRPDVRL PLAKPAAPST THLPRHLVQI ARHVMGEAGE K VRRKALSF ASTLSDQGFS PDVFDPFGTP LSERSRIKRL YNLVCEADSW RVKPDSRGGK GSVPAEAVNA FPFVDEKAAL VR DLPLAEI LYSRHTHRLQ SRRHPFWIDM GYKKRIVRIP YLYRRRVAKE EAQEREFGLS RAHGSPL

UniProtKB: Uncharacterized protein

+
分子 #17: Ribosomal protein, uS2m

分子名称: Ribosomal protein, uS2m / タイプ: protein_or_peptide / ID: 17 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Toxoplasma gondii (トキソプラズマ)
分子量理論値: 18.26624 KDa
配列文字列:
MNFNRIPTRL STHYVCDPYT TLMHYRRTFK FLQALKAKPN CRALCLGNKN QVNISWPKHF DGLTVVTSAV AAQSSILSSA SVYYSLIIC LDPVLFAKHL YRINVPVLGV CTPREIHEHP EILKVIDYLL PAPCSRTDAA LRQLLQREFL EDSEEQKQIP G

UniProtKB: Uncharacterized protein

+
分子 #18: Putative ribosomal protein S8

分子名称: Putative ribosomal protein S8 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 18 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Toxoplasma gondii (トキソプラズマ)
分子量理論値: 14.858699 KDa
配列文字列:
MQRACEMVVS LLRVDALSQR CPFHVLNVQI LDLLQREGLI RGFKVDGTKI DILLKHYKGA PVIRNIRVVS KPSRDIWLTP HELKFRTRF NTGLWIMQTS CGVISHRDCL RMGIGGKMLM AINNGYQHFC

UniProtKB: Putative ribosomal protein S8

+
分子 #19: unidentified peptide

分子名称: unidentified peptide / タイプ: protein_or_peptide / ID: 19 / コピー数: 3 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Toxoplasma gondii (トキソプラズマ)
分子量理論値: 1.124378 KDa
配列文字列:
(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)

+
分子 #20: unidentified peptide

分子名称: unidentified peptide / タイプ: protein_or_peptide / ID: 20 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Toxoplasma gondii (トキソプラズマ)
分子量理論値: 2.230741 KDa
配列文字列:
(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)

+
分子 #21: Mitochondrial ribosomal protein, mS26

分子名称: Mitochondrial ribosomal protein, mS26 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 21 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Toxoplasma gondii (トキソプラズマ)
分子量理論値: 59.459469 KDa
配列文字列: MLRLQLAPER VLSPAVSAHT PRLPLRFCSK LDGLLAARPI PPACAARGDD ADFTTEAPAS LRELQGRLSS LKTARAGFPR SVAPLTLLD ASISRLSSLH TYSEASSRPA HLSSLSRAVR RPSPLASETP PSPGTPSAPS TLSPVLRRSS LSSFSSSLSP A FDSSLSFR ...文字列:
MLRLQLAPER VLSPAVSAHT PRLPLRFCSK LDGLLAARPI PPACAARGDD ADFTTEAPAS LRELQGRLSS LKTARAGFPR SVAPLTLLD ASISRLSSLH TYSEASSRPA HLSSLSRAVR RPSPLASETP PSPGTPSAPS TLSPVLRRSS LSSFSSSLSP A FDSSLSFR SSPFVSSSRA SSSVASSPGS GDAAARGRKT RRVFSGTGGL VEDGDQPFRA NCGGEDRRVW RFPRRPPGGE SW RTVFASH GMRHLAELYD GSGSPAEEAR EKEAKLNWFA LGRVVDQNRG RHLAGYTVPY KFRIIDPISV AKSVPKNLGQ LNR RTQTGD QYVDFSQNRF PVLNTAENFR YWKDRGLDRL LPRVFPLKLP AHRRVDPLLR EYIFFLHSMD PARFSIRKLG ERYG LKERT VELICREFSV AEFLRRTELA TPYTRRVSRE KAVLRMKEAL FSLKLGYDQL GDEDLDEQEE HEFRGFRSTQ DWIQR QNIE VEMMSAFPLP AKRNPLPKRV DVDVTVHNTP KLKVMNWIDP NDKVVF

UniProtKB: Uncharacterized protein

+
分子 #22: Putative ribosomal protein S17

分子名称: Putative ribosomal protein S17 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 22 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Toxoplasma gondii (トキソプラズマ)
分子量理論値: 14.084434 KDa
配列文字列:
MALNLSSTLL HWHYKTWQRN TAGYLRTFMR NKLPNNEMIG YVINDKHPKS IRVACDRFMY VMRYKKTFRY TKKVWAHDEE SEARLGDVV RIQPLGYRIG PWKNYVLVRV LHKEPRD

UniProtKB: Putative ribosomal protein S17

+
分子 #23: Putative 30S ribosomal protein S15

分子名称: Putative 30S ribosomal protein S15 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 23 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Toxoplasma gondii (トキソプラズマ)
分子量理論値: 44.807918 KDa
配列文字列: MASLARRIFS PTKALGAAAK RNPLLRFDGR SSARSRASPP LPLSSSLSEA SSSPRSSSRS SSRSSPLFAL STSYPSLLAA SSPSSSSPL SSLSPSCPSP LPSPSPLSPP SLGGRPAAWC LDQRRGVARL KSHRYGGVVA LKTRAPKSPW YIEAEKEFLN E RAQVPDAY ...文字列:
MASLARRIFS PTKALGAAAK RNPLLRFDGR SSARSRASPP LPLSSSLSEA SSSPRSSSRS SSRSSPLFAL STSYPSLLAA SSPSSSSPL SSLSPSCPSP LPSPSPLSPP SLGGRPAAWC LDQRRGVARL KSHRYGGVVA LKTRAPKSPW YIEAEKEFLN E RAQVPDAY IERWHGEDLS KLSPALRRCL HLRCASSKEL HSWRKLQLCR LLQRRPFDTG SPAVQLACLT EKILNVRAHL LR HFRDQQK KKVLSIWLSR RHRVMKYLYR VDFNLYKYVC QQLRIKCVRF AIPDSRDRQR AISPIAVDGD RCKFLIRQKL WKA RFRPRQ LKQVDGKVVR FTRHPMEQPS SAWNLPKEHR PSLSRAWPYG VREERLKGNY VIQNPTAAGL GYCPAPLFF

UniProtKB: Putative 30S ribosomal protein S15

+
分子 #24: unidentified peptide

分子名称: unidentified peptide / タイプ: protein_or_peptide / ID: 24 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Toxoplasma gondii (トキソプラズマ)
分子量理論値: 4.017944 KDa
配列文字列: (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK) ...文字列:
(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)

+
分子 #25: Macro domain-containing protein

分子名称: Macro domain-containing protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 25 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Toxoplasma gondii (トキソプラズマ)
分子量理論値: 75.927227 KDa
配列文字列: MLNSGTAPLG RRARRVAAES LLHSPHLPLI SRQSKRRNAR PRCCSSSLLA SFSLSSVSSP VASPPSAVAP VSLSSGPLSG SVSRFSSSS MSPFSEASFS VPHSRSFVFV PARPSTFSRT NGPVSPSAVL SSSFVCSSSL SSPFSLASSA ASALASPLGS R NFSSSHLS ...文字列:
MLNSGTAPLG RRARRVAAES LLHSPHLPLI SRQSKRRNAR PRCCSSSLLA SFSLSSVSSP VASPPSAVAP VSLSSGPLSG SVSRFSSSS MSPFSEASFS VPHSRSFVFV PARPSTFSRT NGPVSPSAVL SSSFVCSSSL SSPFSLASSA ASALASPLGS R NFSSSHLS RKLRLHQERA SRGHIEYLRQ LERPPTPSPF PLPPSPSPSS PASAAAAKAA AFAEQAAAQT PEPSVLVRSA EE WIKRDFF FPLSHQPDTA TAGEAARALE RELGLSRGDE AADAAPLLLS AEGPQYGGLL QQIELPGFGE INVVHGDLLS GSD REALQR RAEEESAGRP GQEKQEGNVL AADAMLVPVP PNFLPYRGFG LEVLERGGPA LQKAAFVEVK RKLQQREVAR DLLS GQAGR EEGAQREGSG LGFLSRRVAH ESASEGGLDP GDLLLTPTFG VCPRVSLLAF LVTPYYWQGN STEAARRLRF TMRRA LDDL NRQGPGSLLL PFVGIGLYGY EPRGAAEILV ESAVEQLLQV DAVDPNYTLR KITFVDRDAT NAALLAEAAQ AAKRAW LPE HQVVPAPVYW SQKQRRLLDV TDGMLMFCRK HTRLSFKKHH GVIRRQKTHY FSNVRPFLWR SSRVLEPPPL LLYRHSG KP ADWQLPARPF YRQGVSGLLF PPRLRRGFPS MRVNSKGQFV GVNKMPYIAE KAQPRL

UniProtKB: Macro domain-containing protein

+
分子 #26: Ribosomal protein, bS21m

分子名称: Ribosomal protein, bS21m / タイプ: protein_or_peptide / ID: 26 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Toxoplasma gondii (トキソプラズマ)
分子量理論値: 28.104543 KDa
配列文字列: MSCHRHVFRA APAAVFASVQ RWGRRNNVHK LTLLVQTYEK PCVKRTRIAE EKAYYPRWFY LRYATEVIRY SLKHHLRLGQ ALDPNDDQR LDAVKPLRLP SSEERRQHLR HMEDALALLH QQVMEMDAVC AVTGAKKSAA ARDPLHVSAA DILAEVERSQ G RLLSLPAF ...文字列:
MSCHRHVFRA APAAVFASVQ RWGRRNNVHK LTLLVQTYEK PCVKRTRIAE EKAYYPRWFY LRYATEVIRY SLKHHLRLGQ ALDPNDDQR LDAVKPLRLP SSEERRQHLR HMEDALALLH QQVMEMDAVC AVTGAKKSAA ARDPLHVSAA DILAEVERSQ G RLLSLPAF LRRFYRPSGG GHSWSVNELR ILHLRLTRFV KLVLDIHSTR ELLALEEGKH ARWGKSLSEE ELGKLFDAKR LD LPA

UniProtKB: Uncharacterized protein

+
分子 #27: Mitochondrial ribosomal protein, mS156

分子名称: Mitochondrial ribosomal protein, mS156 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 27 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Toxoplasma gondii (トキソプラズマ)
分子量理論値: 30.802619 KDa
配列文字列: MVRSIMAVHR GTLSPSLSML VSSGSSLPVS ARRFSPYRMQ SCLPGQPRHF PSLSRLFSPV SCPSPHLFSH VGLASPSTST LTHAPPLFL PVSALPSSPS SCIKSKSASS LLSPPVSSSV SSLLSFSLVS SSLPSPLRYS PGSPSCRFYR HWSRHRAFDR L RRLPNKAL ...文字列:
MVRSIMAVHR GTLSPSLSML VSSGSSLPVS ARRFSPYRMQ SCLPGQPRHF PSLSRLFSPV SCPSPHLFSH VGLASPSTST LTHAPPLFL PVSALPSSPS SCIKSKSASS LLSPPVSSSV SSLLSFSLVS SSLPSPLRYS PGSPSCRFYR HWSRHRAFDR L RRLPNKAL RPGKCAGSLF PSLPASVGDA PSVHGDFCVV RRADGGFHLV PPYPPRINRT VEPYPPSAGN FYELNRQFKL QW KNVEYQF VPKLLPRPWG RAGPWGGDLV RIFHRRTKKK PAH

+
分子 #28: unidentified peptide

分子名称: unidentified peptide / タイプ: protein_or_peptide / ID: 28 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Toxoplasma gondii (トキソプラズマ)
分子量理論値: 1.209482 KDa
配列文字列:
(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)

+
分子 #29: Putative homeodomain containing protein

分子名称: Putative homeodomain containing protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 29 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Toxoplasma gondii (トキソプラズマ)
分子量理論値: 67.147445 KDa
配列文字列: MAVVERGLLP RIVHRLQRPK PAGLSMETPA RALSYSRPWV SPVSFLSAST SSCNLPPQKS TLLTESPVDT FTCSLSRPGI QLTIRRGGR YTRAGDQLSS RPPPSHIFPM ASFPRCQYAG RDLDFWAHIR CFSRDFSLVS KGERTATAAR IPSMPPTVPP S PHHQFGIC ...文字列:
MAVVERGLLP RIVHRLQRPK PAGLSMETPA RALSYSRPWV SPVSFLSAST SSCNLPPQKS TLLTESPVDT FTCSLSRPGI QLTIRRGGR YTRAGDQLSS RPPPSHIFPM ASFPRCQYAG RDLDFWAHIR CFSRDFSLVS KGERTATAAR IPSMPPTVPP S PHHQFGIC SVDGHRSKSS GFLRSRFPCL VSASLLSVSP FVSRARSAPA SFAFSPASVL SSPCVLSLSS SSSCPSFSSF SR PHLNSTR SPTRPPVHRR KEGKNDETGC RPRSGSPGQY FLEMPPRVFG LNRGYQVGAH FFLCSARRSF AAAAGGGTAG RSR SSVGLV LGSNAKSLVD IPVRPKPRRF FDLKTFKRFI LRYKQKEEEA EDLLLKRTYT KPLPEGWTVL TFLEKINIGE NAED IAAAF SSWTDLANAT IDVLQSVEGM TNQQRRLIVK HVRLYNHGLW PENSYEDYID KFQAPPLENE NKEWTEADDA RLLEL AAQY DVSFGDPWLY ISWEMQRDFV DVQTRYEQLV TIPKNKERHC EAVLTKCTKP LFFSRYFKLL PSMLYVIPSK AHFNTA PVQ PFYLPTPFAA YRRNDCFRQL HSSPSVDPNK KEDL

UniProtKB: Putative homeodomain containing protein

+
分子 #30: Mitochondrial ribosomal protein, mS144

分子名称: Mitochondrial ribosomal protein, mS144 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 30 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Toxoplasma gondii (トキソプラズマ)
分子量理論値: 59.97873 KDa
配列文字列: MSPLLPVSPV MGRRVSPVSL HALTTPLGIR QRQNLAPRLS PISCRSTVGA SPPAASFPPS SSCALSPNLR RAGLSGLLLS STPGTSCET TRITRRAGAS SSSSSSSSPR SSSDFLGSAC SCVSACFSSP RLSPFRPPLR FDLAITTRAS RMLKDFAAKK Q LASQARAF ...文字列:
MSPLLPVSPV MGRRVSPVSL HALTTPLGIR QRQNLAPRLS PISCRSTVGA SPPAASFPPS SSCALSPNLR RAGLSGLLLS STPGTSCET TRITRRAGAS SSSSSSSSPR SSSDFLGSAC SCVSACFSSP RLSPFRPPLR FDLAITTRAS RMLKDFAAKK Q LASQARAF SALTRDSVEI QPAFDRLEGF LLSNLPPEVT NNQQLLSSLL GRSGLPVPPL TDASSSSSSS PSSSSTSSSS SS SNSASIL LQRSRLGRTA GRCLVLLPFP SSAFLTGEDR KALQTRLAAV LPAGSTVTAC DRNDVENCIE EFERYFFLTE DLQ RLGVPS NLRKVVTLSP VPPTYGRREV RDLLREHANV DVDPRDIVFR FRKDGVQGDT CYVLCRSERD AGVVLARIQE TAVP NRVHY GQLFGCSFLW ASRSALFLCD SQLDYLPARS PFQVFTTGWE GDVSEEEFKN LAYQLRLFPK AVRKFSHPGG EDVSS FFLE FHRMRDAKLT MSRLQLLRRR WRIGANTPFF GFLRMADLRF EDDVKFADED SAADSDLDEP IDY

UniProtKB: Uncharacterized protein

+
分子 #31: unidentified peptide

分子名称: unidentified peptide / タイプ: protein_or_peptide / ID: 31 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Toxoplasma gondii (トキソプラズマ)
分子量理論値: 954.168 Da
配列文字列:
(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)

+
分子 #32: unidentified peptide

分子名称: unidentified peptide / タイプ: protein_or_peptide / ID: 32 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Toxoplasma gondii (トキソプラズマ)
分子量理論値: 869.063 Da
配列文字列:
(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)

+
分子 #33: unidentified peptide

分子名称: unidentified peptide / タイプ: protein_or_peptide / ID: 33 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Toxoplasma gondii (トキソプラズマ)
分子量理論値: 698.854 Da
配列文字列:
(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)

+
分子 #34: Enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein

分子名称: Enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 34 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Toxoplasma gondii (トキソプラズマ)
分子量理論値: 80.344 KDa
配列文字列: MFPAHHFSRG PVFLENADTM RNLFSSLCSL GDRGGKPVCG LRQQQRRRVK INFPVQTAIQ ERREARQEKN EQSRGSSTLS PPTSSCFSP SAFSPSSSSS FKSLLSCNVS PSSSPLVLRF ESRSSRSLFS SFCLSDSPRR PSSSPSPLLL SSTAHAPGSG R RHRETLWC ...文字列:
MFPAHHFSRG PVFLENADTM RNLFSSLCSL GDRGGKPVCG LRQQQRRRVK INFPVQTAIQ ERREARQEKN EQSRGSSTLS PPTSSCFSP SAFSPSSSSS FKSLLSCNVS PSSSPLVLRF ESRSSRSLFS SFCLSDSPRR PSSSPSPLLL SSTAHAPGSG R RHRETLWC LRSSQRGVRT GFFRTDPGFI DPEDVLFAED PVRTWSHADG GGDLAEEVLE RSNVGMGTCI LNNASGVLNM KG LCGLFRK LRDLEVNPLK RFVVLTSRHR HFFSTGFDLK ELLFLAELTQ KSTEKTIPLV ALWQLRNLCD VAYLVHNYTK PLI VLMNGA TAGSGASLCC LANRSAAYHS SSFTCDPTAY GWIPDSGMSF VLANLRGSLG VFLALTGHTL SGPDLIWSGL CKHW ISPEA LPFLELTAEK QLEVSEREAA VLLEEHFLDA PDAYSLDDWE EVIHEHFDAP TVAEVRARLK ATASRQSTSV EGQLH AAWA RAVLDRLARR SPLAADVTFA LIRTVQQLKK QIIQDAGIFR SEWHKIRRTG LSVPFTLQGD CRKQILEAVE DRLVQE ALQ LELRAALRLL AWSTDTIDGL RSECAGRLNP EYAYRPQWKQ SQRFHKESYL TPLQDFFPTI SSSRDAASHR AGPHISP SC AYFFPTPEFT VTPRTFFPLS AHPLIRRIHP DFDEETGNDH NPYAMHKLQM QWNHSLFIQE RMQALRHFRN VANV

UniProtKB: Enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein

+
分子 #35: unidentified peptide

分子名称: unidentified peptide / タイプ: protein_or_peptide / ID: 35 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Toxoplasma gondii (トキソプラズマ)
分子量理論値: 2.826475 KDa
配列文字列:
(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK) (UNK)

+
分子 #36: unidentified peptide

分子名称: unidentified peptide / タイプ: protein_or_peptide / ID: 36 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Toxoplasma gondii (トキソプラズマ)
分子量理論値: 1.549902 KDa
配列文字列:
(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)

+
分子 #37: Ribosomal protein, uS2m

分子名称: Ribosomal protein, uS2m / タイプ: protein_or_peptide / ID: 37 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Toxoplasma gondii (トキソプラズマ)
分子量理論値: 34.172914 KDa
配列文字列: MASGDVNIQT EKEVPPPLKS GIGEPKKTGY KFPHVFFPYK SRYRSPHRQR WWPGSAPRFL LHSHPKRWAP RRDLSFAFFA FHGLKPFAE KNLYELMHSL PLRGASSYFW READSDPWKH LGRKANRLQA RGVRTQPACD SEVQASGEAG NEAADHKPAG A STGDASQP ...文字列:
MASGDVNIQT EKEVPPPLKS GIGEPKKTGY KFPHVFFPYK SRYRSPHRQR WWPGSAPRFL LHSHPKRWAP RRDLSFAFFA FHGLKPFAE KNLYELMHSL PLRGASSYFW READSDPWKH LGRKANRLQA RGVRTQPACD SEVQASGEAG NEAADHKPAG A STGDASQP PQGRGGRKQL VFSPREIYYK RRPFHALVFG RLSVGQLGAS PPEAVPPEPE RAEKPPDCES KEQRKCAGVS RV LKHPEII RGLSRVAPPQ ASLGGWKWRP PKDASRWIFR PKFPLPFRPE LFQPDPETHA KNPSA

UniProtKB: Uncharacterized protein

+
分子 #38: Putative 30S ribosomal protein S16

分子名称: Putative 30S ribosomal protein S16 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 38 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Toxoplasma gondii (トキソプラズマ)
分子量理論値: 19.450664 KDa
配列文字列:
MVRHMFLPFY SKERGPPRIR MQVAGVKGKR FYKIVAANQR DPRDGKHMEV LGSYAPCTPS GVEELRLRFS RIKFWLAAGA AFNSKMGGL LGNAGLVPLP PPMFGWRTKA RYTLLESVMQ KQEKLRENQL REYFKTAEPV VYRQVSEDRD DVEQEGEKKE E RIRKILR

UniProtKB: Putative 30S ribosomal protein S16

+
分子 #39: Mitochondrial ribosomal protein, mS153

分子名称: Mitochondrial ribosomal protein, mS153 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 39 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Toxoplasma gondii (トキソプラズマ)
分子量理論値: 28.70466 KDa
配列文字列: MGAVSPPTVR GFLLSSVANF LSVTPLSGVP KTVSIRHVAA VQARGTRASS RPYHTSRRNA MTPPQSNQIC CARVLPCFYR SLSSSSSSG PEEASSSPEA SSASSLPRLL DSELTAIFQG AAAGPRAATG KDKSQKRKIT VSSNRLFKAL LQSGILDRDL T GSSAQNSP ...文字列:
MGAVSPPTVR GFLLSSVANF LSVTPLSGVP KTVSIRHVAA VQARGTRASS RPYHTSRRNA MTPPQSNQIC CARVLPCFYR SLSSSSSSG PEEASSSPEA SSASSLPRLL DSELTAIFQG AAAGPRAATG KDKSQKRKIT VSSNRLFKAL LQSGILDRDL T GSSAQNSP RPVVEFQKLC DLYEEGRFYR TWAGGAHILK ISGVKGLAPP GGNLKGGIID GTPKHMSYEE FRTFVHAVRV WL RDERSPV PLCDATVRAT GSSRMPAHVL D

UniProtKB: Uncharacterized protein

+
分子 #40: Mitochondrial ribosomal protein, mS26

分子名称: Mitochondrial ribosomal protein, mS26 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 40 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Toxoplasma gondii (トキソプラズマ)
分子量理論値: 51.592316 KDa
配列文字列: MPAATALPNP SVPRAALVAA RFLRPPGRFK RAELREHPRS KTGAFANLVK TAVRLREKAR AFSLVPPPRL IPIPLPARKK HLESVRGVP TVSSDVLARR LHFLLGPAAI EQQKAAKMQR GLTPYQTELF MWERQMREIR KIYRAQYLQR LAEVTEEERQ K QLQLYLQE ...文字列:
MPAATALPNP SVPRAALVAA RFLRPPGRFK RAELREHPRS KTGAFANLVK TAVRLREKAR AFSLVPPPRL IPIPLPARKK HLESVRGVP TVSSDVLARR LHFLLGPAAI EQQKAAKMQR GLTPYQTELF MWERQMREIR KIYRAQYLQR LAEVTEEERQ K QLQLYLQE KRERRLRREE QLQRIYDDKK RRAVLKDRMR IEKKVTQSLQ TARVSRRKVA HVLWLKKLQD SSDFLQEQEE AA RGVAALA RARAKETGEE EEELLATEMA KLKENAFVNL PSRNVSVPDL LAQLGLNDEK VKSIKKKITG TDNVFRHIME ESF AVLPED GPEFEEDGGV SAKQQKSQIL SERQRAVLTY AGFTEAEKLR LLDEKIDMLN KKLDEDYELR GAPQNLVYLQ LRDH LQAAK ISYREKLYVR ETQKRLQEQQ AKSASSGTGT SENGDDKIKD TR

UniProtKB: Uncharacterized protein

+
分子 #41: 30S ribosomal protein S12, putative

分子名称: 30S ribosomal protein S12, putative / タイプ: protein_or_peptide / ID: 41 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Toxoplasma gondii (トキソプラズマ)
分子量理論値: 66.517188 KDa
配列文字列: MRGFARGLEV KKRSLPPLCI SCLSAVFAFL FSVSLLSSLL LAILSSLPPA PRRSCLSNLR LFLRREFFSL STHTALKYRH RCLFISSRF LIFVCRLPLL PLGTSVACLI SCSHSSSCSL PSLDPLPPPP HLRGWTAGLS VPDGFSSSSH LSIHSRRFLF G RIFSSRVI ...文字列:
MRGFARGLEV KKRSLPPLCI SCLSAVFAFL FSVSLLSSLL LAILSSLPPA PRRSCLSNLR LFLRREFFSL STHTALKYRH RCLFISSRF LIFVCRLPLL PLGTSVACLI SCSHSSSCSL PSLDPLPPPP HLRGWTAGLS VPDGFSSSSH LSIHSRRFLF G RIFSSRVI CRRFRGSPSV ALPLFWKKAR AEAQRAARTE TRERREENKS SSVSAMESQT AFSSLYLLRR KIFRGRQVKI RL SALPSFA CSPSPSPSSS AFSFSSVRVL PSSSVNSLRA QPSGEDSGSC SRLACTVFRG STLKRWTVSR DSTRDSVRSS LRV FPSLAS SRPSPLSPSS PLPQPSCCAA LSPLSLSSVA PYPAPLLFSP LLSGCSSSFA SSSSSSFFPS QSRQFSTRSI SGRL FYKRR PLQVPKLKPP NIRSKWLEGA PQKKGICVKV RVQTPRKPNS GLRKVARVRL STGRTVLVYI PGIGHNLNVH SVVLV RGGR CKDVPGCNYK AVRGVADLLP VKNRERKRSK YGVKLSSEKK EWRLQRWNNK HLTIEKDREL FNQFRWMTWR NEEGEM RTS PLADDEEVPR HTQLFNRWYR LKMQREGKET

UniProtKB: Ribosomal protein S12, mitochondrial

+
分子 #42: 30S ribosomal protein S5, putative

分子名称: 30S ribosomal protein S5, putative / タイプ: protein_or_peptide / ID: 42
詳細: Right sequence (uniprot ID = S8F5G8): ...詳細: Right sequence (uniprot ID = S8F5G8): MRCPLAPRRQRRLPRDSSSSVSLFLPHRGSLSLSSAFSPSFRRSPCPRSSPCLASSVPPSRLFSSASPNDSRLALKKPLSPSFSSPFAFSRYTRDPELRHLTSTSRVQAPLPLRRCAAPVASLASSPCLSSSRASSASLSPCSLASLGSRSSPFCGGSRRGGERPPCERRASAGCGAAANSFSSAPRPSRLSPSSPFFPSGLGCSSSPAHRARVAGPRLPLRSAFVALFPGQPTRTLCFPAASSALSFSAQPSPPTASASSFQSPRRLHNSHQARVLRRRHVYRDKHLDHVPTERARQLAEQRSAFELPRGTGEPLQGGSRFPGGVMAPHLRVKLEKEKFLRDCMREQENLAALFTETEKETLLGRRGDSRESHEEEPATREAEKQTSEGGKSDEAGKDGGKQEDKQGAAPFGRKLQELESFVGSALRTYRLLRPHALPFYKEDSLLSMQSKLNEATLKHSPLVHDLVELKKRNLSVPSDLLPPDFNALQFSLPVVSARGFLLALSAAANSVAEDLEFLCRRLSVPNLPHPTHPFRLKLLLDALFESFKLRKDPHYAHDWAQRNWPRLQAAMPEPLSELSADSVGLWLKAHLERVIENQRGRHADGRGRLLAQKFPLKSDEEDLYSLADDFIFDHEIVDEQFCDERLSQFPIDKAGELFRRVADFFGLTKGPQPAVNDAVVAQFQNLVYTLDEIGLSNWMKMDTREIEEFLPEGDPPSFAASQQDLDAARLLLKAAARGKANLLDFEALDPYKLLHGFDFKTVQEELATLPPNPFLTDADIDELFDITTAAVSMNQSEVAPSASLRNFKAKFGRTPLEALLDSEEKFLTSAGPVDWLKDEDENGEAFVSWRWKRPAQTVYDAEKGMFVREREGVDPLIKLHELRQTLLSVSRMMSMNKQGRVYYFRAIVAVGNGRGLFGIGIAFGPSPKEARSNAALAAIQNLDHIDFDVGRTLTTPVHGSEYSAHVKIVPRPLGKGLKSNLRYLPLLYLMGIDNCRVSFYGPSASARWFTRAKALKRALEQLQSRRTLANATGQKYDLLVAPGEHWMHWPDRWFRPISTEYARMLERIKKKRPPSYRRGFRAAIDEVIPEEIRPEFTPYTWKSPLQKWAEELKRKRLTSHNVYETEVFLHPPAQSSSPS
コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Toxoplasma gondii (トキソプラズマ)
分子量理論値: 127.333422 KDa
配列文字列: MRCPLAPRRQ RRLPRDSSSS VSLFLPHRGS LSLSSAFSPS FRRSPCPRSS PCLASSVPPS RLFSSASPND SRLALKKPLS PSFSSPFAF SRYTRDPELR HLTSTSRVQA PLPLRRCAAP VASLASSPCL SSSRASSASL SPCSLASLGS RSSPFCGGSR R GGERPPCE ...文字列:
MRCPLAPRRQ RRLPRDSSSS VSLFLPHRGS LSLSSAFSPS FRRSPCPRSS PCLASSVPPS RLFSSASPND SRLALKKPLS PSFSSPFAF SRYTRDPELR HLTSTSRVQA PLPLRRCAAP VASLASSPCL SSSRASSASL SPCSLASLGS RSSPFCGGSR R GGERPPCE RRASAGCGAA ANSFSSAPRP SRLSPSSPFF PSGLGCSSSP AHRARVAGPR LPLRSAFVAL FPGQPTRTLC FP AASSALS FSAQPSPPTA SASSFQSPRR LHNSHQARVL RRRHVYRDKH LDHVPTERAR QLAEQRSAFE LPRGTGEPLQ GGS RFPGGV MAPHLRVKLE KEKFLRDCMR EQENLAALFT ETEKETLLGR RGDSRESHEE EPATREAEKQ TSEGGKSDEA GKDG GKQED KQGAAPFGRK LQELESFVGS ALRTYRLLRP HALPFYKEDS LLSMQSKLNE ATLKHSPLVH DLVELKKRNL SVPSD LLPP DFNALQFSLP VVSARGFLLA LSAAANSVAE DLEFLCRRLS VPNLPHPTHP FRLKLLLDAL FESFKLRKDP HYAHDW AQR NWPRLQAAMP EPLSELSADS VGLWLKAHLE RVIENQRGRH ADGRGRLLAQ KFPLKSDEED LYSLADDFIF DHEIVDE QF CDERLSQFPI DKAGELFRRV ADFFGLTKGP QPAVNDAVVA QFQNLVYTLD EIGLSNWMKM DTREIEEFLP EGDPPSFA A SQQDLDAARL LLKAAARGKA NLLDFEALDP YKLLHGFDFK TVQEELATLP PNPFLTDADI DELFDITTAA VSMNQSEVA PSASLRNFKA KFGRTPLEAL LDSEEKFLTS AGPVDWLKDE DENGEAFVSW RWKRPAQTVY DAEKGMFVRE REGVDPLIKL HELRQTLLS VSRMMSMNKQ GRVYYFRAIV AVGNGRGLFG IGIAFGPSPK EARSNAALAA IQNLDHIDFD VGRTLTTPVH G SEYSAHVK IVPRPLGKGL KSNLRYLPLL YLMGIDNCRV SFYGPSASAR WFTRAKALKR ALEQLQSRRT LANATGQKYD LL VAPGEHW MHWPDRWFRP ISTEYARMLE RIKKKRPPSY RRGFRAAIDE VIPEEIRPEF TPYTWKSPLQ KWAEELKRKR LTS HNVYET EVFLHPPAQS SSPS

UniProtKB: 30S ribosomal protein S5, putative

+
分子 #43: Acylphosphatase-like domain-containing protein

分子名称: Acylphosphatase-like domain-containing protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 43
詳細: Correct sequence: ...詳細: Correct sequence: MAPFPRGIVKPRSAKVRAILNLSVEQRQPNPLRAPRKSLLDPPPCVAPLEKGNPKLDRQFDTLNRSITGFRKYKAPHTTAPRVVRDRDETNFHEMLGKFRFDLQGSFKENGDMLRDSLLQVGRDLFLVGWVKCRSRFATGHIQGDVHALSYMRRYLEKHVDESVSSVRFYEENFGMPLLEYERLSAVNDFRAPGKKQQHALRAAEKNKAKKLEQESLRHAQELERFYEENCIRNY
コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Toxoplasma gondii (トキソプラズマ)
分子量理論値: 27.403414 KDa
配列文字列: MAPFPRGIVK PRSAKVRAIL NLSVEQRQPN PLRAPRKSLL DPPPCVAPLE KGNPKLDRQF DTLNRSITGF RKYKAPHTTA PRVVRDRDE TNFHEMLGKF RFDLQGSFKE NGDMLRDSLL QVGRDLFLVG WVKCRSRFAT GHIQGDVHAL SYMRRYLEKH V DESVSSVR ...文字列:
MAPFPRGIVK PRSAKVRAIL NLSVEQRQPN PLRAPRKSLL DPPPCVAPLE KGNPKLDRQF DTLNRSITGF RKYKAPHTTA PRVVRDRDE TNFHEMLGKF RFDLQGSFKE NGDMLRDSLL QVGRDLFLVG WVKCRSRFAT GHIQGDVHAL SYMRRYLEKH V DESVSSVR FYEENFGMPL LEYERLSAVN DFRAPGKKQQ HALRAAEKNK AKKLEQESLR HAQELERFYE ENCIRNY

UniProtKB: Acylphosphatase-like domain-containing protein

+
分子 #44: ulr11

分子名称: ulr11 / タイプ: rna / ID: 44 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Toxoplasma gondii (トキソプラズマ)
分子量理論値: 2.404369 KDa
配列文字列:
UUUUUUUU

+
分子 #45: SSUE

分子名称: SSUE / タイプ: rna / ID: 45 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Toxoplasma gondii (トキソプラズマ)
分子量理論値: 15.342208 KDa
配列文字列:
AAUGAGCGCA UGUAAACUAG UCUUAAACAC ACCGCUCGUC ACGUAACA

+
分子 #46: ulr12

分子名称: ulr12 / タイプ: rna / ID: 46 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Toxoplasma gondii (トキソプラズマ)
分子量理論値: 1.485872 KDa
配列文字列:
UUUUU

+
分子 #47: RNA13

分子名称: RNA13 / タイプ: rna / ID: 47 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Toxoplasma gondii (トキソプラズマ)
分子量理論値: 11.019599 KDa
配列文字列:
AAAGGGAUGU UUAGCCGGGA AGUUAGCGUC UAAC

+
分子 #48: RNA19

分子名称: RNA19 / タイプ: rna / ID: 48 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Toxoplasma gondii (トキソプラズマ)
分子量理論値: 10.856399 KDa
配列文字列:
AGUUCUAUUG UGUUAGCAUG GUUUCGAGAA CACU

+
分子 #49: RNA15

分子名称: RNA15 / タイプ: rna / ID: 49 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Toxoplasma gondii (トキソプラズマ)
分子量理論値: 8.832327 KDa
配列文字列:
CGGCGAGAAG GGAAGUGUGU UUCAAAG

+
分子 #50: RNA8

分子名称: RNA8 / タイプ: rna / ID: 50 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Toxoplasma gondii (トキソプラズマ)
分子量理論値: 34.45348 KDa
配列文字列:
UAAUACAGGG UUGAACUGUG GGUUAGUUUC AAUGCCCAAG GCAGAGCACU GGAUUGGAUA CCCAGGGAAC UGUGCUCCCA UUAAUAAGA AUCAUAAUAU AAGUCACC

+
分子 #51: ulr13

分子名称: ulr13 / タイプ: rna / ID: 51 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Toxoplasma gondii (トキソプラズマ)
分子量理論値: 1.179706 KDa
配列文字列:
UUUU

+
分子 #52: ulr14

分子名称: ulr14 / タイプ: rna / ID: 52 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Toxoplasma gondii (トキソプラズマ)
分子量理論値: 567.374 Da
配列文字列:
UU

+
分子 #53: ulr15

分子名称: ulr15 / タイプ: rna / ID: 53 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Toxoplasma gondii (トキソプラズマ)
分子量理論値: 873.54 Da
配列文字列:
UUU

+
分子 #54: RNA33

分子名称: RNA33 / タイプ: rna / ID: 54 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Toxoplasma gondii (トキソプラズマ)
分子量理論値: 22.623381 KDa
配列文字列:
CAUAGAAGAU UAAGCUGCAU UACGUUUAAA CUUUACACUG GAUACGUUUU AAUGUUAACU UACUACAGAC C

+
分子 #55: RNA5

分子名称: RNA5 / タイプ: rna / ID: 55 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Toxoplasma gondii (トキソプラズマ)
分子量理論値: 26.45467 KDa
配列文字列:
ACAGUUACCG UAGCUGUAGA UGAAUGCUAA UUAUAGAGUA UAUCUCCUAU GACACUGCAU AACAUAUAAA UGCUCCUUCC GCC

+
分子 #56: RNA17

分子名称: RNA17 / タイプ: rna / ID: 56 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Toxoplasma gondii (トキソプラズマ)
分子量理論値: 15.372085 KDa
配列文字列:
UUUUAUGAUC CCAGGCUGGU UUAAUAAGUC AAAGUUUAGC CAGAGUCG

+
分子 #57: SSUB

分子名称: SSUB / タイプ: rna / ID: 57 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Toxoplasma gondii (トキソプラズマ)
分子量理論値: 39.02991 KDa
配列文字列:
UUCUUUGCCU GGAGGUUUGU UACGUUCCGU ACAGUUGUAG GUAAAAGGUA UGUUAGAGAC UUAGACUAGC GUUGGAGCAC AUUGUUUCA UUCGAUAGUC CACGCUCAAU CUUACCAUAC AUA

+
分子 #58: SSUA

分子名称: SSUA / タイプ: rna / ID: 58 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Toxoplasma gondii (トキソプラズマ)
分子量理論値: 36.984035 KDa
配列文字列:
AGAGGCUUGA UAGUACUACC GUAAGUACAU AAUAUACAGU CCCAGCAGUA GCGGUUAAAC UAUAGAAGAG UCGAGUAUUA UCCAUACAU ACCAGGCGUA AAAAGCGUUC AUCCAU

+
分子 #59: ulr16

分子名称: ulr16 / タイプ: rna / ID: 59 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Toxoplasma gondii (トキソプラズマ)
分子量理論値: 4.547529 KDa
配列文字列:
UUUUUUUUUU UUUUU

+
分子 #60: ulr17

分子名称: ulr17 / タイプ: rna / ID: 60 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Toxoplasma gondii (トキソプラズマ)
分子量理論値: 4.241363 KDa
配列文字列:
UUUUUUUUUU UUUU

+
分子 #61: RNA30

分子名称: RNA30 / タイプ: rna / ID: 61 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Toxoplasma gondii (トキソプラズマ)
分子量理論値: 9.904919 KDa
配列文字列:
UAAGAUCAUC GAAUAUAACG GUAUGCUCCU G

+
分子 #62: url18

分子名称: url18 / タイプ: rna / ID: 62 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Toxoplasma gondii (トキソプラズマ)
分子量理論値: 9.446182 KDa
配列文字列:
UUUUUUUUUU UUUUUUUUUU UUUUUUUUUU U

+
分子 #63: SSUF

分子名称: SSUF / タイプ: rna / ID: 63 / 詳細: polyA at the end / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Toxoplasma gondii (トキソプラズマ)
分子量理論値: 19.508744 KDa
配列文字列:
ACACAGUCGG UACGAAGUCG AAACAAGGUA GUUGAUGGUG AACCAGUGGC UGAACAAAAA

+
分子 #64: ulr19

分子名称: ulr19 / タイプ: rna / ID: 64 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Toxoplasma gondii (トキソプラズマ)
分子量理論値: 7.609189 KDa
配列文字列:
UUUUUUUUUU UUUUUUUUUU UUUUU

+
分子 #65: ulr20

分子名称: ulr20 / タイプ: rna / ID: 65 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Toxoplasma gondii (トキソプラズマ)
分子量理論値: 1.792037 KDa
配列文字列:
UUUUUU

+
分子 #66: ulr21

分子名称: ulr21 / タイプ: rna / ID: 66 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Toxoplasma gondii (トキソプラズマ)
分子量理論値: 3.322866 KDa
配列文字列:
UUUUUUUUUU U

-
実験情報

-
構造解析

手法クライオ電子顕微鏡法
解析単粒子再構成法
試料の集合状態particle

-
試料調製

緩衝液pH: 7.5
グリッドモデル: Quantifoil R2/2 / 材質: COPPER / 支持フィルム - 材質: CARBON / 支持フィルム - トポロジー: HOLEY / 支持フィルム - Film thickness: 2
凍結凍結剤: ETHANE / チャンバー内湿度: 100 % / チャンバー内温度: 277 K / 装置: FEI VITROBOT MARK IV / 詳細: Blotting force 5, blotting time 2.5 seconds..

-
電子顕微鏡法

顕微鏡FEI TALOS ARCTICA
温度最低: 90.0 K / 最高: 95.0 K
撮影フィルム・検出器のモデル: GATAN K2 SUMMIT (4k x 4k)
検出モード: COUNTING / デジタル化 - サイズ - 横: 4096 pixel / デジタル化 - サイズ - 縦: 4096 pixel / デジタル化 - 画像ごとのフレーム数: 1-40 / 撮影したグリッド数: 1 / 実像数: 9524 / 平均露光時間: 6.0 sec. / 平均電子線量: 50.0 e/Å2
電子線加速電圧: 200 kV / 電子線源: FIELD EMISSION GUN
電子光学系C2レンズ絞り径: 30.0 µm / 照射モード: FLOOD BEAM / 撮影モード: BRIGHT FIELD / Cs: 2.7 mm / 最大 デフォーカス（公称値）: 2.5 µm / 最小 デフォーカス（公称値）: 0.5 µm / 倍率（公称値）: 59000
試料ステージ試料ホルダーモデル: FEI TITAN KRIOS AUTOGRID HOLDER
ホルダー冷却材: NITROGEN
実験機器
モデル: Talos Arctica / 画像提供: FEI Company

+
画像解析

粒子像選択選択した数: 280177
初期モデルモデルのタイプ: NONE
最終 再構成使用したクラス数: 1 / アルゴリズム: BACK PROJECTION / 解像度のタイプ: BY AUTHOR / 解像度: 3.29 Å / 解像度の算出法: FSC 0.143 CUT-OFF / 使用した粒子像数: 22169
初期 角度割当タイプ: COMMON LINE
最終 角度割当タイプ: PROJECTION MATCHING
最終 3次元分類クラス数: 4 / 平均メンバー数/クラス: 70000 / ソフトウェア - 名称: cryoSPARC (ver. 4.5.1) / ソフトウェア - 詳細: Heterogeneous refinement
FSC曲線 (解像度の算出)

-
原子モデル構築 1

精密化空間: REAL / プロトコル: AB INITIO MODEL
得られたモデル

PDB-9fia:
SSU(body) structure derived from the SSU sample of the mitoribosome from T. gondii.

+
万見について

-
お知らせ

-
2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

-
2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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万見 (Yorodumi)

幾万の構造データを、幾万の視点から

  • 万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
  • EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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