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基本情報
登録情報 | ![]() | |||||||||
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タイトル | Tomograms of isolated synaptic vesicles from wild-type mouse brain | |||||||||
![]() | tomogram of isolated synaptic vesicles from wild-type mouse brain | |||||||||
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![]() | V-ATPase / synaptic vesicle / MEMBRANE PROTEIN | |||||||||
生物種 | ![]() ![]() | |||||||||
手法 | 電子線トモグラフィー法 / クライオ電子顕微鏡法 | |||||||||
![]() | Wang C / Jiang W / Yang K / Wang X / Guo Q / Brunger AT | |||||||||
資金援助 | ![]()
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![]() | ![]() タイトル: Structure and topography of the synaptic V-ATPase-synaptophysin complex. 著者: Chuchu Wang / Wenhong Jiang / Jeremy Leitz / Kailu Yang / Luis Esquivies / Xing Wang / Xiaotao Shen / Richard G Held / Daniel J Adams / Tamara Basta / Lucas Hampton / Ruiqi Jian / Lihua Jiang ...著者: Chuchu Wang / Wenhong Jiang / Jeremy Leitz / Kailu Yang / Luis Esquivies / Xing Wang / Xiaotao Shen / Richard G Held / Daniel J Adams / Tamara Basta / Lucas Hampton / Ruiqi Jian / Lihua Jiang / Michael H B Stowell / Wolfgang Baumeister / Qiang Guo / Axel T Brunger / ![]() ![]() ![]() ![]() 要旨: Synaptic vesicles are organelles with a precisely defined protein and lipid composition, yet the molecular mechanisms for the biogenesis of synaptic vesicles are mainly unknown. Here we discovered a ...Synaptic vesicles are organelles with a precisely defined protein and lipid composition, yet the molecular mechanisms for the biogenesis of synaptic vesicles are mainly unknown. Here we discovered a well-defined interface between the synaptic vesicle V-ATPase and synaptophysin by in situ cryo-electron tomography and single-particle cryo-electron microscopy of functional synaptic vesicles isolated from mouse brains. The synaptic vesicle V-ATPase is an ATP-dependent proton pump that establishes the proton gradient across the synaptic vesicle, which in turn drives the uptake of neurotransmitters. Synaptophysin and its paralogues synaptoporin and synaptogyrin belong to a family of abundant synaptic vesicle proteins whose function is still unclear. We performed structural and functional studies of synaptophysin-knockout mice, confirming the identity of synaptophysin as an interaction partner with the V-ATPase. Although there is little change in the conformation of the V-ATPase upon interaction with synaptophysin, the presence of synaptophysin in synaptic vesicles profoundly affects the copy number of V-ATPases. This effect on the topography of synaptic vesicles suggests that synaptophysin assists in their biogenesis. In support of this model, we observed that synaptophysin-knockout mice exhibit severe seizure susceptibility, suggesting an imbalance of neurotransmitter release as a physiological consequence of the absence of synaptophysin. | |||||||||
履歴 |
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構造の表示
添付画像 |
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ダウンロードとリンク
-EMDBアーカイブ
マップデータ | ![]() | 242.8 MB | ![]() | |
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ヘッダ (付随情報) | ![]() ![]() | 29.2 KB 29.2 KB | 表示 表示 | ![]() |
画像 | ![]() | 154.7 KB | ||
Filedesc metadata | ![]() | 4.4 KB | ||
その他 | ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() | 242.6 MB 242.7 MB 242.9 MB 242.6 MB 242.7 MB 225.6 MB 242.6 MB 242.6 MB 243.1 MB | ||
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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マップ
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注釈 | tomogram of isolated synaptic vesicles from wild-type mouse brain | ||||||||||||||||||||||||||||||||
投影像・断面図 | 画像のコントロール
画像は Spider により作成 これらの図は立方格子座標系で作成されたものです | ||||||||||||||||||||||||||||||||
ボクセルのサイズ | X=Y=Z: 8.888 Å | ||||||||||||||||||||||||||||||||
密度 |
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対称性 | 空間群: 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
詳細 | EMDB XML:
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-添付データ
-追加マップ: tomogram of isolated synaptic vesicles from wild-type mouse brain
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注釈 | tomogram of isolated synaptic vesicles from wild-type mouse brain | ||||||||||||
投影像・断面図 |
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-追加マップ: tomogram of isolated synaptic vesicles from wild-type mouse brain
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注釈 | tomogram of isolated synaptic vesicles from wild-type mouse brain | ||||||||||||
投影像・断面図 |
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密度ヒストグラム |
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試料の構成要素
-全体 : Mouse brain isolated glutamatergic synaptic vesicles
全体 | 名称: Mouse brain isolated glutamatergic synaptic vesicles |
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要素 |
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-超分子 #1: Mouse brain isolated glutamatergic synaptic vesicles
超分子 | 名称: Mouse brain isolated glutamatergic synaptic vesicles タイプ: organelle_or_cellular_component / ID: 1 / 親要素: 0 / 含まれる分子: #1-#9 |
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由来(天然) | 生物種: ![]() ![]() |
-実験情報
-構造解析
手法 | クライオ電子顕微鏡法 |
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![]() | 電子線トモグラフィー法 |
試料の集合状態 | cell |
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試料調製
緩衝液 | pH: 7.4 |
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凍結 | 凍結剤: ETHANE |
詳細 | The specimen state should be an intact subcellular component. |
切片作成 | その他: NO SECTIONING |
位置合わせマーカー | Manufacturer: EMS / 直径: 10 nm |
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電子顕微鏡法
顕微鏡 | TFS KRIOS |
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撮影 | フィルム・検出器のモデル: GATAN K3 BIOQUANTUM (6k x 4k) 平均電子線量: 50.0 e/Å2 |
電子線 | 加速電圧: 300 kV / 電子線源: ![]() |
電子光学系 | 照射モード: FLOOD BEAM / 撮影モード: BRIGHT FIELD / 最大 デフォーカス(公称値): 2.0 µm / 最小 デフォーカス(公称値): 0.8 µm |
実験機器 | ![]() モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company |
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画像解析
最終 再構成 | 使用した粒子像数: 41 |
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-原子モデル構築 1
精密化 | プロトコル: FLEXIBLE FIT |
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