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- EMDB-4370: Unique features of mammalian mitochondrial translation initiation... -

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登録情報
データベース: EMDB / ID: EMD-4370
タイトルUnique features of mammalian mitochondrial translation initiation revealed by cryo-EM. This file contains the 39S ribosomal subunit.
マップデータ
試料
  • 複合体: mammalian mitochondrial translation initiation complex
    • 複合体: mammalian mitochondrial ribosome
      • タンパク質・ペプチド: x 52種
      • RNA: x 2種
    • 複合体: Translation initiation factor IF-2, mitochondrial
      • タンパク質・ペプチド: x 1種
    • 複合体: tRNA
      • RNA: x 1種
  • リガンド: x 8種
キーワードtranslation initiation / initiation factor IF2 / mitochondria / membrane targeting / RIBOSOME
機能・相同性
機能・相同性情報


Mitochondrial translation elongation / Mitochondrial translation termination / mitochondrial translational initiation / translation factor activity, RNA binding / mitochondrial translational termination / mitochondrial transcription / mitochondrial translational elongation / ribonuclease III activity / translation release factor activity, codon nonspecific / Mitochondrial translation initiation ...Mitochondrial translation elongation / Mitochondrial translation termination / mitochondrial translational initiation / translation factor activity, RNA binding / mitochondrial translational termination / mitochondrial transcription / mitochondrial translational elongation / ribonuclease III activity / translation release factor activity, codon nonspecific / Mitochondrial translation initiation / mitochondrial large ribosomal subunit / peptidyl-tRNA hydrolase / mitochondrial ribosome / ribosome disassembly / peptidyl-tRNA hydrolase activity / mitochondrial translation / regulation of translational initiation / organelle membrane / ribosomal small subunit binding / RNA processing / translation initiation factor activity / rescue of stalled ribosome / cell junction / large ribosomal subunit / double-stranded RNA binding / rRNA binding / nuclear body / structural constituent of ribosome / ribosome / translation / ribonucleoprotein complex / protein domain specific binding / nucleotide binding / mRNA binding / intracellular membrane-bounded organelle / GTPase activity / GTP binding / positive regulation of DNA-templated transcription / mitochondrion / RNA binding / nucleoplasm / nucleus / plasma membrane / cytosol / cytoplasm
類似検索 - 分子機能
Translation initiation factor IF-2, domain II / Initiation factor 2 signature. / Translation initiation factor IF-2, bacterial-like / Translation initiation factor IF- 2, domain 3 / Translation-initiation factor 2 / : / Elongation factor G domain 2 / Translation initiation factor IF- 2 / Translation initiation factor IF-2, domain 3 superfamily / : ...Translation initiation factor IF-2, domain II / Initiation factor 2 signature. / Translation initiation factor IF-2, bacterial-like / Translation initiation factor IF- 2, domain 3 / Translation-initiation factor 2 / : / Elongation factor G domain 2 / Translation initiation factor IF- 2 / Translation initiation factor IF-2, domain 3 superfamily / : / Ribosomal protein L55, mitochondrial / Mitochondrial ribosomal protein L55 superfamily / Mitochondrial ribosomal protein L55 / Mitochondrial ribosomal protein L48 / 39S ribosomal protein L40, mitochondrial / 39S ribosomal protein L42, mitochondrial / Mitochondrial 28S ribosomal protein S32 / Ribosomal protein L37, mitochondrial / Ribosomal protein L28/L40, mitochondrial / Mitochondrial ribosomal protein L37 / Mitochondrial ribosomal protein L28 / Ribosomal protein 63, mitochondrial / Growth arrest/ DNA-damage-inducible protein-interacting protein 1 / Ribosomal protein L35, mitochondrial / Ribosomal protein L51, mitochondrial / Growth arrest and DNA-damage-inducible proteins-interacting protein 1 / Mitochondrial ribosomal subunit / Mitochondrial ribosome protein 63 / Ribosomal protein L37/S30 / Growth arrest and DNA damage-inducible proteins-interacting protein 1 domain superfamily / : / : / Mitochondrial 28S ribosomal protein S30 (PDCD9) / 39S ribosomal protein L52, mitochondrial / Mitoribosomal protein mL52 / : / MRPL44, double-stranded RNA binding domain / : / MRPL44 dsRNA-binding domain / Large ribosomal subunit protein mL44, endonuclease domain / : / : / Large ribosomal subunit protein bL9m C-terminal domain / Large ribosomal subunit protein bL9m N-terminal domain / Tim44-like domain / Tim44-like domain / Tim44 / : / : / Ribosomal protein L7/L12, oligomerisation / Ribosomal protein L7/L12, oligomerisation domain superfamily / Ribosomal protein L7/L12 dimerisation domain / Mitochondrial ribosomal protein L46 NUDIX / Ribosomal protein L7/L12 / Ribosomal protein L7/L12, C-terminal / Ribosomal protein L7/L12 C-terminal domain / Ribosomal protein L46, N-terminal / 39S mitochondrial ribosomal protein L46 / Ribosomal protein L50, mitochondria / Ribosomal subunit 39S / Ribosomal protein L49/IMG2 / Mitochondrial large subunit ribosomal protein (Img2) / Ribosomal protein L27/L41, mitochondrial / Mitochondrial ribosomal protein L27 / 39S ribosomal protein L46, mitochondrial / 39S ribosomal protein L43/54S ribosomal protein L51 / Ribosomal protein L47, mitochondrial / MRP-L47 superfamily, mitochondrial / Mitochondrial 39-S ribosomal protein L47 (MRP-L47) / Phosphatidylethanolamine-binding protein, eukaryotic / Phosphatidylethanolamine-binding protein / Phosphatidylethanolamine-binding protein / PEBP-like superfamily / Ribosomal protein L7/L12, C-terminal/adaptor protein ClpS-like / Threonyl/alanyl tRNA synthetase, class II-like, putative editing domain superfamily / TGS-like / TGS domain profile. / TGS / Peptide chain release factor class I / RF-1 domain / Ribonuclease III, endonuclease domain superfamily / Double stranded RNA-binding domain (dsRBD) profile. / Double-stranded RNA-binding domain / : / Mitochondrial ribosomal protein L51 / S25 / CI-B8 domain / Ribosomal protein/NADH dehydrogenase domain / Mitochondrial ribosomal protein L51 / S25 / CI-B8 domain / Beta-grasp domain superfamily / NTF2-like domain superfamily / NUDIX hydrolase-like domain superfamily / Translational (tr)-type GTP-binding domain / Elongation factor Tu GTP binding domain / Translational (tr)-type guanine nucleotide-binding (G) domain profile. / Ribosomal protein L10-like domain superfamily / Ribosomal protein L10P / Ribosomal protein L10 / Ribosomal protein L11/L12 / Ribosomal protein L11, C-terminal / Ribosomal protein L11, C-terminal domain superfamily / Ribosomal protein L11/L12, N-terminal domain superfamily
類似検索 - ドメイン・相同性
Large ribosomal subunit protein mL49 / Large ribosomal subunit protein mL62 / Large ribosomal subunit protein uL18m / Large ribosomal subunit protein mL40 / Large ribosomal subunit protein bL28m / Large ribosomal subunit protein bL20m / Large ribosomal subunit protein bL33m / Large ribosomal subunit protein mL64 / 39S ribosomal protein L23, mitochondrial / Large ribosomal subunit protein bL34m ...Large ribosomal subunit protein mL49 / Large ribosomal subunit protein mL62 / Large ribosomal subunit protein uL18m / Large ribosomal subunit protein mL40 / Large ribosomal subunit protein bL28m / Large ribosomal subunit protein bL20m / Large ribosomal subunit protein bL33m / Large ribosomal subunit protein mL64 / 39S ribosomal protein L23, mitochondrial / Large ribosomal subunit protein bL34m / Ribosomal protein / Large ribosomal subunit protein bL12m / Mitochondrial ribosomal protein L41 / Large ribosomal subunit protein uL4m / Large ribosomal subunit protein mL51 / Large ribosomal subunit protein mL37 / Mitochondrial ribosomal protein L57 / Large ribosomal subunit protein mL42 / Large ribosomal subunit protein mL48 / Large ribosomal subunit protein uL24m / Large ribosomal subunit protein uL16m / Large ribosomal subunit protein bL17m / Large ribosomal subunit protein uL22m / Large ribosomal subunit protein mL66 / Mitochondrial ribosomal protein L2 / 39S ribosomal protein L15, mitochondrial / Large ribosomal subunit protein bL27m / Large ribosomal subunit protein uL11m / Large ribosomal subunit protein mL38 / Large ribosomal subunit protein uL10m / Large ribosomal subunit protein bL21m / Mitochondrial ribosomal protein L4 / Large ribosomal subunit protein mL43 / Large ribosomal subunit protein mL52 / Large ribosomal subunit protein uL29m / Large ribosomal subunit protein mL39 / Large ribosomal subunit protein mL44 / Large ribosomal subunit protein mL46 / Large ribosomal subunit protein uL30m / Large ribosomal subunit protein mL48 / Large ribosomal subunit protein bL35m / Large ribosomal subunit protein mL50 / Mitochondrial ribosomal protein L55 / Large ribosomal subunit protein mL45 / Large ribosomal subunit protein mL54 / Large ribosomal subunit protein bL9m / Translation initiation factor IF-2, mitochondrial
類似検索 - 構成要素
生物種Sus scrofa (ブタ) / Homo sapiens (ヒト)
手法単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 3.2 Å
データ登録者Kummer E / Leibundgut M
資金援助 スイス, 3件
OrganizationGrant number国
European Molecular Biology OrganizationALTF 1196-2014 スイス
Swiss National Science Foundation310030B_163478 スイス
Swiss National Science Foundation138262 スイス
引用ジャーナル: Nature / 年: 2018
タイトル: Unique features of mammalian mitochondrial translation initiation revealed by cryo-EM.
著者: Eva Kummer / Marc Leibundgut / Oliver Rackham / Richard G Lee / Daniel Boehringer / Aleksandra Filipovska / Nenad Ban /
要旨: Mitochondria maintain their own specialized protein synthesis machinery, which in mammals is used exclusively for the synthesis of the membrane proteins responsible for oxidative phosphorylation. The ...Mitochondria maintain their own specialized protein synthesis machinery, which in mammals is used exclusively for the synthesis of the membrane proteins responsible for oxidative phosphorylation. The initiation of protein synthesis in mitochondria differs substantially from bacterial or cytosolic translation systems. Mitochondrial translation initiation lacks initiation factor 1, which is essential in all other translation systems from bacteria to mammals. Furthermore, only one type of methionyl transfer RNA (tRNA) is used for both initiation and elongation, necessitating that the initiation factor specifically recognizes the formylated version of tRNA (fMet-tRNA). Lastly, most mitochondrial mRNAs do not possess 5' leader sequences to promote mRNA binding to the ribosome. There is currently little mechanistic insight into mammalian mitochondrial translation initiation, and it is not clear how mRNA engagement, initiator-tRNA recruitment and start-codon selection occur. Here we determine the cryo-EM structure of the complete translation initiation complex from mammalian mitochondria at 3.2 Å. We describe the function of an additional domain insertion that is present in the mammalian mitochondrial initiation factor 2 (mtIF2). By closing the decoding centre, this insertion stabilizes the binding of leaderless mRNAs and induces conformational changes in the rRNA nucleotides involved in decoding. We identify unique features of mtIF2 that are required for specific recognition of fMet-tRNA and regulation of its GTPase activity. Finally, we observe that the ribosomal tunnel in the initiating ribosome is blocked by insertion of the N-terminal portion of mitochondrial protein mL45, which becomes exposed as the ribosome switches to elongation mode and may have an additional role in targeting of mitochondrial ribosomes to the protein-conducting pore in the inner mitochondrial membrane.
履歴
登録2018年4月13日-
ヘッダ(付随情報) 公開2018年5月23日-
マップ公開2018年8月8日-
更新2024年5月15日-
現状2024年5月15日処理サイト: PDBe / 状態: 公開

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構造の表示

ムービー
  • 表面図（断面を密度値に従い着色）
  • 表面レベル: 0.12
  • UCSF Chimeraによる作画
  • ダウンロード
  • 表面図（高さに従い着色）
  • 表面レベル: 0.12
  • UCSF Chimeraによる作画
  • ダウンロード
  • あてはめたモデルとの重ね合わせ
  • 原子モデル: PDB-6gb2
  • 表面レベル: 0.12
  • UCSF Chimeraによる作画
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ムービービューア
構造ビューアEMマップ:
SurfViewMolmilJmol/JSmol
添付画像

emd_4370.png

ダウンロードとリンク

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マップ

ファイルダウンロード / ファイル: emd_4370.map.gz / 形式: CCP4 / 大きさ: 84.6 MB / タイプ: IMAGE STORED AS FLOATING POINT NUMBER (4 BYTES)
投影像・断面図

画像のコントロール

大きさ
明度
コントラスト
その他
軸Z (Sec.)Y (Row.)X (Col.)
1.39 Å/pix.
x 281 pix.
= 390.59 Å		1.39 Å/pix.
x 281 pix.
= 390.59 Å		1.39 Å/pix.
x 281 pix.
= 390.59 Å

表面

投影像

断面 (1/3)

断面 (1/2)

断面 (2/3)

画像は Spider により作成

ボクセルのサイズX=Y=Z: 1.39 Å
密度

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)
表面レベル登録者による: 0.12 / ムービー #1: 0.12
最小 - 最大-0.3282438 - 0.65797997
平均 (標準偏差)0.0017977863 (±0.0235527)
対称性空間群: 1
詳細

EMDB XML:

マップ形状
Axis orderXYZ
Origin000
サイズ281281281
Spacing281281281
セルA=B=C: 390.59 Å
α=β=γ: 90.0 °

CCP4マップ ヘッダ情報:

modeImage stored as Reals
Å/pix. X/Y/Z1.391.391.39
M x/y/z281281281
origin x/y/z0.0000.0000.000
length x/y/z390.590390.590390.590
α/β/γ90.00090.00090.000
MAP C/R/S123
start NC/NR/NS000
NC/NR/NS281281281
D min/max/mean-0.3280.6580.002

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添付データ

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マスク #1

ファイルemd_4370_msk_1.map
投影像・断面図
軸ZYX

投影像

断面 (1/2)
密度ヒストグラム

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)

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ハーフマップ: #1

ファイルemd_4370_half_map_1.map
投影像・断面図
軸ZYX

投影像

断面 (1/2)
密度ヒストグラム

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)

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ハーフマップ: #2

ファイルemd_4370_half_map_2.map
投影像・断面図
軸ZYX

投影像

断面 (1/2)
密度ヒストグラム

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)

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試料の構成要素

+
全体 : mammalian mitochondrial translation initiation complex

全体名称: mammalian mitochondrial translation initiation complex
要素
  • 複合体: mammalian mitochondrial translation initiation complex
    • 複合体: mammalian mitochondrial ribosome
      • タンパク質・ペプチド: Mitochondrial ribosomal protein L12
      • タンパク質・ペプチド: Mitochondrial ribosomal protein L27
      • タンパク質・ペプチド: Mitochondrial ribosomal protein L28
      • タンパク質・ペプチド: Mitochondrial ribosomal protein L47
      • タンパク質・ペプチド: 'Mitochondrial ribosomal protein L30
      • タンパク質・ペプチド: 'Mitochondrial ribosomal protein L55
      • タンパク質・ペプチド: Mitochondrial ribosomal protein L32
      • タンパク質・ペプチド: Mitochondrial ribosomal protein L33
      • タンパク質・ペプチド: Mitochondrial ribosomal protein L34
      • タンパク質・ペプチド: Mitochondrial ribosomal protein L35
      • タンパク質・ペプチド: Ribosomal protein
      • RNA: 16S ribosomal RNA, mitochondrial
      • RNA: CP tRNAPhe, mitochondrial
      • タンパク質・ペプチド: Mitochondrial ribosomal protein L2
      • タンパク質・ペプチド: ICT1
      • タンパク質・ペプチド: Mitochondrial ribosomal protein L4
      • タンパク質・ペプチド: Mitochondrial ribosomal protein L9
      • タンパク質・ペプチド: Mitochondrial ribosomal protein L10
      • タンパク質・ペプチド: Mitochondrial ribosomal protein L11
      • タンパク質・ペプチド: Mitochondrial ribosomal protein L13
      • タンパク質・ペプチド: Mitochondrial ribosomal protein L14
      • タンパク質・ペプチド: Mitochondrial ribosomal protein L15
      • タンパク質・ペプチド: Mitochondrial ribosomal protein L16
      • タンパク質・ペプチド: Mitochondrial ribosomal protein L17
      • タンパク質・ペプチド: Mitochondrial ribosomal protein L18
      • タンパク質・ペプチド: Mitochondrial ribosomal protein L19
      • タンパク質・ペプチド: Mitochondrial ribosomal protein L20
      • タンパク質・ペプチド: Mitochondrial ribosomal protein L21
      • タンパク質・ペプチド: Mitochondrial ribosomal protein L22
      • タンパク質・ペプチド: Mitochondrial ribosomal protein L23
      • タンパク質・ペプチド: Mitochondrial ribosomal protein L24
      • タンパク質・ペプチド: Mitochondrial ribosomal protein L37
      • タンパク質・ペプチド: Mitochondrial ribosomal protein L38
      • タンパク質・ペプチド: Mitochondrial ribosomal protein L39
      • タンパク質・ペプチド: Mitochondrial ribosomal protein L40
      • タンパク質・ペプチド: Mitochondrial ribosomal protein L41
      • タンパク質・ペプチド: Mitochondrial ribosomal protein L42
      • タンパク質・ペプチド: Mitochondrial ribosomal protein L43
      • タンパク質・ペプチド: Mitochondrial ribosomal protein L44
      • タンパク質・ペプチド: Mitochondrial ribosomal protein L45
      • タンパク質・ペプチド: Mitochondrial ribosomal protein L46
      • タンパク質・ペプチド: Mitochondrial ribosomal protein L48
      • タンパク質・ペプチド: Mrpl34
      • タンパク質・ペプチド: Mitochondrial ribosomal protein L50
      • タンパク質・ペプチド: Mitochondrial ribosomal protein L51
      • タンパク質・ペプチド: Mitochondrial ribosomal protein L52
      • タンパク質・ペプチド: mL53, MRPL53
      • タンパク質・ペプチド: Uncharacterized protein
      • タンパク質・ペプチド: Mitochondrial ribosomal protein L57
      • タンパク質・ペプチド: Mitochondrial ribosomal protein L58
      • タンパク質・ペプチド: 'Mitochondrial ribosomal protein L59
      • タンパク質・ペプチド: mL65, MRPS30
      • タンパク質・ペプチド: Mitochondrial ribosomal protein S18A
      • タンパク質・ペプチド: unassigned secondary structure elements
    • 複合体: Translation initiation factor IF-2, mitochondrial
      • タンパク質・ペプチド: Translation initiation factor IF-2, mitochondrial
    • 複合体: tRNA
      • RNA: P-site fMet-tRNAMet, mitochondrial
  • リガンド: MAGNESIUM ION
  • リガンド: ZINC ION
  • リガンド: GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE
  • リガンド: SPERMINE
  • リガンド: 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE
  • リガンド: SODIUM ION
  • リガンド: N-FORMYLMETHIONINE
  • リガンド: water

+
超分子 #1: mammalian mitochondrial translation initiation complex

超分子名称: mammalian mitochondrial translation initiation complex
タイプ: complex / ID: 1 / 親要素: 0 / 含まれる分子: #1-#56
分子量理論値: 2.85 MDa

+
超分子 #2: mammalian mitochondrial ribosome

超分子名称: mammalian mitochondrial ribosome / タイプ: complex / ID: 2 / 親要素: 1 / 含まれる分子: #1-#13, #15-#55
由来(天然)生物種: Sus scrofa (ブタ)

+
超分子 #3: Translation initiation factor IF-2, mitochondrial

超分子名称: Translation initiation factor IF-2, mitochondrial / タイプ: complex / ID: 3 / 親要素: 1 / 含まれる分子: #14
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)

+
超分子 #4: tRNA

超分子名称: tRNA / タイプ: complex / ID: 4 / 親要素: 1 / 含まれる分子: #56
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)

+
分子 #1: Mitochondrial ribosomal protein L12

分子名称: Mitochondrial ribosomal protein L12 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 1
詳細: Unassigned residues have been built as poly-alanine.
コピー数: 7 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sus scrofa (ブタ) / 器官: liver
分子量理論値: 21.268975 KDa
配列文字列: MLPAAASSLW GPCFGLRAAA LRVARHQGPR LCGVRLMRCS SHRKGEALAG APLDNAPKEY PPKIQQLVQD IASLTLLEIS DLNELLKKT LKIQDVGFMP MGAVAPGAPP AAAAPEAAEE DLPKRKEQTH FTVRLTEAKP VDKVKLIKEI KSHIQGINLV Q AKKLVESL ...文字列:
MLPAAASSLW GPCFGLRAAA LRVARHQGPR LCGVRLMRCS SHRKGEALAG APLDNAPKEY PPKIQQLVQD IASLTLLEIS DLNELLKKT LKIQDVGFMP MGAVAPGAPP AAAAPEAAEE DLPKRKEQTH FTVRLTEAKP VDKVKLIKEI KSHIQGINLV Q AKKLVESL PQEIKANVPK AEAEKIKAAL EAVGGTVVLE

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein bL12m

+
分子 #2: Mitochondrial ribosomal protein L27

分子名称: Mitochondrial ribosomal protein L27 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 2 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sus scrofa (ブタ) / 器官: liver
分子量理論値: 15.943688 KDa
配列文字列:
MALAVLALRT RAAVTALLSP PQAAALAVRY ASKKTGGSSK NLGGKSPGKR FGIKKMEGHY VHAGNILATQ RHFRWHPGAH VGLGKNKCL YALEEGVVRY TKEVYVPNPS NSEAVDLVTR LPQGAVLYKT FVHVVPAKPE GTFKLVAML

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein bL27m

+
分子 #3: Mitochondrial ribosomal protein L28

分子名称: Mitochondrial ribosomal protein L28 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 3 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sus scrofa (ブタ) / 器官: liver
分子量理論値: 30.148953 KDa
配列文字列: MPLHKVPVGL WKQLRLWEGI YSRLPRHYLR SLEEARTPTP VHYRPHGAKF KINPKNWQRE RVEDVPIPVH YPPESQLGLW GGEGWVLGH RYVNNDKLSK RVRKVWKPQL FQRELYSEIL DKRFTVTVTM RTLDLIDQAC GFDFYILKTP KEDLCSKFGM D LKRGMLLR ...文字列:
MPLHKVPVGL WKQLRLWEGI YSRLPRHYLR SLEEARTPTP VHYRPHGAKF KINPKNWQRE RVEDVPIPVH YPPESQLGLW GGEGWVLGH RYVNNDKLSK RVRKVWKPQL FQRELYSEIL DKRFTVTVTM RTLDLIDQAC GFDFYILKTP KEDLCSKFGM D LKRGMLLR LARQDPQLHP DDPARRAAIY DRYKAFVIPE AEAEWVGLTL DEAVEKQRLL EEKDPIPLFK IFVEELLGQL QQ QALSEPA VVQTRASRK

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein bL28m

+
分子 #4: Mitochondrial ribosomal protein L47

分子名称: Mitochondrial ribosomal protein L47 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 4 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sus scrofa (ブタ) / 器官: liver
分子量理論値: 30.085088 KDa
配列文字列: MAAAGLAVFC RRVSAALKAC RLLIRPQAPP STSCRFSPSL LPKNTPNVTS FHQFRIFHTT FSRRGLEEFF DDPKNWGEEK VKSGASWTC QQLRNKSNED LHKLWYVLLK ERNMLLTLEQ EAKRQRLPMP SPERLEKVVD SMDALDKVVQ EREDALRLLQ T GQEKARPG ...文字列:
MAAAGLAVFC RRVSAALKAC RLLIRPQAPP STSCRFSPSL LPKNTPNVTS FHQFRIFHTT FSRRGLEEFF DDPKNWGEEK VKSGASWTC QQLRNKSNED LHKLWYVLLK ERNMLLTLEQ EAKRQRLPMP SPERLEKVVD SMDALDKVVQ EREDALRLLQ T GQEKARPG AWRRDIFGRI IWHKFKQWPI PWYLNKKYNR KRFFAMPYVE RFVRMRIEKQ ARIKARKRSL ERKKEKFLQE KF PHLSETQ KSSHV

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL29m

+
分子 #5: 'Mitochondrial ribosomal protein L30

分子名称: 'Mitochondrial ribosomal protein L30 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 5 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sus scrofa (ブタ) / 器官: liver
分子量理論値: 18.58584 KDa
配列文字列:
MAGILRSVVQ RPPGRLQTVT KGMESLICTD WIRHKFTRSR IPDKVFQPSP EDHEKYGGDP QYPHKLHIVT RIKSTKRRPY WEKDIIKML GLEKAHTPQV HKNIPSVNAK LKVVKHLIRI KPLKLPQGLP TEEDMANTCL KSNGELVVRW LLNPANQEAR K S

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL30m

+
分子 #6: 'Mitochondrial ribosomal protein L55

分子名称: 'Mitochondrial ribosomal protein L55 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 6 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sus scrofa (ブタ)
分子量理論値: 15.156537 KDa
配列文字列:
MAAKGSLLRL LWQRVVTGAA PESCRHLYTS SWRADCNRAL LTRLHRQTYA RLYPVLLVKQ DGSTIHIRYR EPRRMLTMPV DLDSLSPEE RRARFRKREA KFKEKKEEPE LSDDFDVEQY KRFWTKK

UniProtKB: Mitochondrial ribosomal protein L55

+
分子 #7: Mitochondrial ribosomal protein L32

分子名称: Mitochondrial ribosomal protein L32 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 7 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sus scrofa (ブタ) / 器官: liver
分子量理論値: 21.53793 KDa
配列文字列:
MASAMLVLVV PPWPAARGLL RNWWEQLQRK LQHNRLGLPL HPWGPALAVQ GPAICTEPAN DTNGSKAISS LLDSVFWMAA PKNRRSIEV NRCRRRNPQK LIKVKNNIDV CPECGHLKQK HILCGYCYEK VRKETAEIRR QMGKQEGGPF RAPTTETVVL Y SGETPSEQ DQGKRIIERE RKRPSWFTQN

+
分子 #8: Mitochondrial ribosomal protein L33

分子名称: Mitochondrial ribosomal protein L33 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 8 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sus scrofa (ブタ) / 器官: liver
分子量理論値: 7.508097 KDa
配列文字列:
MFLSAVTFAK SKSKTILVKM MSQAGTGFSF NTKRSRLREK LTLLHYDPVV KKKVLFVEQK KIRSL

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein bL33m

+
分子 #9: Mitochondrial ribosomal protein L34

分子名称: Mitochondrial ribosomal protein L34 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 9 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sus scrofa (ブタ) / 器官: liver
分子量理論値: 10.871729 KDa
配列文字列:
MAFLARSVGR LLDPVSRSAA LVGGRWLQPQ AWLGFPDTWG LPAMQQTRGK ARGNEYQPSN IKRKHKHGWV RRLRTPTGVQ VILRRMHKG RKSLSH

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein bL34m

+
分子 #10: Mitochondrial ribosomal protein L35

分子名称: Mitochondrial ribosomal protein L35 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 10 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sus scrofa (ブタ)
分子量理論値: 21.548543 KDa
配列文字列:
MAASAFAGAV RAATGILRPL HILASSAYQN CAKNACLSSV LSSRHFSHIQ TSALLSAPRL ITSVRNLMCG PTAPVLNRVA PLLPHVLKP PVRTVTYFSS RKGKRKTVKA VIYRFLRLHS GLWLRRKAGY KKKLWKKTAA RKRRLREFVF CNKTQSKLLD K MTTSFWKR RNWYADDPYQ KYQDRTNLKV

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein bL35m

+
分子 #11: Ribosomal protein

分子名称: Ribosomal protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 11 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sus scrofa (ブタ) / 器官: liver
分子量理論値: 10.841016 KDa
配列文字列:
MATAFLRTVL SAVGPLLHLG GRPLSTFAAG PPRAALAVGA QPSPAAALLS ARPLLGPQPA LGFKTKGVLK KRCRDCYLVK RRGRWFIYC KTNPKHKQRQ M

UniProtKB: Ribosomal protein

+
分子 #14: Translation initiation factor IF-2, mitochondrial

分子名称: Translation initiation factor IF-2, mitochondrial / タイプ: protein_or_peptide / ID: 14
詳細: Unassigned residues have been built as poly-alanine.
コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 72.811219 KDa
組換発現生物種: Escherichia coli (大腸菌)
配列文字列: SGGSGSGWKS QLSSTKSKKV VEVWIGMTIE ELARAMEKNT DYVYEALLNT DIDIDSLEAD SHLDEVWIKE VITKAGMKLK WSKLKQDKV RKNKDAVRRP QADPALLTPR SPVVTIMGHV DHGKTTLLDK FRKTQVAAVE TGGITQHIGA FLVSLPSGEK I TFLDTPGH ...文字列:
SGGSGSGWKS QLSSTKSKKV VEVWIGMTIE ELARAMEKNT DYVYEALLNT DIDIDSLEAD SHLDEVWIKE VITKAGMKLK WSKLKQDKV RKNKDAVRRP QADPALLTPR SPVVTIMGHV DHGKTTLLDK FRKTQVAAVE TGGITQHIGA FLVSLPSGEK I TFLDTPGH AAFSAMRARG AQVTDIVVLV VAADDGVMKQ TVESIQHAKD AQVPIILAVN KCDKAEADPE KVKKELLAYD VV CEDYGGD VQAVPVSALT GDNLMALAEA TVALAEMLEL KADPNGPVEG TVIESFTDKG RGLVTTAIIQ RGTLRKGSVL VAG KCWAKV RLMFDENGKT IDEAYPSMPV GITGWRDLPS AGEEILEVES EPRAREVVDW RKYEQEQEKG QEDLKIIEEK RKEH KEAHQ KAREKYGHLL WKKRSILRFL ERKEQIPLKP KEKRERDSNV LSVIIKGDVD GSVEAILNII DTYDASHECE LELVH FGVG DVSANDVNLA ETFDGVIYGF NVNAGNVIQQ SAAKKGVKIK LHKIIYRLVE DLQEELSSRL PCAVEEHPVG EASILA TFS VTEGKKKVPV AGCRVQKGQL EKQKKFKLTR NGHVIWKGSL TSLKHHKDDI SIVKTGMDCG LSLDEDNMEF QVGDRIV CY EEKQIQAKTS WDPGF

UniProtKB: Translation initiation factor IF-2, mitochondrial

+
分子 #15: Mitochondrial ribosomal protein L2

分子名称: Mitochondrial ribosomal protein L2 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 15 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sus scrofa (ブタ)
分子量理論値: 33.270934 KDa
配列文字列: MALRVLTRAL SSLSLTPRIA VAPGLNLLPA VQVTNNVLLT LPSGLMSLPC RPILTSVALS ATSVSWKSRT KYTVMPVKMR KSGGRNHTG QIQVHGIGGG HKQRYRMIDF LRFRPEHESK PGPFEEKVIA VRYDPCRSAD IALVAGGNRK RWIIATENMK A GDTVLNSD ...文字列:
MALRVLTRAL SSLSLTPRIA VAPGLNLLPA VQVTNNVLLT LPSGLMSLPC RPILTSVALS ATSVSWKSRT KYTVMPVKMR KSGGRNHTG QIQVHGIGGG HKQRYRMIDF LRFRPEHESK PGPFEEKVIA VRYDPCRSAD IALVAGGNRK RWIIATENMK A GDTVLNSD HIGRMAVAAR EGDAHPLGAL PVGTLINNVE SEPGRGAQYI RAAGTCGVLL RKVNGTAIIQ LPSKRQMQVL ET CIATVGR VSNVDHNKRV IGKAGRNRWL GKRPNSGLWQ RKGGWAGRKI RPLPPMKSYV KLPSAAAQS

UniProtKB: Mitochondrial ribosomal protein L2

+
分子 #16: ICT1

分子名称: ICT1 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 16 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sus scrofa (ブタ)
分子量理論値: 38.427199 KDa
配列文字列: MPGWGLLGRA GARVLGCGAD GLGASRGLGN RTDICLLVRS LHGKSVTWWD EHLSEENVPF VKQLVSDENK AQLASKLCPL KDEPWPIHP WEPGSSRVGL IALKLGMMPL WTKDGQKHVV TLLQVQDCHV LKYTPKENHN GRMAALTVGG KTVSHFHKSA S ILEFYQEL ...文字列:
MPGWGLLGRA GARVLGCGAD GLGASRGLGN RTDICLLVRS LHGKSVTWWD EHLSEENVPF VKQLVSDENK AQLASKLCPL KDEPWPIHP WEPGSSRVGL IALKLGMMPL WTKDGQKHVV TLLQVQDCHV LKYTPKENHN GRMAALTVGG KTVSHFHKSA S ILEFYQEL GLPPKQKVKI FNVTENAVIK PGTPLYAAHF RPGQYVDVTA KTIGKGFQGV MRRWGFKGQP ATHGQTKTHR RP GAISTGD VARVWPGTKM PGQLGNIDRT AFGLKVWRIN TKHNIIYVNG SVPGHKNCLV KIKDSKLPAY KDFCKNLPFP TYF PDGDEE ALPEDLYDEN VCQPGAPSIT FT

+
分子 #17: Mitochondrial ribosomal protein L4

分子名称: Mitochondrial ribosomal protein L4 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 17 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sus scrofa (ブタ)
分子量理論値: 33.251469 KDa
配列文字列: MLQLVRAGAR TWFRPSGCRG LNTLAEEAVQ QAEKPESVAS LGLQPPVLRK CELPVPAHRR PVQAWIESLR GYEQERVGLT ELHPDVFST APRLDILHQV AIWQKNFKRI SYAKTKTRAE VRGGGRKPWV QKGSGRARHG SIRSPIWRGG GVAHGPRGPT S YYYMLPMK ...文字列:
MLQLVRAGAR TWFRPSGCRG LNTLAEEAVQ QAEKPESVAS LGLQPPVLRK CELPVPAHRR PVQAWIESLR GYEQERVGLT ELHPDVFST APRLDILHQV AIWQKNFKRI SYAKTKTRAE VRGGGRKPWV QKGSGRARHG SIRSPIWRGG GVAHGPRGPT S YYYMLPMK VRVQGLKVAL TVKLAQDDLH IVDSLELPTA DPQYLIELAR YRRWGDSVLL VDLEHEDMPQ NVVAATSGLK TF NLVPAVG LNVHSMLKHQ TLVLTLPTVA FLEEKLLWHN SRYTPLYPFR LPYCDFP

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL4m

+
分子 #18: Mitochondrial ribosomal protein L9

分子名称: Mitochondrial ribosomal protein L9 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 18 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sus scrofa (ブタ) / 器官: liver
分子量理論値: 30.373449 KDa
配列文字列: MAAAACTAAG GGLLRAGLER LLRGGVRALL RPRLEGVTPR SERAFSLSLS RSTVIVERWW KVPLAGEGRK PRLHRRHRVY KLVEDTKHR PKDNLELVLT QSVEELGVRG DLVSVKKSVG RNRLLPQGLA VYASPENKKL FEEEKLLRQE GKLEKLQTKA G EATVKFLR ...文字列:
MAAAACTAAG GGLLRAGLER LLRGGVRALL RPRLEGVTPR SERAFSLSLS RSTVIVERWW KVPLAGEGRK PRLHRRHRVY KLVEDTKHR PKDNLELVLT QSVEELGVRG DLVSVKKSVG RNRLLPQGLA VYASPENKKL FEEEKLLRQE GKLEKLQTKA G EATVKFLR RCHLEVGMKN NVKWELNPEI VARHFLRNLG VVVAPHALKL PEEPITQRGE YWCEVTVNGL DTVRVPMSVV NF ERPKTKR YKYWLAQQAA KGDVPTSSQM I

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein bL9m

+
分子 #19: Mitochondrial ribosomal protein L10

分子名称: Mitochondrial ribosomal protein L10 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 19 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sus scrofa (ブタ)
分子量理論値: 29.449689 KDa
配列文字列: MAAVVAGMLR GGLLPQAGRL PTFQTVRYGS KAVTRHRRVM HFERQKLMAV TEYIPPKPTI NPRCLPPPPT PPQEETGLVR LLRREIAAV FRDNRMIAVC QHVALSAEDK LLLRHQLRKH KILMKIFPNQ VLKPFLEESK YQNLLPLFVG HNLLLVSEEP K VKEMVRIL ...文字列:
MAAVVAGMLR GGLLPQAGRL PTFQTVRYGS KAVTRHRRVM HFERQKLMAV TEYIPPKPTI NPRCLPPPPT PPQEETGLVR LLRREIAAV FRDNRMIAVC QHVALSAEDK LLLRHQLRKH KILMKIFPNQ VLKPFLEESK YQNLLPLFVG HNLLLVSEEP K VKEMVRIL KGIPFLPLLG GCIDDTILSR QGFINYSKLP SLALVQGELV GGLTFLTAQT YSMLQHQPRQ LTALLDQYVK QQ QEGHPAV PASGQPEPPD PVPDP

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL10m

+
分子 #20: Mitochondrial ribosomal protein L11

分子名称: Mitochondrial ribosomal protein L11 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 20
詳細: Unassigned residues have been built as poly-alanine.
コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sus scrofa (ブタ)
分子量理論値: 20.809271 KDa
配列文字列: MSKLSRATRA LKKPEASGMI RAIVRAGQAR PGPPLGPILG QRGVSINQFC KEFNEKTKDI KEGIPLPTKI FVKPDRTFEI KIGQPTVSY FLKAAAGIEK GARHTGKEVA GLVTLKHVYE IARVKAQDDA FALQDVPLSS VVRSIIGSAR SLGIRVVKDL S SEELAAFQ ...文字列:
MSKLSRATRA LKKPEASGMI RAIVRAGQAR PGPPLGPILG QRGVSINQFC KEFNEKTKDI KEGIPLPTKI FVKPDRTFEI KIGQPTVSY FLKAAAGIEK GARHTGKEVA GLVTLKHVYE IARVKAQDDA FALQDVPLSS VVRSIIGSAR SLGIRVVKDL S SEELAAFQ KERALFLAAQ READLAAQAE AAKK

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL11m

+
分子 #21: Mitochondrial ribosomal protein L13

分子名称: Mitochondrial ribosomal protein L13 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 21 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sus scrofa (ブタ)
分子量理論値: 20.633801 KDa
配列文字列:
MSSFSKAPQQ WATFARVWYL LDGKMQPPGK LAAMASVKLQ GLHKPVYHQL SDCGDHVVIM NTRHIAFSGN KWEQKVYSSH TGYPGGFRQ VTAAQLHQKD PVAIVKLAIY GMLPKNLHRR TMMQRLHLFP DEDIPEDILK NLVEELPQPR KVPRRLDEYT Q EEIEAFPR VWSPPEDYRL

+
分子 #22: Mitochondrial ribosomal protein L14

分子名称: Mitochondrial ribosomal protein L14 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 22 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sus scrofa (ブタ) / 器官: liver
分子量理論値: 15.955632 KDa
配列文字列:
MAFCTGLRGP FAQVSRALSQ RCFSTTGSLS AIQKMTRVRV VDNSALGTTP YHRPPRCIHV YNKTGVGKVG DRILLAIRGQ KKKALIVGH RMPGPRMTPR FDSNNVVLLE DNGNPVGTRI KTPIPSSLRQ REGEFSKVLA IAQNFV

+
分子 #23: Mitochondrial ribosomal protein L15

分子名称: Mitochondrial ribosomal protein L15 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 23 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sus scrofa (ブタ)
分子量理論値: 33.481723 KDa
配列文字列: MGGPVQGGGP RALDLLRALP RVSLANLKPN PGSRKPERRP RGRRRGRKCG RGHKGERQRG TRPRLGFEGG QTPFYLRIPK YGFNEGHSF RHQYQPLSLN RLQYLIDLGR VDPTQPIDLT QLVNGRGVTI QPSKRDYGVQ LVEEGADTFK AKVNIEVQMA S ELAIAAIE ...文字列:
MGGPVQGGGP RALDLLRALP RVSLANLKPN PGSRKPERRP RGRRRGRKCG RGHKGERQRG TRPRLGFEGG QTPFYLRIPK YGFNEGHSF RHQYQPLSLN RLQYLIDLGR VDPTQPIDLT QLVNGRGVTI QPSKRDYGVQ LVEEGADTFK AKVNIEVQMA S ELAIAAIE KNGGVVTTAF YDPRSLEILC KPVPFFLRGQ PIPKRMLPPE ALVPYYTDAK NRGYLADPAR FPEARLELAR KY GYVLPDI TKDELFKMLS TRKDPRQIFF GLAPGWVVNM ADKKILKPTD ENLLKYYSS

UniProtKB: 39S ribosomal protein L15, mitochondrial

+
分子 #24: Mitochondrial ribosomal protein L16

分子名称: Mitochondrial ribosomal protein L16 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 24 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sus scrofa (ブタ)
分子量理論値: 28.680531 KDa
配列文字列: MWRLLARACA PLLRAPLSDS WAAPSATAGF KTLLPVPTFE DVAIPEKPKL RFVERVPLVP KVRRERKNLS DIRGPSTEAT EFTEGRFAI LALGGGYLHW GHFEMMRLTI NRSMDPKNMF ALWRVPAPFK PITRKGMGQR MGGGKGAIDH YVTPVKAGRL I VEMGGRCE ...文字列:
MWRLLARACA PLLRAPLSDS WAAPSATAGF KTLLPVPTFE DVAIPEKPKL RFVERVPLVP KVRRERKNLS DIRGPSTEAT EFTEGRFAI LALGGGYLHW GHFEMMRLTI NRSMDPKNMF ALWRVPAPFK PITRKGMGQR MGGGKGAIDH YVTPVKAGRL I VEMGGRCE FKEVQGFLDL VAHKLPFPAK AVSRETLEKM RKDQEERERN NQNPWTFERI ATANMLGIRK VLSPYDLTHK GR YWGKFYT PERV

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL16m

+
分子 #25: Mitochondrial ribosomal protein L17

分子名称: Mitochondrial ribosomal protein L17 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 25 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sus scrofa (ブタ)
分子量理論値: 19.268178 KDa
配列文字列:
MRLSVAAAIS HGRVFRRLGL GPESRIHLLQ NLLTGLVRHE RIEASWARVD ELRGYAEKLI DYGKLGDTNE RAMRMADFWL TEKDLIPKL FQVLAPRFQG QNGGYTRMLQ IPNRNEQDRA KMAVIEYKGN CLPPLPLPRR DSNLTLLNQL LQGLRQDQEA S SHTAQTPA V

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein bL17m

+
分子 #26: Mitochondrial ribosomal protein L18

分子名称: Mitochondrial ribosomal protein L18 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 26 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sus scrofa (ブタ)
分子量理論値: 20.582568 KDa
配列文字列:
MALRSRFWAL LSICRNPGCR AAALSTSCKP ATNPETDPVE NEAVAPEFTN RNPRNLELLA VARKERGWGT VWPSREFWHR LRVIRTQHH IEALVEHRNG QVVVSASTRE WAIKKHLYST RNVVACESVG RVLAERCLEA GINFMVYHPT PWEAASDSIK R LQHAMTEG GVVLREPRRI YE

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL18m

+
分子 #27: Mitochondrial ribosomal protein L19

分子名称: Mitochondrial ribosomal protein L19 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 27 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sus scrofa (ブタ) / 器官: liver
分子量理論値: 33.441539 KDa
配列文字列: MAASITRGSW AAVGLGQSFP PTRALLPAPA SVICRTLAGS GRQQVTGSSE PGAFQPPPKP VIVDKRRPQR PETRFLSPEF IPPRGRTNP LKFQIERKDM LERRKILHIP EFYVGSILRV TTADPYASAK TSQFLGICIQ RSGSGLGATF ILRNTIEGQG V EICFELYN ...文字列:
MAASITRGSW AAVGLGQSFP PTRALLPAPA SVICRTLAGS GRQQVTGSSE PGAFQPPPKP VIVDKRRPQR PETRFLSPEF IPPRGRTNP LKFQIERKDM LERRKILHIP EFYVGSILRV TTADPYASAK TSQFLGICIQ RSGSGLGATF ILRNTIEGQG V EICFELYN PRIQEIQVVK LEKRLDNSLL YLRDALPEYS TFDVNMKPIT QEFNQEVPVN QLKVKMKPKP WSKRWERPKF NI KGIRFDL CLTEEQMREA QKWSQPWLEF DMMREYDTSK IEAAIWDEIE ASKNS

+
分子 #28: Mitochondrial ribosomal protein L20

分子名称: Mitochondrial ribosomal protein L20 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 28 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sus scrofa (ブタ) / 器官: liver
分子量理論値: 17.554793 KDa
配列文字列:
MVFLTVPLWL RSRVTDRYWR VQEVLKHARH FRGRKNRCYR LAVRAVTRAF VKCTRARRLK KRSLRTLWIN RITAASQEHG LKYPAFIIN LIKCQVELNR KVLADLAIYE PKTFKSLAAL AKRRREEGFA AALGDGKEPD GIFSRVVQHR

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein bL20m

+
分子 #29: Mitochondrial ribosomal protein L21

分子名称: Mitochondrial ribosomal protein L21 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 29 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sus scrofa (ブタ) / 器官: liver
分子量理論値: 23.154861 KDa
配列文字列: MAAAVAASVL QGTFGRLVSA YSRSVLRTSR PGTAPPWSAP RRLSSQHTSS LRGCVPKTSL GSPPWPDIVL PDPVEETRHH AEVVGQVNE LIAAGRYGRL FAVVHFAGHQ WKVTAEDLIL IENELDVACG ERIRLEKVLL VGADNFTLLG KPLLGKELVR V EATVIEKT ...文字列:
MAAAVAASVL QGTFGRLVSA YSRSVLRTSR PGTAPPWSAP RRLSSQHTSS LRGCVPKTSL GSPPWPDIVL PDPVEETRHH AEVVGQVNE LIAAGRYGRL FAVVHFAGHQ WKVTAEDLIL IENELDVACG ERIRLEKVLL VGADNFTLLG KPLLGKELVR V EATVIEKT ESWPKINMKF QKRKNYQRKR ITVNPQTVLR INSIEIAPCL C

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein bL21m

+
分子 #30: Mitochondrial ribosomal protein L22

分子名称: Mitochondrial ribosomal protein L22 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 30 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sus scrofa (ブタ) / 器官: liver
分子量理論値: 24.313357 KDa
配列文字列: MAAAVLERLG GLWMQNLRGK LALRLLSSHS ILPQSHIHTS ASVEISRKWE KKNKIVYPPQ LPGEPRRPAE IYHCRRQIKY SKDKMWYLA KLIRGMSIDQ ALAQLEFSDK KGAQIIKEVL LEAQDMAVRD HNVEFRSNLY VAESTSGRGQ YLKRIRYHGR G RFGIMEKV ...文字列:
MAAAVLERLG GLWMQNLRGK LALRLLSSHS ILPQSHIHTS ASVEISRKWE KKNKIVYPPQ LPGEPRRPAE IYHCRRQIKY SKDKMWYLA KLIRGMSIDQ ALAQLEFSDK KGAQIIKEVL LEAQDMAVRD HNVEFRSNLY VAESTSGRGQ YLKRIRYHGR G RFGIMEKV FCHYFVKLVE GPPPPREAPK TAVAHAREYI QELRNRTITH AL

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL22m

+
分子 #31: Mitochondrial ribosomal protein L23

分子名称: Mitochondrial ribosomal protein L23 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 31
詳細: Unassigned residues have been built as poly-alanine.
コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sus scrofa (ブタ)
分子量理論値: 17.643205 KDa
配列文字列:
MARNVLYPLY QLGNPQLRVF RTNFFIQLVR PGTAQPEDTV QFRIPMEMTR VDLRNYLERI YNVPVAAVRT RVQYGSNRRR DHRNIRIKK PDYKVAYVQL ALGQTFTFPD LFPERKGASV DVDVRDQVLE DQRQKHSPDP RRGGVPGWFG L

UniProtKB: 39S ribosomal protein L23, mitochondrial

+
分子 #32: Mitochondrial ribosomal protein L24

分子名称: Mitochondrial ribosomal protein L24 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 32 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sus scrofa (ブタ)
分子量理論値: 24.893529 KDa
配列文字列: MRLSALLALA SKVTLPPNYR YGMSRPGSLS DKRKNPPGTR RRRVPVEPIS DEDWHLFCGD KVEILEGKDA GKQGKVVQVI RQRNWVVVE GLNTHYRYVG KTVDYRGTMI PSEAPLLHNQ VKLVDPTDRK PTDVEWRFTE AGERVRVSTR SGRIIPKPEF P RADGIVPE ...文字列:
MRLSALLALA SKVTLPPNYR YGMSRPGSLS DKRKNPPGTR RRRVPVEPIS DEDWHLFCGD KVEILEGKDA GKQGKVVQVI RQRNWVVVE GLNTHYRYVG KTVDYRGTMI PSEAPLLHNQ VKLVDPTDRK PTDVEWRFTE AGERVRVSTR SGRIIPKPEF P RADGIVPE TWIDGPKDTS VEDALEKTYV PRLKTLEEEV MEAMGIQETR RHKKVYWY

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL24m

+
分子 #33: Mitochondrial ribosomal protein L37

分子名称: Mitochondrial ribosomal protein L37 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 33 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sus scrofa (ブタ)
分子量理論値: 47.917988 KDa
配列文字列: MALASGPARR ALARLGRLGL GGCGAPRRGA YEWGVRSTRK PEPPPLDRVY EIPGLEPITY AGKMHFMPGL ARPVFPPWDP GWTHPKFRR LPPLHEHPLY KDQACYVFHQ RCRLLEGVKQ ALWLTKTQLI EGLPEKVLRL ADDPRNHIEN QDERVLNAIS H ARLWHSTE ...文字列:
MALASGPARR ALARLGRLGL GGCGAPRRGA YEWGVRSTRK PEPPPLDRVY EIPGLEPITY AGKMHFMPGL ARPVFPPWDP GWTHPKFRR LPPLHEHPLY KDQACYVFHQ RCRLLEGVKQ ALWLTKTQLI EGLPEKVLRL ADDPRNHIEN QDERVLNAIS H ARLWHSTE DIPKRETYCP VIVDSLIQLC KSQILKHPSL ARRICAQNNT LSATWNRESI LLQVHGSSGA RLNAKDPLPP VA SQEEVEA TKNHVLETFY PISPTMGLQE CNVYDVNDDT GFQEGYPYPC PHTLYFLESA NLRPRRFQPD QLRAKMILFA FGS ALAQAR LLYGNDSKVL EQPVVVQSVG TDGRLFQFLV LQLNTTDLAS DEGVKNLAWV DSDQLLYQHF WCLPVIKKKV VVEP VGPIG FQPETFRKFL ALYLHGAV

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein mL37

+
分子 #34: Mitochondrial ribosomal protein L38

分子名称: Mitochondrial ribosomal protein L38 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 34 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sus scrofa (ブタ) / 器官: liver
分子量理論値: 44.656387 KDa
配列文字列: MAAPWWRAAL CASRRWRGFS TSAALSRRAA PLGPMPNEDI DVSDLERLKK YRSFDRYRRR AEQEARKPHW WRTYREHFGE ESGPKDRVD IGLPPPKVSR TQQLLERKQA LRELRANVEE ERAARLQTAR IPLEAVRAEW ERTCGPYHKQ RLAEYCGLYR D LFHGATFV ...文字列:
MAAPWWRAAL CASRRWRGFS TSAALSRRAA PLGPMPNEDI DVSDLERLKK YRSFDRYRRR AEQEARKPHW WRTYREHFGE ESGPKDRVD IGLPPPKVSR TQQLLERKQA LRELRANVEE ERAARLQTAR IPLEAVRAEW ERTCGPYHKQ RLAEYCGLYR D LFHGATFV PRVPLHVAYA VGEDDLMPVY HGNEVTPTEA AQAPEVTYEA DEGSLWTLLL TNLDGHLLEP DAEYVHWLVT NI PGNRVTE GQETCPYLPP FPARGSGFHR FAFLLFKQDK RIDFSGDTRP SPCYQLAQRT FHTFDFYKKH QDAMTPAGLA FFQ CRWDDS VTRVFHQLLD MREPVFEFVR PPPYHPKQKR FPHRQPLRYL DRYRDSHEPT YGIY

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein mL38

+
分子 #35: Mitochondrial ribosomal protein L39

分子名称: Mitochondrial ribosomal protein L39 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 35 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sus scrofa (ブタ)
分子量理論値: 38.523422 KDa
配列文字列: MAMGAWGLRL WRAVPRGEAG WRLIATSPAS QLSPTELIEM QNDLFNKEKN RQLSLTPRTE KIEVKHVGKT DPGTVFVMNK NISTPYSCA MHLSEWYCRK SILALVDGQP WDMYKPLTKS CEIKFLTFKD DDPGEVNKAY WRSCAMMMGC VIERAFKDEY V VSLVRAPE ...文字列:
MAMGAWGLRL WRAVPRGEAG WRLIATSPAS QLSPTELIEM QNDLFNKEKN RQLSLTPRTE KIEVKHVGKT DPGTVFVMNK NISTPYSCA MHLSEWYCRK SILALVDGQP WDMYKPLTKS CEIKFLTFKD DDPGEVNKAY WRSCAMMMGC VIERAFKDEY V VSLVRAPE VPVIAGAFCY DVVLDKRLDE WMPTKENLHS FTKDARALIY KDLPFETLEV EAKVALEIFQ HNKYKLDFIE EK ASQNPER IVKLHRFGDF IDVSEGPLIP RTSICFQYEV SAVHNLQTQS SLVRRFQGLS LPVHLRAHFT IWNKLLERSR KMV TEDKTK PTEESAST

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein mL39

+
分子 #36: Mitochondrial ribosomal protein L40

分子名称: Mitochondrial ribosomal protein L40 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 36 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sus scrofa (ブタ)
分子量理論値: 24.075658 KDa
配列文字列: MAAAALGAAS RTLRPASRLV GAWPTQTRDA HERGSLFSFW GLVPMRAEPL RKKKKVDPKK DQAAKDRLKK RIRRLEKASQ ELIPIEDFI TPVKFLNKER QRPPVELPFE ESERRALLLK RWSLYKQREH EMERSAIRSL LEAQEEALQE LRLSSPELHA E ATKRDPSL ...文字列:
MAAAALGAAS RTLRPASRLV GAWPTQTRDA HERGSLFSFW GLVPMRAEPL RKKKKVDPKK DQAAKDRLKK RIRRLEKASQ ELIPIEDFI TPVKFLNKER QRPPVELPFE ESERRALLLK RWSLYKQREH EMERSAIRSL LEAQEEALQE LRLSSPELHA E ATKRDPSL FPFERQGPDY TPPISDYQPP EGRYQDITKV YTQVEFKK

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein mL40

+
分子 #37: Mitochondrial ribosomal protein L41

分子名称: Mitochondrial ribosomal protein L41 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 37 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sus scrofa (ブタ)
分子量理論値: 15.073404 KDa
配列文字列:
MGLLSGAARA LVRGADRMSK WTSKRGPRTF CKGRGAKGTG FHGRDGKFVQ IKEMIPELVV PELAGFKLKP YVNYRAPEGT DTPLTAKQL FLETAAPAIE KDFKAGTFDP EHLEKYGFEP TQEGKLFQLY PKNFPR

UniProtKB: Mitochondrial ribosomal protein L41

+
分子 #38: Mitochondrial ribosomal protein L42

分子名称: Mitochondrial ribosomal protein L42 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 38
詳細: Unassigned residues have been built as poly-alanine.
コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sus scrofa (ブタ) / 器官: liver
分子量理論値: 16.680178 KDa
配列文字列:
MALAAVKWVI SSRTILKHLF PIQNSASYCV CHKSTYSSLP DDYNCKVELA LTSDGRTIVC YHPSVDIPYE HTKPIPRPDP VHNIEETHD LVLKTRLEEK GEHLEQGPMI EQLSKMFFTT KHRWYPRGQY HRRRRKPNPP KDR

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein mL42

+
分子 #39: Mitochondrial ribosomal protein L43

分子名称: Mitochondrial ribosomal protein L43 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 39 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sus scrofa (ブタ)
分子量理論値: 17.728109 KDa
配列文字列:
MTARGTASRF LTSVLHNGLG RYVQQLQRLS FSLSRDAPSS RGAREFVERE VTDFARRNPG VVIYVNPRPC CVPRVVAEYL NGAVREESI HCKSVEEIAA LVQKLADQSG LDVIRIRKPF HTDSPSIQGQ WHPFTNKPTT LGGLRPREVQ DPAPAQVQAQ

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein mL43

+
分子 #40: Mitochondrial ribosomal protein L44

分子名称: Mitochondrial ribosomal protein L44 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 40 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sus scrofa (ブタ) / 器官: liver
分子量理論値: 37.527195 KDa
配列文字列: MASGLVRLLQ WGPRRLLAPA APTLAPPVRG AKKGFRAAYR FQKELERWRL LRCPPPPVRR SEKPNWDYHA EIQAFGHRLQ ETFSLDLLK TAFVNSCYIK SEEAKRQKLG IDKEAALLNL KDNQELSEQG ISFSQTCLTQ FFEDAFPDLP TEGVTSLVDF L TSEEVVCH ...文字列:
MASGLVRLLQ WGPRRLLAPA APTLAPPVRG AKKGFRAAYR FQKELERWRL LRCPPPPVRR SEKPNWDYHA EIQAFGHRLQ ETFSLDLLK TAFVNSCYIK SEEAKRQKLG IDKEAALLNL KDNQELSEQG ISFSQTCLTQ FFEDAFPDLP TEGVTSLVDF L TSEEVVCH VARNLAVEQL ALSAEFPVPP PVLRQTFFAV IGALLQSSGP ERTALFIRDF LITQMTGKEL FEMWTITNPM GL LVEELKK RKISAPESRL TRQSGSTTAL PVYFVGLYCD RKLIAEGPGE TVLVAEEEAA RVALRKLFGF TENRRPWDYS KPK EHVRAE KTITAS

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein mL44

+
分子 #41: Mitochondrial ribosomal protein L45

分子名称: Mitochondrial ribosomal protein L45 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 41 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sus scrofa (ブタ)
分子量理論値: 35.331805 KDa
配列文字列: MAAPVTRGLS CLPRVLGWWS RQPVLVTQST AVVPVRTKKR FTPPTYQPKY KSEKEFVEHA RKAGLVIPHE RLERPIHLAC TAGIFDAYV PPEGDARISS LSKEGLAQRA ERLKKNVASQ LSIRKIRESD PNFKIKDFPE KAKDIFIEAH LCLNNSDHDR L HTLVTENC ...文字列:
MAAPVTRGLS CLPRVLGWWS RQPVLVTQST AVVPVRTKKR FTPPTYQPKY KSEKEFVEHA RKAGLVIPHE RLERPIHLAC TAGIFDAYV PPEGDARISS LSKEGLAQRA ERLKKNVASQ LSIRKIRESD PNFKIKDFPE KAKDIFIEAH LCLNNSDHDR L HTLVTENC FPDMVWDIRY KTVRWSFVES LEPPQVVQVR CSSLMNQGNI YGQVTVRMHT RQTLAIYDRF GRLMYGQEDV PR DVLEYVV FEKHLVDPYG SWRMHGKIIP PWAPPKQPIL KTVMIPGPQL KPWEEFEEPQ GEVHKPQPA

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein mL45

+
分子 #42: Mitochondrial ribosomal protein L46

分子名称: Mitochondrial ribosomal protein L46 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 42 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sus scrofa (ブタ)
分子量理論値: 32.215998 KDa
配列文字列: MAAPVRRTML RVVRGWRRFE GPWAHSLGSR NLALAVAPSS SSSPWRLLGA LCLQRPPLVT KPLTPLQEEM ADLLQQIEIE RSLYSDHEL RALDEAQQLA KKKSDLYEEE DEQNILLAQD LEDMWEQKFL HFKLGARLTE ADKKDDRTSL HRKLDRNLIL L VREKLGDQ ...文字列:
MAAPVRRTML RVVRGWRRFE GPWAHSLGSR NLALAVAPSS SSSPWRLLGA LCLQRPPLVT KPLTPLQEEM ADLLQQIEIE RSLYSDHEL RALDEAQQLA KKKSDLYEEE DEQNILLAQD LEDMWEQKFL HFKLGARLTE ADKKDDRTSL HRKLDRNLIL L VREKLGDQ DIWMLPQSDW QPGETLRQTA ERTLATLSEN NMEAKFLGNA PCGHYKFKFP QAMRTETSLG AKVFFFKALL LT GDFSQAG KKGHHVWVSK EELGDYLKPK YLAQVRRFLL DL

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein mL46

+
分子 #43: Mitochondrial ribosomal protein L48

分子名称: Mitochondrial ribosomal protein L48 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 43 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sus scrofa (ブタ) / 器官: liver
分子量理論値: 23.749512 KDa
配列文字列: MNGALGKALC LRNDTVLKQA LSLIRVRASG ESPICSAGGI LLSTSRHYRS KPTHGIGRYK HLVKAQEPKK KKGKVEVRPI NLGTDYEYG VLNIHLIAYD MALAESYAQY VHNLCNHLAI KVEESYAMPT KTMEVLQLQE QGSKMFLDAV LTTHERVVQI S GLSATFAE ...文字列:
MNGALGKALC LRNDTVLKQA LSLIRVRASG ESPICSAGGI LLSTSRHYRS KPTHGIGRYK HLVKAQEPKK KKGKVEVRPI NLGTDYEYG VLNIHLIAYD MALAESYAQY VHNLCNHLAI KVEESYAMPT KTMEVLQLQE QGSKMFLDAV LTTHERVVQI S GLSATFAE IFLEIIHSNL PEGVKLSVRE HTEEDFKGRF KARPELEELL AKLN

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein mL48

+
分子 #44: Mrpl34

分子名称: Mrpl34 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 44 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sus scrofa (ブタ)
分子量理論値: 18.957779 KDa
配列文字列:
MAATVLCGVL RAWRTGVPLG CGLRRLSQTQ GTPEYPSFVE SVDEYHFVER LLPPASIPRP PKHEHYPTPS GWQPPRDPAP SLPYFVRRS RMHNIPVYRD ITHGNRQMTV IRKVEGDIWA LQKDVEDFLS PLLGKTPVTQ VNEVTGTLRV KGYFDQQLKA W LLEKGF

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein mL49

+
分子 #45: Mitochondrial ribosomal protein L50

分子名称: Mitochondrial ribosomal protein L50 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 45 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sus scrofa (ブタ) / 器官: liver
分子量理論値: 18.351 KDa
配列文字列:
MAARWVSGLA RRSLTCAVSG APRREFWSPF RKEKQPVVAE TVEEVKKEPI LVCPPIQSRT YIPPEDLQSR LESHVKEVFG SSVPSNWQD ISLEDVHLKF SFLARLANDL RHAVPNSRLH QMCRVRDVLD FYNVPVQDRS KFDELIASNL PHNLKITWGY

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein mL50

+
分子 #46: Mitochondrial ribosomal protein L51

分子名称: Mitochondrial ribosomal protein L51 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 46 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sus scrofa (ブタ) / 器官: liver
分子量理論値: 15.249048 KDa
配列文字列:
MAGSLSWVTG RGLWGRLPLT CRSFSLGIPR LFHVRVTLPP RKVVDRWNEK RAMFGVYDNI GILGNFEKHP KELIKGPIWL RGWKGNELQ RCIRKKRMVG NRMFIDDLHN LNKRISYLYK HFNRHGKYR

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein mL51

+
分子 #47: Mitochondrial ribosomal protein L52

分子名称: Mitochondrial ribosomal protein L52 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 47 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sus scrofa (ブタ)
分子量理論値: 13.813705 KDa
配列文字列:
MAAWGILLST GVRRLHCGTA AQAGSQWRLQ QGFAANPSGY GPLTELPDWS YADGRPAPPM KGQLRRKAQR EKFARRVVLL SQEMDAGLQ AWQLRQQEKL QEEEGKQKNA LKSKGALLQN PQPSQ

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein mL52

+
分子 #48: mL53, MRPL53

分子名称: mL53, MRPL53 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 48 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sus scrofa (ブタ) / 器官: liver
分子量理論値: 12.015747 KDa
配列文字列:
MAAALARLGL RAVKQVRVQF CPFEKNVEST RTFLQAVSSE KVRCTNLNCS VIADVRHDGS EPCVDVLFGD GHRLIMRGAH LTAQEMLTA FASHIQARGA AGSGDKPSAS TGR

+
分子 #49: Uncharacterized protein

分子名称: Uncharacterized protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 49
詳細: Unassigned residues have been built as poly-alanine.
コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sus scrofa (ブタ) / 器官: liver
分子量理論値: 15.957357 KDa
配列文字列:
MAARRLFGAA RSWAAWRAWE LSDAAVSGRL HVRNYAKRPV IKGGKGGKGA VVGEALKDPE VCTDPFRLTT HAMGVNIYKE GQDVVLKPD SEYPEWLFEM NVGPPKKLEE LDPETREYWR LLRKHNIWRH NRLSKNRKF

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein mL54

+
分子 #50: Mitochondrial ribosomal protein L57

分子名称: Mitochondrial ribosomal protein L57 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 50 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sus scrofa (ブタ) / 器官: liver
分子量理論値: 12.001915 KDa
配列文字列:
MFLTALLRRN RIPGRQWIGK HRRPRPVSAQ AKQNMIRRLE TEAENQYWLS RPFLTAEQER GHAAVRRAAA FQALKAAQAA RFPAHRRLE EQLGHLLVTR KWS

UniProtKB: Mitochondrial ribosomal protein L57

+
分子 #51: Mitochondrial ribosomal protein L58

分子名称: Mitochondrial ribosomal protein L58 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 51
詳細: Unassigned residues have been built as poly-alanine.
コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sus scrofa (ブタ) / 器官: liver
分子量理論値: 23.545873 KDa
配列文字列: MAAARCLRWG LNRAGAWLLP SPTRYPRRAL HKQVEGTEFQ SIYSLDKLYP ESRGSDTAWR LPDDAKQAND IPVDRLTISY CRSSGPGGQ NVNKVNSKAE VRFHLASADW IAEPVRLKLA VKHKNRINRS GELILTSECS RYQFRNLADC LQKLRDMIAE A SQPAKEPS ...文字列:
MAAARCLRWG LNRAGAWLLP SPTRYPRRAL HKQVEGTEFQ SIYSLDKLYP ESRGSDTAWR LPDDAKQAND IPVDRLTISY CRSSGPGGQ NVNKVNSKAE VRFHLASADW IAEPVRLKLA VKHKNRINRS GELILTSECS RYQFRNLADC LQKLRDMIAE A SQPAKEPS REDAELRRSR IENMNRERLR KKRISSAIKT SRRVDVD

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein mL62

+
分子 #52: 'Mitochondrial ribosomal protein L59

分子名称: 'Mitochondrial ribosomal protein L59 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 52 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sus scrofa (ブタ)
分子量理論値: 25.815031 KDa
配列文字列: MAAPVQQART LLRLVTTLGQ GSRGYRARPP PRRSQEPRWP DPDDPLTPRW QLSPRYAAKQ FARHGAASGV AAGSLWPSQE QLRELEAEE REWYPSLAAM QESLRVQQLA EEQKRQAREQ LIEECMAKMP QMIENWRQQQ QERREKEQAD KDRRARLQAE A QERLGYHV ...文字列:
MAAPVQQART LLRLVTTLGQ GSRGYRARPP PRRSQEPRWP DPDDPLTPRW QLSPRYAAKQ FARHGAASGV AAGSLWPSQE QLRELEAEE REWYPSLAAM QESLRVQQLA EEQKRQAREQ LIEECMAKMP QMIENWRQQQ QERREKEQAD KDRRARLQAE A QERLGYHV DPRSARFQEL LQDMEKQHRK RLKEEKQRKK KEARAAAMAA AAAQDPADSE TPSS

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein mL64

+
分子 #53: mL65, MRPS30

分子名称: mL65, MRPS30 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 53 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sus scrofa (ブタ)
分子量理論値: 49.100504 KDa
配列文字列: MAAARCWRFP LRGAGLSLHT AAKAAVTAPE VTGPDVPATP VARYPPIVAS LTAKSKAARQ RRVEQWQATV HAAKSVDEKL RILTKMQFM KYVVYPQTFA LNADNWYQSF TKTVFLSGLP PTPAKLEPEP TLDITALREA VCDCLLQEHF FLRRKKRAPV I QDREAIAS ...文字列:
MAAARCWRFP LRGAGLSLHT AAKAAVTAPE VTGPDVPATP VARYPPIVAS LTAKSKAARQ RRVEQWQATV HAAKSVDEKL RILTKMQFM KYVVYPQTFA LNADNWYQSF TKTVFLSGLP PTPAKLEPEP TLDITALREA VCDCLLQEHF FLRRKKRAPV I QDREAIAS PFLDQLVASL TGLLSVHNPV LAAAALDCKR PVHFFWLRGE EIIPRGHRKG RVDALRYQIN DKPHNQIRIS RQ LPEFVPL DYSIPIEVPV MSCKPDKLPL FKRQYENTIF IGSKTADPLC YGHTQFHLLP DKLKREKLLK QNCADQIEVV FRA NAIASL FAWTGAQAMY QGFWSEADVT RPFVSQGVIT DGKYFSFFCY QLNTLALTAQ ADQNNPRKNI CWGTQSKPLY ETIE DNNVK GFNDDVLLQL VQFLLNRPKE DKSQLLEN

+
分子 #54: Mitochondrial ribosomal protein S18A

分子名称: Mitochondrial ribosomal protein S18A / タイプ: protein_or_peptide / ID: 54 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sus scrofa (ブタ)
分子量理論値: 22.273084 KDa
配列文字列: MVGLNVLVSG CGRLLRGLLA GPAATSWARP PSRGFREVVE ILDGKTTIIE GRITETPQES PNPPNPTGQC PICRWNLKHK YNYEDVLLL SQFIRPHGGM LPRRITGLCQ EEHLKIEECV KMAHRAGLLP NHRPKLPEGF VPKSKPRLNR YLTRWSPRSV K PIYNKGHR ...文字列:
MVGLNVLVSG CGRLLRGLLA GPAATSWARP PSRGFREVVE ILDGKTTIIE GRITETPQES PNPPNPTGQC PICRWNLKHK YNYEDVLLL SQFIRPHGGM LPRRITGLCQ EEHLKIEECV KMAHRAGLLP NHRPKLPEGF VPKSKPRLNR YLTRWSPRSV K PIYNKGHR WNKVRMPVGS PLLKDNVSYS GRPLLLYH

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein mL66

+
分子 #55: unassigned secondary structure elements

分子名称: unassigned secondary structure elements / タイプ: protein_or_peptide / ID: 55
詳細: Unassigned secondary structure elements have been built as poly-alanine.
コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sus scrofa (ブタ) / 器官: liver
分子量理論値: 5.846387 KDa
配列文字列:
AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AA

+
分子 #12: 16S ribosomal RNA, mitochondrial

分子名称: 16S ribosomal RNA, mitochondrial / タイプ: rna / ID: 12 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Sus scrofa (ブタ)
分子量理論値: 504.852031 KDa
配列文字列: ACCAAAGCUA GCUCAACAUA CUAAACAAAU ACAAAAAUAC ACCAAAAUAA AAUAAAACAU UCACCUAACA UUAAAGUAUA GGAGAUAGA AAUUUUUAUC CUGACGCUAU AGAGAUAGUA CCGUAAGGGA AAGAUGAAAG AAUAAAAUAA AAGUAAAAAA A AGCAAAGA ...文字列:
ACCAAAGCUA GCUCAACAUA CUAAACAAAU ACAAAAAUAC ACCAAAAUAA AAUAAAACAU UCACCUAACA UUAAAGUAUA GGAGAUAGA AAUUUUUAUC CUGACGCUAU AGAGAUAGUA CCGUAAGGGA AAGAUGAAAG AAUAAAAUAA AAGUAAAAAA A AGCAAAGA UUACCCCUUC UACCUUUUGC AUAAUGGUUU AACCAGAAAA AAUCUAACAA AGAGAACUUU AGCUAGAUAC CC CGAAACC AGACGAGCUA CCCAUGAGCA GUUUAAAAGA ACCAACUCAU CUAUGUGGCA AAAUAGUGAG AAGACUUGUA GGU AGAGGU GAAAAGCCUA ACGAGCCUGG UGAUAGCUGG UUGUCCGAGA AAGAAUUUUA GUUCAACCUU AAAAAUACCC CAAA AACCC UAAAUUCCAA UGUAUUUUUA AGAGAUAGUC UAAAAAGGUA CAGCUUUUUA GAAACGGAUA CAACCUUGAC UAGAG AGUA AAAUCUUAAU ACUACCAUAG UAGGCCUAAA AGCAGCCAUC AAUUGAGAAA GCGUUAAAGC UCAACAAAUU CACCAA CAU AAUCCCAAAA ACUAAUAACA AACUCCUAGC CCAAUACCGG ACUAAUCUAU UGAAACAUAG AAGCAAUAAU GUUAAUA UG AGUAACAAGA AGCCUUUCUC CUCGCACACG CUUACAUCAG UAACUAAUAA UAUACUGAUA AUUAACAACC AAUAAACC A AAACAACACU AAAACGUUUA UUAAUUACAU UGUUAACCCA ACACAGGAGU GCACCAAGGA AAGAUUAAAA GAAGUAAAA GGAACUCGGC AAACACAAAC CCCGCCUGUU UACCAAAAAC AUCACCUCUA GCAUUACUAG UAUUAGAGGC AAUGCCUGCC CAGUGACAC CAGUUUAACG GCCGCGGUAU UCUGACCGUG CAAAGGUAGC AUAAUCACUU GUUCUCCAAA UAAGGACUUG U AUGAAUGG CCACACGAGG GUUUUACUGU CUCUUACUUC CAAUCAGUGA AAUUAACCUU CCCGUGAAGA GGCGGGAAUA AA AAAAUAA GACGAGAAGA CCCUAUGGAG CUUUAAUUAA CUAUUCCAAA AGUUAAACAA CUCAACCACA AAGGGAUAAA ACA UAACUU AACAUGGACU AGCAAUUUCG GUUGGGGUGA CCUCGGAGUA CAAAAAACCC UCCGAGUGAU UUUAAUCUAG ACAA ACCAG UCAAAAUAAC CAUAACAUCA CUUAUUGAUC CAAAAUUUUG AUCAACGGAA CAAGUUACCC UAGGGAUAAC AGCGC AAUC CUGUUCUAGA GUUCCUAUCG ACAAUAGGGU UUACGACCUC GAUGUUGGAU CAGGACACCC AAAUGGUGCA ACCGCU AUU AAAGGUUCGU UUGUUCAACG AUUAAAGUCC UACGUGAUCU GAGUUCAGAC CGGAGCAAUC CAGGUCGGUU UCUAUCU AU UAUAAAUUUC UCCCAGUACG AAAGGACAAG AGAAAUGGGA CCAACCUCAC AAACGCGUCU CAGAGAUAAU UAAUGAUU U AAUCUUAACC UAAUUAACUC AUAAUAAAUC CAGCCCUAGA ACAGGGCACA

GENBANK: GENBANK: AF486858.1

+
分子 #13: CP tRNAPhe, mitochondrial

分子名称: CP tRNAPhe, mitochondrial / タイプ: rna / ID: 13 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Sus scrofa (ブタ)
分子量理論値: 23.402018 KDa
配列文字列:
GUUAAUGUAG CUUAAAUUAU CAAAGCAAGG CACUGAAAAU GCCUAGAUGA GCCUCACAGC UCCAUAAACA CCA

GENBANK: GENBANK: DQ207753.1

+
分子 #56: P-site fMet-tRNAMet, mitochondrial

分子名称: P-site fMet-tRNAMet, mitochondrial / タイプ: rna / ID: 56 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 22.664498 KDa
配列文字列:
AGUAAGGUCA GCUAAAUAAG CUAUCGGGCC CAUACCCCGA AAAUGUUGGU UAUACCCUUC CCGUACUACC A

GENBANK: GENBANK: KY671085.1

+
分子 #57: MAGNESIUM ION

分子名称: MAGNESIUM ION / タイプ: ligand / ID: 57 / コピー数: 216 / 式: MG
分子量理論値: 24.305 Da

+
分子 #58: ZINC ION

分子名称: ZINC ION / タイプ: ligand / ID: 58 / コピー数: 3 / 式: ZN
分子量理論値: 65.409 Da

+
分子 #59: GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE

分子名称: GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE / タイプ: ligand / ID: 59 / コピー数: 2 / 式: 5GP
分子量理論値: 363.221 Da
Chemical component information

ChemComp-5GP:
GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE / GMP

+
分子 #60: SPERMINE

分子名称: SPERMINE / タイプ: ligand / ID: 60 / コピー数: 2 / 式: SPM
分子量理論値: 202.34 Da
Chemical component information

ChemComp-SPM:
SPERMINE / スペルミン

+
分子 #61: 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE

分子名称: 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE / タイプ: ligand / ID: 61 / コピー数: 1 / 式: GSP
分子量理論値: 539.246 Da
Chemical component information

ChemComp-GSP:
5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE / GTP-γ-S

+
分子 #62: SODIUM ION

分子名称: SODIUM ION / タイプ: ligand / ID: 62 / コピー数: 1
分子量理論値: 22.99 Da

+
分子 #63: N-FORMYLMETHIONINE

分子名称: N-FORMYLMETHIONINE / タイプ: ligand / ID: 63 / コピー数: 1 / 式: FME
分子量理論値: 177.221 Da
Chemical component information

ChemComp-FME:
N-FORMYLMETHIONINE / N-ホルミルメチオニン

+
分子 #64: water

分子名称: water / タイプ: ligand / ID: 64 / コピー数: 2 / 式: HOH
分子量理論値: 18.015 Da
Chemical component information

ChemComp-HOH:
WATER

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実験情報

-
構造解析

手法クライオ電子顕微鏡法
解析単粒子再構成法
試料の集合状態particle

-
試料調製

濃度0.171 mg/mL
緩衝液pH: 7.6
グリッドモデル: Quantifoil R2/2 / 材質: COPPER / 支持フィルム - 材質: CARBON / 支持フィルム - トポロジー: CONTINUOUS / 前処理 - タイプ: GLOW DISCHARGE
凍結凍結剤: ETHANE / チャンバー内湿度: 100 % / チャンバー内温度: 277.15 K / 装置: FEI VITROBOT MARK IV
詳細contains 55S mitochondrial ribosome, mitochondrial initiation factor 2, mitochondrial formyl-Met-tRNAMet and MT-CO3 mRNA

-
電子顕微鏡法

顕微鏡FEI TITAN KRIOS
撮影フィルム・検出器のモデル: FEI FALCON III (4k x 4k)
検出モード: INTEGRATING / デジタル化 - サイズ - 横: 4096 pixel / デジタル化 - サイズ - 縦: 4096 pixel / 実像数: 13936 / 平均露光時間: 1.4 sec. / 平均電子線量: 40.0 e/Å2
電子線加速電圧: 300 kV / 電子線源: FIELD EMISSION GUN
電子光学系照射モード: FLOOD BEAM / 撮影モード: BRIGHT FIELD
実験機器
モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company

+
画像解析

粒子像選択選択した数: 1366787
初期モデルモデルのタイプ: PDB ENTRY
PDBモデル - PDB ID:

5aj4

最終 再構成使用したクラス数: 1 / アルゴリズム: FOURIER SPACE / 解像度のタイプ: BY AUTHOR / 解像度: 3.2 Å / 解像度の算出法: FSC 0.143 CUT-OFF / ソフトウェア - 名称: RELION (ver. 2.1) / 使用した粒子像数: 75666
初期 角度割当タイプ: MAXIMUM LIKELIHOOD / ソフトウェア - 名称: RELION (ver. 2.1)
最終 角度割当タイプ: MAXIMUM LIKELIHOOD / ソフトウェア - 名称: RELION (ver. 2.1)

-
原子モデル構築 1

精密化空間: RECIPROCAL / プロトコル: OTHER / 温度因子: 56.9
得られたモデル

PDB-6gb2:
Unique features of mammalian mitochondrial translation initiation revealed by cryo-EM. This file contains the 39S ribosomal subunit.

+
万見について

-
お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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万見 (Yorodumi)

幾万の構造データを、幾万の視点から

  • 万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
  • EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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