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-基本情報
登録情報 | データベース: SASBDB / ID: SASDDZ2 |
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試料 | Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 4: Fragment SALM3 LRR-Ig-Fn
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機能・相同性 | 機能・相同性情報 Synaptic adhesion-like molecules / regulation of postsynaptic density assembly / synaptic membrane adhesion / regulation of presynapse assembly / GABA-ergic synapse / postsynaptic density membrane / glutamatergic synapse / cell surface 類似検索 - 分子機能 |
生物種 | Mus musculus (ハツカネズミ) |
引用 | 日付: 2018 Jun 12 タイトル: The structure of SALM5 suggests a dimeric assembly for the presynaptic RPTP ligand recognition 著者: Karki S / Paudel P / Sele C / Shkumatov A |
登録者 |
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-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-モデル
モデル #1732 | タイプ: dummy / ソフトウェア: (r9684) / ダミー原子の半径: 4.50 A / 対称性: P1 / コメント: averaged (damstart.pdb) refined model / カイ2乗値: 0.942 / P-value: 0.000298 Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細) |
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モデル #1733 | タイプ: atomic / ソフトウェア: (r9684) / ダミー原子の半径: 1.90 A / 対称性: P2 / カイ2乗値: 2.200 / P-value: 0.000042 Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細) |
モデル #1734 | タイプ: atomic / ソフトウェア: (r9684) / ダミー原子の半径: 1.90 A / 対称性: P2 / カイ2乗値: 2.200 / P-value: 0.000042 Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細) |
モデル #1735 | タイプ: atomic / ソフトウェア: (r9684) / ダミー原子の半径: 1.90 A / 対称性: P2 / カイ2乗値: 2.200 / P-value: 0.000042 Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細) |
モデル #1736 | タイプ: atomic / ソフトウェア: (r9684) / ダミー原子の半径: 1.90 A / 対称性: P2 / カイ2乗値: 2.200 / P-value: 0.000042 Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細) |
-試料
試料 | 名称: Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 4: Fragment SALM3 LRR-Ig-Fn 試料濃度: 22.3 mg/ml |
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バッファ | 名称: 20 mM Tris HCl, 100 mM NaCl, 0.02% NaN3, / pH: 7.5 |
要素 #945 | 名称: LRR-Ig-Fn / タイプ: protein 記述: Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 4 分子量: 54.616 / 分子数: 2 / 由来: Mus musculus / 参照: UniProt: Q80XU8 配列: MDKLCPLPCV CQNLSESLST LCAHRGLLFV PPNVDRRTVE LRLADNFIQA LGPPDFRNMT GLVDLTLSRN AITRIGARSF GDLESLRSLH LDGNRLVELG SSSLRGPVNL QHLILSGNQL GRIAPGAFDD FLDSLEDLDV SYNNLRQVPW AGIGSMPALH TLNLDHNLID ...配列: MDKLCPLPCV CQNLSESLST LCAHRGLLFV PPNVDRRTVE LRLADNFIQA LGPPDFRNMT GLVDLTLSRN AITRIGARSF GDLESLRSLH LDGNRLVELG SSSLRGPVNL QHLILSGNQL GRIAPGAFDD FLDSLEDLDV SYNNLRQVPW AGIGSMPALH TLNLDHNLID ALPPGVFAQL SQLSRLDLTS NRLATLAPDP LFSRGRDAEA SPSPLVLSFS GNPLHCNCEL LWLRRLARPD DLETCASPPT LAGRYFWAVP EGEFSCEPPL IARHTQRLWV LEGQRATLRC RALGDPVPTM HWVGPDDRLV GNSSRAWAFP NGTLEIGVTG AGDAGAYTCI ATNPAGEATA RVELRVLALP HGGNTSAEGG RPGPSDIAAS ARTAAEGEGT LESEPAVQVT EVTATSGLVS WGLGRPADPV WMFQIQYNSS EDETLIYRIV PASSHHFLLK HLVPGADYDL CLLALSPAAG PSDLTATRLL GCAHFSTLPA TPLCHALQYP GILEVLFQ |
-実験情報
ビーム | 設備名称: ESRF BM29 / 地域: Grenoble / 国: France / 線源: X-ray synchrotron / 波長: 0.09919 Å / スペクトロメータ・検出器間距離: 2.867 mm | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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検出器 | 名称: Pilatus 1M | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
スキャン | タイトル: Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 4: Fragment SALM3 LRR-Ig-Fn 測定日: 2017年3月11日 / 保管温度: 4.7 °C / セル温度: 4.7 °C / 照射時間: 1 sec. / フレーム数: 1 / 単位: 1/nm /
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距離分布関数 P(R) | ソフトウェア P(R): GNOM 5.0 / ポイント数: 330 /
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結果 | カーブのタイプ: sec /
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