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- EMDB-16896: 39S mammalian mitochondrial large ribosomal subunit with mtRF1 an... -

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基本情報

登録情報
データベース: EMDB / ID: EMD-16896
タイトル39S mammalian mitochondrial large ribosomal subunit with mtRF1 and P-site tRNA
マップデータ39S mammalian mitochondrial large ribosomal subunit with mtRF1 and P-site tRNA
試料
  • 複合体: 39S mammalian mitochondrial ribosome with mtRF1 and P-site tRNAMet
    • タンパク質・ペプチド: x 53種
    • RNA: x 4種
  • リガンド: x 6種
キーワードmammalian mitochondrial ribosome / release factor mtRF1 / non-canonical stop codon / RIBOSOME
機能・相同性
機能・相同性情報


Mitochondrial translation elongation / Mitochondrial translation termination / translation release factor activity / mitochondrial transcription / mitochondrial translational elongation / mitochondrial translational termination / translation release factor activity, codon nonspecific / microprocessor complex / translation release factor activity, codon specific / ribonuclease III activity ...Mitochondrial translation elongation / Mitochondrial translation termination / translation release factor activity / mitochondrial transcription / mitochondrial translational elongation / mitochondrial translational termination / translation release factor activity, codon nonspecific / microprocessor complex / translation release factor activity, codon specific / ribonuclease III activity / Mitochondrial protein degradation / mitochondrial large ribosomal subunit / peptidyl-tRNA hydrolase / mitochondrial small ribosomal subunit / aminoacyl-tRNA hydrolase activity / mitochondrial ribosome / mitochondrial translation / organelle membrane / RNA processing / rescue of stalled ribosome / cellular response to leukemia inhibitory factor / large ribosomal subunit / double-stranded RNA binding / small ribosomal subunit rRNA binding / cell junction / large ribosomal subunit rRNA binding / cytosolic large ribosomal subunit / negative regulation of translation / nuclear body / rRNA binding / ribosome / structural constituent of ribosome / ribonucleoprotein complex / translation / cell cycle / protein domain specific binding / nucleotide binding / mRNA binding / synapse / positive regulation of DNA-templated transcription / mitochondrion / RNA binding / nucleoplasm / nucleus / plasma membrane / cytosol / cytoplasm
類似検索 - 分子機能
Ribosomal protein L1, mitochondrial / Peptide chain release factor / PCRF domain / PCRF / Peptide chain release factor class I superfamily / Prokaryotic-type class I peptide chain release factors signature. / Ribosomal protein L37, mitochondrial / Ribosomal protein L55, mitochondrial / Mitochondrial ribosomal protein L48 / 39S ribosomal protein L40, mitochondrial ...Ribosomal protein L1, mitochondrial / Peptide chain release factor / PCRF domain / PCRF / Peptide chain release factor class I superfamily / Prokaryotic-type class I peptide chain release factors signature. / Ribosomal protein L37, mitochondrial / Ribosomal protein L55, mitochondrial / Mitochondrial ribosomal protein L48 / 39S ribosomal protein L40, mitochondrial / Mitochondrial ribosomal protein L55 superfamily / Mitochondrial ribosomal protein L37 / Mitochondrial ribosomal protein L55 / Mitochondrial ribosomal protein L46 NUDIX / Ribosomal protein S30, mitochondrial / Ribosomal protein L53, mitochondrial / 39S ribosomal protein L53/MRP-L53 / 39S ribosomal protein L42, mitochondrial / Mitochondrial 28S ribosomal protein S32 / Ribosomal protein L28/L40, mitochondrial / Mitochondrial ribosomal protein L28 / Ribosomal protein L37/S30 / Ribosomal protein 63, mitochondrial / Growth arrest/ DNA-damage-inducible protein-interacting protein 1 / Ribosomal protein L51, mitochondrial / Mitochondrial 28S ribosomal protein S30 (PDCD9) / Growth arrest and DNA-damage-inducible proteins-interacting protein 1 / Mitochondrial ribosomal subunit / Mitochondrial ribosome protein 63 / Growth arrest and DNA damage-inducible proteins-interacting protein 1 domain superfamily / Ribosomal protein L35, mitochondrial / 39S ribosomal protein L52, mitochondrial / Mitoribosomal protein mL52 / MRPL44, double-stranded RNA binding domain / Tim44-like domain / Tim44-like domain / Tim44 / Ribosomal protein L49/IMG2 / Mitochondrial large subunit ribosomal protein (Img2) / Ribosomal protein L46, N-terminal / 39S mitochondrial ribosomal protein L46 / Ribosomal protein L50, mitochondria / Ribosomal protein L27/L41, mitochondrial / Mitochondrial ribosomal protein L27 / Ribosomal subunit 39S / 39S ribosomal protein L46, mitochondrial / Ribosomal protein L7/L12, oligomerisation / Ribosomal protein L7/L12, oligomerisation domain superfamily / Ribosomal protein L7/L12 dimerisation domain / Ribosomal protein L7/L12 / Ribosomal protein L7/L12, C-terminal / Ribosomal protein L7/L12 C-terminal domain / Ribosomal protein L47, mitochondrial / MRP-L47 superfamily, mitochondrial / 39S ribosomal protein L43/54S ribosomal protein L51 / Mitochondrial 39-S ribosomal protein L47 (MRP-L47) / Phosphatidylethanolamine-binding protein / Phosphatidylethanolamine-binding protein / Phosphatidylethanolamine-binding protein, eukaryotic / PEBP-like superfamily / Ribosomal protein L7/L12, C-terminal/adaptor protein ClpS-like / Threonyl/alanyl tRNA synthetase, class II-like, putative editing domain superfamily / TGS domain profile. / TGS / TGS-like / Peptide chain release factor class I / RF-1 domain / Ribonuclease III, endonuclease domain superfamily / Double stranded RNA-binding domain (dsRBD) profile. / Double-stranded RNA-binding domain / : / Ribosomal protein/NADH dehydrogenase domain / Mitochondrial ribosomal protein L51 / S25 / CI-B8 domain / Mitochondrial ribosomal protein L51 / S25 / CI-B8 domain / Beta-grasp domain superfamily / NTF2-like domain superfamily / Ribosomal protein L1, 3-layer alpha/beta-sandwich / NUDIX hydrolase-like domain superfamily / Ribosomal protein L1-like / Ribosomal protein L1/ribosomal biogenesis protein / Ribosomal protein L1p/L10e family / Ribosomal protein L10-like domain superfamily / Ribosomal protein L10 / Ribosomal protein L10P / Ribosomal protein L11/L12 / Ribosomal protein L11, C-terminal / Ribosomal protein L11, C-terminal domain superfamily / Ribosomal protein L11/L12, N-terminal domain superfamily / Ribosomal protein L11, RNA binding domain / Ribosomal protein L11/L12 / Ribosomal protein L28/L24 superfamily / Ribosomal protein L9, N-terminal domain superfamily / Ribosomal protein L9 / Ribosomal protein L9, N-terminal / Ribosomal protein L9, N-terminal domain / Ribosomal protein L36 / Ribosomal protein L36 superfamily / Ribosomal protein L36 / Ribosomal protein L9/RNase H1, N-terminal / Ribosomal protein L35
類似検索 - ドメイン・相同性
Large ribosomal subunit protein uL3m / Large ribosomal subunit protein mL62 / Large ribosomal subunit protein mL40 / Large ribosomal subunit protein bL28m / 39S ribosomal protein L20, mitochondrial isoform 1 / Large ribosomal subunit protein bL33m / Large ribosomal subunit protein mL64 / 39S ribosomal protein L49, mitochondrial / Large ribosomal subunit protein bL34m / Mitochondrial ribosomal protein L2 ...Large ribosomal subunit protein uL3m / Large ribosomal subunit protein mL62 / Large ribosomal subunit protein mL40 / Large ribosomal subunit protein bL28m / 39S ribosomal protein L20, mitochondrial isoform 1 / Large ribosomal subunit protein bL33m / Large ribosomal subunit protein mL64 / 39S ribosomal protein L49, mitochondrial / Large ribosomal subunit protein bL34m / Mitochondrial ribosomal protein L2 / Ribosomal protein / Large ribosomal subunit protein uL1m / Mitochondrial ribosomal protein L12 / Mitochondrial ribosomal protein L41 / Large ribosomal subunit protein uL4m / Large ribosomal subunit protein mL51 / Large ribosomal subunit protein mL37 / Large ribosomal subunit protein uL14m / Mitochondrial ribosomal protein L57 / Large ribosomal subunit protein mL42 / 39S ribosomal protein L48, mitochondrial / Large ribosomal subunit protein uL23m / 39S ribosomal protein S30, mitochondrial / Mitochondrial ribosomal protein L18 / 39S ribosomal protein L35, mitochondrial / Large ribosomal subunit protein uL15m / Large ribosomal subunit protein mL53 / Large ribosomal subunit protein uL24m / Large ribosomal subunit protein uL16m / Large ribosomal subunit protein bL17m / Large ribosomal subunit protein uL22m / Mitochondrial ribosomal protein S18A / 39S ribosomal protein L27, mitochondrial / Large ribosomal subunit protein uL11m / Large ribosomal subunit protein mL38 / Large ribosomal subunit protein uL10m / Large ribosomal subunit protein bL21m / Large ribosomal subunit protein mL43 / Large ribosomal subunit protein mL52 / Large ribosomal subunit protein uL29m / Mitochondrial ribosomal protein L39 / Large ribosomal subunit protein mL44 / Large ribosomal subunit protein mL46 / Large ribosomal subunit protein uL30m / Large ribosomal subunit protein mL50 / Mitochondrial ribosomal protein L55 / Large ribosomal subunit protein mL45 / Large ribosomal subunit protein mL54 / Large ribosomal subunit protein bL19m / Large ribosomal subunit protein bL9m / Large ribosomal subunit protein bL32m / 39S ribosomal protein L13, mitochondrial / Peptide chain release factor 1, mitochondrial
類似検索 - 構成要素
生物種Sus scrofa (ブタ) / Homo sapiens (ヒト)
手法単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 3.5 Å
データ登録者Saurer M / Leibundgut M / Scaiola A / Schoenhut T / Ban N
資金援助 スイス, European Union, 3件
OrganizationGrant number国
Swiss National Science Foundation179190 スイス
Swiss National Science Foundation182341 スイス
European Molecular Biology Organization (EMBO)1074-2019European Union
引用ジャーナル: Science / 年: 2023
タイトル: Molecular basis of translation termination at noncanonical stop codons in human mitochondria.
著者: Martin Saurer / Marc Leibundgut / Hima Priyanka Nadimpalli / Alain Scaiola / Tanja Schönhut / Richard G Lee / Stefan J Siira / Oliver Rackham / René Dreos / Tea Lenarčič / Eva Kummer / ...著者: Martin Saurer / Marc Leibundgut / Hima Priyanka Nadimpalli / Alain Scaiola / Tanja Schönhut / Richard G Lee / Stefan J Siira / Oliver Rackham / René Dreos / Tea Lenarčič / Eva Kummer / David Gatfield / Aleksandra Filipovska / Nenad Ban /
要旨: The genetic code that specifies the identity of amino acids incorporated into proteins during protein synthesis is almost universally conserved. Mitochondrial genomes feature deviations from the ...The genetic code that specifies the identity of amino acids incorporated into proteins during protein synthesis is almost universally conserved. Mitochondrial genomes feature deviations from the standard genetic code, including the reassignment of two arginine codons to stop codons. The protein required for translation termination at these noncanonical stop codons to release the newly synthesized polypeptides is not currently known. In this study, we used gene editing and ribosomal profiling in combination with cryo-electron microscopy to establish that mitochondrial release factor 1 (mtRF1) detects noncanonical stop codons in human mitochondria by a previously unknown mechanism of codon recognition. We discovered that binding of mtRF1 to the decoding center of the ribosome stabilizes a highly unusual conformation in the messenger RNA in which the ribosomal RNA participates in specific recognition of the noncanonical stop codons.
履歴
登録2023年3月23日-
ヘッダ(付随情報) 公開2023年6月14日-
マップ公開2023年6月14日-
更新2023年11月15日-
現状2023年11月15日処理サイト: PDBe / 状態: 公開

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構造の表示

添付画像

emd_16896.png

ダウンロードとリンク

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マップ

ファイルダウンロード / ファイル: emd_16896.map.gz / 形式: CCP4 / 大きさ: 476.8 MB / タイプ: IMAGE STORED AS FLOATING POINT NUMBER (4 BYTES)
注釈39S mammalian mitochondrial large ribosomal subunit with mtRF1 and P-site tRNA
ボクセルのサイズX=Y=Z: 1.065 Å
密度
表面レベル登録者による: 0.5
最小 - 最大-2.4873815 - 3.8000934
平均 (標準偏差)-0.00095234596 (±0.13020763)
対称性空間群: 1
詳細

EMDB XML:

マップ形状
Axis orderXYZ
Origin000
サイズ500500500
Spacing500500500
セルA=B=C: 532.5 Å
α=β=γ: 90.0 °

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添付データ

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ハーフマップ: half map A

ファイルemd_16896_half_map_1.map
注釈half map A
投影像・断面図
軸ZYX

投影像

断面 (1/2)
密度ヒストグラム

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)

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ハーフマップ: half map B

ファイルemd_16896_half_map_2.map
注釈half map B
投影像・断面図
軸ZYX

投影像

断面 (1/2)
密度ヒストグラム

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)

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試料の構成要素

+
全体 : 39S mammalian mitochondrial ribosome with mtRF1 and P-site tRNAMet

全体名称: 39S mammalian mitochondrial ribosome with mtRF1 and P-site tRNAMet
要素
  • 複合体: 39S mammalian mitochondrial ribosome with mtRF1 and P-site tRNAMet
    • タンパク質・ペプチド: Mitochondrial ribosomal protein L12
    • RNA: E-site tRNA
    • RNA: 16S rRNA
    • RNA: CP Phe-tRNA
    • タンパク質・ペプチド: uL22m
    • タンパク質・ペプチド: 39S ribosomal protein L23, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: uL24m
    • タンパク質・ペプチド: Mitochondrial ribosomal protein L27
    • タンパク質・ペプチド: Mitochondrial ribosomal protein L28
    • タンパク質・ペプチド: Mitochondrial ribosomal protein L47
    • タンパク質・ペプチド: uL30m
    • タンパク質・ペプチド: Mitochondrial ribosomal protein L32
    • タンパク質・ペプチド: bL33m
    • タンパク質・ペプチド: Mitochondrial ribosomal protein L34
    • タンパク質・ペプチド: 39S ribosomal protein L35, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: Mitochondrial ribosomal protein L2
    • タンパク質・ペプチド: ICT1
    • タンパク質・ペプチド: Mitochondrial ribosomal protein L4
    • タンパク質・ペプチド: Mitochondrial ribosomal protein L9
    • タンパク質・ペプチド: Mitochondrial ribosomal protein L10
    • タンパク質・ペプチド: Mitochondrial ribosomal protein L11
    • タンパク質・ペプチド: 39S ribosomal protein L13, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: Mitochondrial ribosomal protein L14
    • タンパク質・ペプチド: 39S ribosomal protein L15, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: uL16m
    • タンパク質・ペプチド: bL17m
    • タンパク質・ペプチド: Mitochondrial ribosomal protein L18
    • タンパク質・ペプチド: 39S ribosomal protein L19, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: Mitochondrial ribosomal protein L20
    • タンパク質・ペプチド: Mitochondrial ribosomal protein L21
    • タンパク質・ペプチド: 39S ribosomal protein L52, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: Mitochondrial ribosomal protein L53
    • タンパク質・ペプチド: mL54
    • タンパク質・ペプチド: bL31m
    • タンパク質・ペプチド: Mitochondrial ribosomal protein L57
    • タンパク質・ペプチド: mL62 (ICT1)
    • タンパク質・ペプチド: mL64
    • タンパク質・ペプチド: Mitochondrial ribosomal protein S18A
    • タンパク質・ペプチド: 39S ribosomal protein S30, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: 39S ribosomal protein L1, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: Ribosomal protein
    • タンパク質・ペプチド: Mitochondrial ribosomal protein L37
    • タンパク質・ペプチド: Mitochondrial ribosomal protein L38
    • タンパク質・ペプチド: Mitochondrial ribosomal protein L39
    • タンパク質・ペプチド: Mitochondrial ribosomal protein L40
    • タンパク質・ペプチド: Mitochondrial ribosomal protein L41
    • タンパク質・ペプチド: mL42
    • タンパク質・ペプチド: 39S ribosomal protein L43, mitochondrial isoform X2
    • タンパク質・ペプチド: mL44
    • タンパク質・ペプチド: Mitochondrial ribosomal protein L45
    • タンパク質・ペプチド: Mitochondrial ribosomal protein L46
    • タンパク質・ペプチド: 39S ribosomal protein L48, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: 39S ribosomal protein L49, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: Mitochondrial ribosomal protein L50
    • タンパク質・ペプチド: Mitochondrial ribosomal protein L51
    • RNA: P-site Met-tRNA(fMet)
    • タンパク質・ペプチド: Peptide chain release factor 1, mitochondrial
  • リガンド: MAGNESIUM ION
  • リガンド: POTASSIUM ION
  • リガンド: PHENYLALANINE
  • リガンド: ZINC ION
  • リガンド: FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER
  • リガンド: N-FORMYLMETHIONINE

+
超分子 #1: 39S mammalian mitochondrial ribosome with mtRF1 and P-site tRNAMet

超分子名称: 39S mammalian mitochondrial ribosome with mtRF1 and P-site tRNAMet
タイプ: complex / ID: 1 / 親要素: 0 / 含まれる分子: #1-#57
詳細: Mammalian mitochondrial translation termination complex, in vitro reconstituted from porcine mitoribosomal subunits, human mtRF1-3xFLAG, human methionine-tRNA(formyl-methionine), and a ...詳細: Mammalian mitochondrial translation termination complex, in vitro reconstituted from porcine mitoribosomal subunits, human mtRF1-3xFLAG, human methionine-tRNA(formyl-methionine), and a synthetic mRNA (5'-A AUG AGA CAA-3') containing the non-canonical stop codon AGA. Refined with focus on the large subunit.
由来(天然)生物種: Sus scrofa (ブタ) / 器官: Liver / Organelle: Mitochondria / 細胞中の位置: Mitochondrial matrix
分子量理論値: 1.5 MDa

+
分子 #1: Mitochondrial ribosomal protein L12

分子名称: Mitochondrial ribosomal protein L12 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 1 / コピー数: 6 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sus scrofa (ブタ) / 器官: Liver
分子量理論値: 21.268975 KDa
配列文字列: MLPAAASSLW GPCFGLRAAA LRVARHQGPR LCGVRLMRCS SHRKGEALAG APLDNAPKEY PPKIQQLVQD IASLTLLEIS DLNELLKKT LKIQDVGFMP MGAVAPGAPP AAAAPEAAEE DLPKRKEQTH FTVRLTEAKP VDKVKLIKEI KSHIQGINLV Q AKKLVESL ...文字列:
MLPAAASSLW GPCFGLRAAA LRVARHQGPR LCGVRLMRCS SHRKGEALAG APLDNAPKEY PPKIQQLVQD IASLTLLEIS DLNELLKKT LKIQDVGFMP MGAVAPGAPP AAAAPEAAEE DLPKRKEQTH FTVRLTEAKP VDKVKLIKEI KSHIQGINLV Q AKKLVESL PQEIKANVPK AEAEKIKAAL EAVGGTVVLE

UniProtKB: Mitochondrial ribosomal protein L12

+
分子 #5: uL22m

分子名称: uL22m / タイプ: protein_or_peptide / ID: 5 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sus scrofa (ブタ) / 器官: Liver
分子量理論値: 24.313357 KDa
配列文字列: MAAAVLERLG GLWMQNLRGK LALRLLSSHS ILPQSHIHTS ASVEISRKWE KKNKIVYPPQ LPGEPRRPAE IYHCRRQIKY SKDKMWYLA KLIRGMSIDQ ALAQLEFSDK KGAQIIKEVL LEAQDMAVRD HNVEFRSNLY VAESTSGRGQ YLKRIRYHGR G RFGIMEKV ...文字列:
MAAAVLERLG GLWMQNLRGK LALRLLSSHS ILPQSHIHTS ASVEISRKWE KKNKIVYPPQ LPGEPRRPAE IYHCRRQIKY SKDKMWYLA KLIRGMSIDQ ALAQLEFSDK KGAQIIKEVL LEAQDMAVRD HNVEFRSNLY VAESTSGRGQ YLKRIRYHGR G RFGIMEKV FCHYFVKLVE GPPPPREAPK TAVAHAREYI QELRNRTITH AL

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL22m

+
分子 #6: 39S ribosomal protein L23, mitochondrial

分子名称: 39S ribosomal protein L23, mitochondrial / タイプ: protein_or_peptide / ID: 6 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sus scrofa (ブタ) / 器官: Liver
分子量理論値: 17.685244 KDa
配列文字列:
M(AYA)RNVLYPLY QLGNPQLRVF RTNFFIQLVR PGTAQPEDTV QFRIPMEMTR VDLRNYLERI YNVPVAAVRT RVQYGS NRR RDHRNIRIKK PDYKVAYVQL ALGQTFTFPD LFPERKGASV DVDVRDQVLE DQRQKHSPDP RRGGVPGWFG L

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL23m

+
分子 #7: uL24m

分子名称: uL24m / タイプ: protein_or_peptide / ID: 7 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sus scrofa (ブタ) / 器官: Liver
分子量理論値: 24.893529 KDa
配列文字列: MRLSALLALA SKVTLPPNYR YGMSRPGSLS DKRKNPPGTR RRRVPVEPIS DEDWHLFCGD KVEILEGKDA GKQGKVVQVI RQRNWVVVE GLNTHYRYVG KTVDYRGTMI PSEAPLLHNQ VKLVDPTDRK PTDVEWRFTE AGERVRVSTR SGRIIPKPEF P RADGIVPE ...文字列:
MRLSALLALA SKVTLPPNYR YGMSRPGSLS DKRKNPPGTR RRRVPVEPIS DEDWHLFCGD KVEILEGKDA GKQGKVVQVI RQRNWVVVE GLNTHYRYVG KTVDYRGTMI PSEAPLLHNQ VKLVDPTDRK PTDVEWRFTE AGERVRVSTR SGRIIPKPEF P RADGIVPE TWIDGPKDTS VEDALEKTYV PRLKTLEEEV MEAMGIQETR RHKKVYWY

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL24m

+
分子 #8: Mitochondrial ribosomal protein L27

分子名称: Mitochondrial ribosomal protein L27 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 8 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sus scrofa (ブタ) / 器官: Liver
分子量理論値: 15.943688 KDa
配列文字列:
MALAVLALRT RAAVTALLSP PQAAALAVRY ASKKTGGSSK NLGGKSPGKR FGIKKMEGHY VHAGNILATQ RHFRWHPGAH VGLGKNKCL YALEEGVVRY TKEVYVPNPS NSEAVDLVTR LPQGAVLYKT FVHVVPAKPE GTFKLVAML

UniProtKB: 39S ribosomal protein L27, mitochondrial

+
分子 #9: Mitochondrial ribosomal protein L28

分子名称: Mitochondrial ribosomal protein L28 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 9 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sus scrofa (ブタ) / 器官: Liver
分子量理論値: 30.148953 KDa
配列文字列: MPLHKVPVGL WKQLRLWEGI YSRLPRHYLR SLEEARTPTP VHYRPHGAKF KINPKNWQRE RVEDVPIPVH YPPESQLGLW GGEGWVLGH RYVNNDKLSK RVRKVWKPQL FQRELYSEIL DKRFTVTVTM RTLDLIDQAC GFDFYILKTP KEDLCSKFGM D LKRGMLLR ...文字列:
MPLHKVPVGL WKQLRLWEGI YSRLPRHYLR SLEEARTPTP VHYRPHGAKF KINPKNWQRE RVEDVPIPVH YPPESQLGLW GGEGWVLGH RYVNNDKLSK RVRKVWKPQL FQRELYSEIL DKRFTVTVTM RTLDLIDQAC GFDFYILKTP KEDLCSKFGM D LKRGMLLR LARQDPQLHP DDPARRAAIY DRYKAFVIPE AEAEWVGLTL DEAVEKQRLL EEKDPIPLFK IFVEELLGQL QQ QALSEPA VVQTRASRK

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein bL28m

+
分子 #10: Mitochondrial ribosomal protein L47

分子名称: Mitochondrial ribosomal protein L47 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 10 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sus scrofa (ブタ) / 器官: Liver
分子量理論値: 29.894867 KDa
配列文字列: MAAAGLAVFC RRVSAALKAC RLLIRPQAPP STRFSPSLLP KNTPNVTSFH QFRIFHTTFS RRGLEEFFDD PKNWGEEKVK SGASWTCQQ LRNKSNEDLH KLWYVLLKER NMLLTLEQEA KRQRLPMPSP ERLEKVVDSM DALDKVVQER EDALRLLQTG Q EKARPGAW ...文字列:
MAAAGLAVFC RRVSAALKAC RLLIRPQAPP STRFSPSLLP KNTPNVTSFH QFRIFHTTFS RRGLEEFFDD PKNWGEEKVK SGASWTCQQ LRNKSNEDLH KLWYVLLKER NMLLTLEQEA KRQRLPMPSP ERLEKVVDSM DALDKVVQER EDALRLLQTG Q EKARPGAW RRDIFGRIIW HKFKQWPIPW YLNKKYNRKR FFAMPYVERF VRMRIEKQAR IKARKRSLER KKEKFLQEKF PH LSETQKS SHV

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL29m

+
分子 #11: uL30m

分子名称: uL30m / タイプ: protein_or_peptide / ID: 11 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sus scrofa (ブタ) / 器官: Liver
分子量理論値: 18.9211 KDa
配列文字列:
HPPRQDFLVR RQPHRNRTVT KGMESLICTD WIRHKFTRSR IPDKVFQPSP EDHEKYGGDP QYPHKLHIVT RIKSTKRRPY WEKDIIKML GLEKAHTPQV HKNIPSVNAK LKVVKHLIRI KPLKLPQGLP TEEDMANTCL KSNGELVVRW LLNPANQEAR K S

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL30m

+
分子 #12: Mitochondrial ribosomal protein L32

分子名称: Mitochondrial ribosomal protein L32 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 12 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sus scrofa (ブタ) / 器官: Liver
分子量理論値: 23.567215 KDa
配列文字列: MLEVGVGPRP DGRGFWASNM ASAMLVLVVP PWPAARGLLR NWWEQLQRKL QHNRLGLPLH PWGPALAVQG PAICTEPAND TNGSKAISS LLDSVFWMAA PKNRRSIEVN RCRRRNPQKL IKVKNNIDVC PECGHLKQKH ILCGYCYEKV RKETAEIRRQ M GKQEGGPF ...文字列:
MLEVGVGPRP DGRGFWASNM ASAMLVLVVP PWPAARGLLR NWWEQLQRKL QHNRLGLPLH PWGPALAVQG PAICTEPAND TNGSKAISS LLDSVFWMAA PKNRRSIEVN RCRRRNPQKL IKVKNNIDVC PECGHLKQKH ILCGYCYEKV RKETAEIRRQ M GKQEGGPF RAPTTETVVL YSGETPSEQD QGKRIIERER KRPSWFTQN

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein bL32m

+
分子 #13: bL33m

分子名称: bL33m / タイプ: protein_or_peptide / ID: 13 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sus scrofa (ブタ) / 器官: Liver
分子量理論値: 7.508097 KDa
配列文字列:
MFLSAVTFAK SKSKTILVKM MSQAGTGFSF NTKRSRLREK LTLLHYDPVV KKKVLFVEQK KIRSL

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein bL33m

+
分子 #14: Mitochondrial ribosomal protein L34

分子名称: Mitochondrial ribosomal protein L34 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 14 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sus scrofa (ブタ) / 器官: Liver
分子量理論値: 10.871729 KDa
配列文字列:
MAFLARSVGR LLDPVSRSAA LVGGRWLQPQ AWLGFPDTWG LPAMQQTRGK ARGNEYQPSN IKRKHKHGWV RRLRTPTGVQ VILRRMHKG RKSLSH

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein bL34m

+
分子 #15: 39S ribosomal protein L35, mitochondrial

分子名称: 39S ribosomal protein L35, mitochondrial / タイプ: protein_or_peptide / ID: 15 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sus scrofa (ブタ) / 器官: Liver
分子量理論値: 21.548543 KDa
配列文字列:
MAASAFAGAV RAATGILRPL HILASSAYQN CAKNACLSSV LSSRHFSHIQ TSALLSAPRL ITSVRNLMCG PTAPVLNRVA PLLPHVLKP PVRTVTYFSS RKGKRKTVKA VIYRFLRLHS GLWLRRKAGY KKKLWKKTAA RKRRLREFVF CNKTQSKLLD K MTTSFWKR RNWYADDPYQ KYQDRTNLKV

UniProtKB: 39S ribosomal protein L35, mitochondrial

+
分子 #16: Mitochondrial ribosomal protein L2

分子名称: Mitochondrial ribosomal protein L2 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 16 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sus scrofa (ブタ) / 器官: Liver
分子量理論値: 33.270934 KDa
配列文字列: MALRVLTRAL SSLSLTPRIA VAPGLNLLPA VQVTNNVLLT LPSGLMSLPC RPILTSVALS ATSVSWKSRT KYTVMPVKMR KSGGRNHTG QIQVHGIGGG HKQRYRMIDF LRFRPEHESK PGPFEEKVIA VRYDPCRSAD IALVAGGNRK RWIIATENMK A GDTVLNSD ...文字列:
MALRVLTRAL SSLSLTPRIA VAPGLNLLPA VQVTNNVLLT LPSGLMSLPC RPILTSVALS ATSVSWKSRT KYTVMPVKMR KSGGRNHTG QIQVHGIGGG HKQRYRMIDF LRFRPEHESK PGPFEEKVIA VRYDPCRSAD IALVAGGNRK RWIIATENMK A GDTVLNSD HIGRMAVAAR EGDAHPLGAL PVGTLINNVE SEPGRGAQYI RAAGTCGVLL RKVNGTAIIQ LPSKRQMQVL ET CIATVGR VSNVDHNKRV IGKAGRNRWL GKRPNSGLWQ RKGGWAGRKI RPLPPMKSYV KLPSAAAQS

UniProtKB: Mitochondrial ribosomal protein L2

+
分子 #17: ICT1

分子名称: ICT1 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 17 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sus scrofa (ブタ) / 器官: Liver
分子量理論値: 43.70827 KDa
配列文字列: MAPAALLPSW GQRGAAAGGG GKAWEGRRRN ALKAEWRGAQ RCSGRALLGL TMPGWGLLGR AGARVLGCGA DGLGASRGLG NRTDICLLV RSLHGKSVTW WDEHLSEENV PFVKQLVSDE NKAQLASKLC PLKDEPWPIH PWEPGSSRVG LIALKLGMMP L WTKDGQKH ...文字列:
MAPAALLPSW GQRGAAAGGG GKAWEGRRRN ALKAEWRGAQ RCSGRALLGL TMPGWGLLGR AGARVLGCGA DGLGASRGLG NRTDICLLV RSLHGKSVTW WDEHLSEENV PFVKQLVSDE NKAQLASKLC PLKDEPWPIH PWEPGSSRVG LIALKLGMMP L WTKDGQKH VVTLLQVQDC HVLKYTPKEN HNGRMAALTV GGKTVSHFHK SASILEFYQE LGLPPKQKVK IFNVTENAVI KP GTPLYAA HFRPGQYVDV TAKTIGKGFQ GVMRRWGFKG QPATHGQTKT HRRPGAISTG DVARVWPGTK MPGQLGNIDR TAF GLKVWR INTKHNIIYV NGSVPGHKNC LVKIKDSKLP AYKDFCKNLP FPTYFPDGDE EALPEDLYDE NVCQPGAPSI TFT

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL3m

+
分子 #18: Mitochondrial ribosomal protein L4

分子名称: Mitochondrial ribosomal protein L4 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 18 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sus scrofa (ブタ) / 器官: Liver
分子量理論値: 33.251469 KDa
配列文字列: MLQLVRAGAR TWFRPSGCRG LNTLAEEAVQ QAEKPESVAS LGLQPPVLRK CELPVPAHRR PVQAWIESLR GYEQERVGLT ELHPDVFST APRLDILHQV AIWQKNFKRI SYAKTKTRAE VRGGGRKPWV QKGSGRARHG SIRSPIWRGG GVAHGPRGPT S YYYMLPMK ...文字列:
MLQLVRAGAR TWFRPSGCRG LNTLAEEAVQ QAEKPESVAS LGLQPPVLRK CELPVPAHRR PVQAWIESLR GYEQERVGLT ELHPDVFST APRLDILHQV AIWQKNFKRI SYAKTKTRAE VRGGGRKPWV QKGSGRARHG SIRSPIWRGG GVAHGPRGPT S YYYMLPMK VRVQGLKVAL TVKLAQDDLH IVDSLELPTA DPQYLIELAR YRRWGDSVLL VDLEHEDMPQ NVVAATSGLK TF NLVPAVG LNVHSMLKHQ TLVLTLPTVA FLEEKLLWHN SRYTPLYPFR LPYCDFP

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL4m

+
分子 #19: Mitochondrial ribosomal protein L9

分子名称: Mitochondrial ribosomal protein L9 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 19 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sus scrofa (ブタ) / 器官: Liver
分子量理論値: 30.373449 KDa
配列文字列: MAAAACTAAG GGLLRAGLER LLRGGVRALL RPRLEGVTPR SERAFSLSLS RSTVIVERWW KVPLAGEGRK PRLHRRHRVY KLVEDTKHR PKDNLELVLT QSVEELGVRG DLVSVKKSVG RNRLLPQGLA VYASPENKKL FEEEKLLRQE GKLEKLQTKA G EATVKFLR ...文字列:
MAAAACTAAG GGLLRAGLER LLRGGVRALL RPRLEGVTPR SERAFSLSLS RSTVIVERWW KVPLAGEGRK PRLHRRHRVY KLVEDTKHR PKDNLELVLT QSVEELGVRG DLVSVKKSVG RNRLLPQGLA VYASPENKKL FEEEKLLRQE GKLEKLQTKA G EATVKFLR RCHLEVGMKN NVKWELNPEI VARHFLRNLG VVVAPHALKL PEEPITQRGE YWCEVTVNGL DTVRVPMSVV NF ERPKTKR YKYWLAQQAA KGDVPTSSQM I

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein bL9m

+
分子 #20: Mitochondrial ribosomal protein L10

分子名称: Mitochondrial ribosomal protein L10 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 20 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sus scrofa (ブタ) / 器官: Liver
分子量理論値: 29.238285 KDa
配列文字列: MSSQAFRRHP PQGRLPTFQT VRYGSKAVTR HRRVMHFERQ KLMAVTEYIP PKPTINPRCL PPPPTPPQEE TGLVRLLRRE IAAVFRDNR MIAVCQHVAL SAEDKLLLRH QLRKHKILMK IFPNQVLKPF LEESKYQNLL PLFVGHNLLL VSEEPKVKEM V RILKGIPF ...文字列:
MSSQAFRRHP PQGRLPTFQT VRYGSKAVTR HRRVMHFERQ KLMAVTEYIP PKPTINPRCL PPPPTPPQEE TGLVRLLRRE IAAVFRDNR MIAVCQHVAL SAEDKLLLRH QLRKHKILMK IFPNQVLKPF LEESKYQNLL PLFVGHNLLL VSEEPKVKEM V RILKGIPF LPLLGGCIDD TILSRQGFIN YSKLPSLALV QGELVGGLTF LTAQTYSMLQ HQPRQLTALL DQYVKQQQEG HP AVPASGQ PEPPDPVPDP

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL10m

+
分子 #21: Mitochondrial ribosomal protein L11

分子名称: Mitochondrial ribosomal protein L11 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 21 / 詳細: NCBI Reference Sequence: XP_003122536.1 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sus scrofa (ブタ) / 器官: Liver
分子量理論値: 20.809271 KDa
配列文字列: MSKLSRATRA LKKPEASGMI RAIVRAGQAR PGPPLGPILG QRGVSINQFC KEFNEKTKDI KEGIPLPTKI FVKPDRTFEI KIGQPTVSY FLKAAAGIEK GARHTGKEVA GLVTLKHVYE IARVKAQDDA FALQDVPLSS VVRSIIGSAR SLGIRVVKDL S SEELAAFQ ...文字列:
MSKLSRATRA LKKPEASGMI RAIVRAGQAR PGPPLGPILG QRGVSINQFC KEFNEKTKDI KEGIPLPTKI FVKPDRTFEI KIGQPTVSY FLKAAAGIEK GARHTGKEVA GLVTLKHVYE IARVKAQDDA FALQDVPLSS VVRSIIGSAR SLGIRVVKDL S SEELAAFQ KERALFLAAQ READLAAQAE AAKK

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL11m

+
分子 #22: 39S ribosomal protein L13, mitochondrial

分子名称: 39S ribosomal protein L13, mitochondrial / タイプ: protein_or_peptide / ID: 22 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sus scrofa (ブタ) / 器官: Liver
分子量理論値: 22.988566 KDa
配列文字列: MRRDTSWILR KGRSCCWGNM (SAC)SFSKAPQQW ATFARVWYLL DGKMQPPGKL AAMASVKLQG LHKPVYHQLS DCGDHV VIM NTRHIAFSGN KWEQKVYSSH TGYPGGFRQV TAAQLHQKDP VAIVKLAIYG MLPKNLHRRT MMQRLHLFPD EDIPEDI LK ...文字列:
MRRDTSWILR KGRSCCWGNM (SAC)SFSKAPQQW ATFARVWYLL DGKMQPPGKL AAMASVKLQG LHKPVYHQLS DCGDHV VIM NTRHIAFSGN KWEQKVYSSH TGYPGGFRQV TAAQLHQKDP VAIVKLAIYG MLPKNLHRRT MMQRLHLFPD EDIPEDI LK NLVEELPQPR KVPRRLDEYT QEEIEAFPRV WSPPEDYRL

UniProtKB: 39S ribosomal protein L13, mitochondrial

+
分子 #23: Mitochondrial ribosomal protein L14

分子名称: Mitochondrial ribosomal protein L14 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 23 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sus scrofa (ブタ) / 器官: Liver
分子量理論値: 34.79657 KDa
配列文字列: MVRGWGQRPA PLGPAGPGTS GSRRRLKGGD AQPSPGFFFG WWWDPQRKER GPGKGRVLTP RRRLGSSSEP RVGAGRGWGR GRGSRWAAR APGSCGGRGC VWGRGSGRRE GEEEGRGHEG PTPHASSRKA RAHSQIAARP AGSDAQAQDY RPRGGEGGPG P VGPAAGYS ...文字列:
MVRGWGQRPA PLGPAGPGTS GSRRRLKGGD AQPSPGFFFG WWWDPQRKER GPGKGRVLTP RRRLGSSSEP RVGAGRGWGR GRGSRWAAR APGSCGGRGC VWGRGSGRRE GEEEGRGHEG PTPHASSRKA RAHSQIAARP AGSDAQAQDY RPRGGEGGPG P VGPAAGYS RAAKAGLPSR DCMAFCTGLR GPFAQVSRAL SQRCFSTTGS LSAIQKMTRV RVVDNSALGT TPYHRPPRCI HV YNKTGVG KVGDRILLAI RGQKKKALIV GHRMPGPRMT PRFDSNNVVL LEDNGNPVGT RIKTPIPSSL RQREGEFSKV LAI AQNFV

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL14m

+
分子 #24: 39S ribosomal protein L15, mitochondrial

分子名称: 39S ribosomal protein L15, mitochondrial / タイプ: protein_or_peptide / ID: 24 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sus scrofa (ブタ) / 器官: Liver
分子量理論値: 33.481723 KDa
配列文字列: MGGPVQGGGP RALDLLRALP RVSLANLKPN PGSRKPERRP RGRRRGRKCG RGHKGERQRG TRPRLGFEGG QTPFYLRIPK YGFNEGHSF RHQYQPLSLN RLQYLIDLGR VDPTQPIDLT QLVNGRGVTI QPSKRDYGVQ LVEEGADTFK AKVNIEVQMA S ELAIAAIE ...文字列:
MGGPVQGGGP RALDLLRALP RVSLANLKPN PGSRKPERRP RGRRRGRKCG RGHKGERQRG TRPRLGFEGG QTPFYLRIPK YGFNEGHSF RHQYQPLSLN RLQYLIDLGR VDPTQPIDLT QLVNGRGVTI QPSKRDYGVQ LVEEGADTFK AKVNIEVQMA S ELAIAAIE KNGGVVTTAF YDPRSLEILC KPVPFFLRGQ PIPKRMLPPE ALVPYYTDAK NRGYLADPAR FPEARLELAR KY GYVLPDI TKDELFKMLS TRKDPRQIFF GLAPGWVVNM ADKKILKPTD ENLLKYYSS

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL15m

+
分子 #25: uL16m

分子名称: uL16m / タイプ: protein_or_peptide / ID: 25 / 詳細: NCBI Reference Sequence: NP_001231896.1 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sus scrofa (ブタ) / 器官: Liver
分子量理論値: 28.680531 KDa
配列文字列: MWRLLARACA PLLRAPLSDS WAAPSATAGF KTLLPVPTFE DVAIPEKPKL RFVERVPLVP KVRRERKNLS DIRGPSTEAT EFTEGRFAI LALGGGYLHW GHFEMMRLTI NRSMDPKNMF ALWRVPAPFK PITRKGMGQR MGGGKGAIDH YVTPVKAGRL I VEMGGRCE ...文字列:
MWRLLARACA PLLRAPLSDS WAAPSATAGF KTLLPVPTFE DVAIPEKPKL RFVERVPLVP KVRRERKNLS DIRGPSTEAT EFTEGRFAI LALGGGYLHW GHFEMMRLTI NRSMDPKNMF ALWRVPAPFK PITRKGMGQR MGGGKGAIDH YVTPVKAGRL I VEMGGRCE FKEVQGFLDL VAHKLPFPAK AVSRETLEKM RKDQEERERN NQNPWTFERI ATANMLGIRK VLSPYDLTHK GR YWGKFYT PERV

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL16m

+
分子 #26: bL17m

分子名称: bL17m / タイプ: protein_or_peptide / ID: 26 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sus scrofa (ブタ) / 器官: Liver
分子量理論値: 19.268178 KDa
配列文字列:
MRLSVAAAIS HGRVFRRLGL GPESRIHLLQ NLLTGLVRHE RIEASWARVD ELRGYAEKLI DYGKLGDTNE RAMRMADFWL TEKDLIPKL FQVLAPRFQG QNGGYTRMLQ IPNRNEQDRA KMAVIEYKGN CLPPLPLPRR DSNLTLLNQL LQGLRQDQEA S SHTAQTPA V

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein bL17m

+
分子 #27: Mitochondrial ribosomal protein L18

分子名称: Mitochondrial ribosomal protein L18 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 27 / 詳細: NCBI Reference Sequence: XP_003121157.1 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sus scrofa (ブタ) / 器官: Liver
分子量理論値: 21.422613 KDa
配列文字列:
MVLRSSVPLK QVAHARLHFL VPSRKGCRAA ALSTSCKPAT NPETDPVENE AVAPEFTNRN PRNLELLAVA RKERGWGTVW PSREFWHRL RVIRTQHHIE ALVEHRNGQV VVSASTREWA IKKHLYSTRN VVACESVGRV LAERCLEAGI NFMVYHPTPW E AASDSIKR LQHAMTEGGV VLREPRRIYE

UniProtKB: Mitochondrial ribosomal protein L18

+
分子 #28: 39S ribosomal protein L19, mitochondrial

分子名称: 39S ribosomal protein L19, mitochondrial / タイプ: protein_or_peptide / ID: 28 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sus scrofa (ブタ) / 器官: Liver
分子量理論値: 34.528809 KDa
配列文字列: MGVVVSTQRA GMAASITRGS WAAVGLGQSF PPTRALLPAP ASVICRTLAG SGRQQVTGSS EPGAFQPPPK PVIVDKRRPQ RPETRFLSP EFIPPRGRTN PLKFQIERKD MLERRKILHI PEFYVGSILR VTTADPYASA KTSQFLGICI QRSGSGLGAT F ILRNTIEG ...文字列:
MGVVVSTQRA GMAASITRGS WAAVGLGQSF PPTRALLPAP ASVICRTLAG SGRQQVTGSS EPGAFQPPPK PVIVDKRRPQ RPETRFLSP EFIPPRGRTN PLKFQIERKD MLERRKILHI PEFYVGSILR VTTADPYASA KTSQFLGICI QRSGSGLGAT F ILRNTIEG QGVEICFELY NPRIQEIQVV KLEKRLDNSL LYLRDALPEY STFDVNMKPI TQEFNQEVPV NQLKVKMKPK PW SKRWERP KFNIKGIRFD LCLTEEQMRE AQKWSQPWLE FDMMREYDTS KIEAAIWDEI EASKNS

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein bL19m

+
分子 #29: Mitochondrial ribosomal protein L20

分子名称: Mitochondrial ribosomal protein L20 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 29 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sus scrofa (ブタ) / 器官: Liver
分子量理論値: 17.554793 KDa
配列文字列:
MVFLTVPLWL RSRVTDRYWR VQEVLKHARH FRGRKNRCYR LAVRAVTRAF VKCTRARRLK KRSLRTLWIN RITAASQEHG LKYPAFIIN LIKCQVELNR KVLADLAIYE PKTFKSLAAL AKRRREEGFA AALGDGKEPD GIFSRVVQHR

UniProtKB: 39S ribosomal protein L20, mitochondrial isoform 1

+
分子 #30: Mitochondrial ribosomal protein L21

分子名称: Mitochondrial ribosomal protein L21 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 30 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sus scrofa (ブタ) / 器官: Liver
分子量理論値: 23.154861 KDa
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MAAAVAASVL QGTFGRLVSA YSRSVLRTSR PGTAPPWSAP RRLSSQHTSS LRGCVPKTSL GSPPWPDIVL PDPVEETRHH AEVVGQVNE LIAAGRYGRL FAVVHFAGHQ WKVTAEDLIL IENELDVACG ERIRLEKVLL VGADNFTLLG KPLLGKELVR V EATVIEKT ESWPKINMKF QKRKNYQRKR ITVNPQTVLR INSIEIAPCL C

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein bL21m

+
分子 #31: 39S ribosomal protein L52, mitochondrial

分子名称: 39S ribosomal protein L52, mitochondrial / タイプ: protein_or_peptide / ID: 31 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sus scrofa (ブタ) / 器官: Liver
分子量理論値: 17.989559 KDa
配列文字列:
MAGPVIENQI QDGYFRLPPQ RPAWPSRPRP FPALRLSMAA WGILLSSVRR LHCGTAAQAG SQWRLQQGFA ANPSGYGPLT ELPDWSYAD GRPAPPMKGQ LRRKAQREKF ARRVVLLSQE MDAGLQAWQL RQQEKLQEEE GKQKNALKSK GALLQNPQPS Q

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein mL52

+
分子 #32: Mitochondrial ribosomal protein L53

分子名称: Mitochondrial ribosomal protein L53 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 32 / 詳細: NCBI Reference Sequence: XP_020942999.1 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sus scrofa (ブタ) / 器官: Liver
分子量理論値: 12.057784 KDa
配列文字列:
M(AYA)AALARLGL RAVKQVRVQF CPFEKNVEST RTFLQAVSSE KVRCTNLNCS VIADVRHDGS EPCVDVLFGD GHRLIM RGA HLTAQEMLTA FASHIQARGA AGSGDKPSAS TGR

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein mL53

+
分子 #33: mL54

分子名称: mL54 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 33 / 詳細: NCBI Reference Sequence: XP_003123104.1 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sus scrofa (ブタ) / 器官: Liver
分子量理論値: 15.957357 KDa
配列文字列:
MAARRLFGAA RSWAAWRAWE LSDAAVSGRL HVRNYAKRPV IKGGKGGKGA VVGEALKDPE VCTDPFRLTT HAMGVNIYKE GQDVVLKPD SEYPEWLFEM NVGPPKKLEE LDPETREYWR LLRKHNIWRH NRLSKNRKF

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein mL54

+
分子 #34: bL31m

分子名称: bL31m / タイプ: protein_or_peptide / ID: 34 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sus scrofa (ブタ) / 器官: Liver
分子量理論値: 15.156537 KDa
配列文字列:
MAAKGSLLRL LWQRVVTGAA PESCRHLYTS SWRADCNRAL LTRLHRQTYA RLYPVLLVKQ DGSTIHIRYR EPRRMLTMPV DLDSLSPEE RRARFRKREA KFKEKKEEPE LSDDFDVEQY KRFWTKK

UniProtKB: Mitochondrial ribosomal protein L55

+
分子 #35: Mitochondrial ribosomal protein L57

分子名称: Mitochondrial ribosomal protein L57 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 35 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sus scrofa (ブタ) / 器官: Liver
分子量理論値: 12.001915 KDa
配列文字列:
MFLTALLRRN RIPGRQWIGK HRRPRPVSAQ AKQNMIRRLE TEAENQYWLS RPFLTAEQER GHAAVRRAAA FQALKAAQAA RFPAHRRLE EQLGHLLVTR KWS

UniProtKB: Mitochondrial ribosomal protein L57

+
分子 #36: mL62 (ICT1)

分子名称: mL62 (ICT1) / タイプ: protein_or_peptide / ID: 36 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sus scrofa (ブタ) / 器官: Liver
分子量理論値: 23.545873 KDa
配列文字列: MAAARCLRWG LNRAGAWLLP SPTRYPRRAL HKQVEGTEFQ SIYSLDKLYP ESRGSDTAWR LPDDAKQAND IPVDRLTISY CRSSGPGGQ NVNKVNSKAE VRFHLASADW IAEPVRLKLA VKHKNRINRS GELILTSECS RYQFRNLADC LQKLRDMIAE A SQPAKEPS ...文字列:
MAAARCLRWG LNRAGAWLLP SPTRYPRRAL HKQVEGTEFQ SIYSLDKLYP ESRGSDTAWR LPDDAKQAND IPVDRLTISY CRSSGPGGQ NVNKVNSKAE VRFHLASADW IAEPVRLKLA VKHKNRINRS GELILTSECS RYQFRNLADC LQKLRDMIAE A SQPAKEPS REDAELRRSR IENMNRERLR KKRISSAIKT SRRVDVD

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein mL62

+
分子 #37: mL64

分子名称: mL64 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 37 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sus scrofa (ブタ) / 器官: Liver
分子量理論値: 25.815031 KDa
配列文字列: MAAPVQQART LLRLVTTLGQ GSRGYRARPP PRRSQEPRWP DPDDPLTPRW QLSPRYAAKQ FARHGAASGV AAGSLWPSQE QLRELEAEE REWYPSLAAM QESLRVQQLA EEQKRQAREQ LIEECMAKMP QMIENWRQQQ QERREKEQAD KDRRARLQAE A QERLGYHV ...文字列:
MAAPVQQART LLRLVTTLGQ GSRGYRARPP PRRSQEPRWP DPDDPLTPRW QLSPRYAAKQ FARHGAASGV AAGSLWPSQE QLRELEAEE REWYPSLAAM QESLRVQQLA EEQKRQAREQ LIEECMAKMP QMIENWRQQQ QERREKEQAD KDRRARLQAE A QERLGYHV DPRSARFQEL LQDMEKQHRK RLKEEKQRKK KEARAAAMAA AAAQDPADSE TPSS

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein mL64

+
分子 #38: Mitochondrial ribosomal protein S18A

分子名称: Mitochondrial ribosomal protein S18A / タイプ: protein_or_peptide / ID: 38 / 詳細: NCBI Reference Sequence: XP_005654252.2 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sus scrofa (ブタ) / 器官: Liver
分子量理論値: 22.273084 KDa
配列文字列: MVGLNVLVSG CGRLLRGLLA GPAATSWARP PSRGFREVVE ILDGKTTIIE GRITETPQES PNPPNPTGQC PICRWNLKHK YNYEDVLLL SQFIRPHGGM LPRRITGLCQ EEHLKIEECV KMAHRAGLLP NHRPKLPEGF VPKSKPRLNR YLTRWSPRSV K PIYNKGHR ...文字列:
MVGLNVLVSG CGRLLRGLLA GPAATSWARP PSRGFREVVE ILDGKTTIIE GRITETPQES PNPPNPTGQC PICRWNLKHK YNYEDVLLL SQFIRPHGGM LPRRITGLCQ EEHLKIEECV KMAHRAGLLP NHRPKLPEGF VPKSKPRLNR YLTRWSPRSV K PIYNKGHR WNKVRMPVGS PLLKDNVSYS GRPLLLYH

UniProtKB: Mitochondrial ribosomal protein S18A

+
分子 #39: 39S ribosomal protein S30, mitochondrial

分子名称: 39S ribosomal protein S30, mitochondrial / タイプ: protein_or_peptide / ID: 39 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sus scrofa (ブタ) / 器官: Liver
分子量理論値: 49.100504 KDa
配列文字列: MAAARCWRFP LRGAGLSLHT AAKAAVTAPE VTGPDVPATP VARYPPIVAS LTAKSKAARQ RRVEQWQATV HAAKSVDEKL RILTKMQFM KYVVYPQTFA LNADNWYQSF TKTVFLSGLP PTPAKLEPEP TLDITALREA VCDCLLQEHF FLRRKKRAPV I QDREAIAS ...文字列:
MAAARCWRFP LRGAGLSLHT AAKAAVTAPE VTGPDVPATP VARYPPIVAS LTAKSKAARQ RRVEQWQATV HAAKSVDEKL RILTKMQFM KYVVYPQTFA LNADNWYQSF TKTVFLSGLP PTPAKLEPEP TLDITALREA VCDCLLQEHF FLRRKKRAPV I QDREAIAS PFLDQLVASL TGLLSVHNPV LAAAALDCKR PVHFFWLRGE EIIPRGHRKG RVDALRYQIN DKPHNQIRIS RQ LPEFVPL DYSIPIEVPV MSCKPDKLPL FKRQYENTIF IGSKTADPLC YGHTQFHLLP DKLKREKLLK QNCADQIEVV FRA NAIASL FAWTGAQAMY QGFWSEADVT RPFVSQGVIT DGKYFSFFCY QLNTLALTAQ ADQNNPRKNI CWGTQSKPLY ETIE DNNVK GFNDDVLLQL VQFLLNRPKE DKSQLLEN

UniProtKB: 39S ribosomal protein S30, mitochondrial

+
分子 #40: 39S ribosomal protein L1, mitochondrial

分子名称: 39S ribosomal protein L1, mitochondrial / タイプ: protein_or_peptide / ID: 40 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sus scrofa (ブタ) / 器官: Liver
分子量理論値: 34.372883 KDa
配列文字列: MVSQMPLYPR SVYIQLPNRH FAAAATKPAK KTQKGAKGKA SDEKKDDIEK IKSYPFMEGE PEDDVYLKRL YPRQIYEVEK AIHLLKKFQ VLDFTNPNQG VYLDLTLDMT LGKKKKVEPF ASVLSLPYPF TSEINKVAVF TGNASEIKIA EEKGAAFAGG T NLIQKILD ...文字列:
MVSQMPLYPR SVYIQLPNRH FAAAATKPAK KTQKGAKGKA SDEKKDDIEK IKSYPFMEGE PEDDVYLKRL YPRQIYEVEK AIHLLKKFQ VLDFTNPNQG VYLDLTLDMT LGKKKKVEPF ASVLSLPYPF TSEINKVAVF TGNASEIKIA EEKGAAFAGG T NLIQKILD DEIQPDFYVA VPEIMPELNP LRKKLKKRFP KLTRNSIGRD IPKMLELFKT GHEIKVDEER ENFLETKIAT LN MSSDQIA ANLQAVINEV CRQRPLNLGP FVVRAFLRSS TSEGLLIKIE PLLPKEVEAK ESGTLTA

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL1m

+
分子 #41: Ribosomal protein

分子名称: Ribosomal protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 41 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sus scrofa (ブタ) / 器官: Liver
分子量理論値: 10.841016 KDa
配列文字列:
MATAFLRTVL SAVGPLLHLG GRPLSTFAAG PPRAALAVGA QPSPAAALLS ARPLLGPQPA LGFKTKGVLK KRCRDCYLVK RRGRWFIYC KTNPKHKQRQ M

UniProtKB: Ribosomal protein

+
分子 #42: Mitochondrial ribosomal protein L37

分子名称: Mitochondrial ribosomal protein L37 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 42 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sus scrofa (ブタ) / 器官: Liver
分子量理論値: 47.917988 KDa
配列文字列: MALASGPARR ALARLGRLGL GGCGAPRRGA YEWGVRSTRK PEPPPLDRVY EIPGLEPITY AGKMHFMPGL ARPVFPPWDP GWTHPKFRR LPPLHEHPLY KDQACYVFHQ RCRLLEGVKQ ALWLTKTQLI EGLPEKVLRL ADDPRNHIEN QDERVLNAIS H ARLWHSTE ...文字列:
MALASGPARR ALARLGRLGL GGCGAPRRGA YEWGVRSTRK PEPPPLDRVY EIPGLEPITY AGKMHFMPGL ARPVFPPWDP GWTHPKFRR LPPLHEHPLY KDQACYVFHQ RCRLLEGVKQ ALWLTKTQLI EGLPEKVLRL ADDPRNHIEN QDERVLNAIS H ARLWHSTE DIPKRETYCP VIVDSLIQLC KSQILKHPSL ARRICAQNNT LSATWNRESI LLQVHGSSGA RLNAKDPLPP VA SQEEVEA TKNHVLETFY PISPTMGLQE CNVYDVNDDT GFQEGYPYPC PHTLYFLESA NLRPRRFQPD QLRAKMILFA FGS ALAQAR LLYGNDSKVL EQPVVVQSVG TDGRLFQFLV LQLNTTDLAS DEGVKNLAWV DSDQLLYQHF WCLPVIKKKV VVEP VGPIG FQPETFRKFL ALYLHGAV

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein mL37

+
分子 #43: Mitochondrial ribosomal protein L38

分子名称: Mitochondrial ribosomal protein L38 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 43 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sus scrofa (ブタ) / 器官: Liver
分子量理論値: 44.656387 KDa
配列文字列: MAAPWWRAAL CASRRWRGFS TSAALSRRAA PLGPMPNEDI DVSDLERLKK YRSFDRYRRR AEQEARKPHW WRTYREHFGE ESGPKDRVD IGLPPPKVSR TQQLLERKQA LRELRANVEE ERAARLQTAR IPLEAVRAEW ERTCGPYHKQ RLAEYCGLYR D LFHGATFV ...文字列:
MAAPWWRAAL CASRRWRGFS TSAALSRRAA PLGPMPNEDI DVSDLERLKK YRSFDRYRRR AEQEARKPHW WRTYREHFGE ESGPKDRVD IGLPPPKVSR TQQLLERKQA LRELRANVEE ERAARLQTAR IPLEAVRAEW ERTCGPYHKQ RLAEYCGLYR D LFHGATFV PRVPLHVAYA VGEDDLMPVY HGNEVTPTEA AQAPEVTYEA DEGSLWTLLL TNLDGHLLEP DAEYVHWLVT NI PGNRVTE GQETCPYLPP FPARGSGFHR FAFLLFKQDK RIDFSGDTRP SPCYQLAQRT FHTFDFYKKH QDAMTPAGLA FFQ CRWDDS VTRVFHQLLD MREPVFEFVR PPPYHPKQKR FPHRQPLRYL DRYRDSHEPT YGIY

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein mL38

+
分子 #44: Mitochondrial ribosomal protein L39

分子名称: Mitochondrial ribosomal protein L39 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 44 / 詳細: NCBI Reference Sequence: XP_003132793.4 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sus scrofa (ブタ) / 器官: Liver
分子量理論値: 38.523422 KDa
配列文字列: MAMGAWGLRL WRAVPRGEAG WRLIATSPAS QLSPTELIEM QNDLFNKEKN RQLSLTPRTE KIEVKHVGKT DPGTVFVMNK NISTPYSCA MHLSEWYCRK SILALVDGQP WDMYKPLTKS CEIKFLTFKD DDPGEVNKAY WRSCAMMMGC VIERAFKDEY V VSLVRAPE ...文字列:
MAMGAWGLRL WRAVPRGEAG WRLIATSPAS QLSPTELIEM QNDLFNKEKN RQLSLTPRTE KIEVKHVGKT DPGTVFVMNK NISTPYSCA MHLSEWYCRK SILALVDGQP WDMYKPLTKS CEIKFLTFKD DDPGEVNKAY WRSCAMMMGC VIERAFKDEY V VSLVRAPE VPVIAGAFCY DVVLDKRLDE WMPTKENLHS FTKDARALIY KDLPFETLEV EAKVALEIFQ HNKYKLDFIE EK ASQNPER IVKLHRFGDF IDVSEGPLIP RTSICFQYEV SAVHNLQTQS SLVRRFQGLS LPVHLRAHFT IWNKLLERSR KMV TEDKTK PTEESAST

UniProtKB: Mitochondrial ribosomal protein L39

+
分子 #45: Mitochondrial ribosomal protein L40

分子名称: Mitochondrial ribosomal protein L40 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 45 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sus scrofa (ブタ) / 器官: Liver
分子量理論値: 19.406305 KDa
配列文字列:
MRAEPLRKKK KVDPKKDQAA KDRLKKRIRR LEKASQELIP IEDFITPVKF LNKERQRPPV ELPFEESERR ALLLKRWSLY KQREHEMER SAIRSLLEAQ EEALQELRLS SPELHAEATK RDPSLFPFER QGPDYTPPIS DYQPPEGRYQ DITKVYTQVE F KK

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein mL40

+
分子 #46: Mitochondrial ribosomal protein L41

分子名称: Mitochondrial ribosomal protein L41 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 46 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sus scrofa (ブタ) / 器官: Liver
分子量理論値: 15.073404 KDa
配列文字列:
MGLLSGAARA LVRGADRMSK WTSKRGPRTF CKGRGAKGTG FHGRDGKFVQ IKEMIPELVV PELAGFKLKP YVNYRAPEGT DTPLTAKQL FLETAAPAIE KDFKAGTFDP EHLEKYGFEP TQEGKLFQLY PKNFPR

UniProtKB: Mitochondrial ribosomal protein L41

+
分子 #47: mL42

分子名称: mL42 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 47 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sus scrofa (ブタ) / 器官: Liver
分子量理論値: 16.680178 KDa
配列文字列:
MALAAVKWVI SSRTILKHLF PIQNSASYCV CHKSTYSSLP DDYNCKVELA LTSDGRTIVC YHPSVDIPYE HTKPIPRPDP VHNIEETHD LVLKTRLEEK GEHLEQGPMI EQLSKMFFTT KHRWYPRGQY HRRRRKPNPP KDR

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein mL42

+
分子 #48: 39S ribosomal protein L43, mitochondrial isoform X2

分子名称: 39S ribosomal protein L43, mitochondrial isoform X2 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 48 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sus scrofa (ブタ) / 器官: Liver
分子量理論値: 17.770146 KDa
配列文字列:
M(THC)ARGTASRF LTSVLHNGLG RYVQQLQRLS FSLSRDAPSS RGAREFVERE VTDFARRNPG VVIYVNPRPC CVPRVV AEY LNGAVREESI HCKSVEEIAA LVQKLADQSG LDVIRIRKPF HTDSPSIQGQ WHPFTNKPTT LGGLRPREVQ DPAPAQV QA Q

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein mL43

+
分子 #49: mL44

分子名称: mL44 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 49 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sus scrofa (ブタ) / 器官: Liver
分子量理論値: 37.527195 KDa
配列文字列: MASGLVRLLQ WGPRRLLAPA APTLAPPVRG AKKGFRAAYR FQKELERWRL LRCPPPPVRR SEKPNWDYHA EIQAFGHRLQ ETFSLDLLK TAFVNSCYIK SEEAKRQKLG IDKEAALLNL KDNQELSEQG ISFSQTCLTQ FFEDAFPDLP TEGVTSLVDF L TSEEVVCH ...文字列:
MASGLVRLLQ WGPRRLLAPA APTLAPPVRG AKKGFRAAYR FQKELERWRL LRCPPPPVRR SEKPNWDYHA EIQAFGHRLQ ETFSLDLLK TAFVNSCYIK SEEAKRQKLG IDKEAALLNL KDNQELSEQG ISFSQTCLTQ FFEDAFPDLP TEGVTSLVDF L TSEEVVCH VARNLAVEQL ALSAEFPVPP PVLRQTFFAV IGALLQSSGP ERTALFIRDF LITQMTGKEL FEMWTITNPM GL LVEELKK RKISAPESRL TRQSGSTTAL PVYFVGLYCD RKLIAEGPGE TVLVAEEEAA RVALRKLFGF TENRRPWDYS KPK EHVRAE KTITAS

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein mL44

+
分子 #50: Mitochondrial ribosomal protein L45

分子名称: Mitochondrial ribosomal protein L45 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 50 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sus scrofa (ブタ) / 器官: Liver
分子量理論値: 35.331805 KDa
配列文字列: MAAPVTRGLS CLPRVLGWWS RQPVLVTQST AVVPVRTKKR FTPPTYQPKY KSEKEFVEHA RKAGLVIPHE RLERPIHLAC TAGIFDAYV PPEGDARISS LSKEGLAQRA ERLKKNVASQ LSIRKIRESD PNFKIKDFPE KAKDIFIEAH LCLNNSDHDR L HTLVTENC ...文字列:
MAAPVTRGLS CLPRVLGWWS RQPVLVTQST AVVPVRTKKR FTPPTYQPKY KSEKEFVEHA RKAGLVIPHE RLERPIHLAC TAGIFDAYV PPEGDARISS LSKEGLAQRA ERLKKNVASQ LSIRKIRESD PNFKIKDFPE KAKDIFIEAH LCLNNSDHDR L HTLVTENC FPDMVWDIRY KTVRWSFVES LEPPQVVQVR CSSLMNQGNI YGQVTVRMHT RQTLAIYDRF GRLMYGQEDV PR DVLEYVV FEKHLVDPYG SWRMHGKIIP PWAPPKQPIL KTVMIPGPQL KPWEEFEEPQ GEVHKPQPA

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein mL45

+
分子 #51: Mitochondrial ribosomal protein L46

分子名称: Mitochondrial ribosomal protein L46 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 51 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sus scrofa (ブタ) / 器官: Liver
分子量理論値: 32.215998 KDa
配列文字列: MAAPVRRTML RVVRGWRRFE GPWAHSLGSR NLALAVAPSS SSSPWRLLGA LCLQRPPLVT KPLTPLQEEM ADLLQQIEIE RSLYSDHEL RALDEAQQLA KKKSDLYEEE DEQNILLAQD LEDMWEQKFL HFKLGARLTE ADKKDDRTSL HRKLDRNLIL L VREKLGDQ ...文字列:
MAAPVRRTML RVVRGWRRFE GPWAHSLGSR NLALAVAPSS SSSPWRLLGA LCLQRPPLVT KPLTPLQEEM ADLLQQIEIE RSLYSDHEL RALDEAQQLA KKKSDLYEEE DEQNILLAQD LEDMWEQKFL HFKLGARLTE ADKKDDRTSL HRKLDRNLIL L VREKLGDQ DIWMLPQSDW QPGETLRQTA ERTLATLSEN NMEAKFLGNA PCGHYKFKFP QAMRTETSLG AKVFFFKALL LT GDFSQAG KKGHHVWVSK EELGDYLKPK YLAQVRRFLL DL

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein mL46

+
分子 #52: 39S ribosomal protein L48, mitochondrial

分子名称: 39S ribosomal protein L48, mitochondrial / タイプ: protein_or_peptide / ID: 52 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sus scrofa (ブタ) / 器官: Liver
分子量理論値: 29.942523 KDa
配列文字列: MSEAAGTKVL RELNASRSDI VTGPDQGRSV SIFRPPGIAA AWADLQLARL HTTRQQRMNG ALGKALCLRN DTVLKQALSL IRVRASGES PICSAGGILL STSRHYRSKP THGIGRYKHL VKAQEPKKKK GKVEVRPINL GTDYEYGVLN IHLIAYDMAL A ESYAQYVH ...文字列:
MSEAAGTKVL RELNASRSDI VTGPDQGRSV SIFRPPGIAA AWADLQLARL HTTRQQRMNG ALGKALCLRN DTVLKQALSL IRVRASGES PICSAGGILL STSRHYRSKP THGIGRYKHL VKAQEPKKKK GKVEVRPINL GTDYEYGVLN IHLIAYDMAL A ESYAQYVH NLCNHLAIKV EESYAMPTKT MEVLQLQEQG SKMFLDAVLT THERVVQISG LSATFAEIFL EIIHSNLPEG VK LSVREHT EEDFKGRFKA RPELEELLAK LN

UniProtKB: 39S ribosomal protein L48, mitochondrial

+
分子 #53: 39S ribosomal protein L49, mitochondrial

分子名称: 39S ribosomal protein L49, mitochondrial / タイプ: protein_or_peptide / ID: 53 / 詳細: NCBI Reference Sequence: NP_001231942.1 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sus scrofa (ブタ) / 器官: Liver
分子量理論値: 18.957779 KDa
配列文字列:
MAATVLCGVL RAWRTGVPLG CGLRRLSQTQ GTPEYPSFVE SVDEYHFVER LLPPASIPRP PKHEHYPTPS GWQPPRDPAP SLPYFVRRS RMHNIPVYRD ITHGNRQMTV IRKVEGDIWA LQKDVEDFLS PLLGKTPVTQ VNEVTGTLRV KGYFDQQLKA W LLEKGF

UniProtKB: 39S ribosomal protein L49, mitochondrial

+
分子 #54: Mitochondrial ribosomal protein L50

分子名称: Mitochondrial ribosomal protein L50 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 54 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sus scrofa (ブタ) / 器官: Liver
分子量理論値: 22.785357 KDa
配列文字列: MVRLRGKREC LTLSLRLIGW SWRVTAGGGR CFVSKFSSKM AARWVSGLAR RSLTCAVSGA PRREFWSPFR KEKQPVVAET VEEVKKEPI LVCPPIQSRT YIPPEDLQSR LESHVKEVFG SSVPSNWQDI SLEDVHLKFS FLARLANDLR HAVPNSRLHQ M CRVRDVLD ...文字列:
MVRLRGKREC LTLSLRLIGW SWRVTAGGGR CFVSKFSSKM AARWVSGLAR RSLTCAVSGA PRREFWSPFR KEKQPVVAET VEEVKKEPI LVCPPIQSRT YIPPEDLQSR LESHVKEVFG SSVPSNWQDI SLEDVHLKFS FLARLANDLR HAVPNSRLHQ M CRVRDVLD FYNVPVQDRS KFDELIASNL PHNLKITWGY

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein mL50

+
分子 #55: Mitochondrial ribosomal protein L51

分子名称: Mitochondrial ribosomal protein L51 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 55 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sus scrofa (ブタ) / 器官: Liver
分子量理論値: 15.249048 KDa
配列文字列:
MAGSLSWVTG RGLWGRLPLT CRSFSLGIPR LFHVRVTLPP RKVVDRWNEK RAMFGVYDNI GILGNFEKHP KELIKGPIWL RGWKGNELQ RCIRKKRMVG NRMFIDDLHN LNKRISYLYK HFNRHGKYR

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein mL51

+
分子 #57: Peptide chain release factor 1, mitochondrial

分子名称: Peptide chain release factor 1, mitochondrial / タイプ: protein_or_peptide / ID: 57
詳細: Human mitochondrial release factor 1 (mtRF1), with a C-terminal linker (GGSGGSG) and a 3xFLAG-tag (DYKDHDGDYKDHDIDYKDDDDK), expressed from a pcDNA3.1(+) plasmid in HEK293 EBNA cells.
コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 55.569742 KDa
組換発現生物種: Homo sapiens (ヒト)
配列文字列: MNRHLCVWLF RHPSLNGYLQ CHIQLHSHQF RQIHLDTRLQ VFRQNRNCIL HLLSKNWSRR YCHQDTKMLW KHKALQKYME NLSKEYQTL EQCLQHIPVN EENRRSLNRR HAELAPLAAI YQEIQETEQA IEELESMCKS LNKQDEKQLQ ELALEERQTI D QKINMLYN ...文字列:
MNRHLCVWLF RHPSLNGYLQ CHIQLHSHQF RQIHLDTRLQ VFRQNRNCIL HLLSKNWSRR YCHQDTKMLW KHKALQKYME NLSKEYQTL EQCLQHIPVN EENRRSLNRR HAELAPLAAI YQEIQETEQA IEELESMCKS LNKQDEKQLQ ELALEERQTI D QKINMLYN ELFQSLVPKE KYDKNDVILE VTAGRTTGGD ICQQFTREIF DMYQNYSCYK HWQFELLNYT PADYGGLHHA AA RISGDGV YKHLKYEGGI HRVQRIPEVG LSSRMQRIHT GTMSVIVLPQ PDEVDVKLDP KDLRIDTFRA KGAGGQHVNK TDS AVRLVH IPTGLVVECQ QERSQIKNKE IAFRVLRARL YQQIIEKDKR QQQSARKLQV GTRAQSERIR TYNFTQDRVS DHRI AYEVR DIKEFLCGGK GLDQLIQRLL QSADEEAIAE LLDEHLKSAK GGSGGSGDYK DHDGDYKDHD IDYKDDDDK

UniProtKB: Peptide chain release factor 1, mitochondrial

+
分子 #2: E-site tRNA

分子名称: E-site tRNA / タイプ: rna / ID: 2 / 詳細: likely the CCA-end of a tRNA / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Sus scrofa (ブタ) / 器官: Liver
分子量理論値: 894.612 Da
配列文字列:
CCA

+
分子 #3: 16S rRNA

分子名称: 16S rRNA / タイプ: rna / ID: 3
詳細: Corresponds to GenBank sequence ID NC_012095.1 (positions 1099-2669)
コピー数: 1
由来(天然)生物種: Sus scrofa (ブタ) / 器官: Liver
分子量理論値: 504.908156 KDa
配列文字列: ACCAAAGCUA GCUCAACAUA CUAAACAAAU ACAAAAAUAC ACCAAAAUAA AAUAAAACAU UCACCUAACA UUAAAGUAUA GGAGAUAGA AAUUUUUAUC CUGACGCUAU AGAGAUAGUA CCGUAAGGGA AAGAUGAAAG AAUAAAAUAA AAGUAAAAAA A AGCAAAGA ...文字列:
ACCAAAGCUA GCUCAACAUA CUAAACAAAU ACAAAAAUAC ACCAAAAUAA AAUAAAACAU UCACCUAACA UUAAAGUAUA GGAGAUAGA AAUUUUUAUC CUGACGCUAU AGAGAUAGUA CCGUAAGGGA AAGAUGAAAG AAUAAAAUAA AAGUAAAAAA A AGCAAAGA UUACCCCUUC UACCUUUUGC AUAAUGGUUU AACCAGAAAA AAUCUAACAA AGAGAACUUU AGCUAGAUAC CC CGAAACC AGACGAGCUA CCCAUGAGCA GUUUAAAAGA ACCAACUCAU CUAUGUGGCA AAAUAGUGAG AAGACUUGUA GGU AGAGGU GAAAAGCCUA ACGAGCCUGG UGAUAGCUGG UUGUCCGAGA AAGAAUUUUA GUUCAACCUU AAAAAUACCC CAAA AACCC UAAAUUCCAA UGUAUUUUUA AGAGAUAGUC UAAAAAGGUA CAGCUUUUUA GAAACGGAUA CAACCUUGAC UAGAG AGUA AAAUCUUAAU ACUACCAUAG UAGGCCUAAA AGCAGCCAUC AAUUGAGAAA GCGUUAAAGC UCAACAAAUU CACCAA CAU AAUCCCAAAA ACUAAUAACA AACUCCUAGC CCAAUACCGG ACUAAUCUAU UGAAACAUAG AAGCAAUAAU GUUAAUA UG AGUAACAAGA AGCCUUUCUC CUCGCACACG CUUACAUCAG UAACUAAUAA UAUACUGAUA AUUAACAACC AAUAAACC A AAACAACACU AAAACGUUUA UUAAUUACAU UGUUAACCCA ACACAGGAGU GCACCAAGGA AAGAUUAAAA GAAGUAAAA GGAACUCGGC AAACACAAAC CCCGCCUGUU UACCAAAAAC AUCACCUCUA GCAUUACUAG UAUUAGAGGC AAUGCCUGCC CAGUGACAC CAGUUUAACG GCCGCGGUAU UCUGACCGUG CAAAGGUAGC AUAAUCACUU GUUCUCCAA(1MA) UAAGGAC UU GUAUGAAUGG CCACACGAGG GUUUUACUGU CUCUUACUUC CAAUCAGUGA AAUUAACCUU CCCGUGAAGA GGCGGGAA U AAAAAAAUAA GACGAGAAGA CCCUAUGGAG CUUUAAUUAA CUAUUCCAAA AGUUAAACAA CUCAACCACA AAGGGAUAA AACAUAACUU AACAUGGACU AGCAAUUUCG GUUG(OMG)GGUGA CCUCGGAGUA CAAAAAACCC UCCGAGUGAU UUUAAU CUA GACAAACCAG UCAAAAUAAC CAUAACAUCA CUUAUUGAUC CAAAAUUUUG AUCAACGGAA CAAGUUACCC UAGGGAU AA CAGCGCAAUC CUGUUCUAGA GUUCCUAUCG ACAAUAGGGU UUACGACCUC GAUGUUGGAU CAGGACACCC AAAUGGUG C AACCGCUAUU AAAGGUUCGU U(OMU)(OMG)UUCAACG AUUAAAGUCC UACGUGAUC(PSU) GAGUUCAGAC CGGAGCA AU CCAGGUCGGU UUCUAUCUAU UAUAAAUUUC UCCCAGUACG AAAGGACAAG AGAAAUGGGA CCAACCUCAC AAACGCGU C UCAGAGAUAA UUAAUGAUUU AAUCUUAACC UAAUUAACUC AUAAUAAAUC CAGCCCUAGA ACAGGGCACA

GENBANK: GENBANK: NC_012095.1

+
分子 #4: CP Phe-tRNA

分子名称: CP Phe-tRNA / タイプ: rna / ID: 4 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Sus scrofa (ブタ) / 器官: Liver
分子量理論値: 23.516227 KDa
配列文字列:
GUUAAUGUAG CUUAAAUUAU CAAAGCAAGG CACUGAA(MIA)AU GCCUAGAUGA GCCUCACAGC UCCAUAAACA CCA

+
分子 #56: P-site Met-tRNA(fMet)

分子名称: P-site Met-tRNA(fMet) / タイプ: rna / ID: 56
詳細: Corresponds to GenBank sequence ID LC530718.1 (positions 1-71). In vitro transcribed human tRNA with formyl-methionine attached to the CCA-end of the tRNA.
コピー数: 1
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 22.664498 KDa
配列文字列:
AGUAAGGUCA GCUAAAUAAG CUAUCGGGCC CAUACCCCGA AAAUGUUGGU UAUACCCUUC CCGUACUACC A

GENBANK: GENBANK: KY671085.1

+
分子 #58: MAGNESIUM ION

分子名称: MAGNESIUM ION / タイプ: ligand / ID: 58 / コピー数: 205 / 式: MG
分子量理論値: 24.305 Da

+
分子 #59: POTASSIUM ION

分子名称: POTASSIUM ION / タイプ: ligand / ID: 59 / コピー数: 30 / 式: K
分子量理論値: 39.098 Da

+
分子 #60: PHENYLALANINE

分子名称: PHENYLALANINE / タイプ: ligand / ID: 60 / コピー数: 1 / 式: PHE
分子量理論値: 165.189 Da
Chemical component information

ChemComp-PHE:
PHENYLALANINE / フェニルアラニン

+
分子 #61: ZINC ION

分子名称: ZINC ION / タイプ: ligand / ID: 61 / コピー数: 2 / 式: ZN
分子量理論値: 65.409 Da

+
分子 #62: FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER

分子名称: FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER / タイプ: ligand / ID: 62 / コピー数: 1 / 式: FES
分子量理論値: 175.82 Da
Chemical component information

ChemComp-FES:
FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER

+
分子 #63: N-FORMYLMETHIONINE

分子名称: N-FORMYLMETHIONINE / タイプ: ligand / ID: 63 / コピー数: 1 / 式: FME
分子量理論値: 177.221 Da
Chemical component information

ChemComp-FME:
N-FORMYLMETHIONINE / N-ホルミルメチオニン

-
実験情報

-
構造解析

手法クライオ電子顕微鏡法
解析単粒子再構成法
試料の集合状態particle

-
試料調製

緩衝液pH: 7.5
構成要素:
濃度式名称
20.0 mMC8H18N2O4SHEPES
100.0 mMKClpotassium chloride
20.0 mMMgCl2magnesium chloride

詳細: 20mM HEPES-KOH pH=7.5, 100mM KCl, 20mM MgCl2, ~1% sucrose (from mtRF1 storage buffer)
グリッドモデル: Quantifoil R2/2 / 材質: COPPER / 支持フィルム - #0 - Film type ID: 1 / 支持フィルム - #0 - 材質: CARBON / 支持フィルム - #0 - トポロジー: HOLEY / 支持フィルム - #1 - Film type ID: 2 / 支持フィルム - #1 - 材質: CARBON / 支持フィルム - #1 - トポロジー: CONTINUOUS / 前処理 - タイプ: GLOW DISCHARGE
凍結凍結剤: ETHANE-PROPANE / チャンバー内湿度: 100 % / チャンバー内温度: 277.15 K / 装置: FEI VITROBOT MARK IV
詳細In vitro reconstituted complex (55S). Focused refinement on large subunit.

-
電子顕微鏡法

顕微鏡FEI TITAN KRIOS
特殊光学系エネルギーフィルター - スリット幅: 20 eV
撮影フィルム・検出器のモデル: GATAN K3 BIOQUANTUM (6k x 4k)
撮影したグリッド数: 1 / 実像数: 6973 / 平均電子線量: 60.0 e/Å2
電子線加速電圧: 300 kV / 電子線源: FIELD EMISSION GUN
電子光学系C2レンズ絞り径: 70.0 µm / 照射モード: FLOOD BEAM / 撮影モード: BRIGHT FIELD / Cs: 2.7 mm / 最大 デフォーカス（公称値）: 3.0 µm / 最小 デフォーカス（公称値）: 0.6 µm / 倍率（公称値）: 81000
試料ステージ試料ホルダーモデル: FEI TITAN KRIOS AUTOGRID HOLDER
ホルダー冷却材: NITROGEN
実験機器
モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company

+
画像解析

詳細Micrographs were motion corrected and CTF parameters were estimated using Cryosparc live v4.
粒子像選択選択した数: 1471587
詳細: Particles were picked with blob picker in Cryosparc live v4.
初期モデルモデルのタイプ: EMDB MAP
EMDB ID:

2914


詳細: low-pass filtered to 40A
最終 再構成解像度のタイプ: BY AUTHOR / 解像度: 3.5 Å / 解像度の算出法: FSC 0.143 CUT-OFF / ソフトウェア - 名称: cryoSPARC / 使用した粒子像数: 50622
初期 角度割当タイプ: MAXIMUM LIKELIHOOD / ソフトウェア - 名称: cryoSPARC (ver. 4)
詳細: Homogeneous refinement (Cryosparc v4) of all particles with EMD-2914 (low-pass filtered to 40A) as initial reference
最終 角度割当タイプ: MAXIMUM LIKELIHOOD
FSC曲線 (解像度の算出)

-
原子モデル構築 1

初期モデル
PDB IDChain詳細

7nqh

source_name: PDB, initial_model_type: experimental modelSus scrofa mitoribosome

7qi4

source_name: PDB, initial_model_type: experimental modelHigh-res mammalian mitoribosome

0-f1

source_name: AlphaFold, initial_model_type: in silico modelmtRF1 model prediction
精密化空間: REAL / プロトコル: FLEXIBLE FIT
得られたモデル

PDB-8oiq:
39S mammalian mitochondrial large ribosomal subunit with mtRF1 and P-site tRNA

+
万見について

-
お知らせ

-
2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

-
2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbjlvh1.pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

+
2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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万見 (Yorodumi)

幾万の構造データを、幾万の視点から

  • 万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
  • EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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