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基本情報
登録情報 | ![]() | |||||||||
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タイトル | Subtomogram average of floating microtubule inner protein 5 | |||||||||
![]() | Subtomogram average of floating microtubule inner protein 5 | |||||||||
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![]() | microtubule associated protein / STRUCTURAL PROTEIN | |||||||||
生物種 | ![]() ![]() | |||||||||
手法 | サブトモグラム平均法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 26.0 Å | |||||||||
![]() | Chakraborty S / Mahamid J / Martinez-Sanchez A / Baumeister W | |||||||||
資金援助 | 1件
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![]() | ![]() タイトル: Subtomogram average of floating microtubule inner protein 5 著者: Chakraborty S / Mahamid J / Martinez-Sanchez A / Baumeister W | |||||||||
履歴 |
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構造の表示
添付画像 |
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ダウンロードとリンク
-EMDBアーカイブ
マップデータ | ![]() | 570.2 KB | ![]() | |
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ヘッダ (付随情報) | ![]() ![]() | 13.6 KB 13.6 KB | 表示 表示 | ![]() |
FSC (解像度算出) | ![]() | 4.7 KB | 表示 | ![]() |
画像 | ![]() | 11 KB | ||
Filedesc metadata | ![]() | 3.9 KB | ||
その他 | ![]() ![]() | 6 MB 6 MB | ||
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 765.6 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 765.2 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 10.6 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 14 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
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リンク
EMDBのページ | ![]() ![]() |
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マップ
ファイル | ![]() | ||||||||||||||||||||
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注釈 | Subtomogram average of floating microtubule inner protein 5 | ||||||||||||||||||||
ボクセルのサイズ | X=Y=Z: 2.24 Å | ||||||||||||||||||||
密度 |
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対称性 | 空間群: 1 | ||||||||||||||||||||
詳細 | EMDB XML:
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-添付データ
-ハーフマップ: Subtomogram average of floating microtubule inner protein 5
ファイル | emd_15457_half_map_1.map | ||||||||||||
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注釈 | Subtomogram average of floating microtubule inner protein 5 | ||||||||||||
投影像・断面図 |
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密度ヒストグラム |
-ハーフマップ: Subtomogram average of floating microtubule inner protein 5
ファイル | emd_15457_half_map_2.map | ||||||||||||
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注釈 | Subtomogram average of floating microtubule inner protein 5 | ||||||||||||
投影像・断面図 |
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密度ヒストグラム |
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試料の構成要素
-全体 : MIP5 from primary neuronal microtubules
全体 | 名称: MIP5 from primary neuronal microtubules |
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要素 |
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-超分子 #1: MIP5 from primary neuronal microtubules
超分子 | 名称: MIP5 from primary neuronal microtubules / タイプ: cell / ID: 1 / 親要素: 0 |
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由来(天然) | 生物種: ![]() ![]() |
-実験情報
-構造解析
手法 | クライオ電子顕微鏡法 |
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![]() | サブトモグラム平均法 |
試料の集合状態 | cell |
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試料調製
緩衝液 | pH: 7.2 |
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グリッド | モデル: Quantifoil / 材質: GOLD / メッシュ: 200 / 前処理 - タイプ: GLOW DISCHARGE / 前処理 - 時間: 45 sec. |
凍結 | 凍結剤: ETHANE-PROPANE / チャンバー内湿度: 98 % / チャンバー内温度: 310 K / 装置: FEI VITROBOT MARK IV |
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電子顕微鏡法
顕微鏡 | FEI TITAN KRIOS |
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温度 | 最低: 77.0 K |
撮影 | フィルム・検出器のモデル: GATAN K2 SUMMIT (4k x 4k) 検出モード: COUNTING / 平均電子線量: 1.5 e/Å2 |
電子線 | 加速電圧: 300 kV / 電子線源: ![]() |
電子光学系 | C2レンズ絞り径: 70.0 µm / 照射モード: FLOOD BEAM / 撮影モード: BRIGHT FIELD / Cs: 2.7 mm / 最大 デフォーカス(公称値): 6.0 µm / 最小 デフォーカス(公称値): 2.5 µm / 倍率(公称値): 64000 |
試料ステージ | 試料ホルダーモデル: FEI TITAN KRIOS AUTOGRID HOLDER ホルダー冷却材: NITROGEN |
実験機器 | ![]() モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company |