[日本語] English
万見
- EMDB-3852: Elongation factor G-ribosome complex captures in the absence of i... -

+
データを開く


IDまたはキーワード:

読み込み中...

-
基本情報

登録情報
データベース: EMDB / ID: EMD-3852
タイトルElongation factor G-ribosome complex captures in the absence of inhibitors
マップデータElongation factor G-ribosome complex captured in the absence of inhibitors
試料
  • 複合体: EF-G bound to 70S ribosome
    • 複合体: 70S ribosome
      • RNA: x 3種
      • タンパク質・ペプチド: x 53種
    • 複合体: tRNA PHE
      • RNA: x 1種
    • 複合体: Elongation factor G
      • タンパク質・ペプチド: x 1種
    • 複合体: mRNA
      • RNA: x 1種
  • リガンド: x 3種
キーワードElongation factor G / Translation / Translocation / RIBOSOME
機能・相同性
機能・相同性情報


ribosome disassembly / translation elongation factor activity / large ribosomal subunit / regulation of translation / transferase activity / ribosomal small subunit biogenesis / ribosomal small subunit assembly / small ribosomal subunit / 5S rRNA binding / small ribosomal subunit rRNA binding ...ribosome disassembly / translation elongation factor activity / large ribosomal subunit / regulation of translation / transferase activity / ribosomal small subunit biogenesis / ribosomal small subunit assembly / small ribosomal subunit / 5S rRNA binding / small ribosomal subunit rRNA binding / ribosomal large subunit assembly / large ribosomal subunit rRNA binding / cytosolic small ribosomal subunit / cytosolic large ribosomal subunit / cytoplasmic translation / tRNA binding / negative regulation of translation / rRNA binding / structural constituent of ribosome / ribosome / translation / ribonucleoprotein complex / mRNA binding / GTPase activity / GTP binding / zinc ion binding / metal ion binding / cytosol / cytoplasm
類似検索 - 分子機能
Translation elongation factor EFG/EF2 / : / Elongation factor G, domain III / EFG, domain V / : / Ribosomal protein L1, bacterial-type / 30S ribosomal protein Thx / 30S ribosomal protein Thx / Elongation Factor G, domain II / Elongation Factor G, domain III ...Translation elongation factor EFG/EF2 / : / Elongation factor G, domain III / EFG, domain V / : / Ribosomal protein L1, bacterial-type / 30S ribosomal protein Thx / 30S ribosomal protein Thx / Elongation Factor G, domain II / Elongation Factor G, domain III / 30S ribosomal protein / Translation elongation factor EFG/EF2, domain IV / Elongation factor G, domain IV / Elongation factor G, domain IV / Elongation factor G C-terminus / Ribosomal protein L25, long-form / Ribosomal protein L25, beta domain / Ribosomal protein L25, C-terminal / Ribosomal protein TL5, C-terminal domain / Elongation factor EFG, domain V-like / Elongation factor G C-terminus / EF-G domain III/V-like / Tr-type G domain, conserved site / Translational (tr)-type guanine nucleotide-binding (G) domain signature. / : / Ribosomal protein S14, type Z / Ribosomal protein L1, conserved site / Ribosomal protein L1 signature. / Ribosomal protein L1 / Translation elongation factor EFTu-like, domain 2 / Ribosomal protein L1, 3-layer alpha/beta-sandwich / Elongation factor Tu domain 2 / Ribosomal protein L1-like / Ribosomal protein L1/ribosomal biogenesis protein / Ribosomal protein L1p/L10e family / Ribosomal protein L31 type A / Translational (tr)-type GTP-binding domain / Elongation factor Tu GTP binding domain / Translational (tr)-type guanine nucleotide-binding (G) domain profile. / Ribosomal protein L31 signature. / Ribosomal protein L31 / Ribosomal protein L31 superfamily / Ribosomal protein L31 / Ribosomal protein L9 signature. / Ribosomal protein L9, bacteria/chloroplast / Ribosomal protein L9, C-terminal / Ribosomal protein L9, C-terminal domain / Ribosomal protein L9, C-terminal domain superfamily / Ribosomal L25p family / Ribosomal protein L25 / Ribosomal protein L36 signature. / Ribosomal protein L32p, bacterial type / Ribosomal protein L25/Gln-tRNA synthetase, N-terminal / Ribosomal protein L25/Gln-tRNA synthetase, anti-codon-binding domain superfamily / Ribosomal protein L9, N-terminal domain superfamily / Ribosomal protein L9 / : / Ribosomal protein L9, N-terminal / Ribosomal protein L9, N-terminal domain / Ribosomal protein L33, conserved site / Ribosomal protein L33 signature. / Ribosomal protein L35, conserved site / Ribosomal protein L35 signature. / Ribosomal protein L28 / Ribosomal protein L35, non-mitochondrial / Ribosomal protein L18, bacterial-type / : / Ribosomal protein L6, bacterial-type / Ribosomal protein S19, bacterial-type / Ribosomal protein S3, bacterial-type / Ribosomal protein S13, bacterial-type / Ribosomal protein S6, conserved site / Ribosomal protein S6 signature. / Ribosomal protein L9/RNase H1, N-terminal / Ribosomal protein S7, bacterial/organellar-type / Ribosomal protein S11, bacterial-type / Ribosomal protein L5, bacterial-type / Ribosomal protein S20 / Ribosomal protein S20 superfamily / Ribosomal protein S20 / Ribosomal protein L36 / Ribosomal protein L36 superfamily / Ribosomal protein L36 / Ribosomal protein S14/S29 / Ribosomal protein S4, bacterial-type / Ribosomal protein L19, conserved site / Ribosomal protein L19 signature. / 30S ribosomal protein S17 / Ribosomal protein L27, conserved site / Ribosomal protein L27 signature. / Ribosomal protein S5, bacterial-type / Ribosomal protein S6, plastid/chloroplast / Ribosomal protein L20 signature. / Ribosomal protein L22, bacterial/chloroplast-type / Ribosomal protein L14P, bacterial-type / Ribosomal protein L34, conserved site / Ribosomal protein L34 signature. / Ribosomal protein S2, bacteria/mitochondria/plastid / Ribosomal protein L2, bacterial/organellar-type / Ribosomal protein L35
類似検索 - ドメイン・相同性
Small ribosomal subunit protein uS14 / Small ribosomal subunit protein uS17 / Large ribosomal subunit protein uL6 / Small ribosomal subunit protein uS8 / Small ribosomal subunit protein uS7 / Large ribosomal subunit protein bL33 / Large ribosomal subunit protein uL2 / Large ribosomal subunit protein uL13 / Large ribosomal subunit protein uL16 / Large ribosomal subunit protein bL19 ...Small ribosomal subunit protein uS14 / Small ribosomal subunit protein uS17 / Large ribosomal subunit protein uL6 / Small ribosomal subunit protein uS8 / Small ribosomal subunit protein uS7 / Large ribosomal subunit protein bL33 / Large ribosomal subunit protein uL2 / Large ribosomal subunit protein uL13 / Large ribosomal subunit protein uL16 / Large ribosomal subunit protein bL19 / Large ribosomal subunit protein bL20 / Large ribosomal subunit protein bL21 / Large ribosomal subunit protein bL27 / Large ribosomal subunit protein bL28 / Large ribosomal subunit protein bL32 / Large ribosomal subunit protein bL34 / Small ribosomal subunit protein uS2 / Small ribosomal subunit protein uS3 / Small ribosomal subunit protein uS4 / Small ribosomal subunit protein uS9 / Small ribosomal subunit protein uS11 / Small ribosomal subunit protein uS13 / Small ribosomal subunit protein bS20 / Small ribosomal subunit protein uS12 / Elongation factor G / Small ribosomal subunit protein uS10 / Large ribosomal subunit protein uL3 / Large ribosomal subunit protein uL4 / Large ribosomal subunit protein uL23 / Small ribosomal subunit protein uS19 / Large ribosomal subunit protein uL22 / Large ribosomal subunit protein uL29 / Large ribosomal subunit protein uL14 / Large ribosomal subunit protein uL24 / Large ribosomal subunit protein uL5 / Large ribosomal subunit protein uL18 / Small ribosomal subunit protein uS5 / Large ribosomal subunit protein uL30 / Large ribosomal subunit protein uL15 / Large ribosomal subunit protein bL36 / Large ribosomal subunit protein bL25 / Small ribosomal subunit protein bTHX / Small ribosomal subunit protein uS15 / Large ribosomal subunit protein bL31 / Small ribosomal subunit protein bS16 / Large ribosomal subunit protein bL35 / Large ribosomal subunit protein uL1 / Small ribosomal subunit protein bS6 / Small ribosomal subunit protein bS18 / Large ribosomal subunit protein bL9 / Large ribosomal subunit protein bL17
類似検索 - 構成要素
生物種Thermus thermophilus HB8 (バクテリア) / Escherichia coli (大腸菌) / Thermus thermophilus (バクテリア) / Thermus thermophilus (strain HB8 / ATCC 27634 / DSM 579) (バクテリア)
手法単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 3.8 Å
データ登録者Mace K / Giudice E
資金援助 フランス, 2件
OrganizationGrant number国
French National Research AgencyANR-14-ASTR-0001 フランス
GENCIi2015037391 フランス
引用ジャーナル: Nucleic Acids Res / 年: 2018
タイトル: The structure of an elongation factor G-ribosome complex captured in the absence of inhibitors.
著者: Kevin Macé / Emmanuel Giudice / Sophie Chat / Reynald Gillet /
要旨: During translation's elongation cycle, elongation factor G (EF-G) promotes messenger and transfer RNA translocation through the ribosome. Until now, the structures reported for EF-G-ribosome ...During translation's elongation cycle, elongation factor G (EF-G) promotes messenger and transfer RNA translocation through the ribosome. Until now, the structures reported for EF-G-ribosome complexes have been obtained by trapping EF-G in the ribosome. These results were based on use of non-hydrolyzable guanosine 5'-triphosphate (GTP) analogs, specific inhibitors or a mutated EF-G form. Here, we present the first cryo-electron microscopy structure of EF-G bound to ribosome in the absence of an inhibitor. The structure reveals a natural conformation of EF-G·GDP in the ribosome, with a previously unseen conformation of its third domain. These data show how EF-G must affect translocation, and suggest the molecular mechanism by which fusidic acid antibiotic prevents the release of EF-G after GTP hydrolysis.
履歴
登録2017年8月21日-
ヘッダ(付随情報) 公開2018年2月14日-
マップ公開2018年2月14日-
更新2025年4月9日-
現状2025年4月9日処理サイト: PDBe / 状態: 公開

-
構造の表示

ムービー
  • 表面図（断面を密度値に従い着色）
  • 表面レベル: 0.05
  • UCSF Chimeraによる作画
  • ダウンロード
  • 表面図（高さに従い着色）
  • 表面レベル: 0.05
  • UCSF Chimeraによる作画
  • ダウンロード
  • あてはめたモデルとの重ね合わせ
  • 原子モデル: PDB-5ot7
  • 表面レベル: 0.05
  • UCSF Chimeraによる作画
  • ダウンロード
ムービービューア
構造ビューアEMマップ:
SurfViewMolmilJmol/JSmol
添付画像

emd_3852.png

ダウンロードとリンク

-
マップ

ファイルダウンロード / ファイル: emd_3852.map.gz / 形式: CCP4 / 大きさ: 282.6 MB / タイプ: IMAGE STORED AS FLOATING POINT NUMBER (4 BYTES)
注釈Elongation factor G-ribosome complex captured in the absence of inhibitors
投影像・断面図

画像のコントロール

大きさ
明度
コントラスト
その他
軸Z (Sec.)Y (Row.)X (Col.)
1.1 Å/pix.
x 420 pix.
= 463.05 Å		1.1 Å/pix.
x 420 pix.
= 463.05 Å		1.1 Å/pix.
x 420 pix.
= 463.05 Å

表面

投影像

断面 (1/3)

断面 (1/2)

断面 (2/3)

画像は Spider により作成

ボクセルのサイズX=Y=Z: 1.1025 Å
密度

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)
表面レベル登録者による: 0.04 / ムービー #1: 0.05
最小 - 最大-0.27181298 - 0.45327133
平均 (標準偏差)0.0014783972 (±0.014340088)
対称性空間群: 1
詳細

EMDB XML:

マップ形状
Axis orderXYZ
Origin000
サイズ420420420
Spacing420420420
セルA=B=C: 463.05 Å
α=β=γ: 90.0 °

CCP4マップ ヘッダ情報:

modeImage stored as Reals
Å/pix. X/Y/Z1.10251.10251.1025
M x/y/z420420420
origin x/y/z0.0000.0000.000
length x/y/z463.050463.050463.050
α/β/γ90.00090.00090.000
MAP C/R/S123
start NC/NR/NS000
NC/NR/NS420420420
D min/max/mean-0.2720.4530.001

-
添付データ

-
ハーフマップ: unfiltered, unmasked half map 2

ファイルemd_3852_half_map_1.map
注釈unfiltered, unmasked half map 2
投影像・断面図
軸ZYX

投影像

断面 (1/2)
密度ヒストグラム

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)

-
ハーフマップ: unfiltered, unmasked half map 1

ファイルemd_3852_half_map_2.map
注釈unfiltered, unmasked half map 1
投影像・断面図
軸ZYX

投影像

断面 (1/2)
密度ヒストグラム

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)

-
試料の構成要素

+
全体 : EF-G bound to 70S ribosome

全体名称: EF-G bound to 70S ribosome
要素
  • 複合体: EF-G bound to 70S ribosome
    • 複合体: 70S ribosome
      • RNA: 16S Ribosomal RNA
      • RNA: 23S Ribosomal RNA
      • RNA: 5S Ribosomal RNA
      • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L25
      • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L9
      • タンパク質・ペプチド: 30S ribosomal protein S2
      • タンパク質・ペプチド: 30S ribosomal protein S3
      • タンパク質・ペプチド: 30S ribosomal protein S4
      • タンパク質・ペプチド: 30S ribosomal protein S5
      • タンパク質・ペプチド: 30S ribosomal protein S6
      • タンパク質・ペプチド: 30S ribosomal protein S7
      • タンパク質・ペプチド: 30S ribosomal protein S8
      • タンパク質・ペプチド: 30S ribosomal protein S9
      • タンパク質・ペプチド: 30S ribosomal protein S10
      • タンパク質・ペプチド: 30S ribosomal protein S11
      • タンパク質・ペプチド: 30S ribosomal protein S12
      • タンパク質・ペプチド: 30S ribosomal protein S13
      • タンパク質・ペプチド: 30S ribosomal protein S14 type Z
      • タンパク質・ペプチド: 30S ribosomal protein S15
      • タンパク質・ペプチド: 30S ribosomal protein S16
      • タンパク質・ペプチド: 30S ribosomal protein S17
      • タンパク質・ペプチド: 30S ribosomal protein S18
      • タンパク質・ペプチド: 30S ribosomal protein S19
      • タンパク質・ペプチド: 30S ribosomal protein S20
      • タンパク質・ペプチド: 30S ribosomal protein Thx
      • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L27
      • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L28
      • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L29
      • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L30
      • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L31
      • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L32
      • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L33
      • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L34
      • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L35
      • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L36
      • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L1
      • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L2
      • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L3
      • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L4
      • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L5
      • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L6
      • タンパク質・ペプチド: Ribosomal protein uL10
      • タンパク質・ペプチド: Ribosomal protein uL11
      • タンパク質・ペプチド: Ribosomal protein bL12
      • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L13
      • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L14
      • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L15
      • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L16
      • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L17
      • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L18
      • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L19
      • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L20
      • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L21
      • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L22
      • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L23
      • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L24
    • 複合体: tRNA PHE
      • RNA: tRNA-Phe
    • 複合体: Elongation factor G
      • タンパク質・ペプチド: Elongation factor G
    • 複合体: mRNA
      • RNA: mRNA
  • リガンド: MAGNESIUM ION
  • リガンド: ZINC ION
  • リガンド: GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE

+
超分子 #1: EF-G bound to 70S ribosome

超分子名称: EF-G bound to 70S ribosome / タイプ: complex / ID: 1 / 親要素: 0 / 含まれる分子: #1-#59

+
超分子 #2: 70S ribosome

超分子名称: 70S ribosome / タイプ: complex / ID: 2 / 親要素: 1 / 含まれる分子: #1, #4-#27, #29-#59
由来(天然)生物種: Thermus thermophilus HB8 (バクテリア)

+
超分子 #3: tRNA PHE

超分子名称: tRNA PHE / タイプ: complex / ID: 3 / 親要素: 1 / 含まれる分子: #2
由来(天然)生物種: Escherichia coli (大腸菌)

+
超分子 #4: Elongation factor G

超分子名称: Elongation factor G / タイプ: complex / ID: 4 / 親要素: 1 / 含まれる分子: #28
由来(天然)生物種: Thermus thermophilus (バクテリア)

+
超分子 #5: mRNA

超分子名称: mRNA / タイプ: complex / ID: 5 / 親要素: 1 / 含まれる分子: #3
由来(天然)生物種: Escherichia coli (大腸菌)

+
分子 #1: 16S Ribosomal RNA

分子名称: 16S Ribosomal RNA / タイプ: rna / ID: 1 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Thermus thermophilus (strain HB8 / ATCC 27634 / DSM 579) (バクテリア)
分子量理論値: 489.331719 KDa
配列文字列: UGGAGAGUUU GAUCCUGGCU CAGGGUGAAC GCUGGCGGCG UGCCUAAGAC AUGCAAGUCG UGCGGGCCGC GGGGUUUUAC UCCGUGGUC AGCGGCGGAC GGGUGAGUAA CGCGUGGGUG ACCUACCCGG AAGAGGGGGA CAACCCGGGG AAACUCGGGC U AAUCCCCC ...文字列:
UGGAGAGUUU GAUCCUGGCU CAGGGUGAAC GCUGGCGGCG UGCCUAAGAC AUGCAAGUCG UGCGGGCCGC GGGGUUUUAC UCCGUGGUC AGCGGCGGAC GGGUGAGUAA CGCGUGGGUG ACCUACCCGG AAGAGGGGGA CAACCCGGGG AAACUCGGGC U AAUCCCCC AUGUGGACCC GCCCCUUGGG GUGUGUCCAA AGGGCUUUGC CCGCUUCCGG AUGGGCCCGC GUCCCAUCAG CU AGUUGGU GGGGUAAUGG CCCACCAAGG CGACGACGGG UAGCCGGUCU GAGAGGAUGG CCGGCCACAG GGGCACUGAG ACA CGGGCC CCACUCCUAC GGGAGGCAGC AGUUAGGAAU CUUCCGCAAU GGGCGCAAGC CUGACGGAGC GACGCCGCUU GGAG GAAGA AGCCCUUCGG GGUGUAAACU CCUGAACCCG GGACGAAACC CCCGACGAGG GGACUGACGG UACCGGGGUA AUAGC GCCG GCCAACUCCG UGCCAGCAGC CGCGGUAAUA CGGAGGGCGC GAGCGUUACC CGGAUUCACU GGGCGUAAAG GGCGUG UAG GCGGCCUGGG GCGUCCCAUG UGAAAGACCA CGGCUCAACC GUGGGGGAGC GUGGGAUACG CUCAGGCUAG ACGGUGG GA GAGGGUGGUG GAAUUCCCGG AGUAGCGGUG AAAUGCGCAG AUACCGGGAG GAACGCCGAU GGCGAAGGCA GCCACCUG G UCCACCCGUG ACGCUGAGGC GCGAAAGCGU GGGGAGCAAA CCGGAUUAGA UACCCGGGUA GUCCACGCCC UAAACGAUG CGCGCUAGGU CUCUGGGUCU CCUGGGGGCC GAAGCUAACG CGUUAAGCGC GCCGCCUGGG GAGUACGGCC GCAAGGCUGA AACUCAAAG GAAUUGACGG GGGCCCGCAC AAGCGGUGGA GCAUGUGGUU UAAUUCGAAG CAACGCGAAG AACCUUACCA G GCCUUGAC AUGCUAGGGA ACCCGGGUGA AAGCCUGGGG UGCCCCGCGA GGGGAGCCCU AGCACAGGUG CUGCAUGGCC GU CGUCAGC UCGUGCCGUG AGGUGUUGGG UUAAGUCCCG CAACGAGCGC AACCCCCGCC GUUAGUUGCC AGCGGUUCGG CCG GGCACU CUAACGGGAC UGCCCGCGAA AGCGGGAGGA AGGAGGGGAC GACGUCUGGU CAGCAUGGCC CUUACGGCCU GGGC GACAC ACGUGCUACA AUGCCCACUA CAAAGCGAUG CCACCCGGCA ACGGGGAGCU AAUCGCAAAA AGGUGGGCCC AGUUC GGAU UGGGGUCUGC AACCCGACCC CAUGAAGCCG GAAUCGCUAG UAAUCGCGGA UCAGCCAUGC CGCGGUGAAU ACGUUC CCG GGCCUUGUAC ACACCGCCCG UCACGCCAUG GGAGCGGGCU CUACCCGAAG UCGCCGGGAG CCUACGGGCA GGCGCCG AG GGUAGGGCCC GUGACUGGGG CGAAGUCGUA ACAAGGUAGC UGUACCGGAA GGUGCGGCUG GAUCA

GENBANK: GENBANK: AP008226.1

+
分子 #2: tRNA-Phe

分子名称: tRNA-Phe / タイプ: rna / ID: 2 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Escherichia coli (大腸菌)
分子量理論値: 24.485539 KDa
配列文字列:
GCCCGGAUAG CUCAGUCGGU AGAGCAGGGG AUUGAAAAUC CCCGUGUCCU UGGUUCGAUU CCGAGUCCGG GCACCA

GENBANK: GENBANK: CP024155.1

+
分子 #3: mRNA

分子名称: mRNA / タイプ: rna / ID: 3 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Escherichia coli (大腸菌)
分子量理論値: 4.88993 KDa
配列文字列:
AGGAGGUGAG GUUUU

+
分子 #4: 23S Ribosomal RNA

分子名称: 23S Ribosomal RNA / タイプ: rna / ID: 4 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Thermus thermophilus (strain HB8 / ATCC 27634 / DSM 579) (バクテリア)
分子量理論値: 943.51575 KDa
配列文字列: AGAUGGUAAG GGCCCACGGU GGAUGCCUCG GCACCCGAGC CGAUGAAGGA CGUGGCUACC UGCGAUAAGC CAGGGGGAGC CGGUAGCGG GCGUGGAUCC CUGGAUGUCC GAAUGGGGGA ACCCGGCCGG CGGGAACGCC GGUCACCGCG CUUUUGCGCG G GGGGAACC ...文字列:
AGAUGGUAAG GGCCCACGGU GGAUGCCUCG GCACCCGAGC CGAUGAAGGA CGUGGCUACC UGCGAUAAGC CAGGGGGAGC CGGUAGCGG GCGUGGAUCC CUGGAUGUCC GAAUGGGGGA ACCCGGCCGG CGGGAACGCC GGUCACCGCG CUUUUGCGCG G GGGGAACC UGGGGAACUG AAACAUCUCA GUACCCAGAG GAGAGGAAAG AGAAAUCGAC UCCCUGAGUA GCGGCGAGCG AA AGGGGAC CAGCCUAAAC CGUCCGGCUU GUCCGGGCGG GGUCGUGGGG CCCUCGGACA CCGAAUCCCC AGCCUAGCCG AAG CUGUUG GGAAGCAGCG CCAGAGAGGG UGAAAGCCCC GUAGGCGAAA GGUGGGGGGA UAGGUGAGGG UACCCGAGUA CCCC GUGGU UCGUGGAGCC AUGGGGGAAU CUGGGCGGAC CACCGCCUAA GGCUAAGUAC UCCGGGUGAC CGAUAGCGCA CCAGU ACCG UGAGGGAAAG GUGAAAAGAA CCCCGGGAGG GGAGUGAAAU AGAGCCUGAA ACCGUGGGCU UACAAGCAGU CACGGC CCC GCAAGGGGUU GUGGCGUGCC UAUUGAAGCA UGAGCCGGCG ACUCACGGUC GUGGGCGAGC UUAAGCCGUU GAGGCGG AG GCGUAGGGAA ACCGAGUCCG AACAGGGCGC AAGCGGGCCG CACGCGGCCC GCAAAGUCCG CGGCCGUGGA CCCGAAAC C GGGCGAGCUA GCCCUGGCCA GGGUGAAGCU GGGGUGAGAC CCAGUGGAGG CCCGAACCGG UGGGGGAUGC AAACCCCUC GGAUGAGCUG GGGCUAGGAG UGAAAAGCUA ACCGAGCCCG GAGAUAGCUG GUUCUCCCCG AAAUGACUUU AGGGUCAGCC UCAGGCGCU GACUGGGGCC UGUAGAGCAC UGAUAGGGCU AGGGGGCCCA CCAGCCUACC AAACCCUGUC AAACUCCGAA G GGUCCCAG GUGGAGCCUG GGAGUGAGGG CGCGAGCGAU AACGUCCGCG UCCGAGCGCG GGAACAACCG AGACCGCCAG CU AAGGCCC CCAAGUCUGG GCUAAGUGGU AAAGGAUGUG GCGCGGCGAA GACAGCCAGG AGGUUGGCUU AGAAGCAGCC AUC CUUUAA AGAGUGCGUA AUAGCUCACU GGUCGAGUGG CGCCGCGCCG AAAAUGAUCG GGGCUUAAGC CCAGCGCCGA AGCU GCGGG UCUGGGGGAU GACCCCAGGC GGUAGGGGAG CGUUCCCGAU GCCGAUGAAG GCCGACCCGC GAGGGCGGCU GGAGG UAAG GGAAGUGCGA AUGCCGGCAU GAGUAACGAU AAAGAGGGUG AGAAUCCCUC UCGCCGUAAG CCCAAGGGUU CCUACG CAA UGGUCGUCAG CGUAGGGUUA GGCGGGACCU AAGGUGAAGC CGAAAGGCGU AGCCGAAGGG CAGCCGGUUA AUAUUCC GG CCCUUCCCGC AGGUGCGAUG GGGGGACGCU CUAGGCUAGG GGGACCGGAG CCAUGGACGA GCCCGGCCAG AAGCGCAG G GUGGGAGGUA GGCAAAUCCG CCUCCCAACA AGCUCUGCGU GGUGGGGAAG CCCGUACGGG UGACAACCCC CCGAAGCCA GGGAGCCAAG AAAAGCCUCU AAGCACAACC UGCGGGAACC CGUACCGCAA ACCGACACAG GUGGGCGGGU GCAAGAGCAC UCAGGCGCG CGGGAGAACC CUCGCCAAGG AACUCUGCAA GUUGGCCCCG UAACUUCGGG AGAAGGGGUG CUCCCUGGGG U GAUGAGCC CCGGGGAGCC GCAGUGAACA GGCUCUGGCG ACUGUUUACC AAAAACACAG CUCUCUGCGA ACUCGUAAGA GG AGGUAUA GGGAGCGACG CUUGCCCGGU GCCGGAAGGU CAAGGGGAGG GGUGCAAGCC CCGAACCGAA GCCCCGGUGA ACG GCGGCC GUAACUAUAA CGGUCCUAAG GUAGCGAAAU UCCUUGUCGG GUAAGUUCCG ACCUGCACGA AAAGCGUAAC GACC GGAGC GCUGUCUCGG CGAGGGACCC GGUGAAAUUG AACUGGCCGU GAAGAUGCGG CCUACCCGUG GCAGGACGAA AAGAC CCCG UGGAGCUUUA CUGCAGCCUG GUGUUGGCUC UUGGUCGCGC CUGCGUAGGA UAGGUGGGAG CCUGUAAACC CCCGCC UCC GGGUGGGGGG GAGGCGCCGG UGAAAUACCA CCCUGGCGCG GCUGGGGGCC UAACCCUCGG AUGGGGGGAC AGCGCUU GG CGGGCAGUUU GACUGGGGCG GUCGCCUCCU AAAAGGUAAC GGAGGCGCCC AAAGGUCCCC UCAGGCGGGA CGGAAAUC C GCCGGAGAGC GCAAGGGUAG AAGGGGGCCU GACUGCGAGG CCUGCAAGCC GAGCAGGGGC GAAAGCCGGG CCUAGUGAA CCGGUGGUCC CGUGUGGAAG GGCCAUCGAU CAACGGAUAA AAGUUACCCC GGGGAUAACA GGCUGAUCUC CCCCGAGCGU CCACAGCGG CGGGGAGGUU UGGCACCUCG AUGUCGGCUC GUCGCAUCCU GGGGCUGAAG AAGGUCCCAA GGGUUGGGCU G UUCGCCCA UUAAAGCGGC ACGCGAGCUG GGUUCAGAAC GUCGUGAGAC AGUUCGGUCU CUAUCCGCCA CGGGCGCAGG AG GCUUGAG GGGGGCUCUU CCUAGUACGA GAGGACCGGA AGGGACGCAC CUCUGGUUUC CCAGCUGUCC CUCCAGGGGC AUA AGCUGG GUAGCCAUGU GCGGAAGGGA UAACCGCUGA AAGCAUCUAA GCGGGAAGCC CGCCCCAAGA UGAGGCCUCC CACG GCGUC AAGCCGGUAA GGACCCGGGA AGACCACCCG GUGGAUGGGC CGGGGGUGUA AGCGCCGCGA GGCGUUGAGC CGACC GGUC CCAAUCGUCC GAGGUCU

GENBANK: GENBANK: AP008226.1

+
分子 #5: 5S Ribosomal RNA

分子名称: 5S Ribosomal RNA / タイプ: rna / ID: 5 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Thermus thermophilus (strain HB8 / ATCC 27634 / DSM 579) (バクテリア)
分子量理論値: 38.553 KDa
配列文字列:
UCCCCCGUGC CCAUAGCGGC GUGGAACCAC CCGUUCCCAU UCCGAACACG GAAGUGAAAC GCGCCAGCGC CGAUGGUACU GGGCGGGCG ACCGCCUGGG AGAGUAGGUC GGUGCGGGGG

GENBANK: GENBANK: AP008226.1

+
分子 #6: 50S ribosomal protein L25

分子名称: 50S ribosomal protein L25 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 6 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Thermus thermophilus (strain HB8 / ATCC 27634 / DSM 579) (バクテリア)
分子量理論値: 20.10715 KDa
配列文字列:
YRLKAYYREG EKPSALRRAG KLPGVMYNRH LNRKVYVDLV EFDKVFRQAS IHHVIVLELP DGQSLPTLVR QVNLDKRRRR PEHVDFFVL SDEPVEMYVP LRFVGTPAGV RAGGVLQEIH RDILVKVSPR NIPEFIEVDV SGLEIGDSLH ASDLKLPPGV E LAVSPEET IAAVVPPEDV

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein bL25

+
分子 #7: 50S ribosomal protein L9

分子名称: 50S ribosomal protein L9 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 7 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Thermus thermophilus (strain HB8 / ATCC 27634 / DSM 579) (バクテリア)
分子量理論値: 16.164937 KDa
配列文字列:
MKVILLEPLE NLGDVGQVVD VKPGYARNYL LPRGLAVLAT ESNLKALEAR IRAQAKRLAE RKAEAERLKE ILENLTLTIP VRAGETKIY GSVTAKDIAE ALSRQHGVTI DPKRLALEKP IKELGEYVLT YKPHPEVPIQ LKVSVVA

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein bL9

+
分子 #8: 30S ribosomal protein S2

分子名称: 30S ribosomal protein S2 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 8 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Thermus thermophilus (strain HB8 / ATCC 27634 / DSM 579) (バクテリア)
分子量理論値: 27.116385 KDa
配列文字列: VKELLEAGVH FGHERKRWNP KFARYIYAER NGIHIIDLQK TMEELERTFR FIEDLAMRGG TILFVGTKKQ AQDIVRMEAE RAGMPYVNQ RWLGGMLTNF KTISQRVHRL EELEALFASP EIEERPKKEQ VRLKHELERL QKYLSGFRLL KRLPDAIFVV D PTKEAIAV ...文字列:
VKELLEAGVH FGHERKRWNP KFARYIYAER NGIHIIDLQK TMEELERTFR FIEDLAMRGG TILFVGTKKQ AQDIVRMEAE RAGMPYVNQ RWLGGMLTNF KTISQRVHRL EELEALFASP EIEERPKKEQ VRLKHELERL QKYLSGFRLL KRLPDAIFVV D PTKEAIAV REARKLFIPV IALADTDSDP DLVDYIIPGN DDAIRSIQLI LSRAVDLIIQ ARGGVVEPSP SYALVQE

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS2

+
分子 #9: 30S ribosomal protein S3

分子名称: 30S ribosomal protein S3 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 9 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Thermus thermophilus (strain HB8 / ATCC 27634 / DSM 579) (バクテリア)
分子量理論値: 22.975588 KDa
配列文字列: GNKIHPIGFR LGITRDWESR WYAGKKQYRH LLLEDQRIRG LLEKELYSAG LARVDIERAA DNVAVTVHVA KPGVVIGRGG ERIRVLREE LAKLTGKNVA LNVQEVQNPN LSAPLVAQRV AEQIERRFAV RRAIKQAVQR VMESGAKGAK VIVSGRIGGA E QARTEWAA ...文字列:
GNKIHPIGFR LGITRDWESR WYAGKKQYRH LLLEDQRIRG LLEKELYSAG LARVDIERAA DNVAVTVHVA KPGVVIGRGG ERIRVLREE LAKLTGKNVA LNVQEVQNPN LSAPLVAQRV AEQIERRFAV RRAIKQAVQR VMESGAKGAK VIVSGRIGGA E QARTEWAA QGRVPLHTLR ANIDYGFALA RTTYGVLGVK AYIFLGEVI

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS3

+
分子 #10: 30S ribosomal protein S4

分子名称: 30S ribosomal protein S4 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 10 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Thermus thermophilus (strain HB8 / ATCC 27634 / DSM 579) (バクテリア)
分子量理論値: 24.242254 KDa
配列文字列: GRYIGPVCRL CRREGVKLYL KGERCYSPKC AMERRPYPPG QHGQKRARRP SDYAVRLREK QKLRRIYGIS ERQFRNLFEE ASKKKGVTG SVFLGLLESR LDNVVYRLGF AVSRRQARQL VRHGHITVNG RRVDLPSYRV RPGDEIAVAE KSRNLELIRQ N LEAMKGRK ...文字列:
GRYIGPVCRL CRREGVKLYL KGERCYSPKC AMERRPYPPG QHGQKRARRP SDYAVRLREK QKLRRIYGIS ERQFRNLFEE ASKKKGVTG SVFLGLLESR LDNVVYRLGF AVSRRQARQL VRHGHITVNG RRVDLPSYRV RPGDEIAVAE KSRNLELIRQ N LEAMKGRK VGPWLSLDVE GMKGKFLRLP DREDLALPVN EQLVIEFYSR

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS4

+
分子 #11: 30S ribosomal protein S5

分子名称: 30S ribosomal protein S5 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 11 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Thermus thermophilus (strain HB8 / ATCC 27634 / DSM 579) (バクテリア)
分子量理論値: 16.460193 KDa
配列文字列:
DFEEKMILIR RTARMQAGGR RFRFGALVVV GDRQGRVGLG FGKAPEVPLA VQKAGYYARR NMVEVPLQNG TIPHEIEVEF GASKIVLKP AAPGTGVIAG AVPRAILELA GVTDILTKEL GSRNPINIAY ATMEALRQLR TKADVERLRK GE

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS5

+
分子 #12: 30S ribosomal protein S6

分子名称: 30S ribosomal protein S6 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 12 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Thermus thermophilus (strain HB8 / ATCC 27634 / DSM 579) (バクテリア)
分子量理論値: 11.988753 KDa
配列文字列:
MRRYEVNIVL NPNLDQSQLA LEKEIIQRAL ENYGARVEKV EELGLRRLAY PIAKDPQGYF LWYQVEMPED RVNDLARELR IRDNVRRVM VVKSQEPFLA NA

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein bS6

+
分子 #13: 30S ribosomal protein S7

分子名称: 30S ribosomal protein S7 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 13 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Thermus thermophilus (strain HB8 / ATCC 27634 / DSM 579) (バクテリア)
分子量理論値: 17.919775 KDa
配列文字列:
ARRRRAEVRQ LQPDLVYGDV LVTAFINKIM RDGKKNLAAR IFYDACKIIQ EKTGQEPLKV FKQAVENVKP RMEVRSRRVG GANYQVPME VSPRRQQSLA LRWLVQAANQ RPERRAAVRI AHELMDAAEG KGGAVKKKED VERMAEANRA YAHYRW

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS7

+
分子 #14: 30S ribosomal protein S8

分子名称: 30S ribosomal protein S8 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 14 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Thermus thermophilus (strain HB8 / ATCC 27634 / DSM 579) (バクテリア)
分子量理論値: 15.86857 KDa
配列文字列:
MLTDPIADML TRIRNATRVY KESTDVPASR FKEEILRILA REGFIKGYER VDVDGKPYLR VYLKYGPRRQ GPDPRPEQVI HHIRRISKP GRRVYVGVKE IPRVRRGLGI AILSTSKGVL TDREARKLGV GGELICEVW

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS8

+
分子 #15: 30S ribosomal protein S9

分子名称: 30S ribosomal protein S9 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 15 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Thermus thermophilus (strain HB8 / ATCC 27634 / DSM 579) (バクテリア)
分子量理論値: 14.279419 KDa
配列文字列:
EQYYGTGRRK EAVARVFLRP GNGKVTVNGQ DFNEYFQGLV RAVAALEPLR AVDALGHFDA YITVRGGGKS GQIDAIKLGI ARALVQYNP DYRAKLKPLG FLTRDARVVE RKKYGKHKAR RAPQYSKR

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS9

+
分子 #16: 30S ribosomal protein S10

分子名称: 30S ribosomal protein S10 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 16 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Thermus thermophilus (strain HB8 / ATCC 27634 / DSM 579) (バクテリア)
分子量理論値: 11.398308 KDa
配列文字列:
KIRIKLRGFD HKTLDASAQK IVEAARRSGA QVSGPIPLPT RVRRFTVIRG PFKHKDSREH FELRTHNRLV DIINPNRKTI EQLMTLDLP TGVEIEIKTV

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS10

+
分子 #17: 30S ribosomal protein S11

分子名称: 30S ribosomal protein S11 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 17 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Thermus thermophilus (strain HB8 / ATCC 27634 / DSM 579) (バクテリア)
分子量理論値: 12.606369 KDa
配列文字列:
KRQVASGRAY IHASYNNTIV TITDPDGNPI TWSSGGVIGY KGSRKGTPYA AQLAALDAAK KAMAYGMQSV DVIVRGTGAG REQAIRALQ ASGLQVKSIV DDTPVPHNGC RPKKKFRKAS

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS11

+
分子 #18: 30S ribosomal protein S12

分子名称: 30S ribosomal protein S12 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 18 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Thermus thermophilus (strain HB8 / ATCC 27634 / DSM 579) (バクテリア)
分子量理論値: 13.875388 KDa
配列文字列:
PTINQLVRKG REKVRKKSKV PALKGAPFRR GVCTVVRTVT PKKPNSALRK VAKVRLTSGY EVTAYIPGEG HNLQEHSVVL IRGGRVKDL PGVRYHIVRG VYDAAGVKDR KKSRSKYGTK KPKEAA

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS12

+
分子 #19: 30S ribosomal protein S13

分子名称: 30S ribosomal protein S13 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 19 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Thermus thermophilus (strain HB8 / ATCC 27634 / DSM 579) (バクテリア)
分子量理論値: 13.494739 KDa
配列文字列:
ARIAGVEIPR NKRVDVALTY IYGIGKARAK EALEKTGINP ATRVKDLTEA EVVRLREYVE NTWKLEGELR AEVAANIKRL MDIGCYRGL RHRRGLPVRG QRTRTNARTR KGPRKTVAGK

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS13

+
分子 #20: 30S ribosomal protein S14 type Z

分子名称: 30S ribosomal protein S14 type Z / タイプ: protein_or_peptide / ID: 20 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Thermus thermophilus (strain HB8 / ATCC 27634 / DSM 579) (バクテリア)
分子量理論値: 7.027529 KDa
配列文字列:
ARKALIEKAK RTPKFKVRAY TRCVRCGRAR SVYRFFGLCR ICLRELAHKG QLPGVRKASW

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS14

+
分子 #21: 30S ribosomal protein S15

分子名称: 30S ribosomal protein S15 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 21 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Thermus thermophilus (strain HB8 / ATCC 27634 / DSM 579) (バクテリア)
分子量理論値: 10.447213 KDa
配列文字列:
PITKEEKQKV IQEFARFPGD TGSTEVQVAL LTLRINRLSE HLKVHKKDHH SHRGLLMMVG QRRRLLRYLQ REDPERYRAL IEKLGIRG

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS15

+
分子 #22: 30S ribosomal protein S16

分子名称: 30S ribosomal protein S16 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 22 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Thermus thermophilus (strain HB8 / ATCC 27634 / DSM 579) (バクテリア)
分子量理論値: 9.995546 KDa
配列文字列:
MVKIRLARFG SKHNPHYRIV VTDARRKRDG KYIEKIGYYD PRKTTPDWLK VDVERARYWL SVGAQPTDTA RRLLRQAGVF RQEA

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein bS16

+
分子 #23: 30S ribosomal protein S17

分子名称: 30S ribosomal protein S17 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 23 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Thermus thermophilus (strain HB8 / ATCC 27634 / DSM 579) (バクテリア)
分子量理論値: 11.880098 KDa
配列文字列:
PKKVLTGVVV SDKMQKTVTV LVERQFPHPL YGKVIKRSKK YLAHDPEEKY KLGDVVEIIE SRPISKRKRF RVLRLVESGR MDLVEKYLI RRQNYESLSK R

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS17

+
分子 #24: 30S ribosomal protein S18

分子名称: 30S ribosomal protein S18 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 24 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Thermus thermophilus (strain HB8 / ATCC 27634 / DSM 579) (バクテリア)
分子量理論値: 8.155812 KDa
配列文字列:
KAKVKATLGE FDLRDYRNVE VLKRFLSETG KILPRRRTGL SAKEQRILAK TIKRARILGL LPFTEKLVRK

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein bS18

+
分子 #25: 30S ribosomal protein S19

分子名称: 30S ribosomal protein S19 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 25 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Thermus thermophilus (strain HB8 / ATCC 27634 / DSM 579) (バクテリア)
分子量理論値: 9.961599 KDa
配列文字列:
SLKKGVFVDD HLLEKVLELN AKGEKRLIKT WSRRSTIVPE MVGHTIAVYN GKQHVPVYIT ENMVGHKLGE FAPTRTYRGH GKEAKATK

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS19

+
分子 #26: 30S ribosomal protein S20

分子名称: 30S ribosomal protein S20 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 26 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Thermus thermophilus (strain HB8 / ATCC 27634 / DSM 579) (バクテリア)
分子量理論値: 10.921086 KDa
配列文字列:
RNLSALKRHR QSLKRRLRNK AKKSAIKTLS KKAIQLAQEG KAEEALKIMR KAESLIDKAA KGSTLHKNAA ARRKSRLMRK VRQLLEAAG APLIGGGLSA

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein bS20

+
分子 #27: 30S ribosomal protein Thx

分子名称: 30S ribosomal protein Thx / タイプ: protein_or_peptide / ID: 27 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Thermus thermophilus (strain HB8 / ATCC 27634 / DSM 579) (バクテリア)
分子量理論値: 3.089655 KDa
配列文字列:
GKGDRRTRRG KIWRGTYGKY RPRKK

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein bTHX

+
分子 #28: Elongation factor G

分子名称: Elongation factor G / タイプ: protein_or_peptide / ID: 28 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Thermus thermophilus (strain HB8 / ATCC 27634 / DSM 579) (バクテリア)
株: HB8 / ATCC 27634 / DSM 579
分子量理論値: 76.54757 KDa
組換発現生物種: Escherichia coli BL21(DE3) (大腸菌)
配列文字列: KVEYDLKRLR NIGIAAHIDA GKTTTTERIL YYTGRIHKIG EVHEGAATMD FMEQERERGI TITAAVTTCF WKDHRINIID TPGHVDFTI EVERSMRVLD GAIVVFDSSQ GVEPQSETVW RQAEKYKVPR IAFANKMDKT GADLWLVIRT MQERLGARPV V MQLPIGRE ...文字列:
KVEYDLKRLR NIGIAAHIDA GKTTTTERIL YYTGRIHKIG EVHEGAATMD FMEQERERGI TITAAVTTCF WKDHRINIID TPGHVDFTI EVERSMRVLD GAIVVFDSSQ GVEPQSETVW RQAEKYKVPR IAFANKMDKT GADLWLVIRT MQERLGARPV V MQLPIGRE DTFSGIIDVL RMKAYTYGND LGTDIREIPI PEEYLDQARE YHEKLVEVAA DFDENIMLKY LEGEEPTEEE LV AAIRKGT IDLKITPVFL GSALKNKGVQ LLLDAVVDYL PSPLDIPPIK GTTPEGEVVE IHPDPNGPLA ALAFKIMADP YVG RLTFIR VYSGTLTSGS YVYNTTKGRK ERVARLLRMH ANHREEVEEL KAGDLGAVVG LKETITGDTL VGEDAPRVIL ESIE VPEPV IDVAIEPKTK ADQEKLSQAL ARLAEEDPTF RVSTHPETGQ TIISGMGELH LEIIVDRLKR EFKVDANVGK PQVAY RETI TKPVDVEGKF IRQTGGRGQY GHVKIKVEPL PRGSGFEFVN AIVGGVIPKE YIPAVQKGIE EAMQSGPLIG FPVVDI KVT LYDGSYHEVD SSEMAFKIAG SMAIKEAVQK GDPVILEPIM RVEVTTPEEY MGDVIGDLNA RRGQILGMEP RGNAQVI RA FVPLAEMFGY ATDLRSKTQG RGSFVMFFDH YQEVPKQVQE KLIKG

UniProtKB: Elongation factor G

+
分子 #29: 50S ribosomal protein L27

分子名称: 50S ribosomal protein L27 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 29 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Thermus thermophilus (strain HB8 / ATCC 27634 / DSM 579) (バクテリア)
分子量理論値: 8.760084 KDa
配列文字列:
GSTRNGRDSQ AKRLGVKRYE GQVVRAGNIL VRQRGTRFKP GKNVGMGRDF TLFALVDGVV EFQDRGRLGR YVHVRPLA

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein bL27

+
分子 #30: 50S ribosomal protein L28

分子名称: 50S ribosomal protein L28 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 30 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Thermus thermophilus (strain HB8 / ATCC 27634 / DSM 579) (バクテリア)
分子量理論値: 10.559571 KDa
配列文字列:
KVCEISGKRP IVANSIQRRG KAKREGGVGK KTTGISKRRQ YPNLQKVRVR VAGQEITFRV AASHIPKVYE LVERAKGLKL EGLSPKEIK KELLK

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein bL28

+
分子 #31: 50S ribosomal protein L29

分子名称: 50S ribosomal protein L29 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 31 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Thermus thermophilus (strain HB8 / ATCC 27634 / DSM 579) (バクテリア)
分子量理論値: 8.539062 KDa
配列文字列:
KLSEVRKQLE EARKLSPVEL EKLVREKKRE LMELRFQASI GQLSQNHKIR DLKRQIARLL TVLNEKRRQN A

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL29

+
分子 #32: 50S ribosomal protein L30

分子名称: 50S ribosomal protein L30 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 32 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Thermus thermophilus (strain HB8 / ATCC 27634 / DSM 579) (バクテリア)
分子量理論値: 6.799126 KDa
配列文字列:
MPRLKVKLVK SPIGYPKDQK AALKALGLRR LQQERVLEDT PAIRGNVEKV AHLVRVEVVE

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL30

+
分子 #33: 50S ribosomal protein L31

分子名称: 50S ribosomal protein L31 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 33 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Thermus thermophilus (strain HB8 / ATCC 27634 / DSM 579) (バクテリア)
分子量理論値: 8.300543 KDa
配列文字列:
MKEGIHPKLV PARIICGCGN VIETYSTKPE IYVEVCSKCH PFYTGQQRFV DTEGRVERFQ RRYGDSYRKG R

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein bL31

+
分子 #34: 50S ribosomal protein L32

分子名称: 50S ribosomal protein L32 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 34 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Thermus thermophilus (strain HB8 / ATCC 27634 / DSM 579) (バクテリア)
分子量理論値: 6.590854 KDa
配列文字列:
AKHPVPKKKT SKARRDARRS HHALTPPTLV PCPECKAMKP PHTVCPECGY YAGRKVLEV

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein bL32

+
分子 #35: 50S ribosomal protein L33

分子名称: 50S ribosomal protein L33 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 35 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Thermus thermophilus (strain HB8 / ATCC 27634 / DSM 579) (バクテリア)
分子量理論値: 6.214431 KDa
配列文字列:
VRIKLLLECT ECKRRNYATE KNKRNTPNKL ELRKYCPWCR KHTVHREVKI

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein bL33

+
分子 #36: 50S ribosomal protein L34

分子名称: 50S ribosomal protein L34 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 36 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Thermus thermophilus (strain HB8 / ATCC 27634 / DSM 579) (バクテリア)
分子量理論値: 5.975255 KDa
配列文字列:
MKRTWQPNRR KRAKTHGFRA RMRTPGGRKV LKRRRQKGRW RLTPAVRK

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein bL34

+
分子 #37: 50S ribosomal protein L35

分子名称: 50S ribosomal protein L35 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 37 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Thermus thermophilus (strain HB8 / ATCC 27634 / DSM 579) (バクテリア)
分子量理論値: 7.374981 KDa
配列文字列:
PKMKTHKGAK KRVKITASGK VVAMKTGKRH LNWQKSGKEI RQKGRKFVLA KPEAERIKLL LPYE

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein bL35

+
分子 #38: 50S ribosomal protein L36

分子名称: 50S ribosomal protein L36 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 38 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Thermus thermophilus (strain HB8 / ATCC 27634 / DSM 579) (バクテリア)
分子量理論値: 4.435411 KDa
配列文字列:
MKVRASVKRI CDKCKVIRRH GRVYVICENP KHKQRQG

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein bL36

+
分子 #39: 50S ribosomal protein L1

分子名称: 50S ribosomal protein L1 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 39 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Thermus thermophilus (strain HB8 / ATCC 27634 / DSM 579) (バクテリア)
分子量理論値: 24.644408 KDa
配列文字列: KHGKRYRALL EKVDPNKVYT IDEAARLVKE LATAKFDETV EVHAKLGIDP RRSDQNVRGT VSLPHGLGKQ VRVLAIAKGE KIKEAEEAG ADYVGGEEII QKILDGWMDF DAVVATPDVM GAVGSKLGRI LGPRGLLPNP KAGTVGFNIG EIIREIKAGR I EFRNDKTG ...文字列:
KHGKRYRALL EKVDPNKVYT IDEAARLVKE LATAKFDETV EVHAKLGIDP RRSDQNVRGT VSLPHGLGKQ VRVLAIAKGE KIKEAEEAG ADYVGGEEII QKILDGWMDF DAVVATPDVM GAVGSKLGRI LGPRGLLPNP KAGTVGFNIG EIIREIKAGR I EFRNDKTG AIHAPVGKAS FPPEKLADNI RAFIRALEAH KPEGAKGTFL RSVYVTTTMG PSVRINPHS

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL1

+
分子 #40: 50S ribosomal protein L2

分子名称: 50S ribosomal protein L2 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 40 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Thermus thermophilus (strain HB8 / ATCC 27634 / DSM 579) (バクテリア)
分子量理論値: 30.401355 KDa
配列文字列: AVKKFKPYTP SRRFMTVADF SEITKTEPEK SLVKPLKKTG GRNNQGRITV RFRGGGHKRL YRIIDFKRWD KVGIPAKVAA IEYDPNRSA RIALLHYVDG EKRYIIAPDG LQVGQQVVAG PDAPIQVGNA LPLRFIPVGT VVHAVELEPK KGAKLARAAG T SAQIQGRE ...文字列:
AVKKFKPYTP SRRFMTVADF SEITKTEPEK SLVKPLKKTG GRNNQGRITV RFRGGGHKRL YRIIDFKRWD KVGIPAKVAA IEYDPNRSA RIALLHYVDG EKRYIIAPDG LQVGQQVVAG PDAPIQVGNA LPLRFIPVGT VVHAVELEPK KGAKLARAAG T SAQIQGRE GDYVILRLPS GELRKVHGEC YATVGAVGNA DHKNIVLGKA GRSRWLGRRP HVRGAAMNPV DHPHGGGEGR AP RGRPPAS PWGWQTKGLK TRKRRKPSSR FIIARRKK

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL2

+
分子 #41: 50S ribosomal protein L3

分子名称: 50S ribosomal protein L3 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 41 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Thermus thermophilus (strain HB8 / ATCC 27634 / DSM 579) (バクテリア)
分子量理論値: 22.321031 KDa
配列文字列: MKGILGVKVG MTRIFRDDRA VPVTVILAGP CPVVQRRTPE KDGYTAVQLG FLPQNPKRVN RPLKGHFAKA GVEPVRILRE IRDFNPEGD TVTVEIFKPG ERVDVTGTSK GRGFAGVMKR WNFAGGPDSH GAHKIHRHPG SIGNRKTPGR VYKGKKMAGH Y GAERVTVM ...文字列:
MKGILGVKVG MTRIFRDDRA VPVTVILAGP CPVVQRRTPE KDGYTAVQLG FLPQNPKRVN RPLKGHFAKA GVEPVRILRE IRDFNPEGD TVTVEIFKPG ERVDVTGTSK GRGFAGVMKR WNFAGGPDSH GAHKIHRHPG SIGNRKTPGR VYKGKKMAGH Y GAERVTVM NLEVVDVIPE ENLLLVKGAV PGPNGGLVIV RETKKAA

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL3

+
分子 #42: 50S ribosomal protein L4

分子名称: 50S ribosomal protein L4 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 42 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Thermus thermophilus (strain HB8 / ATCC 27634 / DSM 579) (バクテリア)
分子量理論値: 23.071721 KDa
配列文字列: MKEVAVYQIP VLSPSGRREL AADLPAEINP HLLWEVVRWQ LAKRRRGTAS TKTRGEVAYS GRKIWPQKHT GRARHGDIGA PIFVGGGVV FGPKPRDYSY TLPKKVRKKG LAMAVADRAR EGKLLLVEAF AGVNGKTKEF LAWAKEAGLD GSESVLLVTG N ELVRRAAR ...文字列:
MKEVAVYQIP VLSPSGRREL AADLPAEINP HLLWEVVRWQ LAKRRRGTAS TKTRGEVAYS GRKIWPQKHT GRARHGDIGA PIFVGGGVV FGPKPRDYSY TLPKKVRKKG LAMAVADRAR EGKLLLVEAF AGVNGKTKEF LAWAKEAGLD GSESVLLVTG N ELVRRAAR NLPWVVTLAP EGLNVYDIVR TERLVMDLDA WEVFQNRIGG

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL4

+
分子 #43: 50S ribosomal protein L5

分子名称: 50S ribosomal protein L5 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 43 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Thermus thermophilus (strain HB8 / ATCC 27634 / DSM 579) (バクテリア)
分子量理論値: 20.720127 KDa
配列文字列:
DVALKRKYYE EVRPELIRRF GYQNVWEVPR LEKVVINQGL GEAKEDARIL EKAAQELALI TGQKPAVTRA KKSISNFKLR KGMPIGLRV TLRRDRMWIF LEKLLNVALP RIRDFRGLNP NSFDGRGNYN LGLREQLIFP EITYDMVDAL RGMDIAVVTT A ETDEEARA LLELLGFPFR K

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL5

+
分子 #44: 50S ribosomal protein L6

分子名称: 50S ribosomal protein L6 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 44 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Thermus thermophilus (strain HB8 / ATCC 27634 / DSM 579) (バクテリア)
分子量理論値: 19.182436 KDa
配列文字列:
MSRIGRLPIP VPKGVSVEVA PGRVKVKGPK GELEVPVSPE MRVVVEEGVV RVERPSDERR HKSLHGLTRT LIANAVKGVS EGYSKELLI KGIGYRARLV GRALELTVGF SHPVVVEPPE GITFEVPEPT RVRVSGIDKQ KVGQVAANIR AIRKPSAYHE K GIYYAGEP VRLKPGKA

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL6

+
分子 #45: Ribosomal protein uL10

分子名称: Ribosomal protein uL10 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 45 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Thermus thermophilus (strain HB8 / ATCC 27634 / DSM 579) (バクテリア)
分子量理論値: 11.109704 KDa
配列文字列: (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK) ...文字列:
(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)L(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)

+
分子 #46: Ribosomal protein uL11

分子名称: Ribosomal protein uL11 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 46 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Thermus thermophilus (strain HB8 / ATCC 27634 / DSM 579) (バクテリア)
分子量理論値: 11.932701 KDa
配列文字列: (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK) ...文字列:
(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)

+
分子 #47: Ribosomal protein bL12

分子名称: Ribosomal protein bL12 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 47 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Thermus thermophilus (strain HB8 / ATCC 27634 / DSM 579) (バクテリア)
分子量理論値: 6.060462 KDa
配列文字列: (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK) ...文字列:
(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)

+
分子 #48: 50S ribosomal protein L13

分子名称: 50S ribosomal protein L13 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 48 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Thermus thermophilus (strain HB8 / ATCC 27634 / DSM 579) (バクテリア)
分子量理論値: 15.828771 KDa
配列文字列:
MKTYVPKQVE PRWVLIDAEG KTLGRLATKI ATLLRGKHRP DWTPNVAMGD FVVVVNADKI RVTGKKLEQK IYTRYSGYPG GLKKIPLEK MLATHPERVL EHAVKGMLPK GPLGRRLFKR LKVYAGPDHP HQAQRPEKLE

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL13

+
分子 #49: 50S ribosomal protein L14

分子名称: 50S ribosomal protein L14 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 49 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Thermus thermophilus (strain HB8 / ATCC 27634 / DSM 579) (バクテリア)
分子量理論値: 13.323612 KDa
配列文字列:
MIQPQTYLEV ADNTGARKIM CIRVLKGSNA KYATVGDVIV ASVKEAIPRG AVKEGDVVKA VVVRTKKEIK RPDGSAIRFD DNAAVIINN QLEPRGTRVF GPVARELREK GFMKIVSLAP EVL

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL14

+
分子 #50: 50S ribosomal protein L15

分子名称: 50S ribosomal protein L15 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 50 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Thermus thermophilus (strain HB8 / ATCC 27634 / DSM 579) (バクテリア)
分子量理論値: 16.319142 KDa
配列文字列:
MKLSDLRPNP GANKRRKRVG RGPGSGHGKT ATRGHKGQKS RSGGLKDPRR FEGGRSTTLM RLPKRGMQGQ VPGEIKRPRY QGVNLKDLA RFEGEVTPEL LVRAGLLKKG YRLKILGEGE AKPLKVVAHA FSKSALEKLK AAGGEPVLLE A

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL15

+
分子 #51: 50S ribosomal protein L16

分子名称: 50S ribosomal protein L16 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 51 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Thermus thermophilus (strain HB8 / ATCC 27634 / DSM 579) (バクテリア)
分子量理論値: 15.993909 KDa
配列文字列:
MLMPRRMKYR KQQRGRLKGA TKGGDYVAFG DYGLVALEPA WITAQQIEAA RVAMVRHFRR GGKIFIRIFP DKPYTKKPLE VRMGKGKGN VEGYVAVVKP GRVMFEVAGV TEEQAMEALR IAGHKLPIKT KIVRRDAYDE AQ

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL16

+
分子 #52: 50S ribosomal protein L17

分子名称: 50S ribosomal protein L17 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 52 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Thermus thermophilus (strain HB8 / ATCC 27634 / DSM 579) (バクテリア)
分子量理論値: 13.750148 KDa
配列文字列:
MRHLKSGRKL NRHSSHRLAL YRNQAKSLLT HGRITTTVPK AKELRGFVDH LIHLAKRGDL HARRLVLRDL QDVKLVRKLF DEIAPRYRD RQGGYTRVLK LAERRRGDGA PLALVELVE

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein bL17

+
分子 #53: 50S ribosomal protein L18

分子名称: 50S ribosomal protein L18 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 53 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Thermus thermophilus (strain HB8 / ATCC 27634 / DSM 579) (バクテリア)
分子量理論値: 10.998918 KDa
配列文字列:
KFRVRNRIKR TGRLRLSVFR SLKHIYAQII DDEKGVTLVS ASSLALKLKG NKTEVARQVG RALAEKALAL GIKQVAFDRG PYKYHGRVK ALAEGAREGG

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL18

+
分子 #54: 50S ribosomal protein L19

分子名称: 50S ribosomal protein L19 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 54 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Thermus thermophilus (strain HB8 / ATCC 27634 / DSM 579) (バクテリア)
分子量理論値: 16.289891 KDa
配列文字列:
MNRGALIKLV ESRYVRTDLP EFRPGDTVRV SYKVKEGNRT RIQDFEGIVI RIRRNGFNTT FTVRKVSYGV GVERIFPLHS PLIQKIDIV QRGRARRAKL YFIRNLSDRE IRRKLRADRK RIDQDRAAER AAKEEAQKA

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein bL19

+
分子 #55: 50S ribosomal protein L20

分子名称: 50S ribosomal protein L20 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 55 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Thermus thermophilus (strain HB8 / ATCC 27634 / DSM 579) (バクテリア)
分子量理論値: 13.648081 KDa
配列文字列:
PRAKTGVVRR RKHKKILKLA KGYWGLRSKS FRKARETLFA AGNYAYAHRK RRKRDFRRLW IVRINAACRQ HGLNYSTFIH GLKKAGIEV DRKNLADLAV REPQVFAELV ERAKAAQG

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein bL20

+
分子 #56: 50S ribosomal protein L21

分子名称: 50S ribosomal protein L21 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 56 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Thermus thermophilus (strain HB8 / ATCC 27634 / DSM 579) (バクテリア)
分子量理論値: 11.069153 KDa
配列文字列:
MFAIVKTGGK QYRVEPGLKL RVEKLDAEPG ATVELPVLLL GGEKTVVGTP VVEGASVVAE VLGHGRGKKI LVSKFKAKVQ YRRKKGHRQ PYTELLIKEI RG

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein bL21

+
分子 #57: 50S ribosomal protein L22

分子名称: 50S ribosomal protein L22 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 57 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Thermus thermophilus (strain HB8 / ATCC 27634 / DSM 579) (バクテリア)
分子量理論値: 12.808055 KDa
配列文字列:
MEAKAIARYV RISPRKVRLV VDLIRGKSLE EARNILRYTN KRGAYFVAKV LESAAANAVN NHDMLEDRLY VKAAYVDEGP ALKRVLPRA RGRADIIKKR TSHITVILGE KHGK

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL22

+
分子 #58: 50S ribosomal protein L23

分子名称: 50S ribosomal protein L23 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 58 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Thermus thermophilus (strain HB8 / ATCC 27634 / DSM 579) (バクテリア)
分子量理論値: 10.386274 KDa
配列文字列:
TAYDVILAPV LSEKAYAGFA EGKYTFWVHP KATKTEIKNA VETAFKVKVV KVNTLHVRGK KKRLGRYLGK RPDRKKAIVQ VAPGQKIEA LEGL

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL23

+
分子 #59: 50S ribosomal protein L24

分子名称: 50S ribosomal protein L24 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 59 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Thermus thermophilus (strain HB8 / ATCC 27634 / DSM 579) (バクテリア)
分子量理論値: 11.181658 KDa
配列文字列:
RVKMHVKKGD TVLVASGKYK GRVGKVKEVL PKKYAVIVEG VNIVKKAVRV SPKYPQGGFI EKEAPLHASK VRPICPACGK PTRVRKKFL ENGKKIRVCA KC

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL24

+
分子 #60: MAGNESIUM ION

分子名称: MAGNESIUM ION / タイプ: ligand / ID: 60 / コピー数: 462 / 式: MG
分子量理論値: 24.305 Da

+
分子 #61: ZINC ION

分子名称: ZINC ION / タイプ: ligand / ID: 61 / コピー数: 3 / 式: ZN
分子量理論値: 65.409 Da

+
分子 #62: GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE

分子名称: GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE / タイプ: ligand / ID: 62 / コピー数: 1 / 式: GDP
分子量理論値: 443.201 Da
Chemical component information

ChemComp-GDP:
GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE / GDP / GDP, エネルギー貯蔵分子*YM

-
実験情報

-
構造解析

手法クライオ電子顕微鏡法
解析単粒子再構成法
試料の集合状態particle

-
試料調製

緩衝液pH: 7.5
構成要素:
濃度名称式
5.0 mMHEPES-KOH (pH 7.5)
10.0 mMAmmonium chlorideNH4CL
10.0 mMMgOAc
50.0 mMpotassium chlorideKCl
0.1 mMEthylenediaminetetraacetic acid (EDTA)C10H16N2O8
6.0 mMBeta-mercaptoethanol
グリッドモデル: Quantifoil R2/2 / 材質: COPPER / メッシュ: 300 / 支持フィルム - 材質: CARBON / 支持フィルム - トポロジー: HOLEY / 前処理 - タイプ: GLOW DISCHARGE / 前処理 - 時間: 20 sec. / 前処理 - 雰囲気: AIR / 前処理 - 気圧: 0.04 kPa
凍結凍結剤: ETHANE / チャンバー内湿度: 100 % / チャンバー内温度: 303 K / 装置: FEI VITROBOT MARK II

-
電子顕微鏡法

顕微鏡FEI TITAN KRIOS
特殊光学系球面収差補正装置: CS-corrected
撮影フィルム・検出器のモデル: FEI FALCON II (4k x 4k)
デジタル化 - 画像ごとのフレーム数: 1-7 / 撮影したグリッド数: 1 / 実像数: 949 / 平均露光時間: 1.0 sec. / 平均電子線量: 45.0 e/Å2
電子線加速電圧: 300 kV / 電子線源: FIELD EMISSION GUN
電子光学系C2レンズ絞り径: 100.0 µm / 最大 デフォーカス（補正後）: 2.7 µm / 最小 デフォーカス（補正後）: 0.4 µm / 倍率（補正後）: 120443 / 照射モード: FLOOD BEAM / 撮影モード: BRIGHT FIELD / Cs: 0.0023 mm / 最大 デフォーカス（公称値）: 3.0 µm / 最小 デフォーカス（公称値）: 1.5 µm / 倍率（公称値）: 59000
試料ステージ試料ホルダーモデル: FEI TITAN KRIOS AUTOGRID HOLDER
ホルダー冷却材: NITROGEN
実験機器
モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company

+
画像解析

粒子像選択選択した数: 96509
初期モデルモデルのタイプ: PDB ENTRY
PDBモデル - PDB ID:

4v5f


詳細: filtered at 60A
最終 再構成使用したクラス数: 1 / 想定した対称性 - 点群: C1 (非対称) / アルゴリズム: BACK PROJECTION / 解像度のタイプ: BY AUTHOR / 解像度: 3.8 Å / 解像度の算出法: FSC 0.143 CUT-OFF / ソフトウェア - 名称: RELION (ver. 1.4)
詳細: Resolution : 5.36 Resolution (masked and sharpened) : 3.8
使用した粒子像数: 32383
初期 角度割当タイプ: ANGULAR RECONSTITUTION / ソフトウェア - 名称: RELION (ver. 1.4)
最終 角度割当タイプ: ANGULAR RECONSTITUTION / ソフトウェア - 名称: RELION (ver. 1.4)
最終 3次元分類クラス数: 4 / ソフトウェア - 名称: RELION (ver. 1.4)
FSC曲線 (解像度の算出)

-
原子モデル構築 1

詳細each ribosomal rna and protein was first rigid body fitted in the map using UCSF chimera. The missing componant (mRNA and bL9) were then added and fitted. the quality of the fitting was then assesed and adjust manually, residue per residue using coot. the RNA confomation were ajusted with the ERRASER modul (in Phenix). The final model was refined using phenix real space refinement procedure.
精密化空間: REAL / プロトコル: RIGID BODY FIT
当てはまり具合の基準: Cross-correlation coefficient
得られたモデル

PDB-5ot7:
Elongation factor G-ribosome complex captures in the absence of inhibitors.

+
万見について

-
お知らせ

-
2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

-
2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

+
2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

+
2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

-
万見 (Yorodumi)

幾万の構造データを、幾万の視点から

  • 万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
  • EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

他の情報も見る