EMDB-26624: Composite cryo-EM density map of the 48-nm repeat of the human re...

基本情報

登録情報

データベース: EMDB / ID: EMD-26624

• タイトル: Composite cryo-EM density map of the 48-nm repeat of the human respiratory doublet microtubule
• マップデータ: phenix auto-sharpened map

試料

• 複合体: Doublet microtubule and associated proteins
  • タンパク質・ペプチド: x 35種
• リガンド: x 3種

• キーワード: cilia / microtubule / sperm / cell motility / STRUCTURAL PROTEIN

機能・相同性

分子機能:

axonemal microtubule doublet inner sheath / epithelial cilium movement involved in determination of left/right asymmetry / sperm flagellum assembly / establishment of left/right asymmetry / 9+0 motile cilium / outer acrosomal membrane / regulation of brood size / manchette assembly / axonemal B tubule inner sheath / regulation of calcineurin-NFAT signaling cascade / inner dynein arm assembly / axonemal A tubule inner sheath / sperm axoneme assembly / regulation of microtubule nucleation / protein polyglutamylation / positive regulation of feeding behavior / sperm principal piece / cerebrospinal fluid circulation / cilium-dependent cell motility / cilium movement involved in cell motility / regulation of cilium beat frequency involved in ciliary motility / regulation of store-operated calcium entry / 9+2 motile cilium / 転移酵素; リンを含む基を移すもの / acrosomal membrane / ciliary transition zone / cilium movement / Post-chaperonin tubulin folding pathway / calcium ion sensor activity / axoneme assembly / axonemal microtubule / left/right axis specification / cilium organization / Microtubule-dependent trafficking of connexons from Golgi to the plasma membrane / Cilium Assembly / flagellated sperm motility / Carboxyterminal post-translational modifications of tubulin / gamma-tubulin ring complex / organelle transport along microtubule / glial cell differentiation / forebrain morphogenesis / Sealing of the nuclear envelope (NE) by ESCRT-III / Intraflagellar transport / neuron projection arborization / cytoskeleton-dependent intracellular transport / manchette / cerebellar cortex morphogenesis / Formation of tubulin folding intermediates by CCT/TriC / positive regulation of cilium assembly / dentate gyrus development / COPI-independent Golgi-to-ER retrograde traffic / Gap junction assembly / pyramidal neuron differentiation / Prefoldin mediated transfer of substrate to CCT/TriC / UTP biosynthetic process / CTP biosynthetic process / Kinesins / motile cilium / Assembly and cell surface presentation of NMDA receptors / positive regulation of cell motility / determination of left/right symmetry / centrosome cycle / GTP biosynthetic process / microtubule organizing center / motor behavior / COPI-dependent Golgi-to-ER retrograde traffic / intermediate filament / response to L-glutamate / natural killer cell mediated cytotoxicity / ciliary base / smoothened signaling pathway / intercellular bridge / regulation of synapse organization / regulation of neuron projection development / AMP binding / cytoplasmic microtubule / startle response / beta-tubulin binding / MHC class I protein binding / locomotory exploration behavior / regulation of cell division / cerebral cortex cell migration / Recycling pathway of L1 / microtubule polymerization / axoneme / microtubule-based process / mitotic cytokinesis / centriolar satellite / spermatid development / cilium assembly / cellular response to UV-C / cellular response to unfolded protein / single fertilization / alpha-tubulin binding / sperm flagellum / RHO GTPases activate IQGAPs / response to tumor necrosis factor / Hedgehog 'off' state / response to mechanical stimulus / COPI-mediated anterograde transport

ドメイン・相同性:

Protein of unknown function DUF1143 / Cilia- and flagella-associated protein 68 / Protein of unknown function DUF4541 / Cilia and flagella associated protein 90 / : / FAM183 family / FAM183A and FAM183B related / Sperm-associated antigen 8 / Sperm acrosome-associated protein 9 / Cilia- and flagella-associated protein 95 / NDPK7, first NDPk domain / Cilia- and flagella-associated protein 107 / Sperm acrosome-associated protein 9 / Protein CFAP95 / Cilia- and flagella-associated protein 143 / Cilia and flagella associated protein 107 / Tektin / Cilia- and flagella-associated protein 276 / : / Tektin family / Protein of unknown function (DUF3695) / Cilia- and flagella-associated protein 77 / Cilia- and flagella-associated protein 77 / Uncharacterised protein FAM166/UPF0605 / Protein Flattop / Ciliary microtubule inner protein 2B-like / Flattop / Nucleoside diphosphate kinase 7 / Meiosis-specific nuclear structural protein 1 / Piercer of microtubule wall 1/2 / Cilia- and flagella-associated protein 141 / Cilia- and flagella-associated protein 45 / NDPK7, second NDPk domain / Cilia- and flagella- associated protein 210 / CFAP53/TCHP / Trichohyalin-plectin-homology domain / Trichohyalin-plectin-homology domain / Piercer of microtubule wall 1/2 / Cilia- and flagella-associated protein 141 / RIB43A / RIB43A / DM10 domain / EF-hand domain-containing protein EFHC1/EFHC2/EFHB / DM10 domain / DM10 domain profile. / Domains in hypothetical proteins in Drosophila, C. elegans and mammals. Occurs singly in some nucleoside diphosphate kinases. / Enkurin domain / : / Calmodulin-binding / Enkurin domain profile. / CFA20 domain / Cilia- and flagella-associated protein 20/CFAP20DC / : / CFA20 domain / Parkin co-regulated protein / Parkin co-regulated protein / Nucleoside diphosphate kinase (NDPK)-like domain profile. / Nucleoside diphosphate kinase / Nucleoside diphosphate kinase-like domain / Nucleoside diphosphate kinase / NDK / Nucleoside diphosphate kinase-like domain superfamily / Alpha tubulin / Tubulin-beta mRNA autoregulation signal. / Beta tubulin, autoregulation binding site / Beta tubulin / Tubulin / Tubulin, C-terminal / Tubulin C-terminal domain / Tubulin, conserved site / Tubulin subunits alpha, beta, and gamma signature. / Tubulin/FtsZ family, C-terminal domain / Tubulin/FtsZ-like, C-terminal domain / Tubulin/FtsZ, C-terminal / Tubulin/FtsZ, 2-layer sandwich domain / Tubulin/FtsZ family, GTPase domain / Tubulin/FtsZ family, GTPase domain / Tubulin/FtsZ, GTPase domain / Tubulin/FtsZ, GTPase domain superfamily / EF-hand domain pair / EF-hand, calcium binding motif / EF-Hand 1, calcium-binding site / EF-hand calcium-binding domain. / EF-hand calcium-binding domain profile. / EF-hand domain / EF-hand domain pair / WD40 repeat, conserved site / Trp-Asp (WD) repeats signature. / Trp-Asp (WD) repeats profile. / Trp-Asp (WD) repeats circular profile. / WD domain, G-beta repeat / WD40 repeats / WD40 repeat / WD40-repeat-containing domain superfamily / WD40/YVTN repeat-like-containing domain superfamily

構成要素:

Cilia- and flagella-associated protein 90 / Ciliary microtubule inner protein 2C / Cilia- and flagella-associated protein 144 / Ciliary microtubule inner protein 2B / Piercer of microtubule wall 2 protein / Tubulin beta-4B chain / Cilia- and flagella- associated protein 210 / Piercer of microtubule wall 1 protein / EF-hand domain-containing family member C2 / EF-hand domain-containing protein 1 / Cilia- and flagella-associated protein 276 / Protein Flattop / Cilia- and flagella-associated protein 95 / Cilia- and flagella-associated protein 141 / Cilia- and flagella-associated protein 161 / Cilia- and flagella-associated protein 77 / Tubulin alpha-1A chain / Cilia- and flagella-associated protein 107 / Cilia- and flagella-associated protein 52 / EF-hand domain-containing family member B / Meiosis-specific nuclear structural protein 1 / Enkurin / Tektin-4 / Tektin-1 / Sperm acrosome-associated protein 9 / Cilia- and flagella-associated protein 53 / Parkin coregulated gene protein / Sperm-associated antigen 8 / Tektin-3 / RIB43A-like with coiled-coils protein 2 / Cilia- and flagella-associated protein 68 / Tektin-2 / Cilia- and flagella-associated protein 45 / Nucleoside diphosphate kinase homolog 7 / Cilia- and flagella-associated protein 20

• 生物種: Homo sapiens (ヒト)
• 手法: 単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 3.6 Å
• データ登録者: Gui M / Croft JT / Zabeo D / Acharya V / Kollman JM / Burgoyne T / Hoog JL / Brown A

資金援助

米国, スウェーデン, 6件

Organization	Grant number	国
National Institutes of Health/National Institute of General Medical Sciences (NIH/NIGMS)	GM141109	米国
Swedish Research Council	2015-05427	スウェーデン
Swedish Research Council	2019-04004	スウェーデン
Smith Family Foundation		米国
Pew Charitable Trusts		米国
Charles A. King Trust	Postdoctoral Research Fellowship	米国

• 引用: ジャーナル: Proc Natl Acad Sci U S A / 年: 2022; タイトル: SPACA9 is a lumenal protein of human ciliary singlet and doublet microtubules.; 著者: Miao Gui / Jacob T Croft / Davide Zabeo / Vajradhar Acharya / Justin M Kollman / Thomas Burgoyne / Johanna L Höög / Alan Brown / ; 要旨: The cilium-centrosome complex contains triplet, doublet, and singlet microtubules. The lumenal surfaces of each microtubule within this diverse array are decorated by microtubule inner proteins (MIPs). Here, we used single-particle cryo-electron microscopy methods to build atomic models of two types of human ciliary microtubule: the doublet microtubules of multiciliated respiratory cells and the distal singlet microtubules of monoflagellated human spermatozoa. We discover that SPACA9 is a polyspecific MIP capable of binding both microtubule types. SPACA9 forms intralumenal striations in the B tubule of respiratory doublet microtubules and noncontinuous spirals in sperm singlet microtubules. By acquiring new and reanalyzing previous cryo-electron tomography data, we show that SPACA9-like intralumenal striations are common features of different microtubule types in animal cilia. Our structures provide detailed references to help rationalize ciliopathy-causing mutations and position cryo-EM as a tool for the analysis of samples obtained directly from ciliopathy patients.

履歴

登録	2022年4月11日	-
ヘッダ(付随情報) 公開	2022年10月5日	-
マップ公開	2022年10月5日	-
更新	2024年6月12日	-
現状	2024年6月12日	処理サイト: RCSB / 状態: 公開

マップ

• ファイル: ダウンロード / ファイル: emd_26624.map.gz / 形式: CCP4 / 大きさ: 512 MB / タイプ: IMAGE STORED AS FLOATING POINT NUMBER (4 BYTES)
• 注釈: phenix auto-sharpened map
• ボクセルのサイズ: X=Y=Z: 1.37 Å

密度

表面レベル	登録者による: 1.5
最小 - 最大	-13.574953000000001 - 24.733360000000001
平均 (標準偏差)	-0.00000000000123 (±1.0)

• 対称性: 空間群: 1

詳細

EMDB XML:

マップ形状	Axis order X Y Z Origin 0 0 0 サイズ 512 512 512 Spacing 512 512 512
セル	A=B=C: 701.44 Å α=β=γ: 90.0 °

添付データ

マスク #1

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ハーフマップ: #2

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ハーフマップ: #1

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試料の構成要素

全体 : Doublet microtubule and associated proteins

• 全体: 名称: Doublet microtubule and associated proteins

要素

• 複合体: Doublet microtubule and associated proteins
  • タンパク質・ペプチド: Protein CFAP95
  • タンパク質・ペプチド: EF-hand domain-containing family member B
  • タンパク質・ペプチド: Cilia- and flagella-associated protein 53
  • タンパク質・ペプチド: Nucleoside diphosphate kinase 7
  • タンパク質・ペプチド: Protein CFAP107
  • タンパク質・ペプチド: Protein CFAP141
  • タンパク質・ペプチド: Tektin-1
  • タンパク質・ペプチド: Tubulin alpha-1A chain
  • タンパク質・ペプチド: Tubulin beta-4B chain
  • タンパク質・ペプチド: Meiosis-specific nuclear structural protein 1
  • タンパク質・ペプチド: Tektin-2
  • タンパク質・ペプチド: Tektin-3
  • タンパク質・ペプチド: Sperm-associated antigen 8
  • タンパク質・ペプチド: Tektin-4
  • タンパク質・ペプチド: Cilia- and flagella-associated protein 161
  • タンパク質・ペプチド: Sperm acrosome-associated protein 9
  • タンパク質・ペプチド: Uncharacterized protein C15orf65
  • タンパク質・ペプチド: Protein FAM166B
  • タンパク質・ペプチド: UPF0686 protein C11orf1
  • タンパク質・ペプチド: Isoform 2 of Cilia- and flagella-associated protein 77
  • タンパク質・ペプチド: Protein FAM183A
  • タンパク質・ペプチド: Uncharacterized protein C5orf49
  • タンパク質・ペプチド: Protein FAM166C
  • タンパク質・ペプチド: RIB43A-like with coiled-coils protein 2
  • タンパク質・ペプチド: EF-hand domain-containing protein 1
  • タンパク質・ペプチド: EF-hand domain-containing family member C2
  • タンパク質・ペプチド: Cilia- and flagella-associated protein 20
  • タンパク質・ペプチド: Parkin coregulated gene protein
  • タンパク質・ペプチド: Cilia- and flagella-associated protein 45
  • タンパク質・ペプチド: Cilia- and flagella-associated protein 52
  • タンパク質・ペプチド: Enkurin
  • タンパク質・ペプチド: Protein Flattop
  • タンパク質・ペプチド: Protein CFAP210
  • タンパク質・ペプチド: Protein CFAP276
  • タンパク質・ペプチド: UPF0691 protein C9orf116
• リガンド: GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE
• リガンド: MAGNESIUM ION
• リガンド: GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE

超分子 #1: Doublet microtubule and associated proteins

• 超分子: 名称: Doublet microtubule and associated proteins / タイプ: complex / ID: 1 / 親要素: 0 / 含まれる分子: #1-#35
• 由来(天然): 生物種: Homo sapiens (ヒト)

分子 #1: Protein CFAP95

• 分子: 名称: Protein CFAP95 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 1 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
• 由来(天然): 生物種: Homo sapiens (ヒト)
• 分子量: 理論値: 26.483875 KDa

配列

文字列:

MDSLDRSCQD WCDRKQHWLE IGPPDLVERK GSLTLRSHHK KYSKPVLVYS WHRDREAFPK GYDIEGPEKV KKLCNSTYRR LGTDESPIW TSETHEKLSQ MCLNTEWVEM KSKALLNEET VSSGIIERVT GLPATGFGAV FPRHPPDWSK MCALTTYSED Y VPPYDYQP HAYPCQDDYS IVHRKCRSQF TDLNGSKRFG INTWHDESGI YANSDVKQKL YPLTSGPIVP I

UniProtKB: Cilia- and flagella-associated protein 95

分子 #2: EF-hand domain-containing family member B

• 分子: 名称: EF-hand domain-containing family member B / タイプ: protein_or_peptide / ID: 2 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
• 由来(天然): 生物種: Homo sapiens (ヒト)
• 分子量: 理論値: 93.940008 KDa

配列

文字列:

MNMEIGHPHE GKDDLGDKRV IMGTKFPMEL GIRVGLGKED SRCGESPVVS NKCEGRMAPP ETKFPLSKGL EMGLERQNIS RTVMQRGSL GVDSVSASQG TKPSLLPGRM GLENESLLAG YTHERIIQPP LGRVCGSSQA AGSRRAPLAS GPEGVEELVG K PAFVMEPR QEMEKESTCV LMKPNTEIKL PVEVDIGLTQ AEGPDETKNT EPQMGLVIEP PQCQFAQQHE QRKEAGNIES GV EPPDRIR PIYSGKFFDR TPCWPSAGKV IPVGYRVATC LTEKLPRLIT PPEAKKYFNF RYPPAGVERV FYGRANDPQI APY LTHGIR SKISVLANTL INPQPITTFQ QKIKDKKESI YLSNRRAPLG KSHDQAPGLP KGMDTTNTTF GTAVIKEYSA KDVV NPPKS YEEVFKEGNE GHDLYVVSHN DYYAGEAKNR KYNPSSFHRC SVYGVPTPHF NDGRAMAKSL YWLHELQMKR GAKFV SKRA DDFKEKFQHK LGRVLDPIAE TMNVPPDCTF GACLRPEEYG VGDLIHNRLP DEYLRGKDRQ RALIAAVRHH LKKVNY QKF DTLLAAFRHY DKKGDGMIDK DELQEACDQA NLSLDDKLLD QLFDYCDVDN DGFINYLEFA NFLNWKDKML LKEYEER VI IKGRKPDCVN PTEANVEEPE QTLLIKPEDI VLKEAGSTEK TLRTLLRPSD KVSNYYKTTS SEINAIVGAI PSTCYPIC G VPTIRSDIPA PRIRRISDRT NYGEEGSAYS LLYPTIFARK GVFERDFFKT RSKEEIAEIL CNIGVKLSDE EFENVWNLA SKKHHRGEVC VENIRNVLDE LRHADRIKCK TLM

UniProtKB: EF-hand domain-containing family member B

分子 #3: Cilia- and flagella-associated protein 53

• 分子: 名称: Cilia- and flagella-associated protein 53 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 3 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
• 由来(天然): 生物種: Homo sapiens (ヒト)
• 分子量: 理論値: 61.960844 KDa

配列

文字列:

MYSQRFGTVQ REVKGPTPKV VIVRSKPPKG QGAEHHLERI RRSHQKHNAI LASIKSSERD RLKAEWDQHN DCKILDSLVR ARIKDAVQG FIINIEERRN KLRELLALEE NEYFTEMQLK KETIEEKKDR MREKTKLLKE KNEKERQDFV AEKLDQQFRE R CEELRVEL LSIHQKKVCE ERKAQIAFNE ELSRQKLVEE QMFSKLWEED RLAKEKREAQ EARRQKELME NTRLGLNAQI TS IKAQRQA TQLLKEEEAR LVESNNAQIK HENEQDMLKK QKAKQETRTI LQKALQERIE HIQQEYRDEQ DLNMKLVQRA LQD LQEEAD KKKQKREDMI REQKIYHKYL AQRREEEKAQ EKEFDRILEE DKAKKLAEKD KELRLEKEAR RQLVDEVMCT RKLQ VQEKL QREAKEQEER AMEQKHINES LKELNCEEKE NFARRQRLAQ EYRKQLQMQI AYQQQSQEAE KEEKRREFEA GVAAN KMCL DKVQEVLSTH QVLPQNIHPM RKACPSKLPP

UniProtKB: Cilia- and flagella-associated protein 53

分子 #4: Nucleoside diphosphate kinase 7

• 分子: 名称: Nucleoside diphosphate kinase 7 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 4 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO / EC番号: nucleoside-diphosphate kinase
• 由来(天然): 生物種: Homo sapiens (ヒト)
• 分子量: 理論値: 42.545707 KDa

配列

文字列:

MNHSERFVFI AEWYDPNASL LRRYELLFYP GDGSVEMHDV KNHRTFLKRT KYDNLHLEDL FIGNKVNVFS RQLVLIDYGD QYTARQLGS RKEKTLALIK PDAISKAGEI IEIINKAGFT ITKLKMMMLS RKEALDFHVD HQSRPFFNEL IQFITTGPII A MEILRDDA ICEWKRLLGP ANSGVARTDA SESIRALFGT DGIRNAAHGP DSFASAAREM ELFFPSSGGC GPANTAKFTN CT CCIVKPH AVSEGLLGKI LMAIRDAGFE ISAMQMFNMD RVNVEEFYEV YKGVVTEYHD MVTEMYSGPC VAMEIQQNNA TKT FREFCG PADPEIARHL RPGTLRAIFG KTKIQNAVHC TDLPEDGLLE VQYFFKILDN

UniProtKB: Nucleoside diphosphate kinase homolog 7

分子 #5: Protein CFAP107

• 分子: 名称: Protein CFAP107 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 5 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
• 由来(天然): 生物種: Homo sapiens (ヒト)
• 分子量: 理論値: 23.105348 KDa

配列

文字列:

MFLTAVNPQP LSTPSWQIET KYSTKVLTGN WMEERRKFTR DTDKTPQSIY RKEYIPFPDH RPDQISRWYG KRKVEGLPYK HLITHHQEP PHRYLISTYD DHYNRHGYNP GLPPLRTWNG QKLLWLPEKS DFPLLAPPTN YGLYEQLKQR QLTPKAGLKQ S TYTSSYPR PPLCAMSWRE HAVPVPPHRL HPFPHF

UniProtKB: Cilia- and flagella-associated protein 107

分子 #6: Protein CFAP141

• 分子: 名称: Protein CFAP141 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 6 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
• 由来(天然): 生物種: Homo sapiens (ヒト)
• 分子量: 理論値: 12.151156 KDa

配列

文字列:

MSVEKMTKVE ESFQKAMGLK KTVDRWRNSH THCLWQMALG QRRNPYATLR MQDTMVQELA LAKKQLLMVR QAALHQLFEK EHQQYQQEL NQMGKAFYVE RF

UniProtKB: Cilia- and flagella-associated protein 141

分子 #7: Tektin-1

• 分子: 名称: Tektin-1 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 7 / コピー数: 5 / 光学異性体: LEVO
• 由来(天然): 生物種: Homo sapiens (ヒト)
• 分子量: 理論値: 48.360113 KDa

配列

文字列:

MAKLLQPPPK FLPSEWHIAN KNQYHRADAQ RSRSERLVAE SQRLVDEIEK TTRKSQSDVN KKLEQRLEEV QFWKKELDDK LEQLVNVTD DLLIYKIRLE KALETLKEPL HITETCLAYR EKRIGIDLVH DTVEHELIKE AEIIQGIMAL LTRTLEEASE Q IRMNRSAK YNLEKDLKDK FVALTIDDIC FSLNNNSPNI RYSENAVRIE PNSVSLEDWL DFSSTNVEKA DKQRNNSLML KA LVDRILS QTANDLRKQC DVVDTAFKNG LKDTKDARDK LADHLAKVME EIASQEKNIT ALEKAILDQE GPAKVAHTRL ETR THRPNV ELCRDVAQYR LMKEVQEITH NVARLKETLA QAQAELKGLH RRQLALQEEI QVKENTIYID EVLCMQMRKS IPLR DGEDH GVWAGGLRPD AVC

UniProtKB: Tektin-1

分子 #8: Tubulin alpha-1A chain

• 分子: 名称: Tubulin alpha-1A chain / タイプ: protein_or_peptide / ID: 8 / コピー数: 149 / 光学異性体: LEVO
• 由来(天然): 生物種: Homo sapiens (ヒト)
• 分子量: 理論値: 50.188441 KDa

配列

文字列:

MRECISIHVG QAGVQIGNAC WELYCLEHGI QPDGQMPSDK TIGGGDDSFN TFFSETGAGK HVPRAVFVDL EPTVIDEVRT GTYRQLFHP EQLITGKEDA ANNYARGHYT IGKEIIDLVL DRIRKLADQC TGLQGFLVFH SFGGGTGSGF TSLLMERLSV D YGKKSKLE FSIYPAPQVS TAVVEPYNSI LTTHTTLEHS DCAFMVDNEA IYDICRRNLD IERPTYTNLN RLIGQIVSSI TA SLRFDGA LNVDLTEFQT NLVPYPRIHF PLATYAPVIS AEKAYHEQLS VAEITNACFE PANQMVKCDP RHGKYMACCL LYR GDVVPK DVNAAIATIK TKRTIQFVDW CPTGFKVGIN YQPPTVVPGG DLAKVQRAVC MLSNTTAIAE AWARLDHKFD LMYA KRAFV HWYVGEGMEE GEFSEAREDM AALEKDYEEV GVDSVEGEGE EEGEEY

UniProtKB: Tubulin alpha-1A chain

分子 #9: Tubulin beta-4B chain

• 分子: 名称: Tubulin beta-4B chain / タイプ: protein_or_peptide / ID: 9 / コピー数: 153 / 光学異性体: LEVO
• 由来(天然): 生物種: Homo sapiens (ヒト)
• 分子量: 理論値: 49.877824 KDa

配列

文字列:

MREIVHLQAG QCGNQIGAKF WEVISDEHGI DPTGTYHGDS DLQLERINVY YNEATGGKYV PRAVLVDLEP GTMDSVRSGP FGQIFRPDN FVFGQSGAGN NWAKGHYTEG AELVDSVLDV VRKEAESCDC LQGFQLTHSL GGGTGSGMGT LLISKIREEY P DRIMNTFS VVPSPKVSDT VVEPYNATLS VHQLVENTDE TYCIDNEALY DICFRTLKLT TPTYGDLNHL VSATMSGVTT CL RFPGQLN ADLRKLAVNM VPFPRLHFFM PGFAPLTSRG SQQYRALTVP ELTQQMFDAK NMMAACDPRH GRYLTVAAVF RGR MSMKEV DEQMLNVQNK NSSYFVEWIP NNVKTAVCDI PPRGLKMSAT FIGNSTAIQE LFKRISEQFT AMFRRKAFLH WYTG EGMDE MEFTEAESNM NDLVSEYQQY QDATAEEEGE FEEEAEEEVA

UniProtKB: Tubulin beta-4B chain

分子 #10: Meiosis-specific nuclear structural protein 1

• 分子: 名称: Meiosis-specific nuclear structural protein 1 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 10 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
• 由来(天然): 生物種: Homo sapiens (ヒト)
• 分子量: 理論値: 60.687531 KDa

配列

文字列:

MGSKRRNLSC SERHQKLVDE NYCKKLHVQA LKNVNSQIRN QMVQNENDNR VQRKQFLRLL QNEQFELDME EAIQKAEENK RLKELQLKQ EEKLAMELAK LKHESLKDEK MRQQVRENSI ELRELEKKLK AAYMNKERAA QIAEKDAIKY EQMKRDAEIA K TMMEEHKR IIKEENAAED KRNKAKAQYY LDLEKQLEEQ EKKKQEAYEQ LLKEKLMIDE IVRKIYEEDQ LEKQQKLEKM NA MRRYIEE FQKEQALWRK KKREEMEEEN RKIIEFANMQ QQREEDRMAK VQENEEKRLQ LQNALTQKLE EMLRQREDLE QVR QELYQE EQAEIYKSKL KEEAEKKLRK QKEMKQDFEE QMALKELVLQ AAKEEEENFR KTMLAKFAED DRIELMNAQK QRMK QLEHR RAVEKLIEER RQQFLADKQR ELEEWQLQQR RQGFINAIIE EERLKLLKEH ATNLLGYLPK GVFKKEDDID LLGEE FRKV YQQRSEICEE K

UniProtKB: Meiosis-specific nuclear structural protein 1

分子 #11: Tektin-2

• 分子: 名称: Tektin-2 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 11 / コピー数: 10 / 光学異性体: LEVO
• 由来(天然): 生物種: Homo sapiens (ヒト)
• 分子量: 理論値: 49.743176 KDa

配列

文字列:

MATLSVKPSR RFQLPDWHTN SYLLSTNAQL QRDASHQIRQ EARVLRNETN NQTIWDEHDN RTRLVERIDT VNRWKEMLDK CLTDLDAEI DALTQMKESA EQNLQAKNLP LDVAIECLTL RESRRDIDVV KDPVEDELHK EVEVIEATKK ALQQKVSQAF E QLCLLQEV QQQLNSDHRG KMETLEIDRG CLSLNLRSPN ISLKVDPTRV PDGSTTLQQW DDFSRFNKDR AEAEMKAATE LR EATALTI AETNNELEAQ RVATEFAFRK RLREMEKVYS ELKWQEKNTL EEIAELQEDI RHLEEDLRTK LLSLKLSHTR LEA RTYRPN VELCRDQAQY GLTDEVHQLE ATIAALKQKL AQAQDALDAL CKHLARLQAD IACKANSMLL DTKCMDTRRK LTVP AERFV PEVDTFTRTT NSTLSPLKSC QLELA

UniProtKB: Tektin-2

分子 #12: Tektin-3

• 分子: 名称: Tektin-3 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 12 / コピー数: 5 / 光学異性体: LEVO
• 由来(天然): 生物種: Homo sapiens (ヒト)
• 分子量: 理論値: 56.717902 KDa

配列

文字列:

MERVGCTLTT TYAHPRPTPT NFLPAISTMA SSYRDRFPHS NLTHSLSLPW RPSTYYKVAS NSPSVAPYCT RSQRVSENTM LPFVSNRTT FFTRYTPDDW YRSNLTNYQE SNTSRHNSEK LRVDTSRLIQ DKYQQTRKTQ ADTTQNLGER VNDIGFWKSE I IHELDEMI GETNALTDVK KRLERALMET EAPLQVAREC LFHREKRMGI DLVHDEVEAQ LLTEVDTILC CQERMKLHLD KA IAQLAAN RASQHELEKD LSDKQTAYRI DDKCHHLRNT SDGVGYFRGV ERVDATVSVP ESWAKFTDDN ILRSQSERAA SAK LRDDIE NLLVVTANEM WNQFNKVNLS FTNRIAETAD AKNKIQTHLA KTLQEIFQTE MTIESIKKAI KDKTAFLKVA QTRL DERTR RPNIELCRDM AQLRLVNEVH EVDDTIQTLQ QRLRDAEDTL QSLVHIKATL EYDLAVKANS LYIDQEKCMS MRKSY PNTL RLVGFC

UniProtKB: Tektin-3

分子 #13: Sperm-associated antigen 8

• 分子: 名称: Sperm-associated antigen 8 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 13 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
• 由来(天然): 生物種: Homo sapiens (ヒト)
• 分子量: 理論値: 51.187598 KDa

配列

文字列:

METNESTEGS RSRSRSLDIQ PSSEGLGPTS EPFPSSDDSP RSALAAATAA AAAAASAAAA TAAFTTAKAA ALSTKTPAPC SEFMEPSSD PSLLGEPCAG PGFTHNIAHG SLGFEPVYVS CIAQDTCTTT DHSSNPGPVP GSSSGPVLGS SSGAGHGSGS G SGPGCGSV PGSGSGPGPG SGPGSGPGHG SGSHPGPASG PGPDTGPDSE LSPCIPPGFR NLVADRVPNY TSWSQHCPWE PQ KQPPWEF LQVLEPGARG LWKPPDIKGK LMVCYETLPR GQCLLYNWEE ERATNHLDQV PSMQDGSESF FFRHGHRGLL TMQ LKSPMP SSTTQKDSYQ PPGNVYWPLR GKREAMLEML LQHQICKEVQ AEQEPTRKLF EVESVTHHDY RMELAQAGTP APTK PHDYR QEQPETFWIQ RAPQLPGVSN IRTLDTPFRK NCSFSTPVPL SLGKLLPYEP ENYPYQLGEI SSLPCPGGRL GGGGG RMTP F

UniProtKB: Sperm-associated antigen 8

分子 #14: Tektin-4

• 分子: 名称: Tektin-4 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 14 / コピー数: 8 / 光学異性体: LEVO
• 由来(天然): 生物種: Homo sapiens (ヒト)
• 分子量: 理論値: 50.725926 KDa

配列

文字列:

MAQTVPPCEL PCKEYDVARN TGAYTSSGLA TASFRTSKYL LEEWFQNCYA RYHQAFADRD QSERQRHESQ QLATETQALA QRTQQDSTR TVGERLQDTH SWKSELQREM EALAAETNLL LAQKQRLERA LDATEVPFSI TTDNLQCRER REHPNLVRDH V ETELLKEA ELIRNIQELL KRTIMQAVSQ IRLNREHKET CEMDWSDKME AYNIDETCGR HHSQSTEVQA HPYSTTFQES AS TPETRAK FTQDNLCRAQ RERLASANLR VLVDCILRDT SEDLRLQCDA VNLAFGRRCE ELEDARYKLH HHLHKTLREI TDQ EHNVAA LKQAIKDKEA PLHVAQTRLY LRSHRPNMEL CRDAAQFRLL SEVEELNMSL TALREKLLEA EQSLRNLEDI HMSL EKDIA AMTNSLFIDR QKCMAHRTRY PTILQLAGYQ

UniProtKB: Tektin-4

分子 #15: Cilia- and flagella-associated protein 161

• 分子: 名称: Cilia- and flagella-associated protein 161 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 15 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
• 由来(天然): 生物種: Homo sapiens (ヒト)
• 分子量: 理論値: 34.339973 KDa

配列

文字列:

MAQNVYGPGV RIGNWNEDVY LEEELMKDFL EKRDKGKLLI QRSRRLKQNL LRPMQLSVTE DGYIHYGDKV MLVNPDDPDT EADVFLRGD LSLCMTPDEI QSHLKDELEV PCGLSAVQAK TPIGRNTFII LSVHRDATGQ VLRYGQDFCL GITGGFDNKM L YLSSDHRT LLKSSKRSWL QEVYLTDEVS HVNCWQAAFP DPQLRLEYEG FPVPANAKIL INHCHTNRGL AAHRHLFLST YF GKEAEVV AHTYLDSHRV EKPRNHWMLV TGNPRDASSS MLDLPKPPTE DTRAMEQAMG LDTQ

UniProtKB: Cilia- and flagella-associated protein 161

分子 #16: Sperm acrosome-associated protein 9

• 分子: 名称: Sperm acrosome-associated protein 9 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 16 / コピー数: 21 / 光学異性体: LEVO
• 由来(天然): 生物種: Homo sapiens (ヒト)
• 分子量: 理論値: 25.208977 KDa

配列

文字列:

MNEVKESLRS IEQKYKLFQQ QQLTFTAALE HCRENAHDKI RPISSIGQVQ SYMEHYCNSS TDRRVLLMFL DICSELNKLC QHFEAVHSG TPVTNNLLEK CKTLVSQSND LSSLRAKYPH DVVNHLSCDE ARNHYGGVVS LIPLILDLMK EWIAHSEKLP R KVLQHVSE PQAHQESTRG AARPAQAIGT QPRATKHKCR QLTKASLKPR GCSKPPWRPP GGKL

UniProtKB: Sperm acrosome-associated protein 9

分子 #17: Uncharacterized protein C15orf65

• 分子: 名称: Uncharacterized protein C15orf65 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 17 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
• 由来(天然): 生物種: Homo sapiens (ヒト)
• 分子量: 理論値: 13.778468 KDa

配列

文字列:

MTDRNRDKKS TSPSNSDTEM KSEQLPPCVN PGNPVFSCML DPKTLQTATS LSKPQMIMYK TNSSHYGEFL PIPQFFPCNY TPKEQVFSS HIRATGFYQN NTLNTAPDRT RTLDFPNIQH TL

UniProtKB: Piercer of microtubule wall 2 protein

分子 #18: Protein FAM166B

• 分子: 名称: Protein FAM166B / タイプ: protein_or_peptide / ID: 18 / コピー数: 7 / 光学異性体: LEVO
• 由来(天然): 生物種: Homo sapiens (ヒト)
• 分子量: 理論値: 30.610637 KDa

配列

文字列:

MAVASTFIPG LNPQNPHYIP GYTGHCPLLR FSVGQTYGQV TGQLLRGPPG LAWPPVHRTL LPPIRPPRSP EVPRESLPVR RGQERLSSS MIPGYTGFVP RAQFIFAKNC SQVWAEALSD FTHLHEKQGS EELPKEAKGR KDTEKDQVPE PEGQLEEPTL E VVEQASPY SMDDRDPRKF FMSGFTGYVP CARFLFGSSF PVLTNQALQE FGQKHSPGSA QDPKHLPPLP RTYPQNLGLL PN YGGYVPG YKFQFGHTFG HLTHDALGLS TFQKQLLA

UniProtKB: Ciliary microtubule inner protein 2B

分子 #19: UPF0686 protein C11orf1

• 分子: 名称: UPF0686 protein C11orf1 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 19 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
• 由来(天然): 生物種: Homo sapiens (ヒト)
• 分子量: 理論値: 17.806924 KDa

配列

文字列:

MAASQCLCCS KFLFQRQNLA CFLTNPHCGS LVNADGHGEV WTDWNNMSKF FQYGWRCTTN ENTYSNRTLM GNWNQERYDL RNIVQPKPL PSQFGHYFET TYDTSYNNKM PLSTHRFKRE PHWFPGHQPE LDPPRYKCTE KSTYMNSYSK P

UniProtKB: Cilia- and flagella-associated protein 68

分子 #20: Isoform 2 of Cilia- and flagella-associated protein 77

• 分子: 名称: Isoform 2 of Cilia- and flagella-associated protein 77; タイプ: protein_or_peptide / ID: 20 / コピー数: 5 / 光学異性体: LEVO
• 由来(天然): 生物種: Homo sapiens (ヒト)
• 分子量: 理論値: 33.037211 KDa

配列

文字列:

MPEARSSGPD LTRWRKQQQP VRRTVSQVCP PPRRPLTVAD IRSGMENERL GVVRDSMFQN PLIVKAELGK PRERSYSLPG INFNYGLYI RGLDGGVPEA IGRWNVFKQQ PTCPHELTRN YIAMNRGAVK AGLVTARENL LYRQLNDIRI SDQDDRRMKK E PPPLPPNM TFGIRARPST PFFDLLQHRY LQLWVQEQKA TQKAIKLEKK QKVVLGKLYE TRSSQLRKYK PPVKLDTLWH MP HFQKVGR HLDTFPTEAD RQRALKAHRE ECAVRQGTLR MGNYTHP

UniProtKB: Cilia- and flagella-associated protein 77

分子 #21: Protein FAM183A

• 分子: 名称: Protein FAM183A / タイプ: protein_or_peptide / ID: 21 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
• 由来(天然): 生物種: Homo sapiens (ヒト)
• 分子量: 理論値: 16.028189 KDa

配列

文字列:

MAGHPKEKVI PDEVHQNQIL RELYLKELRT QKLYTQYHVN PLRKIHTVTR KPMSWHDNLE EPADARFLNL IHHAAQGPRK KYPETQTEN QEVGWDLEPL INPERHDRRL NHFRVCSDIT LYKAKTWGLG DDHHK

UniProtKB: Cilia- and flagella-associated protein 144

分子 #22: Uncharacterized protein C5orf49

• 分子: 名称: Uncharacterized protein C5orf49 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 22 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
• 由来(天然): 生物種: Homo sapiens (ヒト)
• 分子量: 理論値: 17.01998 KDa

配列

文字列:

MEDDEEETTA STLRGKPRPP PVSAQSAFSY IPPRRLDPKE HSYYYRPART GIISLYDCIF KRRLDYDQKL HRDDREHAKS LGLHVNEEE QERPVGVLTS SVYGKRINQP IEPLNRDFGR ANHVQADFYR KNDIPSLKEP GFGHIAPS

UniProtKB: Cilia- and flagella-associated protein 90

分子 #23: Protein FAM166C

• 分子: 名称: Protein FAM166C / タイプ: protein_or_peptide / ID: 23 / コピー数: 4 / 光学異性体: LEVO
• 由来(天然): 生物種: Homo sapiens (ヒト)
• 分子量: 理論値: 23.457842 KDa

配列

文字列:

MASRSAGTLL TEFNAAYVPP GLMPGYQGHV PTVAFSFGAP YGTTTLKYFQ DHRNRAMEKS HTPFSQGGHF PTIFSTNPNL LLMERASTR DRWLHKPSYT RFNLDSHRST ELTNFYQMVQ QHRKYYQDKT GTVPRVPYFA MPVREPERYP LPTVLPPLCP K KKWHLLRL APENLKTYQT FPSGKRVSPQ ERKKRDCYFE FRA

UniProtKB: Ciliary microtubule inner protein 2C

分子 #24: RIB43A-like with coiled-coils protein 2

• 分子: 名称: RIB43A-like with coiled-coils protein 2 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 24 / コピー数: 5 / 光学異性体: LEVO
• 由来(天然): 生物種: Homo sapiens (ヒト)
• 分子量: 理論値: 45.510234 KDa

配列

文字列:

MGSQTMAVAL PRDLRQDANL AKRRHAELCR QKRVFNARNR IIGGDTEAWD VQVHDQKIKE ATEKARHETF AAEMRQNDKI MCILENRKK RDRKNLCRAI NDFQQSFQKP ETRREFDLSD PLALKKDLPA RQSDNDVRNT ISGMQKFMGE DLNFHERKKF Q EEQNREWS LQQQREWKNA RAEQKCAEAL YTETRLQFDE TAKHLQKLES TTRKAVCASV KDFNKSQAIE SVERKKQEKK QE QEDNLAE ITNLLRGDLL SENPQQAASS FGPHRVVPDR WKGMTQEQLE QIRLVQKQQI QEKLRLQEEK RQRDLDWDRR RIQ GARATL LFERQQWRRQ RDLRRALDSS NLSLAKEQHL QKKYMNEVYT NQPTGDYFTQ FNTGSR

UniProtKB: RIB43A-like with coiled-coils protein 2

分子 #25: EF-hand domain-containing protein 1

• 分子: 名称: EF-hand domain-containing protein 1 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 25 / コピー数: 3 / 光学異性体: LEVO
• 由来(天然): 生物種: Homo sapiens (ヒト)
• 分子量: 理論値: 74.084102 KDa

配列

文字列:

MVSNPVHGLP FLPGTSFKDS TKTAFHRSQT LSYRNGYAIV RRPTVGIGGD RLQFNQLSQA ELDELASKAP VLTYGQPKQA PPADFIPAH VAFDKKVLKF DAYFQEDVPM STEEQYRIRQ VNIYYYLEDD SMSVIEPVVE NSGILQGKLI KRQRLAKNDR G DHYHWKDL NRGINITIYG KTFRVVDCDQ FTQVFLESQG IELNPPEKMA LDPYTELRKQ PLRKYVTPSD FDQLKQFLTF DK QVLRFYA IWDDTDSMYG ECRTYIIHYY LMDDTVEIRE VHERNDGRDP FPLLMNRQRV PKVLVENAKN FPQCVLEISD QEV LEWYTA KDFIVGKSLT ILGRTFFIYD CDPFTRRYYK EKFGITDLPR IDVSKREPPP VKQELPPYNG FGLVEDSAQN CFAL IPKAP KKDVIKMLVN DNKVLRYLAV LESPIPEDKD RRFVFSYFLA TDMISIFEPP VRNSGIIGGK YLGRTKVVKP YSTVD NPVY YGPSDFFIGA VIEVFGHRFI ILDTDEYVLK YMESNAAQYS PEALASIQNH VRKREAPAPE AESKQTEKDP GVQELE ALI DTIQKQLKDH SCKDNIREAF QIYDKEASGY VDRDMFFKIC ESLNVPVDDS LVKELIRMCS HGEGKINYYN FVRAFSN

UniProtKB: EF-hand domain-containing protein 1

分子 #26: EF-hand domain-containing family member C2

• 分子: 名称: EF-hand domain-containing family member C2 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 26 / コピー数: 4 / 光学異性体: LEVO
• 由来(天然): 生物種: Homo sapiens (ヒト)
• 分子量: 理論値: 87.516828 KDa

配列

文字列:

MALPLLPGNS FNRNVGKEKF HKSQHWGFCN NVMMLVSDEK PGIGGEPLLG QKIKPKCSIY PKGDGSDVPS WVAFDKQVLS FDAYLEEEV LDKSQTNYRI RYYKIYFYPE DDTIQVNEPE VKNSGLLQGT SIRRHRITLP PPDEDQFYTV YHFNVGTEVV F YGRTFKIY DCDAFTRNFL RKIGVKVNPP VQCPEDPYMK IRREVVEHVE PLRPYESLDT LKQFLQYHGK ILCFFCLWDD SV SMFGDRR ELILHYFLCD DTIEIKELLP HSSGRDALKM FLRRSKLPKN CPPRVYQPGQ ITDRAVLNSY GDFIKNQADG YLF DRYKLG KVDQEFYKDS DLSLGVTINV WGRKVLLYDC DEFTKSYYKS KYGIENFTSV SCKPPSPPPK IERKFPPYNG FGSE EDSLR NCIDLKPTPH RRNFKKFMEK DSYGSKSNIL RFFAKLVTDK CVDLDRMFVI SYYLGDDTIS VFEPIERNSG IAGGM FLKR SRVKKPGQEV FKSELSEYIK AEELYIGVTV NVNGYLFRLL NADEYTLNYM EQNTDKYPFS NLKLALQKLK QEEGKS REL KQVFKAADSK HTNMVDYNTF RDILMSLTVG NLAEQEFVTI ARHYRVPEGT CSDMDFLIAL AHEKFKKNMF ENFDTFI YS CVYEDREKKN VLPTKDIKRL CKSSRLPLSD DLLESLLSRF EDSEKQIDYK SFFSALNWRK NPVPELQPAS YLKERCED V WLGMPSPIPA KYIDYWTFLK DAFGLEEE

UniProtKB: EF-hand domain-containing family member C2

分子 #27: Cilia- and flagella-associated protein 20

• 分子: 名称: Cilia- and flagella-associated protein 20 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 27 / コピー数: 7 / 光学異性体: LEVO
• 由来(天然): 生物種: Homo sapiens (ヒト)
• 分子量: 理論値: 22.807469 KDa

配列

文字列:

MFKNTFQSGF LSILYSIGSK PLQIWDKKVR NGHIKRITDN DIQSLVLEIE GTNVSTTYIT CPADPKKTLG IKLPFLVMII KNLKKYFTF EVQVLDDKNV RRRFRASNYQ STTRVKPFIC TMPMRLDDGW NQIQFNLLDF TRRAYGTNYI ETLRVQIHAN C RIRRVYFS DRLYSEDELP AEFKLYLPVQ NKAKQ

UniProtKB: Cilia- and flagella-associated protein 20

分子 #28: Parkin coregulated gene protein

• 分子: 名称: Parkin coregulated gene protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 28 / コピー数: 6 / 光学異性体: LEVO
• 由来(天然): 生物種: Homo sapiens (ヒト)
• 分子量: 理論値: 29.352184 KDa

配列

文字列:

MVAEKETLSL NKCPDKMPKR TKLLAQQPLP VHQPHSLVSE GFTVKAMMKN SVVRGPPAAG AFKERPTKPT AFRKFYERGD FPIALEHDS KGNKIAWKVE IEKLDYHHYL PLFFDGLCEM TFPYEFFARQ GIHDMLEHGG NKILPVLPQL IIPIKNALNL R NRQVICVT LKVLQHLVVS AEMVGKALVP YYRQILPVLN IFKNMNVNSG DGIDYSQQKR ENIGDLIQET LEAFERYGGE NA FINIKYV VPTYESCLLN

UniProtKB: Parkin coregulated gene protein

分子 #29: Cilia- and flagella-associated protein 45

• 分子: 名称: Cilia- and flagella-associated protein 45 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 29 / コピー数: 4 / 光学異性体: LEVO
• 由来(天然): 生物種: Homo sapiens (ヒト)
• 分子量: 理論値: 65.858109 KDa

配列

文字列:

MPLSTAGILS SSSAASNRSR NKARYRTKAV SSEVDESLFG DIKSPAQGQS DSPIVLLRDK HTLQKTLTAL GLDRKPETIQ LITRDMVRE LIVPTEDPSG ESLIISPEEF ERIKWASHVL TREELEARDQ AFKKEKEATM DAVMTRKKIM KQKEMVWNNN K KLSDLEEV AKERAQNLLQ RANKLRMEQE EELKDMSKII LNAKCHAIRD AQILEKQQIQ KELDTEEKRL DQMMEVERQK SI QRQEELE RKRREERIRG RRQIVEQMEK NQEERSLLAE QREQEKEQML EYMEQLQEED LKDMERRQQQ KLKMQAEIKR IND ENQKQK AELLAQEKLA DQMVMEFTKK KMAREAEFEA EQERIRREKE KEIARLRAMQ EKAQDYQAEQ DALRAKRNQE VADR EWRRK EKENARKKME TEAELRKSRL EQVAFKEHAL AVQVQRDRDE FERILRAQRE QIEKERLEEE KKATGRLQHA NELRR QVRE NQQKEVQNRI ATFEEGRRLK EEAQKRRERI DEIKRKKLEE LRATGLPEKY CIEAERKANI LPATSVN

UniProtKB: Cilia- and flagella-associated protein 45

分子 #30: Cilia- and flagella-associated protein 52

• 分子: 名称: Cilia- and flagella-associated protein 52 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 30 / コピー数: 3 / 光学異性体: LEVO
• 由来(天然): 生物種: Homo sapiens (ヒト)
• 分子量: 理論値: 68.379062 KDa

配列

文字列:

MDNKISPEAQ VAELELDAVI GFNGHVPTGL KCHPDQEHMI YPLGCTVLIQ AINTKEQNFL QGHGNNVSCL AISRSGEYIA SGQVTFMGF KADIILWDYK NRELLARLSL HKGKIEALAF SPNDLYLVSL GGPDDGSVVV WSIAKRDAIC GSPAAGLNVG N ATNVIFSR CRDEMFMTAG NGTIRVWELD LPNRKIWPTE CQTGQLKRIV MSIGVDDDDS FFYLGTTTGD ILKMNPRTKL LT DVGPAKD KFSLGVSAIR CLKMGGLLVG SGAGLLVFCK SPGYKPIKKI QLQGGITSIT LRGEGHQFLV GTEESHIYRV SFT DFKETL IATCHFDAVE DIVFPFGTAE LFATCAKKDI RVWHTSSNRE LLRITVPNMT CHGIDFMRDG KSIISAWNDG KIRA FAPET GRLMYVINNA HRIGVTAIAT TSDCKRVISG GGEGEVRVWQ IGCQTQKLEE ALKEHKSSVS CIRVKRNNEE CVTAS TDGT CIIWDLVRLR RNQMILANTL FQCVCYHPEE FQIITSGTDR KIAYWEVFDG TVIRELEGSL SGSINGMDIT QEGVHF VTG GNDHLVKVWD YNEGEVTHVG VGHSGNITRI RISPGNQYIV SVSADGAILR WKYPYTS

UniProtKB: Cilia- and flagella-associated protein 52

分子 #31: Enkurin

• 分子: 名称: Enkurin / タイプ: protein_or_peptide / ID: 31 / コピー数: 4 / 光学異性体: LEVO
• 由来(天然): 生物種: Homo sapiens (ヒト)
• 分子量: 理論値: 29.510348 KDa

配列

文字列:

MDPTCSSECI YNLIPSDLKE PPQPPRYISI FKATVKDDMQ KAKTAMKTMG PAKVEVPSPK DFLKKHSKEK TLPPKKNFDR NVPKKPAVP LKTDHPVMGI QSGKNFINTN AADIIMGVAK KPKPIYVDKR TGDKHDLEPS GLVPKYINKK DYGVTPEYIC K RNEEIKKA QEDYDRYIQE NLKKAAMKRL SDEEREAVLQ GLKKNWEEVH KEFQSLSVFI DSIPKKIRKQ RLEEEMKQLE HD IGIIEKH KIIYIANNA

UniProtKB: Enkurin

分子 #32: Protein Flattop

• 分子: 名称: Protein Flattop / タイプ: protein_or_peptide / ID: 32 / コピー数: 3 / 光学異性体: LEVO
• 由来(天然): 生物種: Homo sapiens (ヒト)
• 分子量: 理論値: 19.320871 KDa

配列

文字列:

MATNYSANQY EKAFSSKYLQ NWSPTKPTKE SISSHEGYTQ IIANDRGHLL PSVPRSKANP WGSFMGTWQM PLKIPPARVT LTSRTTAGA ASLTKWIQKN PDLLKASNGL CPEILGKPHD PDSQKKLRKK SITKTVQQAR SPTIIPSSPA ANLNSPDELQ S SHPSAGHT PGPQRPAKS

UniProtKB: Protein Flattop

分子 #33: Protein CFAP210

• 分子: 名称: Protein CFAP210 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 33 / コピー数: 3 / 光学異性体: LEVO
• 由来(天然): 生物種: Homo sapiens (ヒト)
• 分子量: 理論値: 66.544008 KDa

配列

文字列:

MDTSSEMLVR FGRRCGRAKE STEIRNSEED QVLYLPLLPS KVDLQQVTII PHDEWKRIQD SLDRLTREAA CLRAERKAKK EMHLRSQEV VKHWTNTYAG MKEQKLEAKK KRDEEIEAER QILDLEEEIY KQGKRKKAIE NAKQYQFYQT ERVKNFHSGL L LSRVMKER DAQIEFRKSK IKSDKKWEEQ LKLNIEKAFK EEQEKAEKRH RERVALAKDH LKQIKEHEEE EERRKKYEEK DA EEIKRQN ALYEIEMRKK LEKKREEMHE SRRRFLEHMQ DKHIIKAVEQ QQQEEEDEKM RKFIKAKKRL IQMGKEKEAE THR LMEKRR ERIHNFLSEL LKEKLDNEDM IIARDIAEAE AEWEKREREK DEKNKAELKT IAEYRAIVMK NKEEEERQRK IEAK EQLLA VMKADQIFWE HEKEKKCKAD KEHQEVQDAH IQQMAKNKFN AKQAKQAELD YCRLTEALVA EKEKEFQDYA REVIE LESE TTNKYIYPLV KAVQEGPGGG RGPVFVDRGG LRPSYQANDV TGVQLPFYNS QGPKYNFQKS KRRLGFTW

UniProtKB: Cilia- and flagella- associated protein 210

分子 #34: Protein CFAP276

• 分子: 名称: Protein CFAP276 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 34 / コピー数: 3 / 光学異性体: LEVO
• 由来(天然): 生物種: Homo sapiens (ヒト)
• 分子量: 理論値: 19.376688 KDa

配列

文字列:

MPPTRDPFQQ PTLDNDDSYL GELRASKKLP YKNPTHLAQQ QEPWSRLNST PTITSMRRDA YYFDPEIPKD DLDFRLAALY NHHTGTFKN KSEILLNQKT TQDTYRTKIQ FPGEFLTPPT PPITFLANIR HWINPKKESI HSIQGSIVSP HTAATNGGYS R KKDGGFFS T

UniProtKB: Cilia- and flagella-associated protein 276

分子 #35: UPF0691 protein C9orf116

• 分子: 名称: UPF0691 protein C9orf116 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 35 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
• 由来(天然): 生物種: Homo sapiens (ヒト)
• 分子量: 理論値: 15.278101 KDa

配列

文字列:

MAEECPRACA EPVAPKATAP PERTSDYYRV SADLPGRFNN PGWFRGYRTQ KAVSVYRTSN QAYGSRAPTV HEMPKVFYPN SNKFSQQLA AGGMFRNNTL NVYLEKSIVT GPDNCITSCD RLNFHPSYNI NRPSICD

UniProtKB: Piercer of microtubule wall 1 protein

分子 #36: GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE

• 分子: 名称: GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE / タイプ: ligand / ID: 36 / コピー数: 149 / 式: GTP
• 分子量: 理論値: 523.18 Da

Chemical component information

ChemComp-GTP:
GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE / GTP / GTP, エネルギー貯蔵分子*YM

分子 #37: MAGNESIUM ION

• 分子: 名称: MAGNESIUM ION / タイプ: ligand / ID: 37 / コピー数: 149 / 式: MG
• 分子量: 理論値: 24.305 Da

分子 #38: GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE

• 分子: 名称: GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE / タイプ: ligand / ID: 38 / コピー数: 153 / 式: GDP
• 分子量: 理論値: 443.201 Da

Chemical component information

ChemComp-GDP:
GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE / GDP / GDP, エネルギー貯蔵分子*YM

実験情報

構造解析

• 手法: クライオ電子顕微鏡法
• 解析: 単粒子再構成法
• 試料の集合状態: filament

試料調製

• 緩衝液: pH: 7.3
• グリッド: モデル: Quantifoil R2/1 / 前処理 - タイプ: GLOW DISCHARGE
• 凍結: 凍結剤: ETHANE / チャンバー内湿度: 100 %

電子顕微鏡法

• 顕微鏡: FEI TITAN KRIOS
• 撮影: フィルム・検出器のモデル: GATAN K3 BIOQUANTUM (6k x 4k); 平均電子線量: 60.0 e/Ų
• 電子線: 加速電圧: 300 kV / 電子線源: FIELD EMISSION GUN
• 電子光学系: 照射モード: FLOOD BEAM / 撮影モード: BRIGHT FIELD / 最大 デフォーカス（公称値）: 2.0 µm / 最小 デフォーカス（公称値）: 0.8 µm / 倍率（公称値）: 64000
• 試料ステージ: 試料ホルダーモデル: FEI TITAN KRIOS AUTOGRID HOLDER; ホルダー冷却材: NITROGEN
• 実験機器: モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company

画像解析

初期モデル

モデルのタイプ: EMDB MAP
EMDB ID:

24664

• 最終 再構成: 解像度のタイプ: BY AUTHOR / 解像度: 3.6 Å / 解像度の算出法: FSC 0.143 CUT-OFF / 使用した粒子像数: 208558
• 初期 角度割当: タイプ: MAXIMUM LIKELIHOOD
• 最終 角度割当: タイプ: MAXIMUM LIKELIHOOD