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基本情報
登録情報 | ![]() | |||||||||
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タイトル | CryoEM map of LonC protease open hexamer with Bortezomib | |||||||||
![]() | CryoEM of map of LonC open hexamer with Bortezomib | |||||||||
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![]() | Lon proteases / chaperone / open hexamer / inhibitor | |||||||||
生物種 | ![]() | |||||||||
手法 | 単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 4.5 Å | |||||||||
![]() | Li M / Hsieh K / Liu H / Zhang S / Gao Y / Gong Q / Zhang K / Chang C / Li S | |||||||||
資金援助 | ![]()
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![]() | ![]() タイトル: Bifurcated assembly pathway and dual function of a Lon-like protease revealed by cryo-EM Analysis 著者: Li M / Liu H / Hsieh KY / Zhang S / Gao Y / Gong Q / Zhang K / Chang CI / Li S | |||||||||
履歴 |
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構造の表示
添付画像 |
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ダウンロードとリンク
-EMDBアーカイブ
マップデータ | ![]() | 136.7 MB | ![]() | |
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ヘッダ (付随情報) | ![]() ![]() | 15.8 KB 15.8 KB | 表示 表示 | ![]() |
画像 | ![]() | 25.7 KB | ||
Filedesc metadata | ![]() | 5 KB | ||
その他 | ![]() ![]() ![]() | 71.2 MB 134.5 MB 134.5 MB | ||
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 1.1 MB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 1.1 MB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 14.4 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 17 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
EMDBのページ | ![]() ![]() |
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マップ
ファイル | ![]() | ||||||||||||||||||||
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注釈 | CryoEM of map of LonC open hexamer with Bortezomib | ||||||||||||||||||||
ボクセルのサイズ | X=Y=Z: 0.82 Å | ||||||||||||||||||||
密度 |
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対称性 | 空間群: 1 | ||||||||||||||||||||
詳細 | EMDB XML:
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-添付データ
-追加マップ: CryoEM of map of LonC open hexamer with Bortezomib
ファイル | emd_36978_additional_1.map | ||||||||||||
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注釈 | CryoEM of map of LonC open hexamer with Bortezomib | ||||||||||||
投影像・断面図 |
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密度ヒストグラム |
-ハーフマップ: CryoEM of map of LonC open hexamer with Bortezomib
ファイル | emd_36978_half_map_1.map | ||||||||||||
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注釈 | CryoEM of map of LonC open hexamer with Bortezomib | ||||||||||||
投影像・断面図 |
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密度ヒストグラム |
-ハーフマップ: CryoEM of map of LonC open hexamer with Bortezomib
ファイル | emd_36978_half_map_2.map | ||||||||||||
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注釈 | CryoEM of map of LonC open hexamer with Bortezomib | ||||||||||||
投影像・断面図 |
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密度ヒストグラム |
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試料の構成要素
-全体 : CryoEM structure of LonC protease open hexamer with Bortezomib
全体 | 名称: CryoEM structure of LonC protease open hexamer with Bortezomib |
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要素 |
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-超分子 #1: CryoEM structure of LonC protease open hexamer with Bortezomib
超分子 | 名称: CryoEM structure of LonC protease open hexamer with Bortezomib タイプ: complex / ID: 1 / 親要素: 0 / 含まれる分子: all |
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由来(天然) | 生物種: ![]() |
分子量 | 理論値: 480 KDa |
-分子 #1: LonC open hexamer with Bortezomib
分子 | 名称: LonC open hexamer with Bortezomib / タイプ: protein_or_peptide / ID: 1 / 光学異性体: LEVO |
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由来(天然) | 生物種: ![]() |
組換発現 | 生物種: ![]() ![]() |
配列 | 文字列: MRLSYEALEW RTPIENSTEP VSLPPPPPFF GQERAREALE LAIRGGFHAY LVGPPSLGKH EALLAYLSTQ SVETPPDLLY VPLSERKVAV LTLPSGQEIH LAEAVEGLLL EVNRLDELFR QGSFLREKTQ LEARFKEARE QQLEALRREA QEAGFALSTN GERLELTGPG ...文字列: MRLSYEALEW RTPIENSTEP VSLPPPPPFF GQERAREALE LAIRGGFHAY LVGPPSLGKH EALLAYLSTQ SVETPPDLLY VPLSERKVAV LTLPSGQEIH LAEAVEGLLL EVNRLDELFR QGSFLREKTQ LEARFKEARE QQLEALRREA QEAGFALSTN GERLELTGPG PVPAELSARL EEVTLGSLAA SAELEVALRR LRRDWALHYL NNRFEPLFQR FPQARAYLEA LRARLARYAE TGEPLDPAQW RPNLLTSSSS GTPPPIVYEP YATAPRLFGR LDYLVDRGVW STNVSLIRPG AVHRAQGGYL ILDALSLKRE GTWEAFKRAL RNGQVEPVTE PQAPAGLEVE PFPIQMQVIL VGTPEAFEGL EEDPAFSELF RIRAEFSPTL PASPENCTAL GGWLLAQGFQ LTQGGLTRLY DEARRMAEQR DRMDARLVEI RALAEEAAVL GGGLLTAESV EQAIAAREHR SFLSEEEFLR AVQEGVIRLR TTGRAVGEVN SLVVVEAAPY WGRPARLTAR AAPGRDHLIS IDREAGLGGQ IFHKAVLTLA GYLRSRYIEH GSLPVTISLA FEQNYVSIEG DSAGLAELVA ALSAIGNLPL RQDLAVTGAV DQTGKVLAVG AINAKVEGFF RVCKALGLSG TQGVILPEAN LANLTLRAEV LEAVRAGQFH IYAVETAEQA LEILAGARME GFRGLQEKIR AGLEAFARLE EGHDKEDREK LAAALEHHHH HH |
-実験情報
-構造解析
手法 | クライオ電子顕微鏡法 |
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![]() | 単粒子再構成法 |
試料の集合状態 | particle |
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試料調製
濃度 | 1.0 mg/mL |
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緩衝液 | pH: 7.5 |
凍結 | 凍結剤: ETHANE |
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電子顕微鏡法
顕微鏡 | FEI TITAN KRIOS |
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撮影 | フィルム・検出器のモデル: GATAN K3 (6k x 4k) / 平均電子線量: 60.0 e/Å2 |
電子線 | 加速電圧: 300 kV / 電子線源: ![]() |
電子光学系 | 照射モード: FLOOD BEAM / 撮影モード: BRIGHT FIELD / 最大 デフォーカス(公称値): 2.7 µm / 最小 デフォーカス(公称値): 1.3 µm |
実験機器 | ![]() モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company |